Genes within 1Mb (chr6:132244980:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -156495 sc-eQTL 3.05e-01 -0.113 0.11 0.216 B L1
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0199 0.0414 0.216 B L1
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 1.36e-01 -0.123 0.0822 0.216 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 1.64e-01 0.108 0.0776 0.216 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0301 0.0471 0.216 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0503 0.0991 0.216 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 113092 sc-eQTL 8.94e-01 0.0087 0.0651 0.216 B L1
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 3.22e-02 -0.169 0.0786 0.216 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 8.63e-01 0.0109 0.063 0.216 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 8.84e-01 0.0101 0.0688 0.216 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0276 0.0467 0.216 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 8.31e-01 0.0202 0.0946 0.216 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 2.68e-02 -0.171 0.0769 0.216 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0245 0.0766 0.216 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 6.56e-01 0.0405 0.0908 0.216 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 7.29e-01 0.0107 0.031 0.216 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00722 0.0938 0.216 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 6.75e-01 0.0306 0.0727 0.216 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -489785 sc-eQTL 1.53e-01 0.129 0.0897 0.216 DC L1
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0257 0.106 0.216 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -469075 sc-eQTL 9.52e-01 0.00593 0.0974 0.216 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0936 0.104 0.216 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00436 0.0584 0.216 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0203 0.0924 0.216 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -858148 sc-eQTL 1.20e-01 -0.131 0.0836 0.216 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 3.25e-01 0.0538 0.0545 0.216 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -489785 sc-eQTL 7.26e-01 0.0328 0.0937 0.216 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 2.01e-02 0.206 0.0879 0.216 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -469075 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0252 0.101 0.216 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 3.32e-01 -0.069 0.071 0.216 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0109 0.0426 0.216 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0157 0.0843 0.216 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 8.50e-01 0.0154 0.0813 0.215 NK L1
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 1.09e-01 -0.119 0.0738 0.215 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 7.12e-02 -0.182 0.1 0.215 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0126 0.0418 0.215 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0506 0.0816 0.216 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 3.15e-01 0.102 0.102 0.216 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 2.04e-02 0.228 0.0975 0.216 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 1.46e-01 0.0568 0.039 0.216 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 7.94e-01 0.028 0.107 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -156495 sc-eQTL 5.58e-01 0.0665 0.113 0.209 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 2.64e-01 -0.119 0.106 0.209 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0146 0.118 0.209 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 3.08e-01 0.115 0.113 0.209 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 6.82e-01 0.0249 0.0607 0.209 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0321 0.106 0.209 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 113092 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0585 0.101 0.209 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -156495 sc-eQTL 8.54e-01 0.0186 0.101 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 1.27e-01 -0.101 0.0656 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 1.17e-01 -0.157 0.0997 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0281 0.0993 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00458 0.0608 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0369 0.109 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 113092 sc-eQTL 9.65e-01 0.00409 0.0931 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -156495 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0451 0.101 0.218 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0529 0.0795 0.218 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0405 0.103 0.218 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 7.52e-01 0.033 0.104 0.218 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 2.06e-01 0.0634 0.05 0.218 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 2.14e-01 -0.13 0.104 0.218 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 113092 sc-eQTL 2.81e-01 -0.105 0.0973 0.218 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -156495 sc-eQTL 1.77e-01 -0.156 0.115 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 4.36e-01 0.0394 0.0504 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0548 0.0904 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 2.41e-01 0.115 0.0978 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0586 0.0557 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0622 0.108 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 113092 sc-eQTL 1.83e-01 0.0949 0.0711 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -156495 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0642 0.109 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 2.85e-01 0.0633 0.0591 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 7.48e-01 0.0352 0.109 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 7.90e-01 0.0291 0.109 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0372 0.0576 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 3.24e-01 -0.108 0.11 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 113092 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0874 0.076 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 4.32e-01 0.0862 0.109 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 4.71e-01 0.0822 0.114 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 5.43e-01 0.0673 0.11 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 8.73e-01 -0.00818 0.051 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 2.71e-01 -0.113 0.103 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 6.56e-03 -0.231 0.0841 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 6.73e-01 0.0309 0.0731 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 6.68e-01 0.034 0.0793 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0096 0.0515 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 7.53e-01 0.0312 0.099 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0323 0.0942 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0241 0.0792 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0231 0.0929 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0342 0.0481 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 1.70e-01 0.153 0.111 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0273 0.11 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0114 0.101 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0829 0.105 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0207 0.0431 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 4.17e-02 -0.218 0.106 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 6.91e-01 0.0365 0.0917 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0401 0.094 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0497 0.104 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0347 0.0557 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0884 0.108 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 3.62e-02 -0.229 0.109 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0408 0.0882 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 1.38e-01 0.14 0.0942 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 6.21e-02 0.101 0.0537 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 2.67e-01 -0.121 0.108 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0158 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 2.72e-01 0.123 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 1.86e-01 -0.146 0.11 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 3.48e-01 0.0507 0.0539 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 4.41e-01 0.0912 0.118 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0681 0.114 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 2.51e-01 -0.126 0.109 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 3.89e-01 0.0977 0.113 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 9.72e-01 0.00212 0.061 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 1.10e-01 0.184 0.115 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0628 0.103 0.219 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 4.13e-01 0.0881 0.107 0.219 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 8.81e-02 0.178 0.104 0.219 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 6.39e-01 0.0242 0.0514 0.219 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 9.34e-01 0.00897 0.108 0.219 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 3.79e-01 0.0946 0.107 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 1.11e-01 -0.181 0.113 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 4.21e-01 -0.088 0.109 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0568 0.0607 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0607 0.0869 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 1.34e-01 -0.134 0.0889 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 3.77e-01 -0.096 0.109 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0313 0.0431 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0606 0.105 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 3.01e-01 0.11 0.106 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 1.54e-01 -0.151 0.106 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0632 0.0493 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 6.38e-01 0.0444 0.0942 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0446 0.0974 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 1.14e-01 -0.167 0.105 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 6.39e-01 -0.027 0.0574 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -156495 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0103 0.114 0.23 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0623 0.0954 0.23 PB L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0227 0.13 0.23 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 3.66e-03 0.334 0.112 0.23 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 4.92e-01 0.0456 0.0661 0.23 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 9.42e-01 0.00903 0.124 0.23 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 113092 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00284 0.0817 0.23 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 4.66e-01 0.0718 0.0984 0.215 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 7.48e-01 0.0357 0.111 0.215 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 5.50e-01 0.0632 0.106 0.215 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 1.11e-01 0.0637 0.0397 0.215 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00903 0.103 0.215 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0402 0.104 0.216 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 6.70e-01 0.0457 0.107 0.216 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0408 0.0878 0.216 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 5.07e-01 0.0258 0.0388 0.216 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 1.39e-01 0.162 0.109 0.216 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 5.21e-01 0.0611 0.095 0.212 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -489785 sc-eQTL 1.21e-01 0.146 0.0938 0.212 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 8.42e-01 0.0245 0.123 0.212 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -469075 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0696 0.111 0.212 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 7.75e-01 0.0309 0.108 0.212 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0641 0.0532 0.212 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0378 0.106 0.212 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -858148 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0873 0.0843 0.212 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 4.05e-01 0.0579 0.0694 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -489785 sc-eQTL 5.72e-01 0.0555 0.0981 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 1.83e-02 0.228 0.0958 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -469075 sc-eQTL 4.74e-01 0.071 0.0989 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 7.85e-01 0.0216 0.0792 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 8.82e-01 0.00651 0.044 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 7.91e-01 0.0225 0.0848 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 5.28e-01 0.0478 0.0757 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -489785 sc-eQTL 5.33e-01 0.059 0.0945 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 5.99e-01 0.054 0.103 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -469075 sc-eQTL 9.17e-01 0.0107 0.103 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 4.48e-01 -0.051 0.0672 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00261 0.0484 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00732 0.0896 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0494 0.116 0.221 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 6.90e-01 0.0499 0.125 0.221 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 3.80e-02 0.266 0.127 0.221 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0282 0.0491 0.221 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 3.00e-01 0.132 0.126 0.221 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00307 0.104 0.213 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -489785 sc-eQTL 2.34e-01 0.125 0.105 0.213 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 7.83e-01 -0.032 0.116 0.213 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -469075 sc-eQTL 3.66e-01 0.094 0.104 0.213 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0806 0.106 0.213 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 7.53e-01 0.0145 0.046 0.213 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 2.40e-01 -0.132 0.112 0.213 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 3.02e-01 0.0774 0.0748 0.213 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -489785 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0481 0.106 0.213 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0568 0.107 0.213 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -469075 sc-eQTL 1.44e-01 -0.153 0.104 0.213 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 2.96e-01 -0.106 0.101 0.213 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 9.09e-01 0.0058 0.0506 0.213 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 1.58e-01 0.126 0.089 0.213 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 7.87e-01 0.0239 0.0882 0.232 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -489785 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0913 0.0885 0.232 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0185 0.124 0.232 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -469075 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0198 0.0904 0.232 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 1.38e-02 -0.263 0.105 0.232 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0819 0.0738 0.232 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0966 0.109 0.232 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -858148 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0906 0.105 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -156495 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0946 0.107 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 9.16e-02 -0.103 0.0605 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 8.34e-02 -0.161 0.0926 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 4.12e-01 0.0792 0.0963 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 5.19e-01 0.0355 0.0549 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0887 0.101 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 113092 sc-eQTL 9.71e-01 0.00352 0.0973 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -156495 sc-eQTL 2.86e-01 -0.123 0.115 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 7.90e-01 0.0126 0.0472 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0735 0.0885 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 1.71e-01 0.125 0.0912 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0614 0.0553 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0815 0.104 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 113092 sc-eQTL 6.57e-01 0.0296 0.0664 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 7.02e-01 0.0225 0.0589 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -489785 sc-eQTL 5.62e-01 0.0557 0.0959 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 1.93e-02 0.215 0.0911 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -469075 sc-eQTL 7.09e-01 0.0374 0.1 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0504 0.0661 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0149 0.0454 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0124 0.0808 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 1.36e-01 0.107 0.0713 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -489785 sc-eQTL 6.53e-01 0.0474 0.105 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 6.87e-01 0.0414 0.103 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -469075 sc-eQTL 2.72e-01 -0.115 0.104 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 1.44e-01 -0.144 0.098 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 4.65e-01 0.0306 0.0417 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -568359 sc-eQTL 8.62e-01 0.0177 0.101 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -268218 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0139 0.0815 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 616738 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0822 0.079 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -518479 sc-eQTL 8.69e-02 -0.176 0.102 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -569589 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0236 0.0421 0.216 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -268218 pQTL 0.00343 -0.0796 0.0272 0.0 0.0 0.211


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N -156495 3.21e-06 3.17e-06 3.38e-07 1.85e-06 5.12e-07 8.2e-07 2.18e-06 6.3e-07 2.13e-06 1.1e-06 2.48e-06 1.49e-06 3.69e-06 1.36e-06 9.23e-07 1.77e-06 1.32e-06 2.24e-06 9.86e-07 1.43e-06 1.1e-06 3.02e-06 2.54e-06 9.91e-07 3.75e-06 1.26e-06 1.36e-06 1.69e-06 2.18e-06 2.28e-06 1.94e-06 3.41e-07 5.36e-07 1.22e-06 1.06e-06 9.91e-07 8.32e-07 4.38e-07 9.39e-07 3.33e-07 2.88e-07 4.04e-06 6.27e-07 1.65e-07 3.52e-07 3.36e-07 4.87e-07 2.23e-07 2.21e-07
ENSG00000112306 \N -569589 3.77e-07 1.83e-07 6.86e-08 2.27e-07 1.08e-07 7.75e-08 2.5e-07 6.12e-08 1.86e-07 1.05e-07 1.86e-07 1.57e-07 2.55e-07 8.44e-08 6.2e-08 1.01e-07 5.27e-08 2.21e-07 7.27e-08 7.05e-08 1.23e-07 1.81e-07 1.75e-07 4.37e-08 2.28e-07 1.43e-07 1.25e-07 1.42e-07 1.39e-07 1.39e-07 1.26e-07 5.22e-08 4.23e-08 9.08e-08 4.78e-08 4.77e-08 5.1e-08 7.92e-08 6.45e-08 5.56e-08 6.07e-08 1.63e-07 3.13e-08 1.43e-08 6.21e-08 9.44e-09 7e-08 0.0 4.47e-08