logo

Genes within 1Mb (chr6:132372087:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -29388 sc-eQTL 1.33e-01 0.158 0.104 0.22 B L1
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0188 0.0396 0.22 B L1
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0839 0.0787 0.22 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 3.47e-01 -0.07 0.0743 0.22 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 3.87e-01 0.0389 0.0449 0.22 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 2.45e-01 0.11 0.0944 0.22 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 240199 sc-eQTL 3.60e-01 0.0569 0.062 0.22 B L1
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0508 0.0763 0.22 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0701 0.0605 0.22 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 4.74e-01 0.0474 0.0661 0.22 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 9.41e-02 0.0752 0.0447 0.22 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 5.27e-02 0.176 0.0902 0.22 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0889 0.0743 0.22 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 4.91e-02 -0.144 0.0728 0.22 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 2.84e-01 0.0934 0.0868 0.22 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 1.57e-01 0.042 0.0296 0.22 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 8.56e-01 0.0163 0.09 0.22 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0189 0.0692 0.221 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -362678 sc-eQTL 3.19e-01 0.0856 0.0856 0.221 DC L1
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0748 0.101 0.221 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -341968 sc-eQTL 8.42e-01 0.0185 0.0927 0.221 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0927 0.0989 0.221 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0207 0.0556 0.221 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 1.30e-01 -0.133 0.0875 0.221 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -731041 sc-eQTL 4.30e-01 0.0632 0.08 0.221 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00169 0.0523 0.22 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -362678 sc-eQTL 5.02e-01 0.0603 0.0897 0.22 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 3.71e-01 0.0763 0.0851 0.22 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -341968 sc-eQTL 6.15e-01 0.0486 0.0965 0.22 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0379 0.0681 0.22 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 8.33e-01 0.00864 0.0408 0.22 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 4.87e-01 0.0562 0.0807 0.22 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 6.09e-01 0.0394 0.0768 0.219 NK L1
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0651 0.0701 0.219 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 2.37e-02 0.215 0.0945 0.219 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 8.00e-01 0.0101 0.0396 0.219 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 3.22e-01 0.0765 0.0771 0.22 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 5.95e-01 0.0513 0.0964 0.22 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 6.93e-01 0.037 0.0934 0.22 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00551 0.037 0.22 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 9.21e-01 0.0101 0.101 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -29388 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0548 0.108 0.196 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 6.43e-01 0.0472 0.102 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 7.26e-01 0.0395 0.113 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0479 0.108 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 3.47e-01 0.0545 0.0578 0.196 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0674 0.101 0.196 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 240199 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0313 0.0968 0.196 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -29388 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0105 0.0989 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 9.01e-02 -0.109 0.0643 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 2.78e-01 -0.107 0.0982 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 2.57e-01 -0.111 0.0972 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 1.31e-01 0.0899 0.0594 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 6.21e-01 0.0532 0.107 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 240199 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0324 0.0914 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -29388 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0399 0.0997 0.216 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00886 0.0783 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00555 0.101 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 5.07e-01 0.068 0.102 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 2.58e-01 0.0557 0.0492 0.216 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 2.12e-01 -0.128 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 240199 sc-eQTL 5.73e-01 0.0542 0.0959 0.216 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -29388 sc-eQTL 1.50e-01 0.156 0.108 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00463 0.0473 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0614 0.0846 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 2.59e-01 0.104 0.0915 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00468 0.0523 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 3.29e-01 0.0985 0.101 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 240199 sc-eQTL 7.34e-01 0.0227 0.0668 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -29388 sc-eQTL 7.73e-01 0.0297 0.103 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 6.71e-01 0.0238 0.056 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 6.24e-02 -0.192 0.103 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0753 0.103 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 7.11e-01 0.0202 0.0544 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 6.15e-02 0.194 0.103 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 240199 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0678 0.0718 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 8.59e-01 0.0185 0.104 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 2.45e-01 -0.125 0.108 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 9.47e-01 0.00701 0.105 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 7.48e-01 0.0156 0.0484 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 6.36e-01 0.0462 0.0975 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 7.20e-01 0.0294 0.0819 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 6.38e-01 0.0329 0.0699 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 4.83e-01 0.0533 0.0758 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 1.56e-01 0.0698 0.049 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 1.87e-01 0.125 0.0944 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 3.33e-02 -0.193 0.0901 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 1.11e-02 -0.193 0.0754 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 5.12e-01 0.0589 0.0896 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 1.23e-01 0.0716 0.0463 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 4.29e-01 0.0852 0.108 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0442 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 9.04e-01 0.0118 0.0974 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 4.07e-01 0.0842 0.101 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 1.25e-01 0.0638 0.0414 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 7.86e-01 0.0282 0.103 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 2.07e-01 -0.11 0.087 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 2.55e-01 -0.102 0.0892 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 1.84e-01 0.131 0.0988 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0102 0.0531 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 2.23e-01 -0.125 0.102 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 9.58e-01 0.00551 0.104 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0811 0.0835 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 4.99e-01 0.0608 0.0897 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 4.26e-02 0.104 0.0509 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 2.92e-01 0.109 0.103 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 9.99e-01 -9.11e-05 0.104 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 2.69e-01 0.116 0.104 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 7.73e-02 0.183 0.103 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 5.09e-01 0.0334 0.0505 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 1.91e-01 0.145 0.11 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 7.39e-01 0.0371 0.111 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 2.04e-01 -0.135 0.106 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 5.54e-01 0.0653 0.11 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0283 0.0593 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 6.11e-01 0.0572 0.112 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0227 0.0986 0.219 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 5.67e-01 0.0591 0.103 0.219 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0191 0.1 0.219 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 7.81e-01 0.0137 0.0493 0.219 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0466 0.103 0.219 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 5.42e-01 0.0636 0.104 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0743 0.11 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 3.49e-01 0.099 0.106 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0321 0.0589 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 9.62e-01 0.00391 0.0817 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00081 0.084 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 2.49e-02 0.228 0.101 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 8.60e-01 0.00717 0.0406 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0503 0.103 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 1.27e-01 -0.159 0.104 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 9.96e-01 0.000511 0.104 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 8.26e-01 0.0107 0.0487 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 1.67e-01 0.124 0.0897 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0558 0.0932 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 1.45e-01 0.148 0.101 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 5.02e-01 -0.037 0.0549 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -29388 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0445 0.115 0.215 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 7.15e-01 0.0352 0.0963 0.215 PB L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 2.85e-01 0.14 0.13 0.215 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0246 0.118 0.215 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 3.19e-01 0.0666 0.0665 0.215 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0102 0.125 0.215 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 240199 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00563 0.0824 0.215 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 3.09e-01 0.096 0.0942 0.22 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 7.19e-01 0.0382 0.106 0.22 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 5.47e-01 0.061 0.101 0.22 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 3.62e-01 0.0349 0.0382 0.22 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0195 0.0992 0.22 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 7.70e-01 -0.03 0.102 0.22 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0755 0.105 0.22 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 1.69e-01 -0.118 0.0857 0.22 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 6.37e-01 0.018 0.0381 0.22 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 1.37e-03 0.341 0.105 0.22 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0483 0.0874 0.215 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -362678 sc-eQTL 6.89e-01 0.0348 0.0869 0.215 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0202 0.113 0.215 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -341968 sc-eQTL 8.40e-01 0.0206 0.102 0.215 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0596 0.0995 0.215 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 4.77e-01 0.035 0.0491 0.215 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 2.58e-01 -0.11 0.097 0.215 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -731041 sc-eQTL 3.90e-01 0.0669 0.0777 0.215 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 8.18e-01 0.0152 0.0661 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -362678 sc-eQTL 4.83e-01 0.0656 0.0934 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 2.13e-01 0.115 0.0921 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -341968 sc-eQTL 4.04e-02 0.193 0.0934 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 6.90e-01 0.0301 0.0754 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 5.03e-01 0.0281 0.0418 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 4.56e-01 0.0603 0.0807 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 5.68e-01 0.041 0.0717 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -362678 sc-eQTL 3.79e-01 0.0788 0.0894 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 1.52e-01 -0.139 0.0967 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -341968 sc-eQTL 6.20e-01 0.0483 0.0972 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0304 0.0637 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 4.11e-01 0.0377 0.0458 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0254 0.0849 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 2.07e-01 0.146 0.115 0.203 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 8.12e-01 0.0296 0.124 0.203 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 2.73e-01 0.14 0.127 0.203 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 7.91e-01 0.0129 0.0486 0.203 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 3.41e-01 0.12 0.125 0.203 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0296 0.0967 0.218 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -362678 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0244 0.0976 0.218 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0503 0.107 0.218 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -341968 sc-eQTL 8.23e-01 0.0216 0.0965 0.218 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 2.99e-01 -0.102 0.0979 0.218 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 1.87e-01 0.0563 0.0425 0.218 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0937 0.104 0.218 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 8.84e-01 0.0108 0.0738 0.215 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -362678 sc-eQTL 2.63e-01 0.117 0.104 0.215 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 8.75e-01 0.0166 0.106 0.215 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -341968 sc-eQTL 8.56e-01 0.0188 0.103 0.215 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0832 0.0992 0.215 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 9.43e-01 0.00356 0.0499 0.215 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 6.53e-01 0.0397 0.088 0.215 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0694 0.0833 0.234 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -362678 sc-eQTL 7.51e-01 0.0267 0.0841 0.234 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 8.65e-01 0.0199 0.117 0.234 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -341968 sc-eQTL 6.35e-01 0.0407 0.0855 0.234 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0248 0.102 0.234 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0549 0.07 0.234 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0914 0.104 0.234 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -731041 sc-eQTL 5.29e-01 0.0626 0.0993 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -29388 sc-eQTL 6.29e-01 0.05 0.103 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0647 0.0585 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0496 0.0897 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 6.90e-01 -0.037 0.0927 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 3.96e-02 0.108 0.0523 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0558 0.0969 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 240199 sc-eQTL 4.02e-01 0.0784 0.0934 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -29388 sc-eQTL 3.65e-01 0.0993 0.109 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 7.39e-01 0.015 0.045 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 6.51e-02 -0.155 0.0838 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 5.96e-01 0.0464 0.0873 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 9.28e-01 0.00479 0.0528 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 6.37e-02 0.184 0.0989 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 240199 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00692 0.0633 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 9.61e-01 0.00278 0.0564 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -362678 sc-eQTL 5.66e-01 0.0527 0.0918 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 6.14e-01 0.0446 0.0883 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -341968 sc-eQTL 2.90e-01 0.101 0.0956 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0458 0.0633 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 6.89e-01 0.0174 0.0434 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 7.39e-01 0.0258 0.0773 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 5.74e-01 0.0383 0.068 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -362678 sc-eQTL 2.78e-01 0.109 0.0999 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 8.16e-01 0.0227 0.0975 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -341968 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0412 0.0992 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 1.55e-01 -0.133 0.0931 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 3.27e-01 0.0389 0.0396 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -441252 sc-eQTL 7.41e-01 0.0319 0.0964 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -141111 sc-eQTL 7.12e-01 0.0286 0.0773 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 743845 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0336 0.075 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -391372 sc-eQTL 2.84e-02 0.213 0.0967 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -442482 sc-eQTL 5.48e-01 0.024 0.0399 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -141111 pQTL 0.0144 -0.0691 0.0282 0.0 0.0 0.2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 pQTL 0.0248 -0.0706 0.0314 0.0 0.0 0.2
ENSG00000112303 VNN2 -391372 eQTL 0.0291 -0.0344 0.0157 0.0 0.0 0.203
ENSG00000112306 RPS12 -442482 eQTL 0.00872 0.0192 0.00731 0.00212 0.0 0.203

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112306 RPS12 -442482 8.15e-07 4.97e-07 1.29e-07 4.31e-07 9.26e-08 2.08e-07 5.28e-07 1.11e-07 4.19e-07 2.26e-07 5.29e-07 3.3e-07 7.71e-07 1.23e-07 1.9e-07 2.14e-07 2.48e-07 3.58e-07 2.13e-07 1.97e-07 2.17e-07 3.76e-07 3.08e-07 1.34e-07 6.59e-07 2.46e-07 2.72e-07 2.59e-07 3e-07 4.51e-07 2.6e-07 4.1e-08 4.62e-08 1.54e-07 3.36e-07 1.54e-07 1.97e-07 1.14e-07 7.72e-08 2.8e-08 1.01e-07 5.44e-07 5.44e-08 1.07e-08 2.03e-07 1.52e-08 1.03e-07 5.66e-08 4.71e-08