logo

Genes within 1Mb (chr6:132444530:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 43055 sc-eQTL 1.05e-02 -0.258 0.1 0.256 B L1
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 4.73e-03 -0.107 0.0376 0.256 B L1
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0815 0.0763 0.256 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 3.97e-01 0.0612 0.072 0.256 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0222 0.0436 0.256 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 1.42e-01 -0.135 0.0913 0.256 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 312642 sc-eQTL 7.91e-01 0.016 0.0602 0.256 B L1
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 1.23e-01 -0.116 0.0747 0.256 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 4.09e-01 0.0493 0.0596 0.256 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 7.01e-02 0.118 0.0646 0.256 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 7.44e-01 0.0145 0.0442 0.256 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 1.96e-01 -0.116 0.0892 0.256 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0193 0.0743 0.256 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 8.00e-01 0.0186 0.0732 0.256 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 1.15e-01 0.137 0.0863 0.256 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0297 0.0296 0.256 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 3.25e-02 -0.191 0.0887 0.256 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 8.47e-01 0.0131 0.0677 0.255 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -290235 sc-eQTL 5.42e-01 0.0512 0.0838 0.255 DC L1
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 2.32e-01 0.118 0.0981 0.255 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -269525 sc-eQTL 3.87e-02 -0.186 0.0896 0.255 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0313 0.0969 0.255 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 8.70e-01 -0.00888 0.0543 0.255 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0202 0.086 0.255 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -658598 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0756 0.0781 0.255 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 5.96e-01 0.0265 0.0499 0.256 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -290235 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0275 0.0857 0.256 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 2.91e-02 0.177 0.0805 0.256 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -269525 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0182 0.0923 0.256 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 9.14e-01 0.00702 0.0651 0.256 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 9.93e-01 0.000331 0.039 0.256 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 9.66e-02 -0.128 0.0767 0.256 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0353 0.0781 0.258 NK L1
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 8.66e-01 0.0121 0.0715 0.258 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 7.32e-01 0.0333 0.0972 0.258 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0224 0.0402 0.258 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 3.27e-01 -0.075 0.0763 0.256 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 2.43e-01 0.111 0.0952 0.256 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0135 0.0925 0.256 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 4.79e-01 -0.026 0.0366 0.256 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 2.38e-01 -0.118 0.1 0.256 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 43055 sc-eQTL 6.09e-02 -0.194 0.103 0.247 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 3.83e-01 -0.085 0.097 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0618 0.108 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 6.56e-01 0.0462 0.103 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00775 0.0555 0.247 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 2.99e-01 0.101 0.0968 0.247 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 312642 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0625 0.0925 0.247 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 43055 sc-eQTL 5.70e-01 0.0544 0.0955 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0986 0.0622 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0603 0.0951 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 6.56e-01 0.0419 0.0942 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0416 0.0576 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 3.82e-01 -0.091 0.104 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 312642 sc-eQTL 3.45e-01 0.0834 0.0881 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 43055 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0449 0.0954 0.259 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0804 0.0747 0.259 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 2.70e-01 -0.107 0.0962 0.259 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 1.50e-01 0.141 0.0975 0.259 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00171 0.0472 0.259 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0789 0.0984 0.259 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 312642 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0778 0.0917 0.259 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 43055 sc-eQTL 1.06e-01 -0.171 0.105 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 1.03e-01 -0.0754 0.046 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0871 0.0828 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 8.80e-01 0.0136 0.09 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0608 0.0511 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 1.36e-01 -0.147 0.0983 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 312642 sc-eQTL 4.47e-01 0.0498 0.0654 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 43055 sc-eQTL 3.87e-02 -0.211 0.102 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 8.19e-05 -0.217 0.0539 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 2.84e-01 0.111 0.103 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 3.34e-01 0.0993 0.102 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 7.97e-01 -0.014 0.0544 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 3.79e-01 0.0913 0.104 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 312642 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00888 0.0719 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 2.02e-01 0.131 0.103 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 7.25e-01 0.0378 0.107 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 5.05e-01 0.0694 0.104 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 3.84e-01 0.0418 0.0479 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 5.51e-01 0.0577 0.0967 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 3.78e-02 -0.166 0.0794 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 3.79e-01 0.0603 0.0683 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 1.18e-02 0.186 0.0732 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 9.17e-01 0.00505 0.0482 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0164 0.0928 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 7.81e-01 0.0252 0.0904 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0803 0.0759 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 8.58e-01 0.0159 0.0892 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0247 0.0462 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0452 0.107 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0319 0.103 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 3.41e-01 0.0903 0.0945 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 9.12e-01 0.0109 0.0987 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0194 0.0405 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 1.50e-02 -0.243 0.0992 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0203 0.0856 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 7.23e-01 0.0311 0.0877 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 1.35e-01 0.145 0.0967 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0755 0.0518 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0217 0.101 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 8.06e-01 0.0255 0.104 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 7.83e-01 0.023 0.0833 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 2.69e-01 0.0987 0.0891 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0443 0.0511 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 5.36e-02 -0.197 0.102 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0248 0.103 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 5.26e-01 0.0656 0.103 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0992 0.102 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0205 0.0498 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 2.32e-01 -0.13 0.109 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0658 0.106 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 1.11e-01 -0.162 0.101 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00332 0.105 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 8.02e-02 -0.099 0.0563 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 7.45e-01 0.0349 0.107 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 1.75e-01 -0.132 0.0968 0.258 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 2.37e-01 0.12 0.101 0.258 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 1.98e-01 -0.127 0.0985 0.258 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 8.47e-01 -0.00937 0.0487 0.258 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0981 0.102 0.258 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 4.40e-02 -0.213 0.105 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 1.11e-02 -0.283 0.11 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 3.09e-01 -0.11 0.107 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0816 0.0597 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0391 0.083 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 9.15e-01 0.00909 0.0853 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00367 0.104 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0433 0.0411 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0404 0.105 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 4.59e-01 0.0784 0.106 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00532 0.106 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0523 0.0493 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 6.00e-01 -0.048 0.0914 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0135 0.0946 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 1.72e-01 0.14 0.102 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 7.20e-01 0.02 0.0558 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 43055 sc-eQTL 2.13e-01 -0.137 0.11 0.27 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 1.58e-01 0.13 0.0914 0.27 PB L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0483 0.125 0.27 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 2.41e-01 0.132 0.112 0.27 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 1.83e-01 0.085 0.0635 0.27 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 3.01e-01 -0.124 0.119 0.27 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 312642 sc-eQTL 2.74e-02 -0.172 0.0771 0.27 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 1.04e-01 0.148 0.0909 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0249 0.103 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 5.93e-01 0.0524 0.098 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 8.48e-01 -0.00713 0.0371 0.257 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0255 0.096 0.257 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 1.87e-01 -0.131 0.0987 0.256 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0366 0.102 0.256 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 1.77e-01 -0.112 0.083 0.256 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0014 0.0369 0.256 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 3.00e-01 -0.108 0.104 0.256 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 3.32e-01 0.084 0.0863 0.256 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -290235 sc-eQTL 3.15e-01 0.0863 0.0857 0.256 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 3.36e-02 0.236 0.11 0.256 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -269525 sc-eQTL 9.59e-02 -0.168 0.1 0.256 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 4.58e-01 0.073 0.0983 0.256 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0304 0.0486 0.256 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 6.94e-01 0.0379 0.0962 0.256 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -658598 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0685 0.0768 0.256 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 5.06e-01 0.0427 0.0641 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -290235 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0472 0.0906 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 5.07e-01 0.0595 0.0895 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -269525 sc-eQTL 5.42e-01 0.0559 0.0914 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 5.83e-01 0.0402 0.0731 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0189 0.0406 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 8.06e-02 -0.137 0.0778 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 3.96e-01 0.059 0.0694 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -290235 sc-eQTL 4.98e-01 0.0589 0.0868 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 6.92e-02 0.171 0.0935 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -269525 sc-eQTL 4.49e-01 0.0714 0.0942 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0161 0.0618 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 6.42e-01 0.0207 0.0445 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 1.82e-01 -0.11 0.082 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 2.80e-01 -0.123 0.113 0.261 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0151 0.122 0.261 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 1.66e-01 -0.175 0.125 0.261 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 6.92e-02 -0.0869 0.0475 0.261 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 2.98e-01 -0.129 0.124 0.261 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 4.54e-01 0.0713 0.095 0.258 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -290235 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0612 0.0959 0.258 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 4.04e-01 0.0881 0.105 0.258 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -269525 sc-eQTL 9.71e-01 0.0035 0.095 0.258 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0357 0.0965 0.258 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 9.82e-01 -0.000934 0.042 0.258 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 1.20e-01 -0.159 0.102 0.258 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0102 0.0696 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -290235 sc-eQTL 1.64e-01 0.137 0.0978 0.249 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 4.93e-01 0.0683 0.0994 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -269525 sc-eQTL 1.77e-01 -0.131 0.0971 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 9.15e-01 0.00999 0.0938 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 4.99e-01 0.0318 0.047 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 2.28e-01 0.1 0.0828 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0453 0.0798 0.251 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -290235 sc-eQTL 4.37e-01 0.0625 0.0803 0.251 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 4.33e-01 -0.088 0.112 0.251 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -269525 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00649 0.0819 0.251 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 9.56e-01 0.00538 0.0975 0.251 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0434 0.0671 0.251 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 4.69e-01 -0.072 0.0992 0.251 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -658598 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0737 0.0949 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 43055 sc-eQTL 1.18e-01 -0.157 0.0998 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 1.73e-02 -0.135 0.0561 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 9.19e-02 -0.146 0.0865 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 5.63e-02 0.171 0.0892 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0316 0.0512 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 6.65e-02 -0.172 0.0934 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 312642 sc-eQTL 9.07e-01 0.0106 0.0908 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 43055 sc-eQTL 5.51e-02 -0.204 0.106 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 2.13e-03 -0.133 0.0428 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0617 0.082 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 3.29e-01 0.083 0.0847 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0481 0.0513 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0689 0.0968 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 312642 sc-eQTL 4.71e-01 0.0443 0.0615 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 5.74e-01 0.0303 0.0538 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -290235 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0121 0.0878 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 7.03e-02 0.152 0.0837 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -269525 sc-eQTL 5.72e-01 0.0518 0.0915 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 9.69e-01 0.00236 0.0605 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 8.31e-01 -0.00886 0.0415 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 8.08e-02 -0.129 0.0733 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 9.07e-01 0.00776 0.0662 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -290235 sc-eQTL 5.72e-01 0.0551 0.0973 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 9.48e-02 0.158 0.0942 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -269525 sc-eQTL 1.41e-01 -0.142 0.0959 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 9.74e-01 0.00291 0.0909 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 9.93e-01 0.000333 0.0386 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 sc-eQTL 8.65e-01 -0.016 0.0937 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -68668 sc-eQTL 9.66e-01 0.00341 0.0792 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 816288 sc-eQTL 4.65e-01 0.0562 0.0768 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -318929 sc-eQTL 6.20e-01 0.0497 0.1 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -370039 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0309 0.0409 0.259 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -68668 pQTL 0.0142 -0.0655 0.0267 0.0 0.0 0.255
ENSG00000079950 STX7 -68668 eQTL 0.000196 -0.0688 0.0184 0.0 0.0 0.251
ENSG00000112299 VNN1 -269525 pQTL 1.34e-07 0.217 0.0409 0.00309 0.0 0.255
ENSG00000118523 CCN2 493158 pQTL 0.017 0.059 0.0247 0.0 0.0 0.255
ENSG00000146409 SLC18B1 -368809 eQTL 0.024 -0.0587 0.026 0.0 0.0 0.251

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -68668 5.64e-06 5.82e-06 4.93e-07 3.08e-06 9.11e-07 1.5e-06 4.25e-06 9.96e-07 4.76e-06 2.11e-06 5.78e-06 3.52e-06 7.67e-06 1.97e-06 1.39e-06 2.78e-06 1.84e-06 2.74e-06 1.41e-06 8.79e-07 2.63e-06 4.97e-06 3.67e-06 1.87e-06 9.11e-06 1.22e-06 2.49e-06 1.78e-06 4.23e-06 4.42e-06 2.85e-06 4.54e-07 6.65e-07 1.75e-06 2.13e-06 9.02e-07 8.89e-07 5.04e-07 1.34e-06 3.28e-07 2.87e-07 7.2e-06 3.83e-07 1.65e-07 3.42e-07 3.4e-07 7.28e-07 2.47e-07 1.74e-07