logo

Genes within 1Mb (chr6:132240223:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -161252 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0973 0.111 0.192 B L1
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 9.52e-01 0.00251 0.0418 0.192 B L1
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0911 0.0831 0.192 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 1.03e-01 0.128 0.0781 0.192 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 5.56e-01 -0.028 0.0475 0.192 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0394 0.0999 0.192 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 108335 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0242 0.0656 0.192 B L1
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 1.19e-01 -0.126 0.0806 0.192 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 7.95e-01 0.0167 0.0643 0.192 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 7.62e-01 0.0213 0.0702 0.192 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 7.70e-01 -0.014 0.0477 0.192 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 7.32e-01 0.0331 0.0966 0.192 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 4.17e-02 -0.161 0.0785 0.192 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 9.24e-01 0.00747 0.0781 0.192 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0116 0.0925 0.192 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 5.03e-01 0.0212 0.0316 0.192 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0634 0.0955 0.192 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 7.44e-01 0.0239 0.0732 0.191 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -494542 sc-eQTL 6.37e-02 0.168 0.09 0.191 DC L1
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00384 0.107 0.191 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -473832 sc-eQTL 6.41e-01 0.0457 0.0979 0.191 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 2.86e-01 -0.112 0.105 0.191 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0581 0.0586 0.191 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0462 0.093 0.191 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -862905 sc-eQTL 1.20e-01 -0.131 0.0842 0.191 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 2.60e-01 0.0623 0.0552 0.192 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -494542 sc-eQTL 5.31e-01 0.0596 0.0949 0.192 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 8.65e-03 0.235 0.0888 0.192 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -473832 sc-eQTL 8.19e-01 0.0235 0.102 0.192 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0653 0.072 0.192 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00571 0.0432 0.192 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 5.28e-01 -0.054 0.0854 0.192 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 6.41e-01 0.0385 0.0824 0.191 NK L1
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0991 0.075 0.191 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 4.47e-02 -0.205 0.102 0.191 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 6.82e-01 0.0174 0.0424 0.191 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0638 0.0829 0.192 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 3.25e-01 0.102 0.103 0.192 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 7.61e-03 0.266 0.0987 0.192 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 2.16e-01 0.0492 0.0397 0.192 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 5.52e-01 0.0649 0.109 0.192 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -161252 sc-eQTL 7.40e-01 0.0388 0.117 0.186 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 3.58e-01 -0.101 0.109 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0414 0.121 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 6.11e-01 0.0594 0.116 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 2.45e-01 0.0724 0.0621 0.186 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 6.92e-01 0.0433 0.109 0.186 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 108335 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0238 0.104 0.186 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -161252 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0488 0.102 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0865 0.0666 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 1.76e-01 -0.138 0.101 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0492 0.101 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00381 0.0617 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0524 0.111 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 108335 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00904 0.0944 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -161252 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0363 0.103 0.194 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0663 0.0804 0.194 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0674 0.104 0.194 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 4.55e-01 0.0787 0.105 0.194 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 6.28e-01 0.0246 0.0507 0.194 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 5.16e-02 -0.205 0.105 0.194 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 108335 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0507 0.0986 0.194 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -161252 sc-eQTL 4.20e-01 -0.094 0.116 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 4.09e-01 0.0421 0.0508 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0613 0.0911 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 2.52e-01 0.113 0.0986 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0502 0.0562 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0542 0.109 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 108335 sc-eQTL 7.00e-01 0.0278 0.072 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -161252 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0986 0.11 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 2.16e-01 0.0739 0.0596 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 3.37e-01 0.106 0.11 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 7.96e-01 0.0285 0.11 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0184 0.0581 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0635 0.111 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 108335 sc-eQTL 7.25e-02 -0.138 0.0763 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 2.44e-01 0.131 0.112 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 2.86e-01 0.124 0.116 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 9.32e-01 0.00964 0.113 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 8.84e-01 0.00767 0.0523 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0777 0.105 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 2.88e-02 -0.19 0.0863 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 4.46e-01 0.0568 0.0744 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 3.84e-01 0.0704 0.0807 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 9.53e-01 0.00312 0.0525 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 7.76e-01 0.0287 0.101 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0149 0.0954 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0597 0.0801 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0275 0.094 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0236 0.0487 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 1.99e-01 0.145 0.112 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 8.08e-01 -0.027 0.111 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 8.35e-01 0.0213 0.102 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0256 0.107 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0373 0.0437 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 1.11e-01 -0.173 0.108 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00871 0.0933 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00713 0.0956 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0854 0.106 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0209 0.0567 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 3.26e-01 -0.108 0.11 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 1.11e-01 -0.177 0.111 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0232 0.0896 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 2.25e-01 0.116 0.0958 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 6.58e-02 0.101 0.0546 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 2.18e-01 -0.136 0.11 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0194 0.115 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 1.99e-01 0.149 0.115 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 1.87e-01 -0.151 0.114 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 5.12e-01 0.0366 0.0558 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 4.52e-01 0.0921 0.122 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 3.40e-01 -0.111 0.116 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0611 0.112 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 5.77e-01 0.0647 0.116 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000323 0.0623 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 2.17e-01 0.145 0.117 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0905 0.105 0.195 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 3.12e-01 0.111 0.109 0.195 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 7.10e-02 0.192 0.106 0.195 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 7.42e-01 0.0172 0.0524 0.195 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 7.18e-01 0.0397 0.11 0.195 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 2.28e-01 0.131 0.109 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 1.39e-01 -0.17 0.115 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0969 0.11 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0181 0.0616 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0518 0.0885 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 1.62e-01 -0.127 0.0906 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 2.31e-01 -0.133 0.11 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00139 0.044 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0714 0.107 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 7.56e-01 0.0336 0.108 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 1.99e-01 -0.139 0.108 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0162 0.0505 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 3.43e-01 0.0907 0.0955 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00859 0.099 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 1.29e-01 -0.163 0.107 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 7.34e-01 0.0198 0.0584 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -161252 sc-eQTL 7.21e-01 0.0417 0.116 0.211 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0476 0.0972 0.211 PB L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0314 0.132 0.211 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 2.39e-03 0.354 0.114 0.211 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 5.42e-01 0.0412 0.0674 0.211 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0455 0.126 0.211 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 108335 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0773 0.0829 0.211 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 5.80e-01 0.0554 0.1 0.191 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 7.23e-01 0.0399 0.113 0.191 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 5.41e-01 0.0657 0.107 0.191 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 2.93e-01 0.0427 0.0405 0.191 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 9.91e-01 0.00121 0.105 0.191 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 8.41e-01 0.0213 0.106 0.192 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 7.42e-01 0.0359 0.109 0.192 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 6.30e-01 -0.043 0.0891 0.192 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 6.18e-01 0.0197 0.0394 0.192 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 6.79e-02 0.203 0.11 0.192 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 6.77e-01 0.0401 0.0961 0.185 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -494542 sc-eQTL 1.56e-02 0.229 0.094 0.185 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 8.45e-01 0.0244 0.124 0.185 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -473832 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00523 0.112 0.185 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0146 0.109 0.185 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 4.26e-02 -0.109 0.0534 0.185 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0251 0.107 0.185 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -862905 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0997 0.0852 0.185 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 1.57e-01 0.0994 0.0699 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -494542 sc-eQTL 4.33e-01 0.0779 0.0992 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 5.90e-02 0.185 0.0973 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -473832 sc-eQTL 1.63e-01 0.139 0.0997 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 7.21e-01 0.0286 0.0801 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 8.17e-01 0.0103 0.0445 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 9.13e-01 0.00935 0.0858 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 4.88e-01 0.053 0.0764 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -494542 sc-eQTL 3.63e-01 0.087 0.0953 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 2.47e-01 0.12 0.103 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -473832 sc-eQTL 8.34e-01 0.0217 0.104 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0529 0.0678 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 8.40e-01 0.00986 0.0489 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0781 0.0904 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 5.69e-01 0.0674 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 2.91e-01 0.134 0.126 0.2 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 6.38e-02 0.242 0.129 0.2 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0314 0.0498 0.2 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 3.36e-01 0.124 0.128 0.2 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 9.76e-01 0.00314 0.106 0.189 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -494542 sc-eQTL 3.72e-01 0.0954 0.107 0.189 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 9.44e-01 0.00831 0.117 0.189 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -473832 sc-eQTL 9.21e-02 0.177 0.105 0.189 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00763 0.107 0.189 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 8.00e-01 0.0118 0.0467 0.189 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0959 0.113 0.189 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 5.05e-01 0.0511 0.0765 0.188 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -494542 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0865 0.108 0.188 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 7.84e-01 0.0301 0.11 0.188 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -473832 sc-eQTL 3.50e-01 -0.1 0.107 0.188 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0968 0.103 0.188 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00133 0.0518 0.188 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 9.03e-02 0.155 0.0908 0.188 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 7.70e-01 0.0263 0.09 0.203 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -494542 sc-eQTL 2.14e-01 -0.113 0.0901 0.203 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0355 0.126 0.203 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -473832 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0355 0.0921 0.203 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 1.95e-02 -0.254 0.108 0.203 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0789 0.0753 0.203 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 1.83e-01 -0.149 0.111 0.203 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -862905 sc-eQTL 4.44e-01 -0.082 0.107 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -161252 sc-eQTL 2.61e-01 -0.123 0.109 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0875 0.0614 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 8.42e-02 -0.163 0.0938 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 4.04e-01 0.0815 0.0975 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 5.60e-01 0.0325 0.0556 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 2.28e-01 -0.123 0.102 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 108335 sc-eQTL 7.08e-01 0.037 0.0985 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -161252 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0896 0.116 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 7.11e-01 0.0177 0.0477 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0313 0.0895 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 2.36e-01 0.11 0.0923 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0541 0.0559 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0801 0.106 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 108335 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0366 0.0671 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 3.99e-01 0.0503 0.0595 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -494542 sc-eQTL 4.26e-01 0.0773 0.0969 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 2.32e-02 0.211 0.0921 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -473832 sc-eQTL 4.22e-01 0.0814 0.101 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0553 0.0668 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00346 0.0459 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0574 0.0816 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 1.37e-01 0.108 0.0725 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -494542 sc-eQTL 8.56e-01 0.0195 0.107 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 2.45e-01 0.121 0.104 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -473832 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0348 0.106 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 2.25e-01 -0.122 0.0998 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 6.27e-01 0.0207 0.0425 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -573116 sc-eQTL 5.99e-01 0.0542 0.103 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -272975 sc-eQTL 8.98e-01 0.0106 0.0828 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 611981 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0688 0.0803 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -523236 sc-eQTL 6.13e-02 -0.196 0.104 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -574346 sc-eQTL 8.25e-01 0.00945 0.0428 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -272975 pQTL 0.0094 -0.0735 0.0283 0.0 0.0 0.19

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N -161252 2.63e-06 2.64e-06 3.61e-07 1.68e-06 4.77e-07 8.43e-07 1.78e-06 6.83e-07 1.85e-06 1e-06 2.48e-06 1.34e-06 3.23e-06 1.44e-06 9.53e-07 1.62e-06 1.22e-06 2.2e-06 9.83e-07 1.31e-06 1.16e-06 3.01e-06 2.32e-06 1.01e-06 3.4e-06 1.26e-06 1.31e-06 1.76e-06 2.07e-06 1.85e-06 1.67e-06 3.28e-07 5.76e-07 1.24e-06 1.26e-06 9.87e-07 7.95e-07 4.47e-07 1.21e-06 3.79e-07 2.39e-07 3.32e-06 4.86e-07 1.89e-07 2.91e-07 3.47e-07 8.41e-07 2.28e-07 1.53e-07