Genes within 1Mb (chr6:132324717:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -76758 sc-eQTL 2.31e-02 -0.409 0.179 0.068 B L1
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 8.02e-02 -0.119 0.0678 0.068 B L1
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0824 0.136 0.068 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 1.41e-01 0.189 0.128 0.068 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0491 0.0775 0.068 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 3.67e-01 -0.147 0.163 0.068 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 192829 sc-eQTL 9.31e-01 0.00922 0.107 0.068 B L1
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 2.36e-03 -0.399 0.13 0.068 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 2.68e-02 0.232 0.104 0.068 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 4.87e-01 0.0797 0.115 0.068 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 1.28e-01 -0.119 0.0775 0.068 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 2.50e-01 -0.181 0.157 0.068 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 1.98e-01 -0.168 0.13 0.068 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.43e-01 0.0783 0.129 0.068 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 1.29e-01 0.231 0.152 0.068 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 5.53e-01 0.031 0.0521 0.068 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 1.43e-01 0.23 0.157 0.068 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 3.94e-01 0.105 0.123 0.068 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -410048 sc-eQTL 3.84e-01 0.133 0.152 0.068 DC L1
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 2.80e-01 0.194 0.179 0.068 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -389338 sc-eQTL 7.74e-01 0.0473 0.165 0.068 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 7.72e-01 0.0512 0.176 0.068 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 5.84e-01 0.0541 0.0987 0.068 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 7.02e-01 0.0598 0.156 0.068 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -778411 sc-eQTL 1.64e-01 -0.198 0.142 0.068 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0017 0.0916 0.068 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -410048 sc-eQTL 4.50e-01 0.119 0.157 0.068 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 3.27e-01 0.146 0.149 0.068 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -389338 sc-eQTL 9.16e-02 -0.285 0.168 0.068 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 4.96e-01 0.0813 0.119 0.068 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0171 0.0715 0.068 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 3.39e-01 -0.135 0.141 0.068 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 1.82e-03 -0.419 0.133 0.069 NK L1
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0383 0.124 0.069 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 3.18e-01 -0.169 0.169 0.069 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0931 0.0696 0.069 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0477 0.138 0.068 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 3.47e-01 0.162 0.172 0.068 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 6.30e-02 0.309 0.165 0.068 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 3.54e-01 0.0613 0.066 0.068 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 8.90e-01 -0.025 0.181 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -76758 sc-eQTL 1.57e-01 -0.27 0.19 0.066 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 1.45e-01 -0.26 0.178 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 6.81e-01 0.0815 0.198 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 1.43e-01 0.279 0.189 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 2.25e-01 -0.124 0.102 0.066 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 2.30e-01 0.214 0.178 0.066 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 192829 sc-eQTL 8.04e-02 -0.297 0.169 0.066 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -76758 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0915 0.169 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0903 0.111 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 2.58e-01 -0.191 0.168 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 1.68e-01 0.23 0.166 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 2.56e-01 -0.116 0.102 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 1.43e-01 -0.269 0.183 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 192829 sc-eQTL 3.60e-01 0.143 0.156 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -76758 sc-eQTL 3.91e-01 -0.146 0.17 0.069 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 8.61e-01 0.0234 0.134 0.069 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 9.18e-01 0.0177 0.172 0.069 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 3.26e-01 -0.172 0.175 0.069 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 6.39e-01 0.0396 0.0843 0.069 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 2.23e-01 -0.214 0.175 0.069 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 192829 sc-eQTL 1.90e-01 -0.215 0.163 0.069 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -76758 sc-eQTL 1.29e-01 -0.292 0.192 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0138 0.0843 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 7.62e-01 0.0458 0.151 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 6.67e-02 0.299 0.162 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0422 0.0931 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0282 0.18 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 192829 sc-eQTL 6.59e-02 0.218 0.118 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -76758 sc-eQTL 5.42e-01 -0.114 0.186 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0675 0.101 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.23e-01 0.12 0.187 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 8.88e-01 0.0262 0.186 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00925 0.0987 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 3.06e-01 -0.193 0.188 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 192829 sc-eQTL 9.60e-01 0.00655 0.131 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00844 0.191 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.08e-01 0.131 0.198 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 8.96e-01 0.0251 0.192 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0779 0.0887 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 7.51e-01 -0.057 0.179 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 1.05e-03 -0.463 0.139 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 1.93e-01 0.159 0.121 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 9.17e-01 0.0138 0.132 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 1.67e-01 -0.118 0.0855 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0738 0.165 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 4.29e-01 -0.125 0.158 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 3.57e-01 0.122 0.132 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 5.58e-01 0.0913 0.155 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0555 0.0806 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0219 0.187 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 6.57e-01 0.0814 0.183 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00745 0.169 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 3.11e-01 -0.178 0.176 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0197 0.0722 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 5.66e-02 -0.341 0.178 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 1.48e-01 0.218 0.15 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0401 0.155 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 3.23e-01 0.17 0.171 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 3.49e-01 0.0861 0.0917 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 1.23e-01 0.275 0.177 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 3.75e-03 -0.525 0.179 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 3.91e-02 0.302 0.146 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 4.97e-01 0.107 0.158 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 6.82e-01 -0.037 0.0903 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0242 0.181 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 9.88e-01 0.0029 0.187 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.49e-01 -0.112 0.187 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 3.80e-01 -0.163 0.185 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 6.57e-01 0.0402 0.0902 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 6.18e-01 0.0987 0.198 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0508 0.19 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0758 0.183 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 4.14e-01 0.155 0.189 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 5.03e-01 0.0683 0.102 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 5.72e-01 0.109 0.192 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0619 0.176 0.069 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.97e-01 0.0975 0.184 0.069 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 1.65e-02 0.427 0.177 0.069 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 5.02e-01 0.0592 0.088 0.069 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 7.59e-01 0.0568 0.185 0.069 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 3.74e-01 -0.164 0.184 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.77e-01 0.109 0.195 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 4.57e-01 -0.14 0.187 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 1.08e-01 -0.168 0.104 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 3.61e-04 -0.507 0.14 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 3.41e-01 -0.141 0.148 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0485 0.18 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 1.37e-01 -0.106 0.0712 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0426 0.183 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 1.40e-01 0.272 0.184 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 8.20e-02 -0.321 0.184 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 6.99e-02 -0.156 0.0854 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 6.87e-02 -0.291 0.159 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 6.48e-01 0.0757 0.165 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 5.33e-01 -0.112 0.18 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 2.10e-01 -0.122 0.0973 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -76758 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0259 0.177 0.085 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 5.75e-01 0.0831 0.148 0.085 PB L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 3.81e-01 0.176 0.2 0.085 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 2.70e-01 0.199 0.18 0.085 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0274 0.103 0.085 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0136 0.192 0.085 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 192829 sc-eQTL 7.02e-01 0.0484 0.126 0.085 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 9.93e-01 0.00133 0.163 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 4.59e-01 -0.136 0.183 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 7.02e-01 0.0668 0.174 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0742 0.0658 0.07 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0529 0.171 0.07 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 2.53e-02 -0.393 0.174 0.068 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 3.04e-01 0.186 0.181 0.068 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 4.85e-01 -0.104 0.148 0.068 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 8.07e-01 0.016 0.0656 0.068 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 1.92e-01 -0.241 0.185 0.068 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 1.98e-01 0.204 0.158 0.068 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -410048 sc-eQTL 3.74e-01 0.14 0.157 0.068 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.70e-02 0.389 0.203 0.068 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -389338 sc-eQTL 4.74e-01 -0.133 0.185 0.068 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 1.54e-01 0.257 0.18 0.068 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000392 0.0891 0.068 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 8.43e-01 0.035 0.177 0.068 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -778411 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00598 0.141 0.068 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 3.22e-01 -0.116 0.117 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -410048 sc-eQTL 5.06e-01 0.11 0.165 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.51e-02 0.313 0.162 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -389338 sc-eQTL 2.03e-01 -0.213 0.166 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 1.88e-01 0.176 0.133 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 8.72e-01 -0.012 0.0742 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 3.77e-01 -0.127 0.143 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 9.96e-01 0.000585 0.128 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -410048 sc-eQTL 3.13e-01 0.161 0.159 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.56e-01 -0.102 0.173 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -389338 sc-eQTL 8.10e-02 -0.301 0.172 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 9.03e-01 0.0138 0.113 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 8.26e-01 -0.018 0.0816 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 8.54e-01 0.0278 0.151 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 1.96e-01 -0.283 0.218 0.064 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.95e-01 0.125 0.235 0.064 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 4.31e-03 0.683 0.235 0.064 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 8.52e-01 0.0173 0.0923 0.064 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 3.32e-01 -0.231 0.238 0.064 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 7.43e-01 0.0574 0.175 0.069 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -410048 sc-eQTL 2.86e-01 0.189 0.176 0.069 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 9.78e-01 0.00548 0.194 0.069 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -389338 sc-eQTL 3.50e-01 -0.164 0.175 0.069 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 9.62e-01 0.00842 0.178 0.069 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0118 0.0774 0.069 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 5.95e-01 0.1 0.188 0.069 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 4.50e-01 0.0967 0.128 0.068 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -410048 sc-eQTL 5.41e-01 0.111 0.181 0.068 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 1.08e-01 -0.294 0.182 0.068 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -389338 sc-eQTL 2.66e-02 -0.396 0.177 0.068 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0838 0.172 0.068 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 7.79e-01 0.0244 0.0865 0.068 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 5.50e-01 0.0915 0.153 0.068 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 2.62e-01 0.167 0.149 0.065 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -410048 sc-eQTL 4.06e-01 0.125 0.15 0.065 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0409 0.21 0.065 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -389338 sc-eQTL 7.96e-01 0.0395 0.153 0.065 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 9.41e-02 -0.304 0.181 0.065 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0881 0.125 0.065 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0415 0.186 0.065 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -778411 sc-eQTL 5.30e-01 -0.112 0.178 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -76758 sc-eQTL 6.29e-02 -0.33 0.177 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0987 0.101 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 1.18e-01 -0.241 0.154 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 3.37e-01 0.153 0.159 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0905 0.0907 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 1.79e-01 -0.224 0.166 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 192829 sc-eQTL 4.09e-01 -0.133 0.161 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -76758 sc-eQTL 2.81e-01 -0.206 0.191 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0636 0.0783 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 7.16e-01 0.0536 0.147 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 1.04e-01 0.247 0.151 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0348 0.0921 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0954 0.174 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 192829 sc-eQTL 2.71e-01 0.122 0.11 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0675 0.0984 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -410048 sc-eQTL 3.47e-01 0.151 0.16 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 8.64e-02 0.264 0.153 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -389338 sc-eQTL 1.59e-01 -0.236 0.167 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 3.52e-01 0.103 0.11 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0417 0.0758 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0864 0.135 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 3.03e-01 0.125 0.121 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -410048 sc-eQTL 8.07e-01 0.0435 0.178 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0992 0.173 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -389338 sc-eQTL 4.57e-02 -0.352 0.175 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 9.37e-01 0.0132 0.167 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 7.47e-01 0.0228 0.0707 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -488622 sc-eQTL 6.52e-01 0.0773 0.171 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -188481 sc-eQTL 2.28e-03 -0.412 0.133 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 696475 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0449 0.132 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -438742 sc-eQTL 3.77e-01 -0.153 0.172 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -489852 sc-eQTL 9.59e-02 -0.117 0.07 0.069 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 -76758 eQTL 0.00329 -0.182 0.0617 0.0 0.0 0.0594
ENSG00000079950 STX7 -188481 pQTL 0.0152 -0.114 0.047 0.0 0.0 0.0625
ENSG00000112299 VNN1 -389338 eQTL 0.0197 0.104 0.0446 0.0 0.0 0.0594


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 -76758 1.51e-05 2.01e-05 2.73e-06 1.11e-05 2.58e-06 6.65e-06 2.29e-05 3.36e-06 1.74e-05 7.94e-06 2.11e-05 7.82e-06 3.19e-05 7.19e-06 4.83e-06 9.99e-06 8.74e-06 1.41e-05 4.21e-06 4.2e-06 7.66e-06 1.73e-05 1.64e-05 4.73e-06 2.73e-05 5.34e-06 7.98e-06 7.68e-06 1.75e-05 1.48e-05 1.19e-05 1.19e-06 1.45e-06 4.07e-06 7.35e-06 3.35e-06 1.79e-06 2.38e-06 3.21e-06 2.23e-06 1.14e-06 2.34e-05 2.7e-06 2.62e-07 1.29e-06 2.35e-06 2.02e-06 8.65e-07 6.24e-07