logo

Genes within 1Mb (chr6:132308234:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -93241 sc-eQTL 1.40e-03 -0.606 0.187 0.062 B L1
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 3.41e-03 0.21 0.0708 0.062 B L1
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 8.55e-02 -0.247 0.143 0.062 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 5.28e-01 0.0858 0.136 0.062 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 6.64e-02 -0.15 0.0815 0.062 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0532 0.173 0.062 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 176346 sc-eQTL 1.62e-01 0.159 0.113 0.062 B L1
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 3.26e-02 0.293 0.136 0.062 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00804 0.109 0.062 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 5.89e-03 0.326 0.117 0.062 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 1.42e-01 -0.119 0.0806 0.062 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 4.78e-01 0.116 0.164 0.062 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 7.83e-02 0.238 0.134 0.062 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0388 0.133 0.062 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 1.72e-01 0.215 0.157 0.062 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 2.59e-02 -0.12 0.0534 0.062 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 7.16e-01 0.0594 0.163 0.062 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 7.00e-01 0.0481 0.125 0.063 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -426531 sc-eQTL 4.77e-01 -0.11 0.154 0.063 DC L1
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 4.13e-01 0.149 0.181 0.063 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -405821 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0766 0.167 0.063 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 3.35e-02 0.378 0.176 0.063 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 1.47e-03 -0.315 0.0975 0.063 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 1.18e-01 0.247 0.157 0.063 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -794894 sc-eQTL 8.09e-02 0.251 0.143 0.063 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 1.77e-02 0.221 0.0926 0.062 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -426531 sc-eQTL 8.88e-01 0.0227 0.161 0.062 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 9.78e-04 -0.499 0.149 0.062 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -405821 sc-eQTL 3.14e-01 0.175 0.173 0.062 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 7.35e-02 0.218 0.121 0.062 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 7.13e-02 -0.132 0.0727 0.062 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 6.38e-01 0.0683 0.145 0.062 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 1.53e-01 0.198 0.138 0.062 NK L1
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0529 0.126 0.062 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 6.31e-01 0.0827 0.172 0.062 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0582 0.0712 0.062 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 1.91e-01 0.182 0.138 0.062 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 8.40e-01 0.0352 0.174 0.062 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 4.14e-01 0.137 0.168 0.062 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0649 0.0665 0.062 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 5.21e-01 -0.117 0.182 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -93241 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00744 0.184 0.066 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 2.23e-01 0.21 0.172 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 2.70e-01 -0.211 0.191 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 5.57e-01 -0.108 0.184 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0209 0.0984 0.066 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 4.81e-01 -0.122 0.172 0.066 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 176346 sc-eQTL 2.83e-03 0.485 0.16 0.066 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -93241 sc-eQTL 3.49e-01 -0.163 0.174 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 7.64e-02 0.201 0.113 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 2.14e-01 -0.215 0.173 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 3.11e-01 -0.174 0.171 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0844 0.105 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 7.50e-01 0.0604 0.189 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 176346 sc-eQTL 2.32e-01 0.192 0.16 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -93241 sc-eQTL 6.26e-01 0.0847 0.174 0.06 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 6.06e-02 0.255 0.135 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 9.18e-01 0.018 0.176 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 2.91e-01 -0.188 0.178 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 1.21e-01 -0.133 0.0854 0.06 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 6.18e-02 0.334 0.178 0.06 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 176346 sc-eQTL 1.55e-01 0.237 0.166 0.06 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -93241 sc-eQTL 3.18e-02 -0.426 0.197 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 4.48e-03 0.245 0.0853 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0509 0.156 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 9.81e-01 0.00396 0.169 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 1.37e-01 -0.143 0.0957 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 5.15e-01 0.121 0.185 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 176346 sc-eQTL 4.75e-01 0.0879 0.123 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -93241 sc-eQTL 1.88e-01 -0.244 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 2.88e-02 0.22 0.1 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 8.46e-02 -0.322 0.186 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 2.36e-01 0.22 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 9.80e-02 -0.162 0.0977 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 5.11e-01 -0.123 0.187 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 176346 sc-eQTL 5.82e-01 0.0717 0.13 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 1.54e-01 0.263 0.184 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 3.17e-01 -0.192 0.192 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 8.73e-01 0.0298 0.187 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 2.14e-01 -0.107 0.0858 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 1.80e-01 0.233 0.173 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 3.40e-01 0.142 0.148 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 1.52e-01 -0.181 0.126 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 1.19e-02 0.344 0.136 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0482 0.0893 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 6.21e-01 0.0851 0.172 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 1.43e-03 0.52 0.161 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 5.18e-01 0.0896 0.139 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 5.86e-02 0.307 0.161 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 3.44e-02 -0.178 0.0834 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 4.24e-01 0.156 0.195 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 1.23e-01 0.289 0.187 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 3.86e-01 0.15 0.173 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 4.47e-01 -0.137 0.18 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0967 0.0736 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 6.65e-01 0.0796 0.184 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 2.27e-01 0.189 0.156 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 6.90e-01 0.0641 0.161 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 3.89e-01 0.154 0.178 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0879 0.0951 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 2.70e-01 0.204 0.184 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 1.47e-01 0.271 0.186 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 4.64e-01 -0.11 0.15 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 4.34e-02 0.325 0.16 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 2.37e-01 -0.109 0.0922 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 3.95e-01 -0.158 0.185 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 8.85e-01 0.0271 0.188 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 2.68e-01 -0.209 0.188 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 7.61e-01 0.0566 0.186 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0397 0.0908 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 2.76e-01 0.217 0.198 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 5.23e-01 0.126 0.197 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 9.50e-01 0.0119 0.19 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 2.37e-01 0.232 0.195 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 9.42e-01 0.00762 0.106 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 9.58e-01 0.0105 0.199 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 1.50e-01 0.257 0.177 0.063 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 5.48e-01 0.112 0.186 0.063 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00302 0.181 0.063 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0917 0.089 0.063 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 3.76e-01 0.165 0.187 0.063 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 5.17e-02 0.358 0.183 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 3.66e-01 -0.176 0.195 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 7.88e-01 0.0505 0.188 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0955 0.104 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 2.10e-01 0.184 0.147 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 5.31e-01 -0.095 0.151 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 5.12e-01 0.121 0.184 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0618 0.073 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 5.05e-01 0.123 0.184 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 7.51e-01 0.059 0.186 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 4.14e-01 -0.152 0.186 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0493 0.0866 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0949 0.16 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00455 0.165 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 5.40e-01 0.11 0.18 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0433 0.0976 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -93241 sc-eQTL 8.62e-02 -0.323 0.187 0.074 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 2.97e-01 -0.165 0.157 0.074 PB L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 2.84e-02 0.467 0.21 0.074 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 3.43e-01 0.183 0.192 0.074 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 4.64e-01 0.0802 0.109 0.074 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 4.31e-01 -0.162 0.205 0.074 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 176346 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0272 0.135 0.074 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 1.95e-01 0.215 0.165 0.063 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0259 0.187 0.063 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 4.17e-01 -0.145 0.178 0.063 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 1.17e-02 -0.169 0.0664 0.063 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0896 0.174 0.063 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 6.62e-01 0.0809 0.185 0.062 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 2.42e-01 -0.222 0.189 0.062 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 7.10e-01 0.0579 0.155 0.062 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0618 0.0687 0.062 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0958 0.194 0.062 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 3.99e-01 0.133 0.157 0.066 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -426531 sc-eQTL 7.13e-01 0.0578 0.157 0.066 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00105 0.204 0.066 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -405821 sc-eQTL 7.82e-01 -0.051 0.184 0.066 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 1.84e-01 0.238 0.179 0.066 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 4.32e-02 -0.178 0.0876 0.066 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 5.55e-01 0.104 0.175 0.066 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -794894 sc-eQTL 8.34e-01 0.0295 0.14 0.066 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 5.02e-02 0.242 0.123 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -426531 sc-eQTL 6.75e-01 0.0735 0.175 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 1.80e-03 -0.535 0.169 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -405821 sc-eQTL 4.88e-01 0.123 0.177 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 6.51e-02 0.26 0.14 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 2.92e-02 -0.171 0.0777 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 1.69e-01 0.208 0.151 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 4.10e-01 0.11 0.133 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -426531 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0573 0.167 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 1.83e-01 -0.241 0.18 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -405821 sc-eQTL 3.86e-01 0.157 0.181 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 1.75e-01 0.161 0.118 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0915 0.0852 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 1.43e-01 -0.231 0.157 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 2.58e-01 0.232 0.204 0.07 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0972 0.22 0.07 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 7.62e-01 0.0689 0.227 0.07 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0768 0.0863 0.07 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 8.47e-02 -0.384 0.221 0.07 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 1.13e-01 0.283 0.178 0.058 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -426531 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0702 0.181 0.058 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 5.39e-01 -0.122 0.198 0.058 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -405821 sc-eQTL 2.24e-01 0.217 0.178 0.058 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 7.23e-01 0.0645 0.181 0.058 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 2.22e-02 -0.18 0.0779 0.058 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 6.98e-01 0.0747 0.192 0.058 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 1.75e-01 0.18 0.132 0.059 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -426531 sc-eQTL 4.08e-01 0.155 0.187 0.059 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 2.05e-01 0.24 0.189 0.059 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -405821 sc-eQTL 4.54e-01 0.139 0.186 0.059 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 4.67e-01 0.13 0.179 0.059 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0168 0.0897 0.059 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 3.27e-01 -0.155 0.158 0.059 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 3.23e-01 -0.145 0.146 0.065 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -426531 sc-eQTL 3.72e-01 -0.131 0.147 0.065 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 3.93e-01 -0.176 0.205 0.065 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -405821 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0658 0.15 0.065 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 1.98e-01 0.229 0.177 0.065 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 2.05e-02 -0.283 0.121 0.065 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 2.79e-03 0.537 0.177 0.065 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -794894 sc-eQTL 4.04e-01 0.145 0.174 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -93241 sc-eQTL 7.61e-01 -0.056 0.184 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 4.36e-02 0.209 0.103 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 1.17e-01 -0.25 0.158 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 3.25e-01 -0.162 0.164 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 1.68e-01 -0.129 0.0935 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 1.16e-01 0.27 0.171 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 176346 sc-eQTL 5.84e-03 0.455 0.163 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -93241 sc-eQTL 1.02e-02 -0.506 0.195 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 3.38e-03 0.236 0.0798 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 1.74e-01 -0.208 0.152 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 3.73e-01 0.141 0.158 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 1.00e-01 -0.157 0.095 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 8.84e-01 0.0263 0.18 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 176346 sc-eQTL 4.23e-01 0.0919 0.114 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 2.11e-02 0.233 0.1 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -426531 sc-eQTL 7.65e-01 0.0495 0.165 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 1.14e-03 -0.512 0.155 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -405821 sc-eQTL 2.47e-01 0.2 0.172 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 2.56e-02 0.254 0.113 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 1.78e-02 -0.184 0.0772 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 5.75e-01 0.0782 0.139 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 9.81e-02 0.204 0.123 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -426531 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0154 0.182 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0436 0.177 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -405821 sc-eQTL 1.88e-01 0.237 0.18 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 4.50e-01 0.129 0.17 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0538 0.0721 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -505105 sc-eQTL 5.42e-01 -0.107 0.175 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -204964 sc-eQTL 2.98e-01 0.145 0.138 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 679992 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0236 0.135 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -455225 sc-eQTL 6.17e-01 0.088 0.176 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -506335 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0499 0.0716 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -204964 eQTL 6.5e-16 0.235 0.0286 0.0 0.0 0.0785
ENSG00000118523 CCN2 356862 pQTL 0.00664 -0.107 0.0395 0.0 0.0 0.0798
ENSG00000154269 ENPP3 679792 eQTL 0.0226 -0.104 0.0455 0.00158 0.0 0.0785

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -204964 1.92e-06 2.44e-06 2.71e-07 1.7e-06 4.37e-07 7.98e-07 1.55e-06 4.99e-07 1.72e-06 8.15e-07 2.11e-06 1.38e-06 3.49e-06 1.11e-06 5.01e-07 1.19e-06 9.79e-07 1.79e-06 6.34e-07 8.94e-07 9e-07 2.31e-06 2.02e-06 9.91e-07 3.46e-06 1.29e-06 1.11e-06 1.42e-06 1.8e-06 1.67e-06 1.29e-06 2.48e-07 4.16e-07 1.08e-06 9.38e-07 8.66e-07 7.71e-07 4.62e-07 7.83e-07 3.28e-07 3.05e-07 3.26e-06 4.14e-07 1.89e-07 3.99e-07 3.47e-07 4.08e-07 2.19e-07 2.23e-07