Genes within 1Mb (chr6:132308043:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -93432 sc-eQTL 3.09e-01 0.138 0.135 0.128 B L1
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 1.19e-01 0.0796 0.0509 0.128 B L1
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 1.84e-02 0.239 0.101 0.128 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 1.23e-01 -0.148 0.0956 0.128 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0125 0.0581 0.128 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 5.77e-01 0.0683 0.122 0.128 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 176155 sc-eQTL 3.17e-03 -0.235 0.0787 0.128 B L1
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0765 0.0982 0.128 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 5.18e-01 0.0505 0.078 0.128 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0437 0.0852 0.128 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00205 0.0579 0.128 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 2.78e-02 0.257 0.116 0.128 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 9.10e-02 0.164 0.0969 0.128 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 2.60e-01 0.108 0.0958 0.128 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 7.84e-01 0.0313 0.114 0.128 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0151 0.0389 0.128 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 3.21e-01 -0.117 0.117 0.128 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 1.38e-01 0.135 0.0905 0.126 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -426722 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0119 0.113 0.126 DC L1
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0433 0.132 0.126 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -406012 sc-eQTL 1.86e-01 0.161 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 7.73e-01 0.0377 0.13 0.126 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 7.10e-01 0.0272 0.0731 0.126 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 9.39e-01 0.00884 0.116 0.126 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -795085 sc-eQTL 5.39e-01 0.0648 0.105 0.126 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 1.48e-02 -0.164 0.0668 0.128 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -426722 sc-eQTL 2.56e-01 -0.132 0.116 0.128 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 3.21e-01 0.11 0.11 0.128 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -406012 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0382 0.125 0.128 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 4.13e-01 0.0723 0.0882 0.128 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 3.10e-01 0.0538 0.0528 0.128 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0425 0.105 0.128 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 7.10e-01 0.0385 0.103 0.127 NK L1
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 1.88e-01 0.125 0.0942 0.127 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0656 0.129 0.127 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 5.04e-01 0.0356 0.0532 0.127 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 5.77e-01 0.057 0.102 0.128 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 1.96e-01 -0.165 0.127 0.128 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 3.68e-01 -0.111 0.123 0.128 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0149 0.0489 0.128 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 6.63e-01 0.0584 0.134 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -93432 sc-eQTL 3.58e-01 0.13 0.141 0.13 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0769 0.133 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0116 0.147 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 7.19e-01 0.0509 0.141 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0575 0.0756 0.13 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 2.47e-02 0.296 0.131 0.13 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 176155 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0163 0.127 0.13 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -93432 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0397 0.124 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 2.40e-01 0.0957 0.0812 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 2.65e-01 0.138 0.124 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 1.17e-01 -0.192 0.122 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 8.59e-01 0.0134 0.0751 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0915 0.135 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 176155 sc-eQTL 2.77e-02 -0.252 0.114 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -93432 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0887 0.125 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0201 0.0978 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00281 0.126 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 9.31e-01 0.011 0.128 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0541 0.0616 0.129 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 4.40e-01 0.0993 0.129 0.129 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 176155 sc-eQTL 2.75e-02 -0.263 0.119 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -93432 sc-eQTL 6.28e-01 0.0694 0.143 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 7.05e-01 0.0237 0.0626 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 2.48e-01 0.13 0.112 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 2.18e-01 -0.15 0.121 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 5.19e-01 0.0447 0.0692 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00633 0.134 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 176155 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0866 0.0883 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -93432 sc-eQTL 4.42e-01 0.105 0.137 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0169 0.0745 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 1.49e-01 0.198 0.137 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0283 0.137 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0195 0.0724 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 9.13e-01 0.0152 0.138 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 176155 sc-eQTL 1.66e-02 -0.228 0.0945 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 7.82e-01 0.0378 0.137 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 6.11e-01 0.0724 0.142 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0714 0.138 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 5.20e-01 0.041 0.0637 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 5.59e-01 0.0751 0.129 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 2.48e-01 0.123 0.106 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 8.55e-01 0.0166 0.0907 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000536 0.0985 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0437 0.0638 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 1.09e-01 0.197 0.122 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 1.35e-02 -0.286 0.115 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 5.97e-01 0.0519 0.0979 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000621 0.115 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 5.36e-01 0.0368 0.0595 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 3.57e-01 0.127 0.138 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 6.79e-01 0.0555 0.134 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 7.22e-01 0.044 0.124 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 2.95e-01 -0.135 0.128 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 9.91e-01 0.000604 0.0528 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 2.22e-01 0.16 0.131 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 5.47e-01 0.0673 0.112 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 9.04e-01 0.0139 0.115 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0524 0.127 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 8.60e-01 -0.012 0.068 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 8.99e-01 0.0167 0.132 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 2.28e-01 0.164 0.135 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 6.58e-01 0.0483 0.109 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 4.93e-01 0.0804 0.117 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0167 0.0671 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 2.02e-01 -0.172 0.134 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0499 0.134 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0751 0.134 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0909 0.133 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0883 0.0645 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0285 0.142 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0232 0.141 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 8.76e-01 0.0211 0.135 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 5.58e-01 0.0821 0.14 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 5.72e-01 0.0425 0.0752 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0452 0.142 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 3.91e-01 -0.112 0.13 0.13 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 2.23e-01 -0.166 0.136 0.13 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 9.10e-01 -0.015 0.132 0.13 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0533 0.0649 0.13 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 5.42e-01 0.0832 0.136 0.13 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 6.78e-01 -0.057 0.137 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 1.34e-01 0.217 0.144 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 6.03e-01 0.0724 0.139 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 9.72e-01 0.00271 0.0775 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 2.92e-01 0.117 0.111 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 7.42e-01 0.0377 0.114 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 2.81e-01 -0.15 0.139 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 1.71e-01 0.0757 0.055 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 9.87e-01 0.00228 0.135 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 8.47e-01 0.0264 0.137 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 1.58e-01 0.193 0.136 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 3.69e-01 0.0574 0.0636 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 8.62e-01 0.0215 0.123 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 7.17e-01 0.0463 0.127 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 3.25e-01 -0.136 0.138 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 6.61e-01 0.033 0.0752 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -93432 sc-eQTL 1.39e-01 0.243 0.163 0.104 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 9.02e-01 0.017 0.138 0.104 PB L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 3.06e-01 -0.192 0.186 0.104 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 3.40e-01 0.16 0.167 0.104 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00447 0.0954 0.104 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 9.55e-01 0.0102 0.179 0.104 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 176155 sc-eQTL 5.29e-01 0.0741 0.117 0.104 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 5.86e-01 0.0658 0.121 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 2.10e-01 -0.17 0.135 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00692 0.13 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 9.21e-02 0.0824 0.0487 0.124 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 8.34e-02 -0.219 0.126 0.124 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0962 0.131 0.128 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 6.13e-01 0.068 0.134 0.128 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0346 0.11 0.128 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0476 0.0486 0.128 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 1.07e-01 0.221 0.137 0.128 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 3.37e-01 0.112 0.116 0.127 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -426722 sc-eQTL 3.94e-01 0.0986 0.115 0.127 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 4.46e-01 -0.115 0.15 0.127 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -406012 sc-eQTL 1.38e-01 0.201 0.135 0.127 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 3.65e-01 0.12 0.132 0.127 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 8.04e-01 0.0162 0.0654 0.127 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 9.23e-01 0.0125 0.13 0.127 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -795085 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00198 0.104 0.127 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 2.39e-01 -0.102 0.0864 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -426722 sc-eQTL 3.06e-01 -0.125 0.122 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 2.02e-01 0.154 0.121 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -406012 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0955 0.123 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 4.07e-01 -0.082 0.0987 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 2.97e-01 0.0573 0.0548 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0295 0.106 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 9.19e-03 -0.243 0.0926 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -426722 sc-eQTL 3.85e-01 -0.102 0.117 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 7.40e-01 0.0424 0.128 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -406012 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0297 0.128 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 1.74e-01 0.114 0.0832 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 4.03e-01 0.0503 0.0601 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 7.54e-01 0.0349 0.111 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 4.23e-01 -0.124 0.155 0.124 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0649 0.166 0.124 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0654 0.171 0.124 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 3.44e-01 0.0618 0.0651 0.124 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 8.23e-01 0.0378 0.169 0.124 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 5.15e-01 0.0821 0.126 0.129 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -426722 sc-eQTL 7.98e-01 0.0325 0.127 0.129 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 5.07e-01 0.0927 0.14 0.129 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -406012 sc-eQTL 3.04e-01 -0.129 0.125 0.129 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0099 0.128 0.129 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 8.06e-01 0.0137 0.0556 0.129 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 4.27e-01 -0.108 0.135 0.129 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00327 0.0915 0.133 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -426722 sc-eQTL 2.02e-01 0.165 0.129 0.133 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 4.07e-01 -0.109 0.131 0.133 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -406012 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0275 0.128 0.133 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 1.87e-01 0.162 0.123 0.133 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 3.19e-02 -0.132 0.0611 0.133 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 6.74e-01 0.046 0.109 0.133 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 1.59e-01 0.15 0.106 0.127 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -426722 sc-eQTL 6.56e-02 -0.197 0.106 0.127 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0793 0.15 0.127 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -406012 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0521 0.109 0.127 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 7.87e-01 0.0353 0.13 0.127 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 3.30e-01 0.0876 0.0895 0.127 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0434 0.133 0.127 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -795085 sc-eQTL 1.89e-01 0.167 0.127 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -93432 sc-eQTL 6.94e-01 0.0518 0.132 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 5.04e-01 0.0499 0.0746 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 1.39e-01 0.169 0.114 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 3.92e-01 -0.101 0.118 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00171 0.0673 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 5.55e-01 0.073 0.123 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 176155 sc-eQTL 1.22e-02 -0.297 0.117 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -93432 sc-eQTL 3.28e-01 0.139 0.142 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 8.17e-01 0.0136 0.0584 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 5.06e-02 0.214 0.109 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 2.69e-01 -0.125 0.113 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 6.63e-01 0.03 0.0686 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0376 0.129 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 176155 sc-eQTL 1.82e-02 -0.193 0.0812 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 3.10e-02 -0.156 0.0718 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -426722 sc-eQTL 2.32e-01 -0.141 0.118 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 1.66e-01 0.157 0.113 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -406012 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0559 0.123 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 6.80e-01 0.0337 0.0816 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 2.57e-01 0.0634 0.0558 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0104 0.0996 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 9.78e-01 0.00242 0.088 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -426722 sc-eQTL 6.62e-01 0.0567 0.129 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 8.30e-01 -0.027 0.126 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -406012 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0816 0.128 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 4.82e-01 0.085 0.121 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 3.60e-01 -0.047 0.0512 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -505296 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0548 0.125 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -205155 sc-eQTL 7.44e-01 0.0343 0.105 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 679801 sc-eQTL 3.76e-01 0.0903 0.102 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -455416 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0784 0.133 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -506526 sc-eQTL 2.60e-01 0.0612 0.0542 0.123 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -205155 eQTL 0.00493 -0.0673 0.0239 0.0 0.0 0.13
ENSG00000112306 RPS12 -506526 eQTL 0.0231 -0.0207 0.00908 0.00235 0.0 0.13
ENSG00000118523 CCN2 356671 pQTL 0.0312 -0.0701 0.0325 0.0 0.0 0.123


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000228495 \N 176128 2.22e-06 2.46e-06 3.2e-07 1.68e-06 5.29e-07 8.62e-07 1.78e-06 6.85e-07 1.85e-06 9.61e-07 2.49e-06 1.35e-06 3.27e-06 1.44e-06 8.73e-07 1.62e-06 1.14e-06 2.23e-06 1.09e-06 1.28e-06 1.19e-06 2.9e-06 2.35e-06 9.73e-07 3.46e-06 1.36e-06 1.29e-06 1.79e-06 2.07e-06 1.85e-06 1.65e-06 3.44e-07 5.68e-07 1.25e-06 1.31e-06 1.01e-06 8.28e-07 4.46e-07 1.13e-06 4.16e-07 2.08e-07 3.36e-06 4.36e-07 1.96e-07 2.88e-07 3.24e-07 8.08e-07 1.95e-07 2.04e-07