logo

Genes within 1Mb (chr6:132107206:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -294269 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00357 0.155 0.094 B L1
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 1.22e-03 0.187 0.0571 0.094 B L1
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 3.34e-01 -0.113 0.116 0.094 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 9.24e-01 0.0105 0.11 0.094 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 1.28e-01 -0.101 0.0661 0.094 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 8.88e-01 0.0195 0.138 0.094 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 2.69e-01 -0.155 0.139 0.094 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -24682 sc-eQTL 3.64e-01 0.0834 0.0916 0.094 B L1
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 8.90e-04 0.37 0.11 0.094 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 1.57e-01 0.126 0.0889 0.094 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 8.94e-01 -0.013 0.0975 0.094 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 1.31e-01 -0.1 0.0659 0.094 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 4.88e-02 -0.235 0.119 0.094 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 3.05e-01 -0.138 0.134 0.094 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 5.56e-01 0.066 0.112 0.094 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 4.36e-01 0.086 0.11 0.094 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 7.74e-01 0.0376 0.131 0.094 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0458 0.0446 0.094 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 3.29e-01 -0.122 0.125 0.094 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 2.88e-02 -0.294 0.134 0.094 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 2.04e-01 0.135 0.106 0.092 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -627559 sc-eQTL 3.29e-02 -0.279 0.13 0.092 DC L1
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 9.23e-02 -0.259 0.153 0.092 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -606849 sc-eQTL 1.56e-01 -0.201 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 9.68e-01 0.00618 0.152 0.092 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 2.29e-01 -0.102 0.0849 0.092 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 2.67e-01 0.168 0.151 0.092 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 2.84e-01 -0.144 0.134 0.092 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -995922 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00576 0.123 0.092 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 2.42e-02 0.173 0.0763 0.094 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -627559 sc-eQTL 2.62e-01 -0.149 0.132 0.094 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0105 0.126 0.094 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -606849 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0172 0.143 0.094 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 4.05e-01 0.0837 0.1 0.094 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 7.37e-01 0.0203 0.0603 0.094 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0403 0.125 0.094 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0241 0.119 0.094 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 1.10e-04 0.45 0.114 0.094 NK L1
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0202 0.108 0.094 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 3.25e-01 -0.145 0.147 0.094 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0581 0.0608 0.094 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0938 0.129 0.094 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 4.36e-01 0.0911 0.117 0.094 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 3.40e-01 -0.139 0.146 0.094 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 2.55e-01 -0.161 0.141 0.094 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0167 0.056 0.094 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 9.41e-01 0.00949 0.127 0.094 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 6.20e-01 0.0761 0.153 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -294269 sc-eQTL 2.26e-01 0.189 0.155 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 1.55e-01 0.208 0.145 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 2.81e-01 0.175 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 3.02e-02 -0.335 0.153 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0425 0.0833 0.099 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 7.36e-01 0.0545 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0744 0.146 0.099 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24682 sc-eQTL 5.90e-01 0.0751 0.139 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -294269 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0851 0.145 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 4.25e-02 0.192 0.0943 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 8.85e-01 0.021 0.145 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 1.80e-01 -0.192 0.143 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 1.64e-01 -0.122 0.0874 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 8.01e-01 0.0372 0.147 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 1.42e-01 -0.232 0.157 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24682 sc-eQTL 8.92e-03 -0.349 0.132 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -294269 sc-eQTL 4.82e-01 0.1 0.142 0.095 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 2.91e-01 0.118 0.112 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0312 0.144 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0531 0.146 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 2.44e-02 -0.158 0.0697 0.095 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 2.51e-02 -0.335 0.148 0.095 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 9.68e-01 0.00593 0.147 0.095 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24682 sc-eQTL 9.24e-02 0.23 0.136 0.095 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -294269 sc-eQTL 3.33e-01 -0.156 0.16 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 2.97e-05 0.288 0.0674 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0881 0.126 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 5.30e-01 0.0858 0.136 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0995 0.0774 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 4.67e-01 0.115 0.157 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 8.94e-01 0.02 0.15 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24682 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0481 0.0993 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -294269 sc-eQTL 8.32e-01 0.0324 0.152 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 1.88e-01 0.109 0.0827 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0764 0.153 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 5.83e-01 0.0838 0.152 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 6.80e-02 -0.147 0.0801 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0238 0.161 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 1.03e-01 -0.251 0.153 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24682 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0307 0.107 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 2.80e-01 0.175 0.161 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0287 0.168 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 6.04e-01 0.0848 0.163 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 3.01e-01 -0.078 0.0752 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 4.06e-01 -0.134 0.161 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 7.69e-01 0.0448 0.152 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 7.42e-03 0.323 0.119 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 1.96e-01 0.134 0.103 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 6.06e-01 -0.058 0.112 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0821 0.0728 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 8.40e-02 -0.234 0.135 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 7.08e-02 -0.253 0.139 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 5.27e-02 0.262 0.135 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00194 0.114 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0326 0.134 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 9.06e-02 -0.117 0.0689 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0152 0.133 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 4.64e-01 0.118 0.16 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 3.41e-01 0.149 0.156 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0388 0.144 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 6.82e-01 0.0613 0.15 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0083 0.0614 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 9.68e-02 -0.261 0.157 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 4.28e-01 -0.121 0.152 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0606 0.13 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 5.55e-01 0.0786 0.133 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 7.01e-01 0.0567 0.147 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0153 0.0789 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0832 0.149 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 4.63e-01 -0.112 0.153 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0175 0.157 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0727 0.126 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 9.92e-01 0.00138 0.135 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0188 0.0774 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0952 0.142 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 1.09e-01 -0.249 0.154 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0495 0.157 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0365 0.158 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 2.19e-01 -0.191 0.155 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 6.55e-01 0.034 0.0759 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 6.42e-01 0.0786 0.169 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 6.55e-03 -0.449 0.163 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 8.31e-01 0.036 0.169 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 2.50e-01 0.187 0.162 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 8.70e-02 0.286 0.166 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 2.07e-01 0.114 0.0898 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 3.43e-01 -0.157 0.165 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0584 0.17 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 3.01e-01 0.158 0.153 0.095 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 3.64e-01 -0.146 0.16 0.095 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0776 0.156 0.095 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0237 0.0766 0.095 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 6.79e-01 0.0657 0.158 0.095 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 2.36e-01 0.19 0.16 0.095 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 4.31e-02 0.307 0.151 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0543 0.161 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0602 0.155 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 8.37e-01 0.0178 0.0861 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 5.39e-01 -0.096 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 2.72e-02 0.273 0.123 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00279 0.128 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0991 0.155 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0595 0.0615 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0785 0.135 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 1.42e-01 0.225 0.153 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0716 0.155 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0678 0.156 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 1.64e-01 -0.101 0.0722 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 9.27e-01 0.0148 0.161 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 3.59e-04 0.484 0.133 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 5.06e-01 0.0948 0.142 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0457 0.155 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0814 0.0838 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0138 0.144 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -294269 sc-eQTL 1.69e-01 -0.208 0.15 0.115 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0425 0.127 0.115 PB L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 3.16e-01 -0.172 0.171 0.115 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 8.91e-01 0.0213 0.155 0.115 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 6.48e-01 0.0401 0.0877 0.115 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 6.15e-01 0.0845 0.167 0.115 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 4.73e-01 -0.118 0.164 0.115 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -24682 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0379 0.108 0.115 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 7.00e-01 0.0537 0.139 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0462 0.156 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0823 0.149 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 9.11e-01 0.00628 0.0564 0.096 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00114 0.134 0.096 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0993 0.146 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 1.22e-02 0.369 0.146 0.094 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0205 0.152 0.094 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 3.32e-01 0.121 0.124 0.094 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0299 0.0551 0.094 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 1.10e-02 -0.332 0.129 0.094 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 3.66e-01 -0.141 0.155 0.094 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 4.03e-01 0.111 0.133 0.093 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -627559 sc-eQTL 1.83e-02 -0.31 0.13 0.093 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 3.73e-02 -0.356 0.17 0.093 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -606849 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0864 0.155 0.093 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0537 0.151 0.093 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0412 0.0747 0.093 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 8.09e-02 0.29 0.165 0.093 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 6.23e-03 -0.401 0.145 0.093 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -995922 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0593 0.118 0.093 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 1.34e-01 0.15 0.0999 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -627559 sc-eQTL 1.96e-01 -0.183 0.141 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 7.40e-01 0.0466 0.14 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -606849 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0179 0.143 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 5.57e-01 0.0673 0.114 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000658 0.0636 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 4.32e-01 -0.107 0.136 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0422 0.123 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 2.75e-01 0.119 0.109 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -627559 sc-eQTL 7.97e-01 0.0351 0.137 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0765 0.148 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -606849 sc-eQTL 8.62e-01 0.0259 0.148 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00429 0.0971 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0568 0.0698 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0116 0.145 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 8.93e-01 0.0174 0.129 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 6.44e-01 0.0842 0.182 0.091 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 6.76e-01 0.0819 0.195 0.091 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0443 0.202 0.091 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 8.14e-01 0.0181 0.0768 0.091 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 2.50e-01 0.235 0.203 0.091 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 4.40e-01 0.153 0.198 0.091 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 7.67e-02 0.259 0.145 0.093 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -627559 sc-eQTL 5.52e-01 -0.088 0.148 0.093 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 4.91e-01 -0.112 0.162 0.093 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -606849 sc-eQTL 7.89e-01 0.0392 0.146 0.093 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 3.09e-01 0.151 0.148 0.093 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0343 0.0647 0.093 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 2.56e-01 -0.18 0.158 0.093 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 3.23e-01 -0.156 0.157 0.093 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 2.29e-01 0.13 0.108 0.095 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -627559 sc-eQTL 1.69e-02 -0.364 0.151 0.095 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 3.90e-01 0.133 0.155 0.095 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -606849 sc-eQTL 5.67e-01 0.087 0.152 0.095 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 2.63e-01 0.164 0.146 0.095 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 7.98e-02 0.128 0.0727 0.095 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 1.52e-02 0.363 0.148 0.095 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 6.48e-02 -0.238 0.128 0.095 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 6.93e-01 0.0483 0.122 0.099 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -627559 sc-eQTL 2.08e-01 -0.155 0.122 0.099 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00655 0.171 0.099 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -606849 sc-eQTL 5.31e-03 -0.345 0.122 0.099 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 6.55e-01 0.0667 0.149 0.099 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0775 0.102 0.099 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 3.79e-01 -0.123 0.14 0.099 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 2.38e-01 0.179 0.151 0.099 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -995922 sc-eQTL 4.56e-01 -0.108 0.145 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -294269 sc-eQTL 1.77e-01 0.203 0.15 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 6.79e-03 0.229 0.0837 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 2.24e-01 0.158 0.13 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 2.30e-01 -0.162 0.134 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 1.46e-01 -0.111 0.0764 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 3.74e-01 -0.118 0.132 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 4.08e-01 -0.117 0.141 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -24682 sc-eQTL 5.19e-01 0.0877 0.136 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -294269 sc-eQTL 4.80e-01 -0.113 0.16 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 3.51e-04 0.232 0.0638 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 5.71e-01 -0.07 0.123 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 5.14e-01 0.0835 0.128 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 1.49e-01 -0.111 0.0769 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 6.51e-01 0.0705 0.156 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 3.98e-01 -0.123 0.146 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -24682 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0318 0.0926 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 4.94e-02 0.165 0.0836 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -627559 sc-eQTL 3.53e-01 -0.128 0.137 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 8.79e-01 0.0201 0.132 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -606849 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0359 0.143 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 4.22e-01 0.0761 0.0947 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00641 0.065 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0296 0.13 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0151 0.116 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 4.05e-02 0.209 0.101 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -627559 sc-eQTL 4.14e-03 -0.429 0.148 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0931 0.147 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -606849 sc-eQTL 8.16e-01 0.0347 0.149 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 1.75e-01 0.191 0.14 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 9.21e-01 0.00596 0.0598 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0228 0.151 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -706133 sc-eQTL 1.02e-01 -0.237 0.144 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -405992 sc-eQTL 1.72e-04 0.437 0.114 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 478964 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00181 0.115 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -656253 sc-eQTL 2.56e-01 -0.17 0.149 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -707363 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0522 0.0609 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 971739 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0659 0.126 0.095 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -405992 eQTL 3.59e-08 0.144 0.0259 0.0 0.0 0.0981
ENSG00000118520 ARG1 534062 eQTL 0.000873 -0.101 0.0304 0.0 0.0 0.0981
ENSG00000118523 CCN2 155834 pQTL 1.04e-10 -0.229 0.0351 0.0 0.0 0.0965

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -405992 1.28e-06 9.25e-07 3.02e-07 3.04e-07 1.08e-07 3.36e-07 9.97e-07 6.2e-08 6.27e-07 2.14e-07 8.58e-07 3.5e-07 1.99e-06 2.68e-07 4.55e-07 4.29e-07 7.73e-07 5.27e-07 2.79e-07 1.31e-07 2.53e-07 5.83e-07 6.26e-07 1.19e-07 1.47e-06 2.4e-07 3.48e-07 2.71e-07 5.43e-07 6.73e-07 4.26e-07 4.58e-08 5.42e-08 2.04e-07 3.26e-07 7.57e-08 1.83e-07 5.36e-08 5.77e-08 5.88e-08 5.13e-08 1.64e-06 6.13e-08 7.26e-09 5.4e-08 1.35e-08 7.36e-08 2.05e-09 4.55e-08