logo

Genes within 1Mb (chr6:132454059:T:TAC):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 52584 sc-eQTL 3.24e-01 0.112 0.113 0.177 B L1
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 2.92e-02 0.0927 0.0422 0.177 B L1
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 5.32e-01 0.0532 0.085 0.177 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0518 0.0801 0.177 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 4.91e-01 0.0335 0.0484 0.177 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 9.06e-02 0.172 0.101 0.177 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 322171 sc-eQTL 9.19e-01 0.00682 0.067 0.177 B L1
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 1.05e-02 0.21 0.0813 0.177 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 3.06e-02 -0.141 0.0648 0.177 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 3.07e-01 0.0731 0.0713 0.177 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 7.80e-01 0.0136 0.0486 0.177 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 4.03e-01 0.0824 0.0982 0.177 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 3.04e-01 0.0827 0.0803 0.177 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0613 0.0792 0.177 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0704 0.0938 0.177 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 8.13e-01 -0.00759 0.0321 0.177 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 4.07e-01 0.0805 0.0969 0.177 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 2.85e-01 0.0781 0.0729 0.187 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -280706 sc-eQTL 5.81e-03 -0.248 0.0889 0.187 DC L1
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 3.42e-01 0.101 0.106 0.187 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -259996 sc-eQTL 4.43e-03 0.276 0.0958 0.187 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 2.88e-01 0.111 0.104 0.187 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 3.31e-01 0.057 0.0585 0.187 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 9.64e-01 0.00414 0.0928 0.187 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -649069 sc-eQTL 8.18e-01 0.0194 0.0845 0.187 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 2.68e-01 0.0617 0.0555 0.177 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -280706 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0251 0.0956 0.177 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0433 0.0907 0.177 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -259996 sc-eQTL 2.45e-01 0.12 0.103 0.177 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 8.62e-01 0.0127 0.0726 0.177 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 6.75e-01 0.0182 0.0435 0.177 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 3.74e-01 0.0765 0.0859 0.177 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 5.44e-01 0.0512 0.0843 0.178 NK L1
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0286 0.0771 0.178 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 2.97e-01 0.109 0.105 0.178 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0032 0.0434 0.178 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 4.94e-02 -0.168 0.0852 0.177 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 9.82e-01 0.00243 0.107 0.177 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 3.36e-01 0.1 0.104 0.177 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 6.11e-01 0.021 0.0412 0.177 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 4.97e-01 0.0767 0.113 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 52584 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0945 0.112 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 4.98e-01 0.071 0.105 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 8.06e-01 0.0285 0.116 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0979 0.111 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 6.76e-01 0.025 0.0598 0.184 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 9.91e-01 0.00113 0.105 0.184 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 322171 sc-eQTL 5.41e-01 0.0611 0.0997 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 52584 sc-eQTL 7.90e-01 0.028 0.105 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 7.23e-02 0.123 0.0682 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 5.36e-01 0.0647 0.104 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 3.10e-01 0.105 0.103 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 6.70e-01 0.027 0.0633 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 2.22e-01 0.139 0.114 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 322171 sc-eQTL 5.29e-01 0.0611 0.0969 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 52584 sc-eQTL 1.52e-01 0.149 0.104 0.177 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 2.27e-01 0.099 0.0816 0.177 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0392 0.105 0.177 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 3.73e-01 0.0954 0.107 0.177 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 3.48e-01 0.0484 0.0515 0.177 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 8.86e-01 0.0154 0.108 0.177 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 322171 sc-eQTL 6.46e-01 0.0462 0.1 0.177 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 52584 sc-eQTL 8.25e-02 0.207 0.118 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 1.50e-01 0.075 0.0519 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0757 0.0932 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 1.79e-01 -0.136 0.101 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 4.06e-01 0.0479 0.0575 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 6.93e-03 0.298 0.109 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 322171 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0577 0.0735 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 52584 sc-eQTL 1.51e-01 0.161 0.111 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 2.07e-03 0.186 0.0596 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 1.92e-01 0.147 0.112 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0302 0.112 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 8.25e-02 0.103 0.0588 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0467 0.113 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 322171 sc-eQTL 6.81e-01 0.0322 0.0783 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 9.27e-02 0.194 0.115 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 2.62e-01 -0.135 0.12 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 6.31e-02 0.217 0.116 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 1.43e-01 0.0791 0.0537 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 1.40e-01 0.16 0.108 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 3.14e-02 0.19 0.0876 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 8.12e-03 -0.199 0.0744 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 8.76e-01 0.0128 0.0821 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 6.63e-01 0.0232 0.0532 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 8.13e-01 0.0243 0.102 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 5.41e-01 0.0596 0.0974 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 9.52e-01 0.00492 0.082 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 1.81e-01 0.129 0.0957 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0546 0.0497 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 3.55e-01 0.107 0.115 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 1.65e-01 0.158 0.113 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 2.32e-01 0.125 0.105 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 1.97e-01 -0.141 0.109 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0457 0.0447 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 1.73e-01 0.152 0.111 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 4.76e-01 0.0664 0.093 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 3.05e-01 -0.098 0.0952 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00804 0.106 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0288 0.0566 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 8.89e-02 0.186 0.109 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00947 0.114 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 7.02e-01 0.0352 0.0919 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 9.36e-01 0.00793 0.0986 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 8.07e-01 0.0138 0.0564 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0152 0.113 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0763 0.112 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 3.38e-01 -0.108 0.113 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0544 0.111 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0457 0.0543 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 6.43e-01 0.0553 0.119 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 4.65e-01 0.0898 0.123 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 1.09e-01 0.189 0.117 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0868 0.122 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 7.62e-01 0.02 0.0657 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 2.09e-01 -0.156 0.124 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 1.68e-01 -0.147 0.106 0.18 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 3.48e-01 -0.105 0.112 0.18 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 2.81e-01 0.117 0.109 0.18 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 5.76e-01 0.03 0.0535 0.18 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0463 0.112 0.18 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 2.36e-01 -0.132 0.111 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 2.74e-01 0.129 0.118 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 2.81e-01 -0.122 0.113 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0105 0.0631 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 6.92e-01 0.0355 0.0897 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0722 0.0921 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 1.09e-01 0.179 0.112 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 7.86e-01 0.0121 0.0445 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 3.07e-01 0.114 0.112 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 7.06e-01 0.0427 0.113 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 2.30e-01 0.136 0.113 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0287 0.0527 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 8.01e-01 0.0247 0.098 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0568 0.101 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 6.04e-01 0.0572 0.11 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 9.69e-01 0.00235 0.0598 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 52584 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0133 0.12 0.181 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 2.97e-01 -0.104 0.0995 0.181 PB L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 6.21e-01 0.0673 0.136 0.181 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 3.09e-01 -0.124 0.122 0.181 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0271 0.0693 0.181 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0542 0.13 0.181 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 322171 sc-eQTL 2.55e-01 0.0972 0.0849 0.181 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 3.46e-01 0.0979 0.104 0.176 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 1.27e-01 0.178 0.116 0.176 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 6.73e-01 0.0472 0.111 0.176 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0496 0.042 0.176 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 7.21e-01 0.039 0.109 0.176 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 5.59e-01 0.0636 0.109 0.177 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0494 0.112 0.177 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 6.72e-01 0.0388 0.0914 0.177 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 9.28e-01 0.00365 0.0405 0.177 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 2.72e-01 0.125 0.114 0.177 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 3.90e-01 0.081 0.0941 0.193 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -280706 sc-eQTL 3.19e-02 -0.2 0.0924 0.193 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0167 0.122 0.193 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -259996 sc-eQTL 1.46e-01 0.16 0.109 0.193 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 8.20e-01 0.0244 0.107 0.193 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 7.51e-01 0.0168 0.0529 0.193 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 6.89e-01 0.042 0.105 0.193 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -649069 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0367 0.0838 0.193 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 9.25e-01 0.00671 0.0716 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -280706 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0292 0.101 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 7.60e-01 0.0306 0.1 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -259996 sc-eQTL 2.96e-01 0.107 0.102 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 4.19e-01 0.066 0.0815 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 9.17e-01 0.00471 0.0453 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 3.86e-01 0.0759 0.0873 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 3.16e-02 0.166 0.0769 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -280706 sc-eQTL 7.89e-01 -0.026 0.097 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0304 0.105 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -259996 sc-eQTL 9.23e-02 0.177 0.105 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 4.31e-01 0.0543 0.0689 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 8.62e-01 -0.00862 0.0497 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0123 0.092 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 3.78e-01 -0.113 0.128 0.182 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 5.74e-01 0.0773 0.137 0.182 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0198 0.142 0.182 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 8.50e-01 0.0102 0.0539 0.182 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 6.68e-01 0.0598 0.139 0.182 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 9.62e-01 0.00496 0.104 0.182 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -280706 sc-eQTL 5.86e-01 -0.057 0.105 0.182 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0362 0.115 0.182 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -259996 sc-eQTL 2.71e-01 0.114 0.103 0.182 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 2.46e-02 0.235 0.104 0.182 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0603 0.0456 0.182 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 4.29e-01 0.0881 0.111 0.182 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 1.46e-01 -0.112 0.0767 0.183 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -280706 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0595 0.109 0.183 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0495 0.11 0.183 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -259996 sc-eQTL 1.22e-01 0.167 0.107 0.183 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0773 0.104 0.183 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 4.50e-01 0.0394 0.0521 0.183 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 1.56e-01 -0.131 0.0916 0.183 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 3.58e-01 0.0829 0.09 0.186 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -280706 sc-eQTL 1.59e-01 -0.128 0.0902 0.186 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 8.36e-01 0.0262 0.127 0.186 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -259996 sc-eQTL 5.55e-03 0.254 0.0901 0.186 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 2.77e-01 0.12 0.11 0.186 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0405 0.0757 0.186 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 3.27e-01 0.11 0.112 0.186 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -649069 sc-eQTL 2.55e-01 0.122 0.107 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 52584 sc-eQTL 5.17e-01 0.072 0.111 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 1.21e-01 0.0974 0.0625 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 2.42e-01 0.113 0.0959 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 3.38e-01 0.0954 0.0992 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 3.59e-01 0.0519 0.0565 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 1.55e-01 0.148 0.103 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 322171 sc-eQTL 5.03e-01 0.0672 0.1 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 52584 sc-eQTL 5.11e-02 0.231 0.118 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 5.87e-03 0.133 0.0479 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 9.86e-01 0.00157 0.0915 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0991 0.0944 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 3.28e-01 0.056 0.0571 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 9.77e-02 0.179 0.107 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 322171 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0246 0.0686 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 1.66e-01 0.0831 0.0597 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -280706 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0292 0.0977 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00991 0.094 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -259996 sc-eQTL 1.44e-01 0.149 0.101 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 5.92e-01 0.0361 0.0674 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 8.77e-01 0.00715 0.0462 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 5.03e-01 0.0551 0.0822 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0682 0.073 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -280706 sc-eQTL 2.53e-01 -0.123 0.107 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 4.68e-01 -0.076 0.105 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -259996 sc-eQTL 1.49e-01 0.154 0.106 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 7.50e-01 0.0321 0.101 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00325 0.0427 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -359280 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0541 0.104 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -59139 sc-eQTL 4.50e-01 0.0639 0.0844 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 825817 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0728 0.0819 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -309400 sc-eQTL 1.83e-01 0.142 0.107 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -360510 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0123 0.0437 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 52584 eQTL 0.00784 0.107 0.0402 0.0 0.0 0.153
ENSG00000079950 STX7 -59139 pQTL 0.107 0.049 0.0303 0.0018 0.0 0.157
ENSG00000079950 STX7 -59139 eQTL 6.03e-11 0.138 0.0208 0.0 0.0 0.153
ENSG00000118520 ARG1 880915 eQTL 0.0366 -0.0515 0.0246 0.0 0.0 0.153

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 52584 0.000109 2.45e-05 6.39e-06 6.69e-06 2.35e-06 1.01e-05 3.29e-05 1.04e-06 9.21e-06 4.81e-06 1.6e-05 3.62e-06 2.69e-05 3.53e-06 4.83e-06 6.73e-06 7.73e-06 9.66e-06 2.68e-06 2.41e-06 6.01e-06 1.09e-05 2.39e-05 3.24e-06 2.46e-05 4.32e-06 5.62e-06 2.82e-06 1.81e-05 1.03e-05 7.47e-06 4.56e-07 4.63e-07 3.57e-06 6.33e-06 2.83e-06 1.76e-06 1.98e-06 1.6e-06 8.61e-07 7.24e-07 4.51e-05 6.26e-06 2.96e-07 7.9e-07 1.71e-06 9.95e-07 4.26e-07 5.83e-07
ENSG00000079950 STX7 -59139 0.000106 2.06e-05 4.66e-06 6.21e-06 2.54e-06 8.2e-06 2.67e-05 9.78e-07 7.7e-06 4.22e-06 1.42e-05 2.83e-06 2.18e-05 3.88e-06 4.14e-06 6.36e-06 6.4e-06 8.1e-06 2.23e-06 1.6e-06 5.05e-06 1.01e-05 2e-05 2.76e-06 2.14e-05 4.56e-06 4.85e-06 2.09e-06 1.53e-05 9.23e-06 6.36e-06 3.05e-07 6.31e-07 3.33e-06 5.77e-06 2.83e-06 1.76e-06 1.81e-06 1.39e-06 6.54e-07 4.59e-07 3.92e-05 5.77e-06 2.69e-07 7.07e-07 1.76e-06 1.04e-06 2.07e-07 4.23e-07