Genes within 1Mb (chr6:132463363:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 61888 sc-eQTL 3.97e-01 0.0954 0.112 0.179 B L1
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 2.39e-02 0.0954 0.0419 0.179 B L1
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 6.01e-01 0.0442 0.0845 0.179 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0533 0.0797 0.179 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 4.41e-01 0.0372 0.0482 0.179 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 7.47e-02 0.18 0.101 0.179 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 331475 sc-eQTL 9.56e-01 0.0037 0.0666 0.179 B L1
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 1.52e-02 0.198 0.0809 0.179 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 2.67e-02 -0.144 0.0644 0.179 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 3.31e-01 0.0691 0.0709 0.179 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 8.13e-01 0.0114 0.0483 0.179 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 3.93e-01 0.0836 0.0976 0.179 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 3.82e-01 0.0701 0.0799 0.179 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0808 0.0787 0.179 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0953 0.0933 0.179 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 8.50e-01 -0.00606 0.0319 0.179 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 3.23e-01 0.0956 0.0964 0.179 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 2.99e-01 0.0755 0.0724 0.189 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -271402 sc-eQTL 1.05e-02 -0.229 0.0886 0.189 DC L1
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 3.50e-01 0.0988 0.105 0.189 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -250692 sc-eQTL 1.80e-03 0.3 0.0948 0.189 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 2.91e-01 0.11 0.104 0.189 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 2.77e-01 0.0633 0.0581 0.189 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 9.82e-01 0.00207 0.0923 0.189 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -639765 sc-eQTL 8.30e-01 0.0181 0.084 0.189 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 2.43e-01 0.0645 0.0551 0.179 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -271402 sc-eQTL 9.85e-01 0.00179 0.0949 0.179 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0363 0.0901 0.179 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -250692 sc-eQTL 2.01e-01 0.13 0.102 0.179 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 8.52e-01 0.0134 0.072 0.179 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 6.18e-01 0.0215 0.0431 0.179 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 3.52e-01 0.0795 0.0852 0.179 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 7.22e-01 0.0299 0.0838 0.18 NK L1
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0208 0.0767 0.18 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 3.92e-01 0.0894 0.104 0.18 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 9.59e-01 0.00222 0.0432 0.18 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 6.21e-02 -0.16 0.0853 0.179 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00209 0.107 0.179 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 3.06e-01 0.106 0.104 0.179 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 6.96e-01 0.0161 0.0412 0.179 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 5.63e-01 0.0653 0.113 0.179 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 61888 sc-eQTL 2.67e-01 -0.124 0.111 0.186 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 4.50e-01 0.079 0.104 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 8.80e-01 0.0175 0.116 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0839 0.111 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 7.32e-01 0.0204 0.0595 0.186 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 8.61e-01 0.0183 0.104 0.186 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 331475 sc-eQTL 5.53e-01 0.059 0.0993 0.186 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 61888 sc-eQTL 7.15e-01 0.0381 0.104 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 9.20e-02 0.115 0.0678 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 5.72e-01 0.0588 0.104 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 3.64e-01 0.0934 0.103 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 6.49e-01 0.0287 0.0629 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 1.44e-01 0.166 0.113 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 331475 sc-eQTL 5.70e-01 0.0548 0.0963 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 61888 sc-eQTL 1.56e-01 0.147 0.103 0.179 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 2.06e-01 0.103 0.0811 0.179 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0435 0.105 0.179 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 3.95e-01 0.0907 0.106 0.179 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 3.69e-01 0.0461 0.0512 0.179 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 7.93e-01 0.0281 0.107 0.179 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 331475 sc-eQTL 7.32e-01 0.0342 0.0998 0.179 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 61888 sc-eQTL 1.12e-01 0.189 0.118 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 1.47e-01 0.0753 0.0517 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0765 0.093 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 1.85e-01 -0.134 0.101 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 3.67e-01 0.0518 0.0574 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 7.42e-03 0.295 0.109 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 331475 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0664 0.0733 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 61888 sc-eQTL 1.49e-01 0.161 0.111 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 1.55e-03 0.19 0.0593 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 2.06e-01 0.142 0.112 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0315 0.111 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 7.68e-02 0.104 0.0586 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0351 0.113 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 331475 sc-eQTL 6.95e-01 0.0306 0.078 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 1.16e-01 0.182 0.115 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 2.64e-01 -0.135 0.12 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 7.75e-02 0.206 0.116 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 1.07e-01 0.087 0.0537 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 1.44e-01 0.159 0.108 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 3.92e-02 0.181 0.0872 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 7.10e-03 -0.201 0.0739 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 8.60e-01 0.0144 0.0816 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 6.73e-01 0.0223 0.0529 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 8.03e-01 0.0254 0.102 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 5.38e-01 0.0596 0.0967 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 9.46e-01 0.00548 0.0814 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 2.36e-01 0.113 0.0951 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0563 0.0493 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 3.49e-01 0.107 0.114 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 2.35e-01 0.135 0.113 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 2.99e-01 0.108 0.104 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 1.25e-01 -0.166 0.108 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0479 0.0445 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 1.94e-01 0.144 0.11 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 5.34e-01 0.0577 0.0927 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 2.46e-01 -0.11 0.0947 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00185 0.105 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 7.50e-01 -0.018 0.0564 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 1.27e-01 0.166 0.109 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 8.05e-01 -0.028 0.114 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 8.20e-01 0.0208 0.0913 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0277 0.098 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 8.09e-01 0.0136 0.0561 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 8.83e-01 0.0166 0.113 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 4.58e-01 -0.083 0.112 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 3.24e-01 -0.111 0.112 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0536 0.111 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0419 0.054 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 6.60e-01 0.0522 0.118 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 4.65e-01 0.0898 0.123 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 1.09e-01 0.189 0.117 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0868 0.122 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 7.62e-01 0.02 0.0657 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 2.09e-01 -0.156 0.124 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 2.47e-01 -0.123 0.106 0.182 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 3.11e-01 -0.113 0.111 0.182 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 2.00e-01 0.139 0.108 0.182 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 5.75e-01 0.0298 0.0531 0.182 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0656 0.111 0.182 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 2.36e-01 -0.132 0.111 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 2.74e-01 0.129 0.118 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 2.81e-01 -0.122 0.113 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0105 0.0631 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 8.39e-01 0.0181 0.0892 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0672 0.0915 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 1.79e-01 0.15 0.111 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 5.51e-01 0.0264 0.0442 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 4.01e-01 0.0935 0.111 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 5.93e-01 0.0603 0.112 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 2.83e-01 0.121 0.112 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0288 0.0525 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 8.80e-01 0.0148 0.0975 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0518 0.101 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 7.27e-01 0.0383 0.11 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00414 0.0595 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 61888 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0316 0.119 0.185 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 3.10e-01 -0.101 0.0989 0.185 PB L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 6.69e-01 0.0578 0.135 0.185 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 3.24e-01 -0.12 0.121 0.185 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0348 0.0689 0.185 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0493 0.129 0.185 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 331475 sc-eQTL 2.67e-01 0.0942 0.0845 0.185 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 3.59e-01 0.0951 0.104 0.178 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 1.28e-01 0.177 0.116 0.178 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 7.44e-01 0.0363 0.111 0.178 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0533 0.0419 0.178 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 7.55e-01 0.034 0.109 0.178 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 6.32e-01 0.0519 0.108 0.179 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0386 0.111 0.179 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 5.92e-01 0.0488 0.0909 0.179 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 8.17e-01 -0.00934 0.0402 0.179 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 2.94e-01 0.119 0.113 0.179 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 3.91e-01 0.0805 0.0936 0.195 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -271402 sc-eQTL 5.14e-02 -0.181 0.0922 0.195 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0267 0.121 0.195 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -250692 sc-eQTL 9.87e-02 0.18 0.109 0.195 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 8.36e-01 0.0221 0.107 0.195 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 6.43e-01 0.0244 0.0526 0.195 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 6.88e-01 0.0419 0.104 0.195 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -639765 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0363 0.0833 0.195 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 9.12e-01 0.00789 0.0711 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -271402 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00544 0.101 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 7.39e-01 0.0331 0.0994 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -250692 sc-eQTL 2.40e-01 0.119 0.101 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 4.33e-01 0.0636 0.081 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 8.13e-01 0.0106 0.045 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 3.54e-01 0.0805 0.0867 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 2.70e-02 0.17 0.0763 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -271402 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00553 0.0964 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0271 0.105 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -250692 sc-eQTL 8.11e-02 0.182 0.104 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 4.09e-01 0.0566 0.0685 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00421 0.0494 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0048 0.0914 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 3.78e-01 -0.113 0.128 0.182 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 5.74e-01 0.0773 0.137 0.182 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0198 0.142 0.182 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 8.50e-01 0.0102 0.0539 0.182 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 6.68e-01 0.0598 0.139 0.182 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 9.63e-01 0.00478 0.103 0.184 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -271402 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0391 0.104 0.184 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0402 0.114 0.184 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -250692 sc-eQTL 2.47e-01 0.119 0.102 0.184 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 2.43e-02 0.234 0.103 0.184 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0523 0.0453 0.184 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 5.07e-01 0.0734 0.111 0.184 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 1.38e-01 -0.114 0.0762 0.186 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -271402 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0546 0.108 0.186 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0369 0.11 0.186 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -250692 sc-eQTL 1.35e-01 0.16 0.107 0.186 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0886 0.103 0.186 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 3.86e-01 0.0449 0.0517 0.186 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 1.94e-01 -0.119 0.0911 0.186 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 3.90e-01 0.0769 0.0893 0.189 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -271402 sc-eQTL 2.37e-01 -0.106 0.0897 0.189 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 7.89e-01 0.0336 0.126 0.189 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -250692 sc-eQTL 1.91e-03 0.281 0.0888 0.189 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 3.41e-01 0.104 0.109 0.189 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0252 0.0751 0.189 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 3.78e-01 0.0981 0.111 0.189 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -639765 sc-eQTL 2.51e-01 0.122 0.106 0.189 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 61888 sc-eQTL 5.55e-01 0.0652 0.11 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 1.28e-01 0.095 0.0621 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 2.89e-01 0.101 0.0953 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 3.66e-01 0.0893 0.0986 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 3.63e-01 0.0513 0.0562 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 9.68e-02 0.171 0.103 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 331475 sc-eQTL 4.87e-01 0.0694 0.0996 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 61888 sc-eQTL 6.70e-02 0.216 0.117 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 5.17e-03 0.135 0.0477 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00337 0.0912 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 2.84e-01 -0.101 0.094 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 2.94e-01 0.0599 0.0569 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 9.05e-02 0.182 0.107 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 331475 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0325 0.0683 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 1.44e-01 0.0869 0.0593 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -271402 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00177 0.0971 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00461 0.0933 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -250692 sc-eQTL 1.17e-01 0.158 0.101 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 5.76e-01 0.0375 0.0669 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 7.93e-01 0.0121 0.0459 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 4.59e-01 0.0605 0.0816 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 3.43e-01 -0.069 0.0725 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -271402 sc-eQTL 3.13e-01 -0.108 0.107 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 5.02e-01 -0.07 0.104 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -250692 sc-eQTL 1.52e-01 0.151 0.105 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 8.25e-01 0.0221 0.0999 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 9.46e-01 0.00286 0.0424 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -349976 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0557 0.103 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -49835 sc-eQTL 6.81e-01 0.0346 0.084 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 835121 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0656 0.0814 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -300096 sc-eQTL 2.66e-01 0.118 0.106 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -351206 sc-eQTL 8.66e-01 -0.00735 0.0434 0.179 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 61888 eQTL 0.00823 0.106 0.0401 0.0 0.0 0.154
ENSG00000079950 STX7 -49835 pQTL 0.112 0.0481 0.0303 0.00187 0.0 0.157
ENSG00000079950 STX7 -49835 eQTL 6.36e-11 0.137 0.0208 0.0 0.0 0.154
ENSG00000118520 ARG1 890219 eQTL 0.0377 -0.0512 0.0246 0.0 0.0 0.154


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 61888 1.04e-05 1.26e-05 1.3e-06 6.69e-06 2.18e-06 4.37e-06 1.04e-05 1.79e-06 1e-05 5.03e-06 1.24e-05 5.33e-06 1.68e-05 3.59e-06 2.44e-06 6.52e-06 4.92e-06 7.77e-06 2.64e-06 2.94e-06 4.97e-06 9.92e-06 7.67e-06 3.07e-06 1.48e-05 3.35e-06 4.87e-06 3.74e-06 9.57e-06 8.32e-06 6.24e-06 8.65e-07 1.09e-06 2.93e-06 4.71e-06 2.43e-06 1.72e-06 1.86e-06 2.11e-06 1.01e-06 7.73e-07 1.39e-05 1.4e-06 1.56e-07 7.81e-07 1.47e-06 9.12e-07 7.1e-07 5.25e-07
ENSG00000079950 STX7 -49835 1.24e-05 1.48e-05 2.05e-06 8.01e-06 2.44e-06 5.45e-06 1.23e-05 2.15e-06 1.14e-05 5.43e-06 1.5e-05 6.06e-06 2.09e-05 4.27e-06 3.33e-06 6.69e-06 6.55e-06 9.73e-06 2.99e-06 2.99e-06 6.14e-06 1.14e-05 1.01e-05 3.27e-06 1.97e-05 4.62e-06 5.85e-06 4.77e-06 1.22e-05 1.03e-05 7.68e-06 1.07e-06 1.21e-06 3.26e-06 5.47e-06 2.75e-06 1.82e-06 1.94e-06 2.08e-06 1.01e-06 9.12e-07 1.68e-05 1.57e-06 1.35e-07 7.18e-07 1.82e-06 1.38e-06 7.96e-07 4.4e-07