logo

Genes within 1Mb (chr6:132355606:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -45869 sc-eQTL 1.33e-01 0.158 0.104 0.22 B L1
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0188 0.0396 0.22 B L1
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0839 0.0787 0.22 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 3.47e-01 -0.07 0.0743 0.22 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 3.87e-01 0.0389 0.0449 0.22 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 2.45e-01 0.11 0.0944 0.22 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 223718 sc-eQTL 3.60e-01 0.0569 0.062 0.22 B L1
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0508 0.0763 0.22 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0701 0.0605 0.22 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 4.74e-01 0.0474 0.0661 0.22 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 9.41e-02 0.0752 0.0447 0.22 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 5.27e-02 0.176 0.0902 0.22 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0889 0.0743 0.22 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 4.91e-02 -0.144 0.0728 0.22 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 2.84e-01 0.0934 0.0868 0.22 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 1.57e-01 0.042 0.0296 0.22 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 8.56e-01 0.0163 0.09 0.22 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0189 0.0692 0.221 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -379159 sc-eQTL 3.19e-01 0.0856 0.0856 0.221 DC L1
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0748 0.101 0.221 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -358449 sc-eQTL 8.42e-01 0.0185 0.0927 0.221 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0927 0.0989 0.221 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0207 0.0556 0.221 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 1.30e-01 -0.133 0.0875 0.221 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -747522 sc-eQTL 4.30e-01 0.0632 0.08 0.221 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00169 0.0523 0.22 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -379159 sc-eQTL 5.02e-01 0.0603 0.0897 0.22 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 3.71e-01 0.0763 0.0851 0.22 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -358449 sc-eQTL 6.15e-01 0.0486 0.0965 0.22 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0379 0.0681 0.22 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 8.33e-01 0.00864 0.0408 0.22 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 4.87e-01 0.0562 0.0807 0.22 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 6.09e-01 0.0394 0.0768 0.219 NK L1
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0651 0.0701 0.219 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 2.37e-02 0.215 0.0945 0.219 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 8.00e-01 0.0101 0.0396 0.219 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 3.22e-01 0.0765 0.0771 0.22 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 5.95e-01 0.0513 0.0964 0.22 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 6.93e-01 0.037 0.0934 0.22 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00551 0.037 0.22 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 9.21e-01 0.0101 0.101 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -45869 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0548 0.108 0.196 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 6.43e-01 0.0472 0.102 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 7.26e-01 0.0395 0.113 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0479 0.108 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 3.47e-01 0.0545 0.0578 0.196 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0674 0.101 0.196 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 223718 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0313 0.0968 0.196 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -45869 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0105 0.0989 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 9.01e-02 -0.109 0.0643 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 2.78e-01 -0.107 0.0982 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 2.57e-01 -0.111 0.0972 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 1.31e-01 0.0899 0.0594 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 6.21e-01 0.0532 0.107 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 223718 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0324 0.0914 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -45869 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0399 0.0997 0.216 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00886 0.0783 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00555 0.101 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 5.07e-01 0.068 0.102 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 2.58e-01 0.0557 0.0492 0.216 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 2.12e-01 -0.128 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 223718 sc-eQTL 5.73e-01 0.0542 0.0959 0.216 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -45869 sc-eQTL 1.50e-01 0.156 0.108 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00463 0.0473 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0614 0.0846 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 2.59e-01 0.104 0.0915 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00468 0.0523 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 3.29e-01 0.0985 0.101 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 223718 sc-eQTL 7.34e-01 0.0227 0.0668 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -45869 sc-eQTL 7.73e-01 0.0297 0.103 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 6.71e-01 0.0238 0.056 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 6.24e-02 -0.192 0.103 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0753 0.103 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 7.11e-01 0.0202 0.0544 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 6.15e-02 0.194 0.103 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 223718 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0678 0.0718 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 8.59e-01 0.0185 0.104 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 2.45e-01 -0.125 0.108 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 9.47e-01 0.00701 0.105 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 7.48e-01 0.0156 0.0484 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 6.36e-01 0.0462 0.0975 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 7.20e-01 0.0294 0.0819 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 6.38e-01 0.0329 0.0699 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 4.83e-01 0.0533 0.0758 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 1.56e-01 0.0698 0.049 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 1.87e-01 0.125 0.0944 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 3.33e-02 -0.193 0.0901 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 1.11e-02 -0.193 0.0754 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 5.12e-01 0.0589 0.0896 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 1.23e-01 0.0716 0.0463 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 4.29e-01 0.0852 0.108 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0442 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 9.04e-01 0.0118 0.0974 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 4.07e-01 0.0842 0.101 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 1.25e-01 0.0638 0.0414 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 7.86e-01 0.0282 0.103 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 2.07e-01 -0.11 0.087 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 2.55e-01 -0.102 0.0892 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 1.84e-01 0.131 0.0988 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0102 0.0531 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 2.23e-01 -0.125 0.102 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 9.58e-01 0.00551 0.104 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0811 0.0835 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 4.99e-01 0.0608 0.0897 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 4.26e-02 0.104 0.0509 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 2.92e-01 0.109 0.103 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 9.99e-01 -9.11e-05 0.104 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 2.69e-01 0.116 0.104 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 7.73e-02 0.183 0.103 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 5.09e-01 0.0334 0.0505 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 1.91e-01 0.145 0.11 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 7.39e-01 0.0371 0.111 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 2.04e-01 -0.135 0.106 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 5.54e-01 0.0653 0.11 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0283 0.0593 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 6.11e-01 0.0572 0.112 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0227 0.0986 0.219 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 5.67e-01 0.0591 0.103 0.219 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0191 0.1 0.219 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 7.81e-01 0.0137 0.0493 0.219 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0466 0.103 0.219 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 5.42e-01 0.0636 0.104 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0743 0.11 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 3.49e-01 0.099 0.106 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0321 0.0589 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 9.62e-01 0.00391 0.0817 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00081 0.084 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 2.49e-02 0.228 0.101 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 8.60e-01 0.00717 0.0406 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0503 0.103 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 1.27e-01 -0.159 0.104 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 9.96e-01 0.000511 0.104 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 8.26e-01 0.0107 0.0487 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 1.67e-01 0.124 0.0897 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0558 0.0932 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 1.45e-01 0.148 0.101 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 5.02e-01 -0.037 0.0549 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -45869 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0445 0.115 0.215 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 7.15e-01 0.0352 0.0963 0.215 PB L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 2.85e-01 0.14 0.13 0.215 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0246 0.118 0.215 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 3.19e-01 0.0666 0.0665 0.215 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0102 0.125 0.215 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 223718 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00563 0.0824 0.215 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 3.09e-01 0.096 0.0942 0.22 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 7.19e-01 0.0382 0.106 0.22 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 5.47e-01 0.061 0.101 0.22 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 3.62e-01 0.0349 0.0382 0.22 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0195 0.0992 0.22 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 7.70e-01 -0.03 0.102 0.22 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0755 0.105 0.22 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 1.69e-01 -0.118 0.0857 0.22 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 6.37e-01 0.018 0.0381 0.22 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 1.37e-03 0.341 0.105 0.22 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0483 0.0874 0.215 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -379159 sc-eQTL 6.89e-01 0.0348 0.0869 0.215 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0202 0.113 0.215 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -358449 sc-eQTL 8.40e-01 0.0206 0.102 0.215 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0596 0.0995 0.215 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 4.77e-01 0.035 0.0491 0.215 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 2.58e-01 -0.11 0.097 0.215 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -747522 sc-eQTL 3.90e-01 0.0669 0.0777 0.215 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 8.18e-01 0.0152 0.0661 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -379159 sc-eQTL 4.83e-01 0.0656 0.0934 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 2.13e-01 0.115 0.0921 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -358449 sc-eQTL 4.04e-02 0.193 0.0934 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 6.90e-01 0.0301 0.0754 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 5.03e-01 0.0281 0.0418 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 4.56e-01 0.0603 0.0807 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 5.68e-01 0.041 0.0717 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -379159 sc-eQTL 3.79e-01 0.0788 0.0894 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 1.52e-01 -0.139 0.0967 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -358449 sc-eQTL 6.20e-01 0.0483 0.0972 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0304 0.0637 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 4.11e-01 0.0377 0.0458 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0254 0.0849 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 2.07e-01 0.146 0.115 0.203 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 8.12e-01 0.0296 0.124 0.203 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 2.73e-01 0.14 0.127 0.203 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 7.91e-01 0.0129 0.0486 0.203 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 3.41e-01 0.12 0.125 0.203 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0296 0.0967 0.218 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -379159 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0244 0.0976 0.218 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0503 0.107 0.218 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -358449 sc-eQTL 8.23e-01 0.0216 0.0965 0.218 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 2.99e-01 -0.102 0.0979 0.218 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 1.87e-01 0.0563 0.0425 0.218 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0937 0.104 0.218 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 8.84e-01 0.0108 0.0738 0.215 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -379159 sc-eQTL 2.63e-01 0.117 0.104 0.215 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 8.75e-01 0.0166 0.106 0.215 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -358449 sc-eQTL 8.56e-01 0.0188 0.103 0.215 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0832 0.0992 0.215 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 9.43e-01 0.00356 0.0499 0.215 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 6.53e-01 0.0397 0.088 0.215 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0694 0.0833 0.234 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -379159 sc-eQTL 7.51e-01 0.0267 0.0841 0.234 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 8.65e-01 0.0199 0.117 0.234 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -358449 sc-eQTL 6.35e-01 0.0407 0.0855 0.234 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0248 0.102 0.234 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0549 0.07 0.234 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0914 0.104 0.234 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -747522 sc-eQTL 5.29e-01 0.0626 0.0993 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -45869 sc-eQTL 6.29e-01 0.05 0.103 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0647 0.0585 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0496 0.0897 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 6.90e-01 -0.037 0.0927 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 3.96e-02 0.108 0.0523 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0558 0.0969 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 223718 sc-eQTL 4.02e-01 0.0784 0.0934 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -45869 sc-eQTL 3.65e-01 0.0993 0.109 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 7.39e-01 0.015 0.045 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 6.51e-02 -0.155 0.0838 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 5.96e-01 0.0464 0.0873 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 9.28e-01 0.00479 0.0528 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 6.37e-02 0.184 0.0989 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 223718 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00692 0.0633 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 9.61e-01 0.00278 0.0564 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -379159 sc-eQTL 5.66e-01 0.0527 0.0918 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 6.14e-01 0.0446 0.0883 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -358449 sc-eQTL 2.90e-01 0.101 0.0956 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0458 0.0633 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 6.89e-01 0.0174 0.0434 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 7.39e-01 0.0258 0.0773 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 5.74e-01 0.0383 0.068 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -379159 sc-eQTL 2.78e-01 0.109 0.0999 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 8.16e-01 0.0227 0.0975 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -358449 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0412 0.0992 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 1.55e-01 -0.133 0.0931 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 3.27e-01 0.0389 0.0396 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -457733 sc-eQTL 7.41e-01 0.0319 0.0964 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -157592 sc-eQTL 7.12e-01 0.0286 0.0773 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 727364 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0336 0.075 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -407853 sc-eQTL 2.84e-02 0.213 0.0967 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -458963 sc-eQTL 5.48e-01 0.024 0.0399 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -157592 pQTL 0.0165 -0.067 0.0279 0.0 0.0 0.201
ENSG00000112303 VNN2 -407853 pQTL 0.0283 -0.0683 0.0311 0.0 0.0 0.201
ENSG00000112303 VNN2 -407853 eQTL 0.0422 -0.0316 0.0155 0.0 0.0 0.205
ENSG00000112306 RPS12 -458963 eQTL 0.00855 0.019 0.00722 0.00212 0.0 0.205

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112306 RPS12 -458963 1.25e-06 9.45e-07 2.79e-07 7e-07 1.07e-07 3.39e-07 9.43e-07 2.21e-07 9.89e-07 2.67e-07 1.25e-06 5.98e-07 1.49e-06 2.57e-07 4.6e-07 5.87e-07 6.44e-07 5.12e-07 4.82e-07 3.54e-07 2.82e-07 9.64e-07 5.41e-07 5.53e-07 1.92e-06 2.44e-07 6.03e-07 5.29e-07 6.62e-07 1.18e-06 4.53e-07 3.51e-08 2.33e-07 2.06e-07 4.08e-07 4.5e-07 4e-07 1.13e-07 6.33e-08 2.77e-08 5.38e-08 1.26e-06 3.59e-07 1.83e-07 1.64e-07 7.43e-08 1.21e-07 8.8e-08 9.13e-08