logo

Genes within 1Mb (chr6:132444504:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 43029 sc-eQTL 5.57e-01 0.0621 0.106 0.241 B L1
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 6.92e-04 0.134 0.0388 0.241 B L1
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 1.37e-03 0.252 0.0776 0.241 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 6.70e-01 -0.032 0.0749 0.241 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0423 0.0452 0.241 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 1.69e-01 -0.131 0.0949 0.241 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 312616 sc-eQTL 6.43e-01 -0.029 0.0626 0.241 B L1
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 6.03e-01 0.0401 0.0769 0.241 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 5.85e-01 0.0334 0.061 0.241 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0321 0.0666 0.241 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0425 0.0452 0.241 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 2.76e-01 0.0999 0.0914 0.241 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 9.48e-03 0.193 0.0739 0.241 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 1.97e-01 0.0954 0.0737 0.241 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 1.21e-01 -0.136 0.0872 0.241 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 2.84e-02 -0.0654 0.0296 0.241 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 4.87e-01 -0.063 0.0905 0.241 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0729 0.0695 0.245 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -290261 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0219 0.0864 0.245 DC L1
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 1.89e-01 -0.133 0.101 0.245 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -269551 sc-eQTL 3.96e-01 0.0793 0.0932 0.245 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0913 0.0996 0.245 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0346 0.0559 0.245 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 8.01e-01 0.0224 0.0886 0.245 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -658624 sc-eQTL 8.51e-01 0.0152 0.0806 0.245 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 7.79e-01 0.0146 0.0522 0.241 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -290261 sc-eQTL 3.83e-01 0.0782 0.0895 0.241 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 2.21e-01 -0.104 0.0848 0.241 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -269551 sc-eQTL 5.11e-01 0.0635 0.0963 0.241 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 6.13e-01 0.0345 0.068 0.241 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 9.71e-01 0.00147 0.0408 0.241 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 3.51e-02 -0.169 0.0798 0.241 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 1.58e-02 0.194 0.0795 0.242 NK L1
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 2.44e-01 0.0859 0.0735 0.242 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 8.98e-01 0.0128 0.1 0.242 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00295 0.0415 0.242 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 2.09e-01 0.0978 0.0777 0.241 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 2.59e-01 0.11 0.0971 0.241 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 2.53e-01 -0.108 0.094 0.241 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 4.92e-02 -0.0733 0.037 0.241 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 9.52e-01 0.0062 0.102 0.241 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 43029 sc-eQTL 2.17e-01 0.134 0.108 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 3.70e-01 0.0916 0.102 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 5.95e-02 -0.212 0.112 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0328 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 1.06e-01 -0.0939 0.0578 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0167 0.102 0.242 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 312616 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0142 0.0972 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 43029 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0928 0.0959 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 7.86e-03 0.166 0.0619 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 4.02e-02 0.196 0.0948 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 9.83e-01 0.00204 0.0948 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0121 0.058 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0278 0.105 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 312616 sc-eQTL 9.91e-01 0.000961 0.0889 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 43029 sc-eQTL 1.94e-01 -0.127 0.0975 0.244 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 6.31e-02 0.142 0.0762 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0521 0.0989 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 4.33e-01 0.0788 0.1 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0516 0.0483 0.244 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 2.08e-01 -0.127 0.101 0.244 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 312616 sc-eQTL 4.84e-01 0.0659 0.0941 0.244 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 43029 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0736 0.112 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 9.37e-03 0.127 0.0483 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 7.30e-03 0.234 0.0865 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 4.51e-02 -0.19 0.0945 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0494 0.0542 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 2.04e-01 -0.133 0.104 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 312616 sc-eQTL 7.83e-01 0.0191 0.0694 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 43029 sc-eQTL 7.09e-01 -0.039 0.105 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 3.35e-01 0.0549 0.0568 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 4.29e-01 0.0832 0.105 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 2.16e-02 0.239 0.103 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0353 0.0553 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0711 0.106 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 312616 sc-eQTL 7.76e-02 -0.129 0.0727 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0356 0.103 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 4.04e-01 0.0897 0.107 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 9.89e-01 0.00144 0.104 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0376 0.0482 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 4.79e-01 0.0689 0.0971 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 4.36e-01 0.0646 0.0827 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0308 0.0707 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 8.26e-01 0.0169 0.0768 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0545 0.0497 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 2.37e-01 0.113 0.0955 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 4.38e-01 0.0711 0.0915 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 4.65e-02 0.153 0.0763 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 8.87e-02 -0.153 0.0897 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0342 0.0468 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0708 0.108 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 5.95e-01 0.0562 0.106 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 9.10e-01 0.011 0.0973 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 1.51e-01 -0.146 0.101 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0645 0.0414 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 5.23e-01 0.0661 0.103 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 7.68e-03 0.229 0.0852 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 2.15e-01 0.11 0.0884 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 2.32e-01 -0.117 0.0981 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0124 0.0527 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0385 0.102 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00444 0.105 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 2.45e-01 0.0981 0.0842 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0862 0.0904 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0785 0.0516 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0511 0.104 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 8.13e-01 0.0243 0.103 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0373 0.103 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 6.31e-01 0.049 0.102 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 1.07e-02 -0.126 0.0488 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 3.20e-01 -0.108 0.109 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 3.39e-02 0.231 0.108 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 9.33e-01 0.00892 0.106 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 8.48e-01 0.0209 0.109 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0238 0.0586 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00143 0.111 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 1.69e-01 0.139 0.101 0.245 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 6.30e-01 -0.051 0.106 0.245 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 9.46e-01 0.00702 0.103 0.245 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 9.54e-04 -0.165 0.0493 0.245 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0873 0.106 0.245 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 9.61e-01 0.00518 0.105 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 1.20e-01 0.173 0.111 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0585 0.107 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0807 0.0594 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 6.06e-03 0.235 0.0847 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 8.97e-01 0.0114 0.0886 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 7.44e-01 0.0352 0.108 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0112 0.0428 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 6.15e-01 0.0515 0.102 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 1.87e-01 0.136 0.103 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 8.82e-01 0.0153 0.103 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0386 0.0481 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 3.19e-01 0.0923 0.0925 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 9.43e-01 0.00685 0.0959 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0751 0.104 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0427 0.0565 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 43029 sc-eQTL 9.63e-02 0.185 0.11 0.23 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0363 0.0931 0.23 PB L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000268 0.127 0.23 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 9.82e-01 0.0025 0.114 0.23 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 7.31e-01 0.0223 0.0646 0.23 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0213 0.121 0.23 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 312616 sc-eQTL 2.21e-02 0.181 0.0778 0.23 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 9.35e-01 0.00783 0.0952 0.237 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 1.88e-01 0.141 0.107 0.237 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00399 0.102 0.237 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0087 0.0386 0.237 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0797 0.0998 0.237 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 5.51e-01 0.0615 0.103 0.241 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0193 0.106 0.241 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 2.31e-01 0.104 0.0865 0.241 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 2.10e-02 -0.0881 0.0379 0.241 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 1.61e-01 0.152 0.108 0.241 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0886 0.0882 0.237 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -290261 sc-eQTL 7.53e-01 0.0276 0.0878 0.237 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 2.39e-03 -0.343 0.111 0.237 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -269551 sc-eQTL 9.02e-02 0.175 0.102 0.237 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 5.50e-02 -0.192 0.0996 0.237 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0712 0.0494 0.237 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 8.46e-01 0.0191 0.0984 0.237 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -658624 sc-eQTL 1.15e-01 -0.124 0.0781 0.237 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 7.63e-02 0.117 0.0657 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -290261 sc-eQTL 7.47e-01 0.0303 0.0935 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0798 0.0923 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -269551 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0563 0.0943 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0557 0.0754 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 8.02e-01 0.0105 0.0419 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 3.33e-02 -0.171 0.08 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0205 0.0723 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -290261 sc-eQTL 5.57e-01 0.0531 0.0902 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 4.73e-01 0.0705 0.0979 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -269551 sc-eQTL 9.26e-01 0.00908 0.0981 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 3.34e-01 0.0621 0.0641 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 5.74e-01 0.026 0.0462 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 1.88e-01 -0.113 0.0852 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0742 0.118 0.258 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 4.15e-01 0.103 0.127 0.258 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 1.78e-01 -0.176 0.13 0.258 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0494 0.0496 0.258 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 2.46e-01 0.149 0.128 0.258 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 8.67e-01 0.0169 0.1 0.242 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -290261 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0345 0.101 0.242 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0483 0.111 0.242 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -269551 sc-eQTL 4.35e-02 -0.202 0.0992 0.242 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0541 0.102 0.242 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0361 0.0442 0.242 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 5.30e-01 0.0678 0.108 0.242 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 1.41e-01 -0.108 0.0731 0.242 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -290261 sc-eQTL 4.39e-01 0.0804 0.104 0.242 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 7.30e-02 -0.188 0.104 0.242 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -269551 sc-eQTL 9.58e-01 0.0054 0.103 0.242 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 5.01e-01 0.0667 0.0989 0.242 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 2.25e-02 -0.113 0.049 0.242 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00198 0.0878 0.242 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0273 0.0848 0.249 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -290261 sc-eQTL 9.26e-02 -0.143 0.0846 0.249 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 9.23e-01 0.0115 0.119 0.249 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -269551 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0146 0.0869 0.249 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 6.01e-01 0.0541 0.103 0.249 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0377 0.0712 0.249 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 8.22e-01 0.0238 0.105 0.249 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -658624 sc-eQTL 1.54e-01 0.144 0.1 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 43029 sc-eQTL 8.26e-01 0.0227 0.103 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 1.03e-02 0.149 0.0576 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 5.04e-01 0.0599 0.0895 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0674 0.0925 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 6.91e-01 -0.021 0.0527 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0685 0.0967 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 312616 sc-eQTL 8.64e-01 -0.016 0.0934 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 43029 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0773 0.111 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 1.17e-02 0.114 0.0449 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 1.33e-03 0.272 0.0836 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0202 0.0886 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0313 0.0536 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 1.97e-01 -0.13 0.101 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 312616 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0538 0.0641 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 1.64e-01 0.0774 0.0554 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -290261 sc-eQTL 5.59e-01 0.0531 0.0907 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0303 0.0872 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -269551 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00463 0.0947 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 9.36e-01 0.00506 0.0626 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 4.70e-01 0.0311 0.0429 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 1.66e-02 -0.182 0.0754 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0873 0.0683 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -290261 sc-eQTL 7.53e-01 0.0318 0.101 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 3.22e-02 -0.209 0.0971 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -269551 sc-eQTL 7.99e-01 0.0255 0.0999 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 3.47e-01 0.0886 0.094 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 4.02e-02 -0.0817 0.0396 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -368835 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0247 0.097 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -68694 sc-eQTL 1.91e-02 0.189 0.0799 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 816262 sc-eQTL 4.56e-01 0.0587 0.0785 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -318955 sc-eQTL 9.81e-01 0.00245 0.102 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -370065 sc-eQTL 8.02e-01 0.0105 0.0418 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 43029 eQTL 0.0131 0.0847 0.0341 0.0 0.0 0.231
ENSG00000079950 STX7 -68694 pQTL 9.39e-08 0.139 0.026 0.0 0.0 0.23
ENSG00000079950 STX7 -68694 eQTL 5.45e-10 0.111 0.0177 0.0 0.0 0.231
ENSG00000093134 VNN3 -290261 eQTL 0.0414 -0.0338 0.0165 0.0 0.0 0.231
ENSG00000112299 VNN1 -269551 pQTL 0.00147 -0.129 0.0404 0.0 0.0 0.23

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -68694 8.9e-06 9.98e-06 1.35e-06 6.07e-06 2.04e-06 3.9e-06 9.57e-06 1.86e-06 8.59e-06 4.75e-06 1.05e-05 4.93e-06 1.17e-05 3.77e-06 2.37e-06 6.44e-06 3.84e-06 6.33e-06 2.55e-06 2.77e-06 4.52e-06 8e-06 6.98e-06 2.42e-06 1.29e-05 2.91e-06 4.68e-06 3.69e-06 8.33e-06 7.94e-06 4.95e-06 7.64e-07 1.26e-06 2.89e-06 3.58e-06 2.15e-06 1.57e-06 1.45e-06 1.57e-06 1.02e-06 6.91e-07 1.25e-05 1.38e-06 1.59e-07 7.7e-07 1.72e-06 1.26e-06 6.96e-07 4.74e-07