logo

Genes within 1Mb (chr6:132387888:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -13587 sc-eQTL 4.75e-01 0.0801 0.112 0.194 B L1
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 2.46e-01 -0.049 0.0421 0.194 B L1
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0207 0.0842 0.194 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0336 0.0794 0.194 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 7.51e-01 0.0152 0.048 0.194 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 1.46e-01 0.147 0.101 0.194 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 256000 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0139 0.0663 0.194 B L1
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 1.28e-01 -0.124 0.0811 0.194 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0738 0.0645 0.194 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 7.13e-01 0.026 0.0706 0.194 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 5.97e-02 0.0902 0.0476 0.194 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 3.74e-01 0.0864 0.097 0.194 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 3.25e-02 -0.17 0.0788 0.194 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0919 0.0782 0.194 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 5.64e-01 0.0537 0.093 0.194 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 1.84e-01 0.0422 0.0317 0.194 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0267 0.0961 0.194 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 5.46e-01 0.0446 0.0739 0.191 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -346877 sc-eQTL 2.75e-01 0.1 0.0914 0.191 DC L1
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 1.76e-01 -0.145 0.107 0.191 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -326167 sc-eQTL 5.89e-01 0.0535 0.0989 0.191 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 3.30e-01 -0.103 0.106 0.191 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0418 0.0593 0.191 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 2.86e-01 -0.1 0.0937 0.191 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -715240 sc-eQTL 7.26e-01 0.03 0.0855 0.191 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 5.43e-01 0.0341 0.0561 0.194 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -346877 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000721 0.0963 0.194 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 6.09e-01 0.0468 0.0915 0.194 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -326167 sc-eQTL 8.55e-01 0.0189 0.104 0.194 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0704 0.073 0.194 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 2.14e-01 0.0544 0.0437 0.194 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0108 0.0867 0.194 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 8.86e-01 0.0119 0.0824 0.193 NK L1
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0684 0.0752 0.193 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 1.64e-01 0.143 0.102 0.193 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 7.58e-02 0.0751 0.0421 0.193 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0821 0.0826 0.194 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0408 0.103 0.194 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 9.16e-01 0.0106 0.1 0.194 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 3.31e-01 0.0386 0.0396 0.194 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 3.16e-01 0.109 0.108 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -13587 sc-eQTL 3.71e-01 -0.104 0.116 0.171 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 9.24e-01 0.0104 0.109 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 9.60e-01 0.00608 0.121 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0687 0.116 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 5.57e-01 0.0366 0.0622 0.171 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 2.74e-01 -0.119 0.109 0.171 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 256000 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00197 0.104 0.171 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -13587 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0484 0.105 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 1.62e-02 -0.165 0.068 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0424 0.105 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 4.84e-02 -0.204 0.103 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 7.44e-01 0.0208 0.0635 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 7.92e-01 0.0302 0.114 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 256000 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00239 0.0973 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -13587 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0839 0.106 0.19 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0789 0.0834 0.19 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 7.41e-01 0.0357 0.108 0.19 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 8.39e-01 0.0222 0.109 0.19 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 3.70e-01 0.0472 0.0526 0.19 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 5.13e-01 -0.072 0.11 0.19 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 256000 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0497 0.102 0.19 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -13587 sc-eQTL 6.23e-01 0.0569 0.116 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 2.67e-01 -0.056 0.0504 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0101 0.0905 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 1.07e-01 0.158 0.0975 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 8.33e-01 0.0118 0.0559 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 3.35e-01 0.104 0.108 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 256000 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0267 0.0714 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -13587 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0377 0.111 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0198 0.0602 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0968 0.111 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 2.31e-01 -0.133 0.11 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 6.80e-01 0.0242 0.0585 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 3.22e-02 0.238 0.111 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 256000 sc-eQTL 1.27e-01 -0.118 0.077 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 3.60e-01 -0.1 0.109 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0758 0.114 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 1.84e-01 -0.147 0.11 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 7.25e-01 0.018 0.0511 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 5.53e-01 0.0611 0.103 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0441 0.0877 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 6.55e-01 0.0335 0.0749 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 3.78e-01 0.0717 0.0812 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 1.04e-01 0.0856 0.0524 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00603 0.102 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 2.44e-02 -0.217 0.0957 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 2.83e-03 -0.241 0.0797 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 6.37e-01 0.045 0.0954 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 7.56e-02 0.0877 0.0491 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 3.43e-01 0.109 0.114 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 2.43e-01 -0.131 0.112 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0385 0.104 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 1.09e-01 0.173 0.107 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 1.80e-01 0.0594 0.0441 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0442 0.11 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 4.78e-02 -0.184 0.0924 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 2.76e-01 -0.104 0.0953 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 5.14e-01 0.0692 0.106 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 7.41e-01 0.0188 0.0567 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0023 0.11 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 3.57e-01 -0.102 0.11 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0513 0.0887 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 5.27e-01 0.0603 0.0951 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 7.97e-02 0.0953 0.0541 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 5.41e-01 0.067 0.109 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 6.41e-01 0.0518 0.111 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 3.29e-02 0.236 0.11 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 1.60e-01 0.154 0.109 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 2.38e-01 0.0632 0.0534 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 4.46e-01 0.0897 0.117 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 3.91e-01 -0.101 0.118 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0637 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 6.64e-01 0.0511 0.117 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 6.17e-01 0.0316 0.0631 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0051 0.119 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0819 0.106 0.193 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 7.56e-01 0.0345 0.111 0.193 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 7.48e-01 0.0347 0.108 0.193 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 4.57e-01 0.0395 0.0529 0.193 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00655 0.111 0.193 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 4.70e-01 0.0806 0.111 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0604 0.118 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 4.57e-01 0.0844 0.113 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 1.86e-01 0.0834 0.0628 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0162 0.0873 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 8.72e-01 0.0144 0.0898 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 2.35e-01 0.13 0.109 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 1.40e-01 0.0639 0.0431 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0443 0.11 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 7.42e-02 -0.199 0.111 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 7.68e-01 -0.033 0.112 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 3.48e-01 0.0489 0.0519 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 5.34e-01 0.06 0.0963 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0622 0.0996 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 3.57e-01 0.0999 0.108 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 7.39e-01 0.0196 0.0588 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -13587 sc-eQTL 2.96e-01 -0.126 0.12 0.196 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 7.43e-01 0.033 0.1 0.196 PB L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 8.53e-01 0.0253 0.136 0.196 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 5.68e-01 0.0701 0.122 0.196 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 1.90e-01 0.0912 0.0691 0.196 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 8.98e-02 -0.22 0.129 0.196 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 256000 sc-eQTL 7.80e-01 0.0241 0.0857 0.196 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 5.09e-01 0.0656 0.0992 0.196 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 4.20e-01 0.0901 0.112 0.196 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 3.78e-01 0.0939 0.106 0.196 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 2.90e-01 0.0426 0.0402 0.196 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 2.88e-01 0.111 0.104 0.196 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0111 0.11 0.194 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0302 0.113 0.194 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0944 0.0925 0.194 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 1.16e-01 0.0643 0.0408 0.194 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 5.67e-04 0.394 0.113 0.194 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0666 0.0946 0.188 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -346877 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0314 0.0941 0.188 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 3.69e-01 -0.11 0.122 0.188 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -326167 sc-eQTL 7.04e-01 0.0421 0.111 0.188 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 2.55e-01 -0.123 0.107 0.188 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00712 0.0532 0.188 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0841 0.105 0.188 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -715240 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0141 0.0842 0.188 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 2.12e-01 0.0886 0.0708 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -346877 sc-eQTL 8.83e-01 0.0148 0.1 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 2.67e-01 0.11 0.099 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -326167 sc-eQTL 1.71e-01 0.139 0.101 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0147 0.081 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 6.59e-02 0.0825 0.0447 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0209 0.0868 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 4.36e-01 0.0606 0.0777 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -346877 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000292 0.0971 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 2.38e-01 -0.124 0.105 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -326167 sc-eQTL 9.20e-01 0.0107 0.105 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0295 0.069 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 4.04e-01 0.0415 0.0497 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0287 0.092 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 2.37e-01 0.148 0.124 0.185 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0334 0.134 0.185 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 5.59e-01 0.0808 0.138 0.185 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 9.82e-01 0.00117 0.0526 0.185 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 3.75e-01 0.121 0.136 0.185 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 6.94e-01 0.0409 0.104 0.191 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -346877 sc-eQTL 2.46e-01 0.122 0.105 0.191 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0137 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -326167 sc-eQTL 2.93e-01 0.109 0.103 0.191 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0383 0.105 0.191 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 2.47e-02 0.103 0.0453 0.191 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 2.93e-01 -0.117 0.111 0.191 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 8.82e-01 0.0116 0.0784 0.19 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -346877 sc-eQTL 8.66e-01 0.0187 0.111 0.19 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 2.99e-01 -0.116 0.112 0.19 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -326167 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0152 0.11 0.19 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 9.69e-01 0.00412 0.106 0.19 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00127 0.0529 0.19 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 2.24e-01 0.114 0.0932 0.19 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 8.62e-01 0.0159 0.0911 0.201 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -346877 sc-eQTL 1.59e-01 0.129 0.0911 0.201 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0516 0.128 0.201 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -326167 sc-eQTL 1.99e-01 0.12 0.0928 0.201 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 9.48e-01 0.00731 0.111 0.201 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 9.45e-01 0.00529 0.0765 0.201 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0954 0.113 0.201 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -715240 sc-eQTL 4.65e-01 0.0793 0.108 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -13587 sc-eQTL 8.96e-01 0.0143 0.109 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 1.02e-01 -0.101 0.0616 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000305 0.0949 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 1.88e-01 -0.129 0.0977 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 2.10e-01 0.07 0.0557 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0334 0.103 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 256000 sc-eQTL 6.26e-01 0.0482 0.0989 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -13587 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0161 0.116 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0161 0.0478 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0754 0.0896 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 4.86e-01 0.0648 0.0927 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 7.67e-01 0.0167 0.0562 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 5.02e-02 0.207 0.105 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 256000 sc-eQTL 3.05e-01 -0.069 0.0671 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 3.67e-01 0.0548 0.0606 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -346877 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0198 0.0989 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 6.02e-01 0.0496 0.095 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -326167 sc-eQTL 6.81e-01 0.0425 0.103 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0732 0.068 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 2.04e-01 0.0594 0.0466 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0396 0.0832 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 5.15e-01 0.0477 0.0732 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -346877 sc-eQTL 2.52e-01 0.124 0.107 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0469 0.105 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -326167 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0186 0.107 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0645 0.101 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 1.75e-01 0.0579 0.0426 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -425451 sc-eQTL 7.94e-01 0.0271 0.104 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -125310 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0153 0.0828 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 759646 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0346 0.0803 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -375571 sc-eQTL 2.17e-01 0.129 0.104 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -426681 sc-eQTL 3.95e-02 0.0877 0.0423 0.194 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -125310 pQTL 0.0318 -0.0636 0.0296 0.0 0.0 0.176
ENSG00000093134 VNN3 -346877 eQTL 0.0166 -0.0448 0.0187 0.0 0.0 0.175
ENSG00000112299 VNN1 -326167 pQTL 0.00336 0.134 0.0457 0.0 0.0 0.176
ENSG00000112299 VNN1 -326167 eQTL 0.0295 0.0606 0.0278 0.0 0.0 0.175
ENSG00000112303 VNN2 -375571 eQTL 0.0224 -0.0379 0.0166 0.0 0.0 0.175

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112306 \N -426681 1.01e-06 7.56e-07 1.45e-07 4.1e-07 9.6e-08 3.15e-07 6.19e-07 2.04e-07 6.62e-07 2.98e-07 1.02e-06 4.43e-07 1.05e-06 1.57e-07 3.1e-07 3.36e-07 5.41e-07 4.39e-07 2.79e-07 2.63e-07 2.55e-07 5.11e-07 3.99e-07 2.39e-07 1.2e-06 2.44e-07 4.37e-07 4.06e-07 5.16e-07 7.39e-07 3.79e-07 4.25e-08 8.37e-08 2.08e-07 3.35e-07 1.83e-07 1.97e-07 1.41e-07 8.43e-08 8.59e-09 1.79e-07 7.7e-07 5.09e-08 1.29e-08 1.93e-07 4.23e-08 1.28e-07 3.84e-08 6.14e-08