logo

Genes within 1Mb (chr6:132390047:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -11428 sc-eQTL 6.63e-03 -0.458 0.167 0.075 B L1
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0831 0.0638 0.075 B L1
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 4.79e-01 0.0906 0.128 0.075 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 5.61e-01 0.0701 0.12 0.075 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0609 0.0727 0.075 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0105 0.153 0.075 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 258159 sc-eQTL 9.07e-01 0.0118 0.101 0.075 B L1
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 6.39e-03 -0.334 0.121 0.075 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 4.19e-02 0.198 0.0969 0.075 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 2.03e-01 0.136 0.106 0.075 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 7.35e-01 0.0246 0.0726 0.075 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0681 0.147 0.075 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0546 0.121 0.075 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 2.15e-01 0.148 0.119 0.075 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 4.11e-01 0.116 0.141 0.075 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 1.48e-01 0.0699 0.0481 0.075 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 9.13e-01 0.0159 0.146 0.075 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0402 0.113 0.072 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -344718 sc-eQTL 3.44e-01 0.133 0.14 0.072 DC L1
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 6.07e-01 0.0849 0.165 0.072 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -324008 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0524 0.152 0.072 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 5.32e-01 -0.102 0.162 0.072 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0996 0.0908 0.072 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0307 0.144 0.072 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -713081 sc-eQTL 1.62e-01 -0.183 0.131 0.072 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0366 0.0829 0.075 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -344718 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00724 0.142 0.075 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 7.20e-02 0.243 0.134 0.075 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -324008 sc-eQTL 1.43e-01 -0.224 0.152 0.075 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 6.21e-01 0.0535 0.108 0.075 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 8.91e-01 0.00891 0.0648 0.075 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0796 0.128 0.075 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 3.00e-03 -0.37 0.123 0.073 NK L1
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0715 0.115 0.073 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 7.92e-02 -0.274 0.155 0.073 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0193 0.0647 0.073 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0916 0.127 0.075 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00238 0.158 0.075 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 2.36e-02 0.346 0.152 0.075 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 3.52e-01 0.0566 0.0607 0.075 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 3.47e-01 0.157 0.166 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -11428 sc-eQTL 2.45e-01 -0.201 0.172 0.071 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 1.16e-01 -0.254 0.161 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 7.17e-01 0.0654 0.18 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 4.60e-01 0.128 0.172 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0636 0.0924 0.071 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 1.60e-02 0.388 0.159 0.071 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 258159 sc-eQTL 6.72e-02 -0.282 0.153 0.071 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -11428 sc-eQTL 4.34e-02 -0.318 0.156 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 2.65e-01 -0.115 0.103 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0562 0.157 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 5.22e-01 0.0999 0.156 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0303 0.0953 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 2.15e-01 -0.213 0.171 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 258159 sc-eQTL 6.02e-01 0.0763 0.146 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -11428 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0296 0.158 0.075 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 3.27e-01 -0.121 0.124 0.075 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0242 0.16 0.075 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 9.33e-02 -0.271 0.161 0.075 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 7.94e-01 0.0204 0.0781 0.075 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 7.05e-02 -0.294 0.162 0.075 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 258159 sc-eQTL 1.95e-01 -0.197 0.151 0.075 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -11428 sc-eQTL 3.82e-02 -0.37 0.177 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0226 0.0783 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0642 0.14 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 2.88e-01 0.162 0.152 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00683 0.0866 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0296 0.167 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 258159 sc-eQTL 1.16e-01 0.174 0.11 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -11428 sc-eQTL 1.76e-01 -0.233 0.171 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0595 0.0937 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 3.83e-03 0.497 0.17 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 5.96e-01 0.0913 0.172 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 6.06e-01 0.0471 0.0911 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 5.62e-01 0.101 0.174 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 258159 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0107 0.121 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 3.55e-01 0.157 0.169 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 2.71e-02 0.387 0.174 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0121 0.171 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 9.13e-01 0.00866 0.0789 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 3.03e-01 0.164 0.159 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 4.31e-04 -0.461 0.129 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 9.57e-02 0.188 0.113 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 6.79e-01 0.051 0.123 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 7.32e-01 0.0273 0.0797 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0356 0.153 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0603 0.146 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0608 0.122 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 1.93e-01 0.187 0.143 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 2.56e-01 0.0844 0.0742 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 4.00e-01 0.145 0.172 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 5.95e-01 0.0893 0.168 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 7.65e-01 0.0464 0.155 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 7.65e-01 0.0482 0.161 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 2.62e-01 0.0741 0.0659 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 1.25e-01 -0.251 0.163 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 2.21e-01 0.171 0.139 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0245 0.143 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 2.73e-01 0.174 0.158 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 7.29e-02 0.152 0.0844 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 2.66e-01 0.183 0.164 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 1.14e-01 -0.268 0.168 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 1.28e-02 0.337 0.134 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0172 0.146 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 3.30e-01 0.0816 0.0835 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 4.10e-01 -0.138 0.168 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 4.59e-01 0.127 0.172 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 6.02e-01 -0.09 0.172 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 7.59e-02 -0.302 0.169 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 4.77e-01 0.0591 0.0831 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 9.96e-01 0.000889 0.182 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 1.92e-01 -0.233 0.178 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 5.45e-01 0.104 0.172 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 3.85e-01 0.155 0.178 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 4.92e-01 0.0658 0.0957 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0118 0.181 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 4.60e-01 -0.119 0.161 0.076 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 4.62e-01 0.124 0.168 0.076 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 4.17e-02 0.332 0.162 0.076 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 7.16e-01 0.0293 0.0804 0.076 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 1.04e-01 0.274 0.168 0.076 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 3.70e-01 -0.151 0.168 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 4.73e-01 0.128 0.178 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0361 0.171 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 9.74e-01 0.00307 0.0955 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 3.12e-03 -0.392 0.131 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 2.81e-01 -0.148 0.137 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 4.43e-02 -0.335 0.166 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0207 0.0663 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 2.48e-01 -0.194 0.167 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 6.80e-01 0.0699 0.169 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 3.42e-01 -0.162 0.169 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0233 0.0791 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 2.90e-01 -0.157 0.148 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 9.47e-01 0.0102 0.153 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 4.78e-01 -0.119 0.167 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000999 0.0905 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -11428 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0402 0.169 0.096 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 9.97e-01 0.000551 0.141 0.096 PB L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 5.65e-01 0.111 0.192 0.096 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 3.75e-01 0.153 0.172 0.096 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0888 0.0978 0.096 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 7.25e-01 0.0648 0.184 0.096 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 258159 sc-eQTL 4.09e-01 0.1 0.121 0.096 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 4.89e-01 -0.104 0.15 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 1.92e-01 -0.221 0.169 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 9.36e-01 0.0131 0.162 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0395 0.0611 0.076 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 8.25e-01 -0.035 0.158 0.076 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 1.28e-01 -0.244 0.16 0.075 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 2.03e-01 0.21 0.164 0.075 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0624 0.135 0.075 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 4.55e-01 0.0447 0.0597 0.075 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0966 0.169 0.075 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0967 0.145 0.071 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -344718 sc-eQTL 2.03e-01 0.183 0.144 0.071 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 6.18e-02 0.349 0.186 0.071 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -324008 sc-eQTL 3.48e-01 -0.159 0.169 0.071 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 8.07e-01 0.0405 0.165 0.071 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0825 0.0814 0.071 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 3.86e-01 0.14 0.161 0.071 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -713081 sc-eQTL 8.65e-01 0.022 0.129 0.071 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0449 0.106 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -344718 sc-eQTL 9.78e-01 0.00414 0.15 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 3.08e-01 0.151 0.148 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -324008 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0913 0.151 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 3.43e-01 0.115 0.121 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 9.11e-01 0.00753 0.0673 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0557 0.13 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0793 0.115 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -344718 sc-eQTL 8.70e-01 0.0237 0.144 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 4.32e-01 0.123 0.156 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -324008 sc-eQTL 8.10e-02 -0.272 0.155 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0174 0.103 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 3.99e-01 0.0623 0.0737 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 7.45e-01 0.0445 0.137 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0764 0.191 0.07 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 3.08e-01 0.209 0.204 0.07 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 1.17e-02 0.528 0.206 0.07 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 7.86e-01 0.0219 0.0804 0.07 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0884 0.208 0.07 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 6.66e-01 0.0696 0.161 0.073 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -344718 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00433 0.163 0.073 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 7.14e-01 0.0657 0.179 0.073 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -324008 sc-eQTL 3.05e-01 -0.165 0.161 0.073 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 8.98e-01 0.0211 0.164 0.073 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 8.45e-01 -0.014 0.0712 0.073 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 7.89e-01 0.0463 0.173 0.073 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0236 0.12 0.072 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -344718 sc-eQTL 5.25e-01 0.108 0.169 0.072 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0133 0.171 0.072 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -324008 sc-eQTL 4.46e-02 -0.336 0.166 0.072 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 7.15e-01 0.059 0.161 0.072 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0384 0.0808 0.072 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 6.79e-01 0.0591 0.143 0.072 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 4.32e-01 0.124 0.158 0.056 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -344718 sc-eQTL 3.97e-01 0.135 0.159 0.056 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 1.15e-01 -0.349 0.22 0.056 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -324008 sc-eQTL 7.17e-01 0.0588 0.162 0.056 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 1.04e-01 -0.312 0.191 0.056 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0723 0.133 0.056 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 2.49e-01 -0.226 0.196 0.056 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -713081 sc-eQTL 1.70e-01 -0.258 0.187 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -11428 sc-eQTL 4.52e-02 -0.334 0.166 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 9.01e-02 -0.16 0.0942 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 2.09e-01 -0.182 0.145 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 9.65e-01 0.00666 0.15 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0152 0.0854 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 1.59e-01 -0.221 0.156 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 258159 sc-eQTL 3.18e-01 -0.151 0.151 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -11428 sc-eQTL 6.27e-02 -0.332 0.177 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0525 0.0733 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 2.59e-01 0.155 0.137 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 4.06e-01 0.118 0.142 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 9.04e-01 0.0104 0.0862 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 9.46e-01 -0.011 0.163 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 258159 sc-eQTL 5.56e-01 0.0608 0.103 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0553 0.0889 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -344718 sc-eQTL 9.35e-01 0.0118 0.145 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 1.06e-01 0.225 0.139 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -324008 sc-eQTL 3.43e-01 -0.143 0.151 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 6.23e-01 0.0492 0.1 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 8.48e-01 0.0132 0.0686 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0425 0.122 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 4.90e-01 0.0766 0.111 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -344718 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0128 0.163 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 3.23e-01 0.157 0.159 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -324008 sc-eQTL 6.84e-02 -0.294 0.16 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 7.58e-01 0.0471 0.153 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 9.16e-01 0.00684 0.0647 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -423292 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00349 0.157 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -123151 sc-eQTL 7.15e-03 -0.337 0.124 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 761805 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0952 0.123 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -373412 sc-eQTL 7.65e-02 -0.283 0.159 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -424522 sc-eQTL 5.60e-01 -0.038 0.0652 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 -11428 eQTL 9.39e-05 -0.229 0.0584 0.0 0.0 0.0628
ENSG00000079950 STX7 -123151 pQTL 0.00136 -0.145 0.0451 0.0 0.0 0.0643
ENSG00000112282 MED23 761805 eQTL 0.0186 0.0766 0.0325 0.0 0.0 0.0628
ENSG00000112299 VNN1 -324008 pQTL 0.0132 0.173 0.0698 0.0 0.0 0.0643
ENSG00000112299 VNN1 -324008 eQTL 0.000239 0.156 0.0422 0.0 0.0 0.0628
ENSG00000118520 ARG1 816903 eQTL 0.037 0.0751 0.0359 0.0 0.0 0.0628
ENSG00000118523 CCN2 438675 pQTL 0.0398 0.0861 0.0418 0.0 0.0 0.0643
ENSG00000234484 AL032821.1 -362628 eQTL 0.021 0.14 0.0607 0.0 0.0 0.0628

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 -11428 2.78e-05 2.87e-05 4.47e-06 1.41e-05 4.07e-06 1.19e-05 3.63e-05 3.76e-06 2.27e-05 1.19e-05 3.13e-05 1.33e-05 4.12e-05 1.2e-05 6.24e-06 1.43e-05 1.34e-05 2.02e-05 6.52e-06 5.45e-06 1.13e-05 2.55e-05 2.61e-05 7.43e-06 3.56e-05 6.05e-06 1.06e-05 1.04e-05 2.67e-05 2.1e-05 1.53e-05 1.58e-06 2.24e-06 6.27e-06 9.4e-06 4.56e-06 2.34e-06 2.9e-06 3.63e-06 2.88e-06 1.59e-06 3.36e-05 2.92e-06 1.95e-07 1.98e-06 3.34e-06 3.77e-06 1.47e-06 1.32e-06
ENSG00000112282 MED23 761805 2.69e-07 1.3e-07 3.54e-08 1.86e-07 8.92e-08 9.61e-08 1.42e-07 5.33e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.6e-07 9e-08 1.41e-07 6.76e-08 5.99e-08 7.3e-08 3.94e-08 1.18e-07 5.36e-08 4.45e-08 1.04e-07 1.23e-07 1.34e-07 3.68e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.57e-08 1.03e-07 1.02e-07 9.91e-08 3.87e-08 3.3e-08 8.44e-08 8.38e-08 3.94e-08 5.59e-08 9.68e-08 7.23e-08 3.76e-08 4.69e-08 1.35e-07 5.21e-08 7.51e-09 5.87e-08 1.83e-08 1.24e-07 3.8e-09 4.73e-08
ENSG00000112299 VNN1 -324008 1.17e-06 8.97e-07 1.05e-07 4.01e-07 9.45e-08 2.63e-07 5.76e-07 1.31e-07 5.74e-07 2.62e-07 9.92e-07 5.51e-07 9.97e-07 2.1e-07 2.81e-07 3.57e-07 5.56e-07 4.11e-07 2.17e-07 1.86e-07 1.92e-07 4.66e-07 3.99e-07 2.19e-07 1.38e-06 2.64e-07 4.27e-07 3.9e-07 3.56e-07 7.79e-07 3.56e-07 5.82e-08 5.71e-08 2.04e-07 3.63e-07 1.8e-07 2.04e-07 6.97e-08 5.67e-08 1.63e-08 1.35e-07 7.45e-07 6.17e-08 5.74e-09 1.16e-07 3.87e-08 1.21e-07 7.28e-08 5.71e-08
ENSG00000234484 AL032821.1 -362628 8.48e-07 6.76e-07 8.02e-08 4.31e-07 1.05e-07 1.77e-07 4.53e-07 8.37e-08 3.66e-07 2.12e-07 6.39e-07 4.62e-07 7.53e-07 1.59e-07 1.68e-07 2.36e-07 3.35e-07 3.56e-07 1.56e-07 1.32e-07 1.57e-07 3.34e-07 3.45e-07 1.25e-07 8.99e-07 2.54e-07 2.62e-07 2.63e-07 2.19e-07 5.99e-07 2.55e-07 5.99e-08 5.42e-08 1.52e-07 3.36e-07 1.09e-07 1.22e-07 5.36e-08 5.77e-08 2.68e-08 1.02e-07 6.15e-07 5.09e-08 1.06e-08 8.43e-08 1.31e-08 8.75e-08 2.44e-08 4.52e-08