logo

Genes within 1Mb (chr6:132285106:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -116369 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0902 0.107 0.205 B L1
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 8.94e-01 0.0054 0.0405 0.205 B L1
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 3.73e-01 -0.072 0.0806 0.205 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 1.70e-01 0.105 0.0759 0.205 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0247 0.046 0.205 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 7.84e-01 0.0266 0.0969 0.205 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 153218 sc-eQTL 5.67e-01 0.0365 0.0636 0.205 B L1
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 1.44e-01 -0.115 0.0787 0.205 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 5.85e-01 0.0343 0.0627 0.205 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 8.94e-01 0.00918 0.0685 0.205 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 4.86e-01 0.0324 0.0465 0.205 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 2.85e-01 0.101 0.094 0.205 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 7.92e-02 -0.135 0.0767 0.205 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 7.24e-01 0.027 0.0761 0.205 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 6.60e-01 0.0398 0.0902 0.205 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 1.12e-01 0.049 0.0307 0.205 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0144 0.0932 0.205 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0258 0.0703 0.2 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -449659 sc-eQTL 2.44e-01 0.102 0.0869 0.2 DC L1
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0317 0.102 0.2 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -428949 sc-eQTL 5.97e-01 0.0498 0.0941 0.2 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 2.02e-01 -0.128 0.1 0.2 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0604 0.0563 0.2 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 6.85e-01 0.0362 0.0893 0.2 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -818022 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0533 0.0812 0.2 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 7.03e-01 0.0204 0.0536 0.205 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -449659 sc-eQTL 7.46e-01 0.0298 0.0919 0.205 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 2.21e-01 0.107 0.087 0.205 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -428949 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00311 0.0989 0.205 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0471 0.0698 0.205 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0223 0.0418 0.205 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0221 0.0828 0.205 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00888 0.0806 0.204 NK L1
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0843 0.0735 0.204 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0185 0.1 0.204 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0206 0.0415 0.204 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0176 0.0795 0.205 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 2.24e-01 0.121 0.0989 0.205 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 6.17e-02 0.179 0.0954 0.205 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 3.24e-01 0.0376 0.038 0.205 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 8.94e-01 0.0139 0.104 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -116369 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0747 0.114 0.189 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0559 0.107 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 3.79e-01 0.105 0.119 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0367 0.114 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 5.66e-01 0.0352 0.0612 0.189 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 5.01e-01 0.0722 0.107 0.189 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 153218 sc-eQTL 6.60e-01 0.0451 0.102 0.189 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -116369 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0577 0.099 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0563 0.0647 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 1.96e-01 -0.128 0.0982 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0103 0.0976 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 8.74e-01 0.00947 0.0598 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 8.65e-01 0.0184 0.108 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 153218 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0314 0.0915 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -116369 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0642 0.0993 0.207 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0312 0.0779 0.207 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0331 0.1 0.207 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 5.71e-01 0.0578 0.102 0.207 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 4.49e-01 0.0372 0.0491 0.207 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 2.73e-02 -0.225 0.101 0.207 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 153218 sc-eQTL 6.80e-01 0.0395 0.0955 0.207 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -116369 sc-eQTL 4.60e-01 -0.083 0.112 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 3.56e-01 0.0454 0.049 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 4.20e-01 -0.071 0.0878 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 1.52e-01 0.137 0.0949 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0508 0.0542 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0307 0.105 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 153218 sc-eQTL 4.65e-01 0.0507 0.0693 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -116369 sc-eQTL 1.71e-01 -0.144 0.105 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 8.79e-01 0.00877 0.0575 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 3.45e-01 0.1 0.106 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 7.10e-01 0.0393 0.105 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0284 0.0558 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 6.89e-01 0.0426 0.107 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 153218 sc-eQTL 8.17e-02 -0.128 0.0733 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 4.27e-01 0.0858 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0434 0.112 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0112 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 5.62e-01 0.0293 0.0503 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0351 0.102 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 4.60e-02 -0.168 0.0836 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 1.39e-01 0.106 0.0717 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 4.15e-01 0.0638 0.0781 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 4.94e-01 0.0347 0.0507 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 2.94e-01 0.102 0.0974 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0816 0.0923 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 6.16e-01 -0.039 0.0777 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 7.22e-01 0.0325 0.0912 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 5.38e-01 0.0291 0.0472 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 1.32e-01 0.165 0.109 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 4.85e-01 0.0748 0.107 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 4.74e-01 0.0706 0.0984 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0568 0.103 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 8.13e-01 0.00997 0.0421 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 2.46e-01 -0.121 0.104 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0633 0.0898 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 2.70e-01 0.102 0.0918 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 8.53e-01 0.0189 0.102 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 9.91e-01 0.000602 0.0546 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0421 0.106 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0515 0.107 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 6.27e-01 0.042 0.0863 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 3.87e-01 0.0802 0.0925 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 1.36e-02 0.13 0.0523 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0321 0.106 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0131 0.11 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 9.12e-01 0.0123 0.111 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 8.61e-01 0.0192 0.11 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 5.53e-01 0.0317 0.0534 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 8.50e-01 0.0221 0.117 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0883 0.111 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 3.36e-01 -0.103 0.107 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 4.92e-01 0.076 0.11 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 8.76e-01 -0.00928 0.0595 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 5.65e-01 0.0648 0.112 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0245 0.101 0.206 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 1.06e-01 0.171 0.105 0.206 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 5.18e-01 0.0666 0.103 0.206 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00758 0.0506 0.206 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 9.15e-01 0.0113 0.106 0.206 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 1.64e-01 0.148 0.106 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 2.71e-01 -0.124 0.112 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 7.20e-01 0.0388 0.108 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0195 0.0602 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0931 0.0864 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0608 0.089 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 9.35e-01 0.00888 0.108 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0275 0.043 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0833 0.103 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 9.06e-01 0.0124 0.105 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0187 0.105 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0269 0.0488 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 5.57e-01 0.0548 0.0933 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0759 0.0964 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00656 0.105 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0099 0.057 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -116369 sc-eQTL 3.56e-01 0.105 0.113 0.204 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 5.59e-01 0.0556 0.095 0.204 PB L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 9.80e-01 0.00327 0.129 0.204 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 5.63e-01 0.0672 0.116 0.204 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 7.24e-01 0.0234 0.0659 0.204 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 8.31e-01 0.0264 0.124 0.204 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 153218 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0459 0.0812 0.204 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 2.62e-01 0.107 0.0947 0.204 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 2.82e-01 0.115 0.107 0.204 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 4.39e-01 0.0788 0.102 0.204 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 6.08e-01 0.0198 0.0385 0.204 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0589 0.0996 0.204 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 5.63e-01 0.059 0.102 0.205 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 4.95e-01 0.0715 0.105 0.205 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0496 0.0857 0.205 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 1.98e-01 0.0489 0.0378 0.205 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 1.89e-01 0.141 0.107 0.205 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 8.13e-01 0.0217 0.0916 0.198 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -449659 sc-eQTL 4.01e-01 0.0765 0.0908 0.198 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 9.95e-01 0.000804 0.118 0.198 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -428949 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0189 0.107 0.198 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 9.34e-01 0.00863 0.104 0.198 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0644 0.0512 0.198 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0382 0.102 0.198 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -818022 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0343 0.0814 0.198 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 5.73e-01 0.0387 0.0686 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -449659 sc-eQTL 5.53e-01 0.0576 0.097 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 6.90e-01 0.0383 0.0959 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -428949 sc-eQTL 1.54e-01 0.14 0.0975 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 8.24e-01 0.0174 0.0783 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0198 0.0435 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00303 0.0839 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 5.56e-01 0.0437 0.074 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -449659 sc-eQTL 8.28e-01 0.0201 0.0925 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 5.01e-01 0.0676 0.1 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -428949 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0407 0.1 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0731 0.0656 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 6.27e-01 0.0231 0.0474 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 2.17e-01 -0.108 0.0874 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 1.11e-01 0.181 0.113 0.212 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 5.86e-02 0.23 0.12 0.212 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 5.35e-02 0.242 0.124 0.212 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 6.76e-01 -0.02 0.0479 0.212 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 3.16e-01 0.124 0.123 0.212 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0471 0.101 0.2 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -449659 sc-eQTL 6.77e-01 0.0423 0.101 0.2 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0383 0.112 0.2 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -428949 sc-eQTL 4.24e-01 0.0802 0.1 0.2 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0523 0.102 0.2 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 9.30e-01 0.00389 0.0444 0.2 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0152 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 7.08e-01 0.0279 0.0743 0.197 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -449659 sc-eQTL 9.76e-01 0.00317 0.105 0.197 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 4.63e-01 0.078 0.106 0.197 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -428949 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0538 0.104 0.197 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 2.06e-01 -0.126 0.0998 0.197 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 9.43e-01 0.00362 0.0502 0.197 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 7.07e-02 0.16 0.088 0.197 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0422 0.0834 0.22 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -449659 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0412 0.084 0.22 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0784 0.117 0.22 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -428949 sc-eQTL 8.01e-01 0.0216 0.0855 0.22 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 2.01e-02 -0.235 0.1 0.22 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 1.11e-01 -0.111 0.0695 0.22 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0197 0.104 0.22 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -818022 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0716 0.0991 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -116369 sc-eQTL 3.15e-01 -0.106 0.105 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0381 0.0596 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 1.86e-01 -0.121 0.0909 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 7.04e-01 0.0358 0.0943 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 5.45e-01 0.0325 0.0537 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0643 0.0985 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 153218 sc-eQTL 2.79e-01 0.103 0.0949 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -116369 sc-eQTL 3.08e-01 -0.115 0.112 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 7.32e-01 0.0158 0.0462 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0512 0.0866 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 2.32e-01 0.107 0.0893 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0531 0.0541 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 9.89e-01 0.00143 0.102 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 153218 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0262 0.065 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 9.05e-01 0.00687 0.0576 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -449659 sc-eQTL 6.06e-01 0.0485 0.0939 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 4.30e-01 0.0712 0.0901 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -428949 sc-eQTL 4.89e-01 0.0678 0.0979 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0512 0.0647 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0104 0.0444 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0525 0.079 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 4.67e-01 0.0516 0.0708 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -449659 sc-eQTL 7.22e-01 0.0372 0.104 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 3.48e-01 0.0954 0.101 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -428949 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0693 0.103 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 6.75e-02 -0.178 0.0967 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 6.77e-01 0.0173 0.0413 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -528233 sc-eQTL 1.07e-01 0.162 0.0998 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -228092 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0353 0.081 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 656864 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0571 0.0785 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -478353 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0106 0.103 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -529463 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0183 0.0418 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 -116369 eQTL 0.000971 -0.127 0.0385 0.0 0.0 0.179
ENSG00000079950 STX7 -228092 pQTL 0.0199 -0.0662 0.0284 0.0 0.0 0.189
ENSG00000079950 STX7 -228092 eQTL 0.0439 -0.0412 0.0204 0.0 0.0 0.179
ENSG00000112303 VNN2 -478353 eQTL 0.0148 -0.0406 0.0166 0.0 0.0 0.179
ENSG00000118523 CCN2 333734 pQTL 0.0157 0.0636 0.0263 0.0 0.0 0.189
ENSG00000234484 AL032821.1 -467569 eQTL 0.0363 0.0839 0.04 0.0 0.0 0.179

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 -116369 1.26e-05 1.38e-05 3.08e-06 9.42e-06 2.33e-06 6.28e-06 2.01e-05 2.44e-06 1.74e-05 7.65e-06 2.19e-05 6.75e-06 2.87e-05 5.8e-06 4.5e-06 9e-06 8.09e-06 1.06e-05 4.11e-06 3.15e-06 6.92e-06 1.67e-05 1.12e-05 3.73e-06 2.45e-05 4.53e-06 7.6e-06 7.09e-06 1.51e-05 1.35e-05 1.24e-05 1.12e-06 1.3e-06 3.85e-06 6.34e-06 2.82e-06 1.77e-06 2e-06 2.66e-06 1.27e-06 9.58e-07 1.73e-05 1.61e-06 3.05e-07 8.04e-07 2.35e-06 1.87e-06 7.41e-07 6.07e-07