logo

Genes within 1Mb (chr6:132333692:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -67783 sc-eQTL 1.02e-01 0.178 0.108 0.214 B L1
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00252 0.0411 0.214 B L1
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 5.11e-01 -0.054 0.0819 0.214 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 2.24e-01 -0.094 0.0771 0.214 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 2.78e-01 0.0507 0.0466 0.214 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 1.86e-01 0.13 0.098 0.214 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 201804 sc-eQTL 8.29e-02 0.112 0.0641 0.214 B L1
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0549 0.0798 0.214 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0535 0.0633 0.214 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 5.47e-01 0.0417 0.0692 0.214 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 5.74e-02 0.0892 0.0467 0.214 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 5.10e-02 0.185 0.0944 0.214 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0863 0.0774 0.214 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 5.34e-02 -0.147 0.0758 0.214 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 3.34e-01 0.0875 0.0904 0.214 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 3.99e-01 0.0261 0.0309 0.214 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 8.30e-01 0.0202 0.0936 0.214 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0335 0.0718 0.214 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -401073 sc-eQTL 2.01e-01 0.114 0.0888 0.214 DC L1
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0856 0.104 0.214 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -380363 sc-eQTL 8.51e-01 0.0181 0.0962 0.214 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 1.10e-01 -0.164 0.102 0.214 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 4.56e-01 -0.043 0.0576 0.214 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 2.32e-01 -0.109 0.091 0.214 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -769436 sc-eQTL 6.28e-01 0.0403 0.0831 0.214 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0165 0.0544 0.214 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -401073 sc-eQTL 2.92e-01 0.0983 0.0931 0.214 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 1.39e-01 0.131 0.0882 0.214 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -380363 sc-eQTL 9.87e-01 0.00163 0.1 0.214 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0848 0.0707 0.214 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 5.69e-01 0.0242 0.0425 0.214 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 8.74e-01 0.0133 0.084 0.214 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 2.41e-01 0.0947 0.0805 0.212 NK L1
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 1.74e-01 -0.1 0.0735 0.212 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 4.35e-02 0.202 0.0995 0.212 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 6.07e-01 0.0214 0.0416 0.212 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 4.44e-01 0.0612 0.0798 0.214 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 8.44e-01 0.0197 0.0998 0.214 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 5.88e-01 0.0525 0.0966 0.214 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 8.40e-01 -0.00777 0.0383 0.214 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 6.07e-01 0.054 0.105 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -67783 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0172 0.111 0.191 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0046 0.104 0.191 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 7.84e-01 0.0316 0.115 0.191 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0712 0.111 0.191 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 8.05e-01 0.0147 0.0594 0.191 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 2.26e-01 -0.126 0.104 0.191 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 201804 sc-eQTL 5.22e-01 0.0635 0.0991 0.191 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -67783 sc-eQTL 6.01e-01 0.0528 0.101 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0527 0.0659 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0882 0.1 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 1.57e-01 -0.14 0.0988 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 1.76e-02 0.144 0.06 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 4.24e-01 0.0876 0.109 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 201804 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0186 0.0931 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -67783 sc-eQTL 8.01e-01 0.026 0.103 0.209 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 9.62e-01 0.00384 0.0808 0.209 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 9.10e-01 0.0118 0.104 0.209 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00579 0.106 0.209 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 1.72e-01 0.0695 0.0507 0.209 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0945 0.106 0.209 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 201804 sc-eQTL 7.49e-01 0.0317 0.099 0.209 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -67783 sc-eQTL 1.11e-01 0.179 0.111 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 8.32e-01 0.0104 0.049 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0243 0.0878 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 2.90e-01 0.101 0.095 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 5.89e-01 0.0293 0.0542 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 2.65e-01 0.116 0.104 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 201804 sc-eQTL 5.04e-01 0.0463 0.0692 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -67783 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000299 0.106 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 7.84e-01 0.0158 0.0579 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 1.19e-01 -0.166 0.106 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0842 0.106 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 3.64e-01 0.0511 0.0562 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 1.03e-01 0.175 0.107 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 201804 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0184 0.0744 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 9.18e-01 0.0112 0.108 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0859 0.113 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 6.15e-01 -0.055 0.109 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 6.47e-01 0.0232 0.0505 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0142 0.102 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 9.97e-01 0.000282 0.0856 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 5.04e-01 0.0488 0.073 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 5.17e-01 0.0514 0.0792 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 7.45e-02 0.0916 0.0511 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 1.70e-01 0.136 0.0986 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 6.00e-02 -0.178 0.0941 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 2.36e-02 -0.18 0.0789 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 3.27e-01 0.0916 0.0934 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 9.37e-02 0.0811 0.0482 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 4.62e-01 0.0826 0.112 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0401 0.11 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 7.91e-01 0.0269 0.102 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 2.71e-01 0.116 0.105 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 1.20e-01 0.0674 0.0431 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 8.87e-01 0.0154 0.108 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 1.70e-01 -0.124 0.0904 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0484 0.093 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 4.28e-01 0.0819 0.103 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0313 0.0552 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 1.51e-01 -0.153 0.106 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 7.38e-01 0.0363 0.108 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0874 0.0869 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 2.98e-01 0.0972 0.0932 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 2.82e-02 0.117 0.0529 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 1.78e-01 0.144 0.107 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 9.14e-01 0.0116 0.107 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 1.06e-01 0.174 0.107 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 1.95e-01 0.138 0.106 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 5.75e-01 0.0292 0.0519 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 3.72e-01 0.102 0.114 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 6.18e-01 0.0572 0.115 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 2.80e-01 -0.119 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 5.13e-01 0.0746 0.114 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0303 0.0613 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 5.16e-01 0.0753 0.116 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0388 0.103 0.212 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 5.62e-01 0.0624 0.107 0.212 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0532 0.104 0.212 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 9.13e-01 0.0056 0.0514 0.212 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0327 0.108 0.212 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 4.49e-01 0.0825 0.109 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0379 0.115 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 4.30e-01 0.0872 0.11 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 7.84e-01 0.0169 0.0616 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 3.42e-01 0.081 0.0851 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 8.76e-01 0.0136 0.0876 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 1.03e-01 0.173 0.106 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 8.40e-01 0.00857 0.0423 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0429 0.107 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 1.00e-01 -0.177 0.107 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 7.97e-01 0.0279 0.108 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 5.08e-01 0.0333 0.0502 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 9.38e-02 0.157 0.0934 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 2.25e-01 -0.118 0.0969 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 1.47e-01 0.153 0.105 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0328 0.0573 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -67783 sc-eQTL 6.33e-01 0.0559 0.117 0.219 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 5.28e-01 0.0617 0.0974 0.219 PB L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 4.77e-01 0.0944 0.132 0.219 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0883 0.119 0.219 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 3.72e-01 0.0605 0.0674 0.219 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 6.99e-01 0.0491 0.127 0.219 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 201804 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00456 0.0834 0.219 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 1.08e-01 0.156 0.0967 0.211 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 6.90e-01 0.0436 0.109 0.211 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 2.94e-01 0.109 0.104 0.211 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 3.41e-01 0.0376 0.0394 0.211 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0261 0.102 0.211 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 9.16e-01 0.0112 0.107 0.214 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0606 0.109 0.214 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 2.33e-01 -0.107 0.0894 0.214 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 6.57e-01 0.0176 0.0396 0.214 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 1.85e-04 0.413 0.108 0.214 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0882 0.0921 0.21 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -401073 sc-eQTL 7.95e-01 0.0239 0.0917 0.21 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0462 0.119 0.21 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -380363 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0127 0.108 0.21 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 3.09e-01 -0.107 0.105 0.21 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 6.24e-01 0.0254 0.0518 0.21 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 5.59e-01 -0.06 0.103 0.21 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -769436 sc-eQTL 5.79e-01 0.0456 0.082 0.21 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00613 0.0694 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -401073 sc-eQTL 3.41e-01 0.0934 0.0978 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 6.42e-02 0.179 0.0961 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -380363 sc-eQTL 1.02e-01 0.161 0.0983 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0381 0.0791 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 2.55e-01 0.0499 0.0438 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 5.48e-01 0.0509 0.0847 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 9.17e-01 0.00782 0.0749 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -401073 sc-eQTL 4.54e-01 0.0701 0.0934 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0603 0.101 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -380363 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0147 0.102 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0884 0.0662 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 4.12e-01 0.0393 0.0478 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0799 0.0885 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 2.95e-01 0.124 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 6.67e-01 0.0546 0.127 0.2 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 4.65e-01 0.0956 0.131 0.2 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 9.63e-01 0.00231 0.0498 0.2 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 1.08e-01 0.206 0.128 0.2 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0107 0.101 0.213 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -401073 sc-eQTL 4.73e-01 0.0729 0.101 0.213 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0387 0.112 0.213 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -380363 sc-eQTL 8.01e-01 0.0253 0.1 0.213 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 1.04e-01 -0.165 0.101 0.213 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 1.09e-01 0.071 0.0441 0.213 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 1.88e-01 -0.142 0.108 0.213 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 5.92e-01 0.0414 0.077 0.208 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -401073 sc-eQTL 4.50e-01 0.0823 0.109 0.208 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0188 0.11 0.208 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -380363 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0796 0.108 0.208 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0564 0.104 0.208 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 9.60e-01 0.0026 0.0521 0.208 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 5.17e-01 0.0596 0.0918 0.208 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0964 0.0876 0.226 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -401073 sc-eQTL 7.34e-01 0.0302 0.0885 0.226 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 8.94e-01 0.0165 0.124 0.226 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -380363 sc-eQTL 6.66e-01 0.039 0.0901 0.226 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 2.43e-01 -0.125 0.107 0.226 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 8.89e-02 -0.125 0.0732 0.226 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0901 0.109 0.226 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -769436 sc-eQTL 7.31e-01 0.0361 0.105 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -67783 sc-eQTL 1.51e-01 0.153 0.106 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0379 0.0603 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0324 0.0923 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 2.13e-01 -0.119 0.0951 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 1.91e-02 0.127 0.0537 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 7.56e-01 -0.031 0.0998 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 201804 sc-eQTL 2.32e-01 0.115 0.0959 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -67783 sc-eQTL 3.98e-01 0.0957 0.113 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 4.28e-01 0.0369 0.0464 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 1.96e-01 -0.113 0.087 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 6.56e-01 0.0403 0.0902 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 4.63e-01 0.0401 0.0546 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 5.18e-02 0.2 0.102 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 201804 sc-eQTL 5.94e-01 0.035 0.0654 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0224 0.0588 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -401073 sc-eQTL 3.99e-01 0.0807 0.0956 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 1.65e-01 0.128 0.0916 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -380363 sc-eQTL 4.98e-01 0.0677 0.0998 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0908 0.0658 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 4.52e-01 0.0341 0.0452 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00655 0.0806 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 3.32e-01 0.069 0.0709 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -401073 sc-eQTL 1.93e-01 0.136 0.104 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00311 0.102 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -380363 sc-eQTL 2.20e-01 -0.127 0.103 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 8.38e-02 -0.168 0.097 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 2.85e-01 0.0443 0.0413 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -479647 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00144 0.101 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -179506 sc-eQTL 3.17e-01 0.0809 0.0807 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 705450 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0763 0.0784 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -429767 sc-eQTL 5.22e-02 0.198 0.102 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -480877 sc-eQTL 4.87e-01 0.0291 0.0418 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -179506 pQTL 0.0294 -0.0611 0.028 0.0 0.0 0.195
ENSG00000093134 VNN3 -401073 eQTL 0.0461 -0.0348 0.0175 0.0 0.0 0.198
ENSG00000112306 RPS12 -480877 eQTL 0.016 0.0174 0.0072 0.00134 0.0 0.198

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112306 RPS12 -480877 1.65e-06 1.66e-06 8.34e-07 1.7e-06 2.31e-07 6.43e-07 1.3e-06 2.88e-07 1.7e-06 6.28e-07 1.84e-06 1.05e-06 3.07e-06 2.92e-07 3.98e-07 1.1e-06 9.75e-07 1.09e-06 5.93e-07 6.26e-07 7.58e-07 1.91e-06 1.47e-06 6.2e-07 2.35e-06 4.27e-07 9.41e-07 9.36e-07 1.64e-06 1.9e-06 8.35e-07 2.61e-07 3e-07 6.95e-07 5.46e-07 6.4e-07 7.3e-07 2.31e-07 5e-07 4.17e-07 2.11e-07 4.1e-06 4.42e-07 1.95e-08 2.5e-07 1.3e-07 2.57e-07 1.49e-07 2.25e-07