logo

Genes within 1Mb (chr6:132449035:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 47560 sc-eQTL 6.76e-01 0.0532 0.127 0.13 B L1
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0193 0.048 0.13 B L1
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 9.93e-01 0.000863 0.0958 0.13 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 7.56e-01 -0.028 0.0903 0.13 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 5.32e-01 0.0342 0.0546 0.13 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0501 0.115 0.13 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 317147 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00223 0.0754 0.13 B L1
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 1.63e-02 -0.224 0.0924 0.13 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 1.27e-01 0.113 0.0739 0.13 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 7.21e-02 -0.146 0.0805 0.13 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0131 0.0552 0.13 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 7.01e-01 0.0429 0.112 0.13 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0545 0.0922 0.13 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0561 0.0908 0.13 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 1.25e-02 -0.267 0.106 0.13 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 4.44e-01 0.0282 0.0368 0.13 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00269 0.111 0.13 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0731 0.0864 0.131 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -285730 sc-eQTL 8.07e-01 0.0263 0.107 0.131 DC L1
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 7.22e-01 0.0449 0.126 0.131 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -265020 sc-eQTL 9.53e-01 0.00688 0.116 0.131 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 6.25e-01 0.0607 0.124 0.131 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 5.46e-01 -0.042 0.0694 0.131 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00945 0.11 0.131 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -654093 sc-eQTL 3.88e-01 0.0864 0.0999 0.131 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 5.61e-01 0.0369 0.0634 0.13 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -285730 sc-eQTL 2.33e-01 0.13 0.109 0.13 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00951 0.103 0.13 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -265020 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.117 0.13 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0558 0.0826 0.13 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00353 0.0496 0.13 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 2.16e-01 0.121 0.0977 0.13 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 4.17e-02 -0.199 0.0969 0.127 NK L1
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 6.23e-01 -0.044 0.0894 0.127 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 3.07e-01 -0.124 0.121 0.127 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 2.56e-01 0.0573 0.0502 0.127 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0507 0.0942 0.13 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 2.84e-01 -0.126 0.117 0.13 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 1.03e-01 -0.185 0.113 0.13 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 1.59e-03 0.141 0.0442 0.13 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0671 0.124 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 47560 sc-eQTL 7.37e-01 0.0443 0.132 0.135 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0106 0.124 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 9.12e-01 0.0151 0.137 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 6.43e-01 0.0611 0.131 0.135 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00985 0.0705 0.135 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 7.38e-02 -0.22 0.122 0.135 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 317147 sc-eQTL 3.03e-01 -0.121 0.117 0.135 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 47560 sc-eQTL 2.98e-01 0.123 0.118 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 9.64e-01 0.00352 0.0774 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 6.08e-01 0.0604 0.118 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000492 0.117 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00845 0.0714 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 3.37e-01 -0.124 0.128 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 317147 sc-eQTL 5.68e-01 0.0625 0.109 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 47560 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0896 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 1.79e-01 -0.124 0.0921 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 1.00e-02 0.305 0.117 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 2.36e-01 -0.143 0.121 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0196 0.0583 0.131 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 6.30e-01 0.0587 0.122 0.131 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 317147 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0916 0.113 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 47560 sc-eQTL 5.90e-01 0.0719 0.133 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 4.57e-01 0.0433 0.0581 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00097 0.104 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 5.83e-01 0.0621 0.113 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 9.50e-01 -0.004 0.0644 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 2.04e-01 -0.157 0.124 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 317147 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0851 0.082 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 47560 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0227 0.124 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 6.04e-01 -0.035 0.0674 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 2.01e-01 -0.159 0.124 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 3.02e-01 -0.128 0.123 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 4.38e-01 0.0508 0.0654 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 3.91e-01 0.107 0.125 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 317147 sc-eQTL 5.51e-01 0.0517 0.0866 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 2.34e-01 -0.153 0.129 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 8.76e-01 0.021 0.134 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 4.37e-01 -0.101 0.13 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 2.56e-03 0.18 0.0588 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0589 0.121 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 1.45e-01 -0.146 0.1 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 1.08e-01 0.138 0.0853 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 2.82e-01 -0.1 0.0929 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 6.43e-01 0.028 0.0604 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 5.71e-01 0.066 0.116 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 2.41e-02 -0.25 0.11 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 8.24e-01 0.0209 0.0937 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 9.31e-02 -0.184 0.109 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 7.95e-01 0.0148 0.0569 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 4.75e-01 0.0942 0.132 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 6.67e-02 -0.23 0.125 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00749 0.116 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 2.09e-01 -0.152 0.12 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 3.55e-01 0.0459 0.0494 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 2.36e-02 -0.277 0.122 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 7.81e-01 0.0301 0.108 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 8.34e-01 0.0233 0.111 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 3.38e-02 -0.26 0.122 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 3.07e-02 0.142 0.0651 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0703 0.127 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 2.21e-01 -0.157 0.128 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0665 0.103 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 4.42e-03 -0.312 0.108 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 1.85e-01 0.0839 0.063 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 6.25e-01 0.0621 0.127 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00173 0.13 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 6.24e-02 0.243 0.129 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0663 0.129 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 9.00e-01 0.00791 0.063 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 2.32e-01 -0.165 0.137 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0615 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 1.65e-02 -0.309 0.128 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0691 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 1.29e-01 0.109 0.0715 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 5.80e-01 0.0752 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0779 0.119 0.128 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 2.94e-01 -0.131 0.124 0.128 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 3.99e-01 -0.102 0.121 0.128 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 3.90e-02 0.123 0.0591 0.128 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 8.92e-01 -0.017 0.125 0.128 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 6.80e-01 0.0529 0.128 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0803 0.136 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 9.32e-02 -0.218 0.129 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 6.35e-02 0.134 0.072 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 6.29e-02 -0.194 0.104 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 8.09e-01 0.026 0.108 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0398 0.131 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 4.42e-01 0.04 0.0519 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 1.83e-02 -0.309 0.13 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 4.32e-01 0.105 0.133 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0911 0.133 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 6.41e-01 0.029 0.0622 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 3.42e-01 -0.106 0.112 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0777 0.116 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 4.24e-01 -0.101 0.126 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 3.32e-01 0.0662 0.0681 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 47560 sc-eQTL 8.12e-02 -0.225 0.128 0.141 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 2.54e-01 -0.123 0.108 0.141 PB L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 1.31e-01 -0.222 0.146 0.141 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 5.66e-01 0.076 0.132 0.141 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 2.87e-01 0.0798 0.0746 0.141 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 1.24e-01 0.215 0.139 0.141 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 317147 sc-eQTL 7.58e-01 0.0285 0.0924 0.141 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 6.82e-01 -0.046 0.112 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0627 0.126 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0715 0.12 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 7.43e-03 0.121 0.0448 0.13 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0376 0.118 0.13 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 3.15e-01 -0.122 0.121 0.13 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0217 0.125 0.13 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0055 0.102 0.13 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 1.20e-01 0.07 0.0449 0.13 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 4.35e-02 -0.257 0.126 0.13 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 3.84e-01 -0.1 0.115 0.117 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -285730 sc-eQTL 8.94e-01 0.0152 0.114 0.117 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 9.59e-01 0.00769 0.149 0.117 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -265020 sc-eQTL 5.29e-01 0.0847 0.134 0.117 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0364 0.131 0.117 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 8.46e-01 0.0126 0.0647 0.117 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 4.59e-01 0.0949 0.128 0.117 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -654093 sc-eQTL 8.97e-02 0.173 0.102 0.117 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 3.51e-01 0.0756 0.081 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -285730 sc-eQTL 2.26e-01 0.139 0.114 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 8.84e-01 0.0166 0.113 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -265020 sc-eQTL 4.38e-01 0.0897 0.116 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0158 0.0925 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 8.52e-01 -0.00962 0.0514 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 1.28e-02 0.245 0.0977 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 6.63e-01 0.0386 0.0884 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -285730 sc-eQTL 6.17e-02 0.206 0.11 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0689 0.12 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -265020 sc-eQTL 8.29e-01 0.026 0.12 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0367 0.0785 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 8.74e-01 -0.00898 0.0566 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 9.27e-01 0.00965 0.105 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0469 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0334 0.155 0.139 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0578 0.16 0.139 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 4.48e-01 0.0462 0.0608 0.139 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 3.76e-01 -0.14 0.157 0.139 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 2.54e-01 -0.137 0.12 0.127 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -285730 sc-eQTL 9.52e-01 0.00735 0.121 0.127 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 7.71e-01 0.0389 0.133 0.127 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -265020 sc-eQTL 9.79e-01 0.0032 0.12 0.127 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 4.05e-01 -0.101 0.122 0.127 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 5.81e-01 0.0293 0.053 0.127 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0395 0.129 0.127 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00365 0.0889 0.127 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -285730 sc-eQTL 8.30e-01 -0.027 0.125 0.127 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 2.75e-01 -0.139 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -265020 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0695 0.124 0.127 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0415 0.12 0.127 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 2.82e-01 0.0646 0.0599 0.127 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 1.53e-01 -0.152 0.106 0.127 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 2.54e-01 -0.116 0.101 0.127 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -285730 sc-eQTL 5.38e-01 0.063 0.102 0.127 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 9.29e-01 0.0127 0.143 0.127 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -265020 sc-eQTL 3.27e-01 -0.102 0.104 0.127 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 2.44e-01 0.144 0.123 0.127 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 5.38e-01 0.0525 0.0852 0.127 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 1.06e-01 -0.204 0.125 0.127 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -654093 sc-eQTL 9.47e-01 0.00802 0.121 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 47560 sc-eQTL 8.02e-01 0.0316 0.126 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0688 0.0712 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 4.38e-01 0.0849 0.109 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0211 0.113 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 9.98e-01 0.000122 0.0643 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0969 0.118 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 317147 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0438 0.114 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 47560 sc-eQTL 6.97e-01 0.0515 0.132 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 7.79e-01 0.0152 0.0542 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0644 0.102 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0059 0.105 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 8.28e-01 0.0139 0.0637 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0344 0.12 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 317147 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0114 0.0764 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 5.71e-01 0.0386 0.068 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -285730 sc-eQTL 1.13e-01 0.175 0.11 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0457 0.107 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -265020 sc-eQTL 5.64e-01 0.0668 0.116 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0385 0.0764 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 7.18e-01 -0.019 0.0524 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 1.31e-01 0.141 0.0928 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0632 0.0841 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -285730 sc-eQTL 5.19e-01 -0.08 0.124 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000666 0.121 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -265020 sc-eQTL 2.35e-01 -0.146 0.122 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0789 0.116 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 1.14e-01 0.0776 0.0488 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -364304 sc-eQTL 3.01e-01 -0.123 0.119 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -64163 sc-eQTL 1.67e-02 -0.233 0.0967 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 820793 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0196 0.0952 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -314424 sc-eQTL 3.92e-01 -0.106 0.124 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -365534 sc-eQTL 2.24e-01 0.0616 0.0505 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 47560 1.3e-05 1.53e-05 2.56e-06 8.64e-06 2.36e-06 6.2e-06 1.76e-05 2.45e-06 1.39e-05 6.68e-06 1.82e-05 7.07e-06 2.38e-05 5.28e-06 4.27e-06 8.62e-06 7.72e-06 1.13e-05 3.6e-06 3.49e-06 6.77e-06 1.28e-05 1.3e-05 4.06e-06 2.29e-05 4.58e-06 7.57e-06 5.79e-06 1.45e-05 1.2e-05 8.88e-06 1.06e-06 1.21e-06 3.7e-06 6.34e-06 2.9e-06 1.78e-06 2.15e-06 2.08e-06 1.42e-06 1.07e-06 1.74e-05 1.84e-06 2.09e-07 9.9e-07 2.34e-06 2.11e-06 7.25e-07 5.61e-07