logo

Genes within 1Mb (chr6:132107428:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -294047 sc-eQTL 1.09e-01 -0.238 0.148 0.105 B L1
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 1.48e-01 -0.081 0.0558 0.105 B L1
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 3.54e-01 -0.104 0.112 0.105 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 9.52e-01 0.0064 0.105 0.105 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 3.14e-02 -0.137 0.0631 0.105 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 6.49e-02 -0.244 0.131 0.105 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 6.15e-01 0.0675 0.134 0.105 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -24460 sc-eQTL 1.58e-02 -0.211 0.0869 0.105 B L1
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0563 0.108 0.105 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 1.88e-02 -0.201 0.0848 0.105 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 8.40e-01 -0.019 0.0938 0.105 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 6.67e-01 0.0275 0.0638 0.105 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00615 0.115 0.105 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0603 0.129 0.105 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 1.02e-01 0.176 0.107 0.105 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00847 0.106 0.105 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 9.50e-01 0.00796 0.126 0.105 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0079 0.043 0.105 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 3.71e-01 -0.108 0.121 0.105 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 7.42e-01 0.0428 0.13 0.105 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00424 0.0977 0.108 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -627337 sc-eQTL 3.46e-01 -0.114 0.121 0.108 DC L1
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 1.81e-01 0.19 0.141 0.108 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -606627 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0243 0.131 0.108 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 9.20e-01 -0.014 0.14 0.108 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 3.42e-01 0.0746 0.0782 0.108 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 3.13e-01 0.141 0.139 0.108 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 9.54e-01 0.00714 0.124 0.108 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -995700 sc-eQTL 1.81e-01 -0.151 0.112 0.108 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 4.44e-01 0.0561 0.0731 0.105 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -627337 sc-eQTL 3.10e-01 -0.128 0.125 0.105 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 8.73e-01 0.0191 0.119 0.105 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -606627 sc-eQTL 1.02e-01 -0.221 0.134 0.105 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 1.65e-01 0.132 0.095 0.105 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 8.97e-01 0.00738 0.0572 0.105 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 7.19e-01 0.0427 0.118 0.105 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0054 0.113 0.105 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 6.07e-02 -0.207 0.11 0.105 NK L1
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0739 0.101 0.105 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 1.29e-01 0.209 0.137 0.105 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0247 0.0569 0.105 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 7.35e-01 0.041 0.121 0.105 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 8.04e-01 0.0275 0.111 0.105 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0134 0.139 0.105 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 2.00e-01 -0.172 0.134 0.105 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0288 0.0532 0.105 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0344 0.121 0.105 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 8.10e-01 -0.035 0.146 0.105 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -294047 sc-eQTL 2.85e-01 -0.17 0.158 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0201 0.149 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 2.97e-02 0.357 0.163 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0474 0.159 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0359 0.0849 0.099 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 2.58e-02 -0.365 0.162 0.099 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0436 0.149 0.099 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24460 sc-eQTL 4.51e-01 -0.107 0.142 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -294047 sc-eQTL 8.99e-01 0.0175 0.138 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 2.43e-01 -0.106 0.0902 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 6.36e-01 0.0652 0.138 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0319 0.136 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 2.28e-01 -0.101 0.0832 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 3.06e-02 -0.301 0.138 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 8.17e-01 0.0349 0.15 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24460 sc-eQTL 1.73e-01 -0.174 0.127 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -294047 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0333 0.138 0.106 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 8.66e-01 0.0182 0.108 0.106 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 2.38e-01 -0.165 0.139 0.106 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 6.30e-01 0.0682 0.141 0.106 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0316 0.0681 0.106 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 7.27e-01 0.0508 0.145 0.106 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 1.17e-01 0.223 0.141 0.106 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24460 sc-eQTL 4.08e-02 -0.27 0.131 0.106 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -294047 sc-eQTL 6.36e-02 -0.289 0.155 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0203 0.0682 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0906 0.122 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 3.82e-01 0.116 0.132 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 8.25e-01 0.0166 0.0754 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 2.94e-01 -0.16 0.152 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0755 0.145 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24460 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0632 0.0963 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -294047 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0894 0.147 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0794 0.08 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 4.80e-01 -0.105 0.148 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 5.40e-01 0.0904 0.147 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 2.87e-01 -0.083 0.0778 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0344 0.156 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 1.60e-01 0.209 0.148 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24460 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0726 0.103 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 5.71e-01 0.084 0.148 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 9.41e-03 -0.397 0.151 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 4.84e-01 0.105 0.149 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0115 0.069 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 3.23e-01 0.146 0.147 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 5.83e-02 0.263 0.138 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 9.32e-01 0.01 0.117 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 1.30e-01 -0.151 0.0992 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00753 0.108 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 7.05e-01 0.0266 0.0702 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 4.07e-01 -0.108 0.13 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0829 0.135 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 6.30e-01 0.0621 0.129 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 9.87e-02 -0.179 0.108 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 4.84e-01 0.0891 0.127 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 6.90e-01 0.0264 0.0659 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 7.05e-01 0.0477 0.126 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0644 0.153 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 8.41e-01 0.0297 0.148 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 1.09e-01 -0.219 0.136 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 4.36e-01 0.111 0.142 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 2.24e-01 0.0709 0.0582 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 9.44e-01 0.0105 0.15 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 3.80e-01 0.128 0.145 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 2.65e-01 0.137 0.123 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0754 0.126 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 2.73e-01 0.153 0.14 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 3.66e-01 0.0678 0.0748 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00457 0.141 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 1.57e-01 0.205 0.145 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 7.52e-03 0.396 0.147 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 6.53e-01 0.0541 0.12 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 8.67e-01 0.0216 0.129 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00314 0.0737 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 1.93e-01 -0.176 0.135 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0487 0.148 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0353 0.145 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 3.69e-01 -0.131 0.145 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00951 0.144 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 2.98e-01 0.0731 0.07 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 2.66e-01 0.174 0.156 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 8.14e-01 0.0363 0.154 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 1.75e-01 0.21 0.155 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 8.94e-01 -0.02 0.149 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 8.79e-02 -0.263 0.153 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 1.22e-01 0.128 0.0825 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 1.43e-01 -0.222 0.151 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 3.48e-01 -0.147 0.157 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0982 0.141 0.104 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0673 0.148 0.104 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0869 0.144 0.104 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 8.88e-01 0.00998 0.0707 0.104 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 9.18e-01 0.015 0.146 0.104 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 9.42e-01 0.0109 0.148 0.104 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 4.53e-01 -0.108 0.144 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 2.60e-01 0.172 0.152 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0163 0.147 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0354 0.0816 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 8.29e-01 0.0321 0.148 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 1.11e-01 -0.189 0.118 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 2.88e-01 -0.13 0.122 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 3.64e-01 0.135 0.148 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0382 0.0589 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0439 0.129 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 8.78e-01 0.0222 0.145 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0543 0.146 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 1.50e-02 0.355 0.145 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000499 0.0684 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 1.03e-01 -0.247 0.151 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 2.43e-01 -0.15 0.128 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0589 0.133 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 1.03e-01 0.235 0.144 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00877 0.0784 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 6.13e-01 0.068 0.134 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -294047 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0403 0.159 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 3.52e-01 0.124 0.132 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 8.07e-01 0.0442 0.18 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 9.82e-01 0.00358 0.162 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 2.13e-01 0.115 0.0915 0.111 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 8.09e-01 0.0426 0.176 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 5.36e-01 0.107 0.172 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24460 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00393 0.113 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 3.70e-01 0.121 0.135 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 8.23e-01 0.0341 0.152 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0176 0.145 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 6.24e-01 0.0269 0.0548 0.104 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 1.98e-01 -0.168 0.13 0.104 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 8.91e-01 0.0194 0.142 0.104 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 4.37e-02 -0.288 0.142 0.105 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0225 0.147 0.105 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0616 0.12 0.105 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 3.27e-01 0.0523 0.0532 0.105 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 4.87e-01 0.0882 0.127 0.105 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 9.53e-01 0.00882 0.151 0.105 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0868 0.125 0.11 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -627337 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0512 0.125 0.11 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 4.05e-01 0.135 0.162 0.11 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -606627 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0841 0.147 0.11 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 3.27e-01 0.14 0.143 0.11 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 1.18e-01 0.11 0.0701 0.11 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 7.56e-01 0.049 0.157 0.11 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 1.54e-01 0.199 0.139 0.11 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -995700 sc-eQTL 2.59e-01 -0.126 0.111 0.11 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0295 0.0946 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -627337 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0715 0.134 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00249 0.132 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -606627 sc-eQTL 4.10e-02 -0.275 0.134 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 4.58e-01 0.08 0.108 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 6.07e-01 0.0308 0.0599 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 8.47e-01 0.0249 0.129 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 1.93e-01 -0.15 0.115 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 8.23e-01 -0.023 0.103 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -627337 sc-eQTL 2.13e-01 -0.16 0.128 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0102 0.139 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -606627 sc-eQTL 6.42e-02 -0.257 0.138 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 4.92e-01 0.0627 0.0911 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 5.11e-01 0.0432 0.0656 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 3.60e-01 -0.125 0.136 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 1.56e-01 0.172 0.121 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 3.75e-01 -0.151 0.169 0.097 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 2.41e-01 -0.213 0.181 0.097 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0422 0.188 0.097 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00554 0.0715 0.097 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0128 0.19 0.097 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 8.56e-01 0.0336 0.185 0.097 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00801 0.139 0.107 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -627337 sc-eQTL 8.58e-02 -0.241 0.14 0.107 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 7.73e-01 0.0447 0.155 0.107 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -606627 sc-eQTL 6.83e-02 -0.253 0.138 0.107 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 9.80e-01 0.00353 0.141 0.107 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 6.00e-01 0.0323 0.0615 0.107 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 5.27e-01 0.0954 0.151 0.107 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 7.12e-02 0.269 0.149 0.107 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 7.73e-02 0.176 0.0993 0.109 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -627337 sc-eQTL 3.81e-01 0.124 0.141 0.109 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0399 0.143 0.109 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -606627 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0666 0.14 0.109 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 6.92e-01 0.0534 0.135 0.109 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 1.24e-01 -0.104 0.0672 0.109 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 5.72e-02 -0.263 0.137 0.109 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 8.60e-01 -0.021 0.119 0.109 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 9.64e-01 0.00556 0.122 0.096 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -627337 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00114 0.123 0.096 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 6.06e-01 0.0885 0.171 0.096 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -606627 sc-eQTL 5.08e-02 0.243 0.124 0.096 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 7.84e-01 0.0409 0.149 0.096 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 6.24e-01 0.0504 0.103 0.096 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 1.83e-01 0.186 0.139 0.096 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 4.62e-01 0.112 0.152 0.096 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -995700 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0221 0.145 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -294047 sc-eQTL 3.37e-01 -0.141 0.146 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 9.90e-02 -0.137 0.0825 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 5.30e-01 0.0798 0.127 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 8.78e-01 0.0201 0.131 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0474 0.0747 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 1.43e-02 -0.314 0.127 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 3.74e-01 0.122 0.137 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -24460 sc-eQTL 6.31e-03 -0.359 0.13 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -294047 sc-eQTL 6.38e-02 -0.286 0.154 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0479 0.0635 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 1.14e-01 -0.188 0.119 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 2.23e-01 0.15 0.123 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00771 0.0747 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 2.68e-01 -0.167 0.15 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 5.14e-01 0.0921 0.141 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -24460 sc-eQTL 2.53e-01 -0.102 0.0893 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00895 0.0788 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -627337 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0781 0.128 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 9.37e-01 0.00978 0.123 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -606627 sc-eQTL 8.46e-02 -0.23 0.133 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 2.34e-01 0.105 0.0883 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 4.87e-01 0.0422 0.0607 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 8.68e-01 0.0202 0.121 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0104 0.108 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 1.46e-01 0.14 0.0962 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -627337 sc-eQTL 2.96e-01 -0.149 0.142 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 8.92e-01 0.0188 0.139 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -606627 sc-eQTL 2.30e-01 -0.169 0.14 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 7.55e-01 0.0415 0.133 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0517 0.0563 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0269 0.142 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -705911 sc-eQTL 2.50e-01 0.157 0.136 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -405770 sc-eQTL 7.13e-02 -0.2 0.11 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 479186 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0733 0.108 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -656031 sc-eQTL 1.15e-01 0.221 0.14 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -707141 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0356 0.0574 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 971961 sc-eQTL 9.61e-01 0.00587 0.119 0.106 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118523 CCN2 156056 pQTL 3.95e-07 -0.171 0.0335 0.0 0.0 0.101

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina