Genes within 1Mb (chr6:132239829:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -161646 sc-eQTL 9.33e-02 -0.192 0.114 0.167 B L1
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0177 0.0433 0.167 B L1
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 2.45e-01 -0.1 0.0861 0.167 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 8.48e-02 0.14 0.0809 0.167 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0369 0.0492 0.167 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 5.69e-01 -0.059 0.104 0.167 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 107941 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0134 0.068 0.167 B L1
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0958 0.0839 0.167 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 5.73e-01 0.0377 0.0668 0.167 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 7.94e-01 0.0191 0.0729 0.167 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 8.39e-01 0.0101 0.0496 0.167 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 5.11e-01 0.0659 0.1 0.167 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 5.84e-02 -0.156 0.0819 0.167 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 8.91e-01 0.0112 0.0814 0.167 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0642 0.0963 0.167 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 2.19e-01 0.0405 0.0328 0.167 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0838 0.0995 0.167 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 4.62e-01 0.0554 0.0752 0.167 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -494936 sc-eQTL 9.27e-02 0.157 0.0927 0.167 DC L1
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0144 0.11 0.167 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -474226 sc-eQTL 6.77e-01 0.042 0.101 0.167 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 7.27e-02 -0.193 0.107 0.167 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0597 0.0603 0.167 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0929 0.0954 0.167 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -863299 sc-eQTL 1.72e-01 -0.119 0.0866 0.167 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 7.40e-01 0.019 0.0572 0.167 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -494936 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0463 0.0981 0.167 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 8.59e-02 0.16 0.0926 0.167 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -474226 sc-eQTL 7.29e-01 0.0366 0.106 0.167 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 1.38e-01 -0.11 0.0741 0.167 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 8.13e-01 0.0106 0.0447 0.167 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 2.27e-01 -0.107 0.088 0.167 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0301 0.0867 0.165 NK L1
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0186 0.0793 0.165 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 1.84e-02 -0.253 0.106 0.165 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 9.28e-01 0.00404 0.0447 0.165 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 2.14e-01 -0.107 0.0861 0.167 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 1.72e-01 0.147 0.107 0.167 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 2.07e-02 0.241 0.103 0.167 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 2.93e-01 0.0435 0.0413 0.167 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 4.93e-01 0.0778 0.113 0.167 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -161646 sc-eQTL 7.57e-01 0.0377 0.122 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0944 0.114 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0107 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 4.03e-01 0.102 0.121 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 2.64e-01 0.0727 0.0648 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 7.80e-01 0.0318 0.114 0.161 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 107941 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0372 0.109 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -161646 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0938 0.106 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 2.57e-02 -0.154 0.0685 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0655 0.105 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0574 0.104 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0119 0.0639 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0798 0.115 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 107941 sc-eQTL 7.71e-01 0.0285 0.0978 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -161646 sc-eQTL 2.24e-01 -0.13 0.107 0.168 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0867 0.0838 0.168 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0877 0.108 0.168 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 6.37e-01 0.0519 0.11 0.168 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 6.63e-01 0.0231 0.0529 0.168 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 1.11e-01 -0.176 0.11 0.168 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 107941 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0799 0.103 0.168 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -161646 sc-eQTL 1.13e-01 -0.191 0.12 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 5.37e-01 0.0326 0.0527 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0548 0.0945 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 3.23e-01 0.101 0.102 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 1.13e-01 -0.0923 0.058 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0654 0.113 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 107941 sc-eQTL 4.33e-01 0.0585 0.0745 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -161646 sc-eQTL 2.59e-01 -0.129 0.114 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 5.54e-01 0.0369 0.0623 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 7.81e-01 0.0321 0.115 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 5.26e-01 0.0726 0.114 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0514 0.0606 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 3.26e-01 -0.114 0.115 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 107941 sc-eQTL 5.70e-02 -0.152 0.0795 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 1.34e-01 0.174 0.116 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 7.45e-01 0.0394 0.121 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000433 0.117 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 7.14e-01 0.0199 0.0542 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0722 0.109 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 6.60e-02 -0.167 0.0902 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 3.31e-01 0.0754 0.0774 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 3.83e-01 0.0734 0.0841 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 6.77e-01 0.0228 0.0546 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 5.89e-01 0.0569 0.105 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 9.48e-01 0.00644 0.0994 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0458 0.0836 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0435 0.098 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 9.71e-01 0.00187 0.0508 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 1.47e-01 0.17 0.117 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0254 0.116 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 8.53e-01 0.0198 0.107 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0646 0.111 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 7.11e-01 -0.017 0.0456 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 2.83e-02 -0.248 0.112 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0425 0.0979 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 5.99e-01 0.0528 0.1 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 1.97e-01 -0.143 0.111 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0155 0.0595 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0996 0.115 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 3.83e-01 -0.101 0.116 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0284 0.0934 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 2.84e-01 0.107 0.1 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 2.98e-02 0.124 0.0567 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 1.87e-01 -0.152 0.115 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0173 0.12 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 1.26e-01 0.184 0.12 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 2.66e-01 -0.133 0.119 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 1.64e-01 0.0808 0.0579 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 7.31e-01 0.0439 0.127 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 1.85e-01 -0.161 0.121 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 2.21e-01 -0.143 0.116 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 4.37e-01 0.0938 0.12 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 5.94e-01 0.0346 0.0648 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 3.95e-01 0.104 0.122 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 2.27e-01 -0.132 0.109 0.169 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 1.31e-01 0.173 0.114 0.169 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 1.11e-01 0.177 0.111 0.169 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 4.10e-01 0.0451 0.0547 0.169 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 6.86e-01 0.0465 0.115 0.169 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 4.29e-01 0.0892 0.113 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 4.21e-01 -0.096 0.119 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 3.37e-01 -0.11 0.114 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0112 0.0639 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 2.60e-01 -0.105 0.0931 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0722 0.0958 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 6.82e-02 -0.212 0.116 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0158 0.0463 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 2.15e-01 -0.139 0.111 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0638 0.113 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0688 0.113 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0113 0.0528 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 8.36e-01 0.0208 0.1 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 4.40e-01 0.0801 0.104 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 6.63e-02 -0.206 0.112 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 9.56e-01 0.00339 0.0612 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -161646 sc-eQTL 3.64e-01 0.109 0.12 0.178 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 6.49e-01 0.0459 0.1 0.178 PB L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 8.69e-01 0.0225 0.137 0.178 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 1.50e-01 0.176 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 2.98e-01 0.0726 0.0694 0.178 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 9.84e-01 0.00255 0.131 0.178 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 107941 sc-eQTL 5.07e-01 -0.057 0.0857 0.178 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 7.94e-01 0.0273 0.105 0.165 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 4.63e-01 0.0864 0.118 0.165 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 3.49e-01 0.105 0.112 0.165 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 5.05e-01 0.0283 0.0424 0.165 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000434 0.11 0.165 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 6.83e-01 0.045 0.11 0.167 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 3.32e-01 0.11 0.113 0.167 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0404 0.0926 0.167 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 6.01e-01 0.0214 0.041 0.167 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 9.96e-02 0.19 0.115 0.167 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 5.52e-01 0.0585 0.0981 0.163 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -494936 sc-eQTL 4.36e-02 0.196 0.0964 0.163 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 8.97e-01 0.0164 0.127 0.163 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -474226 sc-eQTL 9.68e-01 0.00456 0.115 0.163 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0155 0.112 0.163 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0817 0.0548 0.163 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0741 0.109 0.163 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -863299 sc-eQTL 2.30e-01 -0.105 0.087 0.163 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 2.66e-01 0.0814 0.0729 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -494936 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0533 0.103 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 2.30e-01 0.123 0.102 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -474226 sc-eQTL 1.62e-01 0.146 0.104 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0363 0.0834 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 4.65e-01 0.0339 0.0463 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0249 0.0893 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 9.96e-01 0.000376 0.0794 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -494936 sc-eQTL 8.37e-01 0.0204 0.0992 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 4.54e-01 0.0806 0.108 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -474226 sc-eQTL 8.05e-01 0.0267 0.108 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0959 0.0702 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 7.55e-01 0.0159 0.0508 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 2.56e-01 -0.107 0.0937 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 4.53e-01 0.0927 0.123 0.173 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 1.36e-01 0.197 0.131 0.173 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 1.12e-01 0.217 0.135 0.173 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0549 0.0518 0.173 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 4.77e-01 0.0957 0.134 0.173 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 8.15e-01 0.0253 0.108 0.164 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -494936 sc-eQTL 6.58e-01 0.0485 0.109 0.164 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0354 0.12 0.164 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -474226 sc-eQTL 1.88e-01 0.142 0.108 0.164 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0227 0.11 0.164 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 5.77e-01 0.0267 0.0478 0.164 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0481 0.116 0.164 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 9.63e-01 0.00372 0.0792 0.163 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -494936 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0987 0.112 0.163 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 7.42e-01 0.0373 0.113 0.163 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -474226 sc-eQTL 2.78e-01 -0.12 0.111 0.163 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 8.52e-02 -0.183 0.106 0.163 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 9.20e-01 0.00537 0.0535 0.163 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 5.49e-02 0.181 0.0936 0.163 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 4.29e-01 0.0723 0.0911 0.181 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -494936 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0943 0.0915 0.181 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 9.61e-01 0.0062 0.128 0.181 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -474226 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0784 0.0933 0.181 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 1.68e-02 -0.264 0.109 0.181 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0804 0.0764 0.181 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 3.35e-02 -0.24 0.112 0.181 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -863299 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0608 0.108 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -161646 sc-eQTL 6.90e-02 -0.205 0.112 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 5.85e-02 -0.121 0.0635 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 2.47e-01 -0.113 0.0976 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 3.39e-01 0.0967 0.101 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 7.17e-01 0.0209 0.0577 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 1.75e-01 -0.144 0.105 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 107941 sc-eQTL 5.16e-01 0.0664 0.102 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -161646 sc-eQTL 1.22e-01 -0.187 0.12 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 9.89e-01 0.000675 0.0496 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 5.26e-01 -0.059 0.093 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 2.29e-01 0.116 0.0959 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 1.03e-01 -0.0947 0.0579 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 2.70e-01 -0.121 0.11 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 107941 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0265 0.0697 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 7.93e-01 0.0162 0.0617 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -494936 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0377 0.101 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 1.52e-01 0.138 0.0962 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -474226 sc-eQTL 3.72e-01 0.0936 0.105 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 1.36e-01 -0.103 0.069 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 7.13e-01 0.0175 0.0475 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0949 0.0844 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 3.56e-01 0.0697 0.0752 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -494936 sc-eQTL 9.58e-01 0.00589 0.111 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 3.91e-01 0.0928 0.108 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -474226 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0878 0.11 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 9.83e-02 -0.171 0.103 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 7.02e-01 0.0169 0.044 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -573510 sc-eQTL 4.07e-01 0.0885 0.107 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -273369 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0483 0.0871 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 611587 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000157 0.0847 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -523630 sc-eQTL 2.12e-02 -0.253 0.109 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -574740 sc-eQTL 9.90e-01 0.00058 0.045 0.166 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -273369 pQTL 0.000727 -0.102 0.03 0.0 0.0 0.163


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N -161646 3e-06 2.75e-06 6.67e-07 2.01e-06 8.47e-07 7.3e-07 2.28e-06 9.82e-07 2.36e-06 1.29e-06 2.77e-06 1.72e-06 3.96e-06 1.47e-06 8.88e-07 1.97e-06 1.64e-06 2.1e-06 1.49e-06 1.2e-06 1.68e-06 3.33e-06 2.87e-06 1.8e-06 3.97e-06 1.21e-06 1.6e-06 1.77e-06 3.22e-06 2.46e-06 2.03e-06 4.71e-07 7.33e-07 1.45e-06 1.61e-06 9.33e-07 9.25e-07 4.3e-07 1.25e-06 3.46e-07 4.26e-07 3.4e-06 6.37e-07 1.74e-07 4.01e-07 3.6e-07 7.69e-07 2.38e-07 3.21e-07