Genes within 1Mb (chr6:132159160:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -242315 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00654 0.162 0.073 B L1
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00597 0.0613 0.073 B L1
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 2.78e-01 0.132 0.122 0.073 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 1.97e-01 -0.149 0.115 0.073 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0176 0.0696 0.073 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 8.16e-01 0.0342 0.147 0.073 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 27272 sc-eQTL 4.96e-02 -0.188 0.0953 0.073 B L1
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 5.32e-01 0.0738 0.118 0.073 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 4.13e-01 0.0767 0.0935 0.073 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 8.55e-01 0.0188 0.102 0.073 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0293 0.0695 0.073 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 2.91e-01 -0.148 0.14 0.073 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0566 0.117 0.073 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 3.22e-01 0.114 0.115 0.073 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 6.60e-01 0.0603 0.137 0.073 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 4.11e-01 0.0385 0.0468 0.073 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 2.76e-01 -0.154 0.141 0.073 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0531 0.107 0.072 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -575605 sc-eQTL 2.63e-01 -0.149 0.133 0.072 DC L1
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 9.19e-01 0.0159 0.156 0.072 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -554895 sc-eQTL 8.35e-01 -0.03 0.144 0.072 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 4.02e-01 0.129 0.154 0.072 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 2.63e-01 0.0965 0.086 0.072 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 4.42e-01 -0.105 0.136 0.072 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -943968 sc-eQTL 2.64e-01 -0.139 0.124 0.072 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000228 0.0827 0.073 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -575605 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0412 0.142 0.073 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 6.13e-01 0.0683 0.135 0.073 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -554895 sc-eQTL 3.21e-01 -0.152 0.152 0.073 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 4.95e-01 0.0736 0.108 0.073 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0252 0.0646 0.073 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 6.23e-01 0.063 0.128 0.073 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0114 0.122 0.073 NK L1
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 2.57e-02 -0.247 0.11 0.073 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 4.46e-01 -0.115 0.151 0.073 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00373 0.0626 0.073 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 7.41e-01 0.0405 0.122 0.073 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 1.55e-01 -0.217 0.152 0.073 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 5.64e-01 0.0853 0.148 0.073 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 8.57e-01 0.0106 0.0586 0.073 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 5.10e-01 0.106 0.16 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -242315 sc-eQTL 8.38e-01 0.0331 0.161 0.077 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 5.68e-01 0.0865 0.151 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 2.63e-03 0.499 0.163 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0165 0.161 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 4.51e-01 0.065 0.0862 0.077 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 9.20e-01 0.0151 0.151 0.077 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 27272 sc-eQTL 9.46e-01 0.00976 0.144 0.077 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -242315 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0914 0.151 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0107 0.0991 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0764 0.151 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 2.06e-01 -0.189 0.149 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0874 0.0912 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 5.38e-01 -0.102 0.165 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 27272 sc-eQTL 1.54e-01 -0.199 0.139 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -242315 sc-eQTL 4.04e-02 0.308 0.149 0.073 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0163 0.118 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 7.94e-01 0.0398 0.152 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 3.15e-01 0.155 0.154 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 5.55e-01 -0.044 0.0745 0.073 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 7.43e-01 -0.051 0.155 0.073 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 27272 sc-eQTL 9.77e-02 0.24 0.144 0.073 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -242315 sc-eQTL 2.68e-01 -0.188 0.169 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 6.59e-01 0.0328 0.0743 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 5.13e-01 0.0871 0.133 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 5.25e-01 0.0918 0.144 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 6.47e-01 0.0376 0.0821 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 4.37e-01 0.123 0.158 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 27272 sc-eQTL 3.09e-03 -0.308 0.103 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -242315 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0415 0.16 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00134 0.0869 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 6.17e-01 0.0805 0.16 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 2.34e-01 -0.19 0.159 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00265 0.0845 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 7.11e-01 0.0599 0.161 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 27272 sc-eQTL 1.31e-01 -0.169 0.111 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 2.42e-01 0.201 0.171 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 3.60e-01 -0.163 0.178 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0565 0.173 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 4.46e-01 0.061 0.0799 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 1.02e-01 0.263 0.16 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 8.06e-01 0.0312 0.127 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 2.91e-01 0.115 0.108 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0593 0.118 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00422 0.0764 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 5.11e-02 -0.286 0.146 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 9.11e-01 0.0157 0.141 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0367 0.119 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 8.63e-01 0.024 0.139 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0515 0.072 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 2.74e-01 0.182 0.166 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0456 0.163 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 1.43e-01 -0.22 0.15 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 2.00e-01 0.201 0.156 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 4.72e-01 0.0463 0.0642 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 6.15e-01 0.0803 0.16 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 1.58e-01 -0.192 0.136 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0519 0.14 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 7.01e-01 0.0595 0.155 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 4.90e-01 0.0572 0.0828 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0538 0.161 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 5.00e-01 0.11 0.162 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 4.37e-01 0.101 0.13 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 4.40e-01 -0.108 0.14 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00102 0.0802 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 4.09e-01 -0.133 0.161 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0863 0.162 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 3.63e-01 -0.148 0.162 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 2.51e-01 -0.184 0.16 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 6.91e-01 0.0311 0.0782 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 9.40e-01 -0.013 0.172 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 1.14e-01 -0.269 0.17 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 9.83e-02 0.271 0.163 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 7.49e-03 0.451 0.167 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 3.82e-02 0.189 0.0904 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 2.52e-01 -0.198 0.172 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0773 0.155 0.074 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 2.72e-01 -0.179 0.162 0.074 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 1.19e-01 0.246 0.157 0.074 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 8.40e-01 0.0157 0.0778 0.074 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 3.29e-01 0.159 0.163 0.074 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 5.28e-01 0.106 0.167 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00738 0.177 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 9.77e-01 0.00482 0.17 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 3.74e-01 0.0843 0.0947 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 3.08e-01 -0.131 0.129 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 1.11e-01 -0.211 0.132 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 4.93e-01 -0.111 0.161 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 8.15e-01 0.015 0.064 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 3.42e-01 -0.16 0.168 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 5.29e-01 -0.107 0.17 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 7.30e-01 0.0591 0.171 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 8.31e-01 0.017 0.0796 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 1.91e-01 0.194 0.148 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 6.70e-01 0.0655 0.153 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 3.96e-01 -0.142 0.166 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 7.97e-01 0.0233 0.0904 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -242315 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0182 0.177 0.074 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 4.89e-01 -0.102 0.147 0.074 PB L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 2.37e-01 -0.237 0.199 0.074 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0281 0.18 0.074 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 7.59e-01 0.0314 0.102 0.074 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0712 0.192 0.074 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 27272 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0882 0.126 0.074 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 6.06e-01 0.0747 0.145 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0995 0.163 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 6.80e-01 0.064 0.155 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 1.78e-01 0.0791 0.0585 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 9.42e-01 0.0111 0.152 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 5.96e-01 0.0822 0.155 0.073 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 2.65e-01 0.177 0.159 0.073 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 2.38e-01 0.154 0.13 0.073 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 5.48e-01 0.0347 0.0576 0.073 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 3.38e-01 -0.156 0.163 0.073 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 9.87e-01 0.00239 0.144 0.071 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -575605 sc-eQTL 4.52e-01 -0.107 0.142 0.071 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 5.54e-01 0.11 0.185 0.071 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -554895 sc-eQTL 2.97e-01 -0.175 0.167 0.071 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0611 0.163 0.071 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 7.95e-01 0.021 0.0807 0.071 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 4.80e-01 -0.113 0.16 0.071 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -943968 sc-eQTL 3.05e-01 -0.131 0.127 0.071 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 9.85e-01 0.00201 0.106 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -575605 sc-eQTL 8.90e-01 0.0207 0.149 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 4.50e-01 0.112 0.147 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -554895 sc-eQTL 4.98e-01 -0.102 0.151 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 2.94e-01 0.127 0.12 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00633 0.0669 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00964 0.129 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0449 0.113 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -575605 sc-eQTL 7.58e-01 0.0436 0.142 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 2.06e-02 -0.354 0.152 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -554895 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0532 0.154 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 6.34e-01 0.0479 0.101 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0884 0.0723 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 2.40e-01 0.158 0.134 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0487 0.182 0.076 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 7.36e-01 -0.066 0.195 0.076 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 7.54e-01 0.0633 0.201 0.076 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 8.77e-01 0.0119 0.0767 0.076 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 5.21e-01 0.127 0.198 0.076 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0843 0.152 0.073 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -575605 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0437 0.153 0.073 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 5.56e-01 0.0995 0.169 0.073 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -554895 sc-eQTL 6.72e-01 0.0643 0.152 0.073 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 3.58e-01 0.142 0.154 0.073 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00585 0.0671 0.073 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 7.38e-01 0.0547 0.163 0.073 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 3.45e-01 0.109 0.115 0.077 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -575605 sc-eQTL 1.76e-01 -0.22 0.162 0.077 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 7.95e-02 0.289 0.164 0.077 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -554895 sc-eQTL 1.69e-01 0.223 0.161 0.077 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 5.86e-01 0.0849 0.156 0.077 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 5.32e-02 0.15 0.0774 0.077 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 4.54e-01 -0.103 0.138 0.077 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0413 0.133 0.073 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -575605 sc-eQTL 4.36e-01 -0.104 0.134 0.073 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0441 0.187 0.073 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -554895 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0686 0.136 0.073 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 1.21e-01 0.251 0.161 0.073 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 3.59e-02 0.233 0.11 0.073 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 5.70e-01 0.0939 0.165 0.073 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -943968 sc-eQTL 6.89e-02 -0.287 0.156 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -242315 sc-eQTL 4.08e-01 0.131 0.158 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 7.67e-01 0.0265 0.0896 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 2.15e-01 0.17 0.137 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 4.00e-01 -0.119 0.141 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0422 0.0807 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00459 0.148 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 27272 sc-eQTL 8.95e-01 0.0188 0.143 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -242315 sc-eQTL 3.79e-01 -0.149 0.17 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 9.25e-01 0.00656 0.0697 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 2.94e-01 0.138 0.131 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00757 0.135 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 8.90e-01 0.0113 0.0819 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 6.32e-01 0.0741 0.154 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 27272 sc-eQTL 2.45e-03 -0.295 0.0961 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0117 0.0884 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -575605 sc-eQTL 9.65e-01 0.00626 0.144 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 8.99e-01 0.0176 0.138 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -554895 sc-eQTL 2.16e-01 -0.186 0.15 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 4.40e-01 0.0767 0.0992 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0294 0.0681 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 7.29e-01 0.0421 0.121 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 8.12e-01 0.0259 0.109 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -575605 sc-eQTL 2.42e-01 -0.187 0.16 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 2.68e-01 0.173 0.155 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -554895 sc-eQTL 7.99e-02 0.277 0.157 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 1.21e-01 0.232 0.149 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 6.30e-01 0.0306 0.0634 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -654179 sc-eQTL 6.77e-01 0.0642 0.154 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -354038 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0454 0.122 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 530918 sc-eQTL 3.39e-02 -0.25 0.117 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -604299 sc-eQTL 3.38e-01 -0.148 0.154 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -655409 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00888 0.0629 0.073 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118520 ARG1 586016 eQTL 0.0115 -0.0784 0.031 0.0 0.0 0.0957
ENSG00000118523 CCN2 207788 pQTL 0.00427 -0.105 0.0365 0.0 0.0 0.091


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina