logo

Genes within 1Mb (chr6:132200407:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -201068 sc-eQTL 6.92e-01 0.0738 0.186 0.062 B L1
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 6.58e-02 0.129 0.0697 0.062 B L1
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 1.08e-01 0.225 0.139 0.062 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0388 0.132 0.062 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 7.70e-01 0.0234 0.0798 0.062 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 4.63e-01 0.123 0.168 0.062 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 68519 sc-eQTL 3.45e-04 -0.389 0.107 0.062 B L1
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0682 0.135 0.062 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 3.47e-01 0.101 0.107 0.062 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 8.91e-01 0.0162 0.117 0.062 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0625 0.0796 0.062 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 6.00e-02 0.302 0.16 0.062 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 3.91e-01 0.114 0.132 0.062 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 7.29e-01 0.0452 0.13 0.062 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0771 0.155 0.062 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0834 0.0525 0.062 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0672 0.16 0.062 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 2.17e-01 -0.154 0.124 0.061 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -534358 sc-eQTL 7.93e-01 0.0406 0.154 0.061 DC L1
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 7.93e-01 0.0477 0.181 0.061 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -513648 sc-eQTL 2.24e-01 0.203 0.166 0.061 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 4.57e-01 -0.133 0.178 0.061 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 2.86e-01 -0.107 0.0998 0.061 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 4.21e-01 -0.127 0.158 0.061 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -902721 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0152 0.144 0.061 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 2.06e-01 -0.115 0.0909 0.062 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -534358 sc-eQTL 5.16e-01 0.102 0.156 0.062 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0607 0.149 0.062 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -513648 sc-eQTL 1.99e-01 -0.216 0.168 0.062 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0679 0.119 0.062 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 7.01e-01 0.0274 0.0712 0.062 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 3.12e-01 -0.142 0.141 0.062 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 8.10e-01 0.0334 0.139 0.062 NK L1
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 1.34e-01 0.189 0.126 0.062 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0807 0.172 0.062 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0253 0.0713 0.062 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 7.77e-01 0.0392 0.138 0.062 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 3.27e-01 0.169 0.172 0.062 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0469 0.167 0.062 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0579 0.0662 0.062 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 6.82e-01 0.0744 0.182 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -201068 sc-eQTL 2.11e-01 -0.232 0.185 0.064 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 8.88e-01 0.0246 0.174 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 1.60e-01 -0.271 0.192 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 6.82e-01 0.0761 0.185 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 1.28e-01 -0.151 0.0986 0.064 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 9.99e-01 0.000322 0.174 0.064 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 68519 sc-eQTL 1.50e-02 -0.4 0.163 0.064 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -201068 sc-eQTL 9.79e-01 0.00459 0.173 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 1.59e-01 0.159 0.113 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 2.75e-01 0.188 0.172 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 5.04e-01 0.114 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 7.49e-01 0.0334 0.104 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0284 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 68519 sc-eQTL 2.57e-01 -0.181 0.159 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -201068 sc-eQTL 8.82e-02 -0.295 0.172 0.062 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 1.63e-01 0.19 0.136 0.062 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 8.17e-01 0.0405 0.175 0.062 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 2.92e-01 -0.188 0.178 0.062 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0501 0.0857 0.062 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 4.91e-02 0.351 0.177 0.062 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 68519 sc-eQTL 4.89e-02 -0.328 0.165 0.062 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -201068 sc-eQTL 5.53e-01 0.117 0.197 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 4.56e-01 0.0642 0.0859 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 3.80e-01 0.135 0.154 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 4.49e-01 -0.127 0.167 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 9.51e-01 0.00585 0.0952 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 6.42e-01 0.0854 0.184 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 68519 sc-eQTL 3.23e-02 -0.259 0.12 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -201068 sc-eQTL 3.02e-01 -0.196 0.189 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0108 0.103 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0362 0.191 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 3.65e-01 0.172 0.19 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00539 0.101 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 8.82e-01 0.0284 0.192 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 68519 sc-eQTL 1.89e-02 -0.311 0.131 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 5.59e-01 0.108 0.185 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 6.81e-01 0.0792 0.192 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0924 0.187 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 9.42e-01 0.00629 0.0863 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0504 0.174 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0435 0.146 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 4.26e-01 0.0993 0.124 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 6.74e-01 0.0568 0.135 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0587 0.0876 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 2.10e-01 0.212 0.168 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0386 0.16 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 6.69e-01 0.0577 0.135 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0302 0.158 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0683 0.0817 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 3.16e-01 0.19 0.189 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0989 0.185 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 8.23e-01 0.0383 0.17 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 5.22e-01 -0.114 0.178 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 1.68e-01 -0.1 0.0725 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 6.56e-02 0.333 0.18 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0476 0.151 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00901 0.155 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 2.85e-01 -0.184 0.172 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 1.97e-01 -0.119 0.0917 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 4.50e-01 0.135 0.178 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 4.37e-01 0.143 0.183 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 3.63e-01 0.134 0.147 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 9.13e-01 0.0173 0.158 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 1.15e-01 -0.143 0.0901 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0775 0.182 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 4.95e-01 0.124 0.182 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0798 0.183 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 5.88e-01 -0.098 0.181 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 1.42e-02 -0.214 0.0867 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 5.03e-01 0.129 0.193 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 6.87e-01 -0.077 0.19 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0559 0.183 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 9.06e-01 0.0225 0.189 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0455 0.102 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 1.67e-01 -0.266 0.192 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 3.59e-01 0.164 0.179 0.063 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 9.07e-01 0.0218 0.187 0.063 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 2.05e-01 0.231 0.181 0.063 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 7.87e-02 -0.157 0.0889 0.063 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 3.51e-01 0.175 0.187 0.063 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 6.81e-01 0.0746 0.181 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 7.21e-01 0.0684 0.192 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0091 0.184 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0243 0.103 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 5.86e-01 0.0822 0.151 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 6.19e-01 0.077 0.155 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0681 0.188 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0083 0.0748 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0501 0.179 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 8.93e-02 0.306 0.179 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0738 0.181 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0619 0.0842 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0431 0.162 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0237 0.167 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0542 0.182 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 2.98e-01 -0.103 0.0984 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 9.00e-01 0.0207 0.165 0.063 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 3.49e-01 -0.174 0.186 0.063 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0631 0.177 0.063 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00618 0.067 0.063 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 9.00e-03 -0.45 0.171 0.063 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 4.34e-01 0.141 0.179 0.062 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 4.74e-01 -0.132 0.185 0.062 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 4.01e-01 0.127 0.151 0.062 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 5.99e-02 -0.126 0.0663 0.062 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 7.01e-02 0.341 0.187 0.062 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 3.80e-01 -0.138 0.157 0.061 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -534358 sc-eQTL 5.83e-01 0.0855 0.156 0.061 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 1.61e-01 -0.283 0.202 0.061 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -513648 sc-eQTL 3.40e-02 0.387 0.181 0.061 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0354 0.178 0.061 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 7.36e-01 0.0298 0.0881 0.061 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 7.78e-01 0.0492 0.174 0.061 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -902721 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0669 0.139 0.061 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 4.02e-01 -0.098 0.117 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -534358 sc-eQTL 3.56e-01 0.153 0.165 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 8.67e-01 0.0275 0.163 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -513648 sc-eQTL 3.52e-01 -0.155 0.166 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 3.61e-01 -0.122 0.133 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 5.73e-01 0.0417 0.074 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 1.75e-01 -0.194 0.142 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 3.08e-01 -0.129 0.126 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -534358 sc-eQTL 5.49e-01 0.0947 0.158 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 4.18e-01 0.139 0.171 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -513648 sc-eQTL 3.10e-02 -0.369 0.17 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000132 0.112 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 9.35e-01 0.00664 0.081 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 3.44e-01 -0.142 0.15 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 3.57e-01 -0.183 0.198 0.067 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 9.39e-01 0.0162 0.213 0.067 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 2.19e-01 -0.27 0.219 0.067 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0916 0.0833 0.067 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 6.94e-01 0.0853 0.216 0.067 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 3.96e-01 0.146 0.171 0.064 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -534358 sc-eQTL 9.35e-01 0.0142 0.173 0.064 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 2.57e-03 -0.568 0.186 0.064 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -513648 sc-eQTL 4.53e-02 -0.342 0.17 0.064 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 4.67e-01 0.127 0.174 0.064 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 7.62e-01 -0.023 0.0758 0.064 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 4.22e-01 0.148 0.184 0.064 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 5.97e-01 0.0675 0.127 0.066 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -534358 sc-eQTL 8.11e-01 0.043 0.18 0.066 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 3.74e-01 -0.162 0.182 0.066 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -513648 sc-eQTL 5.76e-01 -0.1 0.179 0.066 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 9.21e-01 0.017 0.172 0.066 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 1.04e-01 -0.14 0.0856 0.066 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 8.28e-01 0.0331 0.152 0.066 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 9.30e-01 0.0137 0.156 0.056 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -534358 sc-eQTL 8.00e-01 -0.04 0.157 0.056 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 6.44e-01 0.102 0.219 0.056 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -513648 sc-eQTL 7.84e-01 -0.044 0.16 0.056 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0876 0.191 0.056 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 8.54e-01 0.0243 0.131 0.056 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 4.08e-01 -0.161 0.194 0.056 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -902721 sc-eQTL 7.19e-01 0.0671 0.186 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -201068 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0294 0.183 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 7.05e-02 0.187 0.103 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 3.31e-01 0.155 0.159 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 8.17e-01 0.038 0.164 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 7.97e-01 0.0241 0.0936 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 1.70e-01 0.236 0.171 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 68519 sc-eQTL 1.47e-03 -0.521 0.162 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -201068 sc-eQTL 9.19e-01 0.02 0.197 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 4.84e-01 0.0565 0.0806 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 3.55e-01 0.14 0.151 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0292 0.157 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 7.29e-01 0.0329 0.0948 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 7.65e-01 0.0535 0.179 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 68519 sc-eQTL 2.55e-03 -0.34 0.111 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 1.38e-01 -0.145 0.0972 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -534358 sc-eQTL 4.36e-01 0.124 0.159 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 5.21e-01 0.0982 0.153 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -513648 sc-eQTL 1.07e-01 -0.267 0.165 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 3.57e-01 -0.101 0.11 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 4.80e-01 0.0532 0.0752 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 1.58e-01 -0.189 0.133 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 5.52e-01 0.071 0.119 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -534358 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0988 0.175 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 2.54e-02 -0.38 0.169 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -513648 sc-eQTL 3.46e-01 -0.164 0.174 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0199 0.164 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0568 0.0695 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -612932 sc-eQTL 5.23e-01 0.108 0.169 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -312791 sc-eQTL 8.33e-01 0.0298 0.141 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 572165 sc-eQTL 2.05e-01 0.173 0.136 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -563052 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0785 0.178 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -614162 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0165 0.0728 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -513648 pQTL 0.00302 -0.228 0.0768 0.0 0.0 0.056
ENSG00000112306 RPS12 -614162 eQTL 0.0585 -0.0241 0.0127 0.00107 0.0 0.0584
ENSG00000118520 ARG1 627263 eQTL 0.0309 0.084 0.0389 0.0 0.0 0.0584
ENSG00000118523 CCN2 249035 pQTL 6.14e-06 -0.208 0.0458 0.0 0.0 0.056

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina