logo

Genes within 1Mb (chr6:132362623:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -38852 sc-eQTL 2.48e-01 0.12 0.103 0.224 B L1
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0249 0.0391 0.224 B L1
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0734 0.0778 0.224 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0638 0.0734 0.224 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 5.43e-01 0.0271 0.0444 0.224 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 3.69e-01 0.084 0.0933 0.224 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 230735 sc-eQTL 4.35e-01 0.0479 0.0613 0.224 B L1
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0337 0.0757 0.224 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 1.88e-01 -0.079 0.0598 0.224 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 2.03e-01 0.0834 0.0653 0.224 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 1.21e-01 0.069 0.0443 0.224 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 9.04e-02 0.152 0.0896 0.224 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0744 0.0739 0.224 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 1.13e-01 -0.115 0.0725 0.224 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 3.39e-01 0.0827 0.0863 0.224 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 4.05e-01 0.0246 0.0295 0.224 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 9.12e-01 0.00991 0.0893 0.224 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0149 0.0684 0.225 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -372142 sc-eQTL 3.58e-01 0.078 0.0847 0.225 DC L1
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0933 0.0994 0.225 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -351432 sc-eQTL 8.02e-01 0.023 0.0916 0.225 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0782 0.0978 0.225 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0375 0.0549 0.225 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 2.17e-01 -0.107 0.0866 0.225 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -740505 sc-eQTL 2.82e-01 0.0851 0.0789 0.225 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00426 0.0522 0.224 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -372142 sc-eQTL 5.27e-01 0.0567 0.0895 0.224 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 3.79e-01 0.0749 0.0849 0.224 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -351432 sc-eQTL 6.81e-01 0.0397 0.0963 0.224 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0185 0.068 0.224 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 8.09e-01 -0.00988 0.0408 0.224 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 5.48e-01 0.0485 0.0806 0.224 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 5.12e-01 0.0502 0.0763 0.223 NK L1
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0513 0.0698 0.223 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 4.10e-02 0.194 0.0942 0.223 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 7.25e-01 0.0138 0.0393 0.223 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 4.30e-01 0.0602 0.0762 0.224 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 4.56e-01 0.0711 0.0951 0.224 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 7.23e-01 0.0327 0.0922 0.224 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0098 0.0366 0.224 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 9.35e-01 0.00816 0.1 0.224 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -38852 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0527 0.106 0.204 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 7.38e-01 0.0335 0.0998 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 9.47e-01 0.00732 0.111 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0556 0.106 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 3.30e-01 0.0555 0.0568 0.204 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0757 0.0996 0.204 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 230735 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0224 0.0951 0.204 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -38852 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0374 0.0977 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 4.43e-02 -0.128 0.0634 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 2.71e-01 -0.107 0.097 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0948 0.0961 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 2.14e-01 0.0733 0.0588 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 5.62e-01 0.0618 0.106 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 230735 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0393 0.0903 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -38852 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0717 0.098 0.22 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0215 0.0769 0.22 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 8.71e-01 0.0161 0.0991 0.22 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 7.07e-01 0.0379 0.101 0.22 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 5.93e-01 0.0259 0.0485 0.22 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 1.53e-01 -0.144 0.101 0.22 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 230735 sc-eQTL 3.85e-01 0.082 0.0941 0.22 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -38852 sc-eQTL 1.63e-01 0.149 0.107 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00571 0.0468 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0446 0.0838 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 3.01e-01 0.094 0.0906 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00688 0.0518 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 4.72e-01 0.0718 0.0997 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 230735 sc-eQTL 9.38e-01 0.00513 0.0661 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -38852 sc-eQTL 9.73e-01 0.0035 0.102 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 8.76e-01 0.00866 0.0554 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 7.15e-02 -0.184 0.102 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0859 0.102 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 8.07e-01 0.0132 0.0538 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 1.07e-01 0.165 0.102 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 230735 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0787 0.071 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 8.67e-01 0.0172 0.103 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 2.44e-01 -0.124 0.106 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 6.44e-01 0.0479 0.103 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 5.97e-01 0.0253 0.0478 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 6.96e-01 0.0377 0.0964 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 7.19e-01 0.0292 0.0811 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 7.47e-01 0.0223 0.0692 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 1.86e-01 0.0992 0.0748 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 1.55e-01 0.0692 0.0485 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 2.96e-01 0.0982 0.0936 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 5.88e-02 -0.17 0.0897 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 1.09e-02 -0.192 0.0749 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 4.35e-01 0.0697 0.089 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 2.31e-01 0.0554 0.0461 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 5.40e-01 0.0656 0.107 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0344 0.105 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0116 0.0963 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 5.54e-01 0.0594 0.1 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 1.94e-01 0.0535 0.041 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 7.29e-01 0.0355 0.102 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 2.30e-01 -0.104 0.0861 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 5.65e-01 -0.051 0.0885 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 3.62e-01 0.0895 0.098 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000364 0.0525 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 1.68e-01 -0.14 0.101 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 8.30e-01 0.0222 0.103 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0847 0.0826 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 4.25e-01 0.0709 0.0887 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 1.40e-01 0.0749 0.0506 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 3.04e-01 0.105 0.102 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0198 0.104 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 3.31e-01 0.102 0.104 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 5.26e-02 0.199 0.102 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 5.87e-01 0.0273 0.0503 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 1.05e-01 0.178 0.11 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 9.95e-01 0.000629 0.11 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 3.10e-01 -0.107 0.105 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 5.71e-01 0.0618 0.109 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0436 0.0586 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 9.06e-01 0.0131 0.111 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0257 0.0978 0.223 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 3.11e-01 0.104 0.102 0.223 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0294 0.0995 0.223 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00449 0.049 0.223 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0338 0.103 0.223 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 5.46e-01 0.0622 0.103 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 3.55e-01 -0.101 0.109 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 3.66e-01 0.0945 0.104 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0374 0.0582 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 8.67e-01 0.0137 0.0819 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 7.41e-01 0.0278 0.0841 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 2.10e-02 0.235 0.101 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 6.53e-01 0.0183 0.0406 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0583 0.102 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 1.88e-01 -0.136 0.103 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 9.85e-01 0.00191 0.103 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 6.61e-01 0.0212 0.0482 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 2.37e-01 0.106 0.0895 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0686 0.0927 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 2.73e-01 0.11 0.101 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0341 0.0547 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -38852 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0649 0.113 0.226 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 4.80e-01 0.0667 0.0942 0.226 PB L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 1.44e-01 0.187 0.127 0.226 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0072 0.115 0.226 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 3.86e-01 0.0568 0.0653 0.226 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0547 0.123 0.226 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 230735 sc-eQTL 9.44e-01 0.00567 0.0807 0.226 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 3.66e-01 0.0843 0.0931 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 7.06e-01 0.0396 0.105 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 4.99e-01 0.0677 0.0999 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 3.57e-01 0.0349 0.0378 0.224 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0194 0.0979 0.224 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0143 0.102 0.224 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 2.50e-01 -0.12 0.104 0.224 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 1.92e-01 -0.111 0.0851 0.224 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 6.87e-01 0.0152 0.0378 0.224 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 1.55e-03 0.334 0.104 0.224 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0627 0.087 0.217 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -372142 sc-eQTL 5.69e-01 0.0494 0.0865 0.217 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0139 0.113 0.217 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -351432 sc-eQTL 7.00e-01 0.0393 0.102 0.217 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0553 0.099 0.217 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 6.54e-01 0.0219 0.0489 0.217 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0855 0.0967 0.217 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -740505 sc-eQTL 3.50e-01 0.0724 0.0773 0.217 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 9.07e-01 0.00771 0.0659 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -372142 sc-eQTL 5.33e-01 0.0581 0.093 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 2.54e-01 0.105 0.0917 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -351432 sc-eQTL 4.07e-02 0.191 0.093 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 3.85e-01 0.0652 0.075 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 6.93e-01 0.0165 0.0417 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 4.48e-01 0.0611 0.0803 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 6.90e-01 0.0286 0.0717 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -372142 sc-eQTL 3.49e-01 0.0838 0.0893 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 2.46e-01 -0.113 0.0969 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -351432 sc-eQTL 6.14e-01 0.049 0.0971 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0206 0.0637 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 7.54e-01 0.0144 0.0458 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0355 0.0848 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 2.15e-01 0.143 0.115 0.2 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 8.41e-01 0.0249 0.124 0.2 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 2.71e-01 0.141 0.127 0.2 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 7.61e-01 0.0149 0.0487 0.2 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 3.27e-01 0.124 0.126 0.2 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0244 0.0965 0.22 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -372142 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0309 0.0974 0.22 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0601 0.107 0.22 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -351432 sc-eQTL 6.04e-01 0.0501 0.0962 0.22 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0865 0.0977 0.22 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 2.31e-01 0.051 0.0424 0.22 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0832 0.104 0.22 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 7.22e-01 0.0266 0.0744 0.215 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -372142 sc-eQTL 1.30e-01 0.159 0.104 0.215 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 9.77e-01 0.00313 0.106 0.215 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -351432 sc-eQTL 6.88e-01 0.0419 0.104 0.215 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0754 0.1 0.215 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 8.54e-01 -0.00926 0.0503 0.215 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 5.67e-01 0.0509 0.0888 0.215 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0856 0.0827 0.237 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -372142 sc-eQTL 7.04e-01 0.0318 0.0835 0.237 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 9.49e-01 0.00752 0.117 0.237 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -351432 sc-eQTL 3.67e-01 0.0768 0.0848 0.237 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 8.52e-01 0.0189 0.101 0.237 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0666 0.0695 0.237 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 4.16e-01 -0.084 0.103 0.237 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -740505 sc-eQTL 4.09e-01 0.0816 0.0986 0.237 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -38852 sc-eQTL 9.20e-01 0.0103 0.102 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0857 0.0576 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0538 0.0885 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0231 0.0915 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 9.24e-02 0.0876 0.0518 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0595 0.0956 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 230735 sc-eQTL 2.92e-01 0.0973 0.0921 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -38852 sc-eQTL 4.77e-01 0.077 0.108 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 9.01e-01 0.00553 0.0444 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 9.97e-02 -0.137 0.0829 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 6.59e-01 0.0381 0.0862 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 9.67e-01 0.00218 0.0522 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 1.38e-01 0.146 0.0979 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 230735 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0168 0.0625 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00749 0.0563 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -372142 sc-eQTL 6.14e-01 0.0463 0.0918 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 5.89e-01 0.0478 0.0882 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -351432 sc-eQTL 3.52e-01 0.0891 0.0956 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0264 0.0633 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 9.88e-01 0.000646 0.0434 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 8.01e-01 0.0195 0.0772 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 4.08e-01 0.0563 0.068 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -372142 sc-eQTL 2.41e-01 0.117 0.0998 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00841 0.0976 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -351432 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0259 0.0993 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 1.92e-01 -0.122 0.0932 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 4.54e-01 0.0297 0.0397 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -450716 sc-eQTL 6.92e-01 0.0383 0.0964 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -150575 sc-eQTL 7.00e-01 0.0297 0.0769 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 734381 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0127 0.0747 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -400836 sc-eQTL 4.42e-02 0.195 0.0964 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -451946 sc-eQTL 4.52e-01 0.0299 0.0397 0.224 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -150575 pQTL 0.0151 -0.0666 0.0274 0.0 0.0 0.214
ENSG00000093134 VNN3 -372142 eQTL 0.0249 -0.0386 0.0172 0.0 0.0 0.217
ENSG00000112303 VNN2 -400836 pQTL 0.0341 -0.0647 0.0305 0.0 0.0 0.214
ENSG00000112303 VNN2 -400836 eQTL 0.0296 -0.0333 0.0153 0.0 0.0 0.217
ENSG00000112306 RPS12 -451946 eQTL 0.0294 0.0155 0.0071 0.00105 0.0 0.217
ENSG00000234484 AL032821.1 -390052 eQTL 0.0321 0.0786 0.0366 0.0 0.0 0.217

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112303 VNN2 -400836 1.25e-06 9.07e-07 2.81e-07 3.17e-07 1.16e-07 4.02e-07 8.39e-07 2.7e-07 8.39e-07 2.85e-07 1.09e-06 5.69e-07 1.23e-06 2.1e-07 3.72e-07 4.29e-07 7.79e-07 5.26e-07 3.95e-07 3.99e-07 2.83e-07 6.27e-07 5.81e-07 4.09e-07 1.57e-06 2.4e-07 4.83e-07 4.77e-07 7.61e-07 9.08e-07 4.61e-07 3.77e-08 1.48e-07 2.04e-07 3.28e-07 2.54e-07 2.79e-07 1.41e-07 1.14e-07 9.74e-09 2.19e-07 1.02e-06 6.17e-08 2.68e-08 1.59e-07 3.54e-08 1.71e-07 7.35e-08 5.25e-08
ENSG00000112306 RPS12 -451946 1.01e-06 6.56e-07 1.5e-07 4.34e-07 1.12e-07 3.24e-07 6.29e-07 1.62e-07 5.49e-07 2.8e-07 9e-07 4.62e-07 9.37e-07 1.59e-07 2.48e-07 2.85e-07 5.34e-07 4.33e-07 2.79e-07 1.87e-07 2.42e-07 4.81e-07 4.01e-07 2.6e-07 1.06e-06 2.71e-07 3.1e-07 3.24e-07 5.16e-07 6.98e-07 3.67e-07 5.45e-08 5.82e-08 1.57e-07 3.48e-07 1.44e-07 1.31e-07 1.13e-07 7.63e-08 1.6e-08 1.47e-07 6.95e-07 5.51e-08 1.25e-08 2.03e-07 1.35e-08 1.37e-07 2.41e-08 6.46e-08