logo

Genes within 1Mb (chr6:132100318:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -301157 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0197 0.156 0.092 B L1
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 3.62e-03 0.17 0.0577 0.092 B L1
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 3.67e-01 -0.106 0.117 0.092 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 9.13e-01 0.012 0.111 0.092 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0791 0.0666 0.092 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 7.76e-01 0.0396 0.139 0.092 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 3.02e-01 -0.145 0.14 0.092 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -31570 sc-eQTL 4.21e-01 0.0744 0.0922 0.092 B L1
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 1.85e-03 0.349 0.111 0.092 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 2.52e-01 0.103 0.0896 0.092 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00939 0.0981 0.092 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0839 0.0664 0.092 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 5.66e-02 -0.229 0.12 0.092 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 2.84e-01 -0.145 0.135 0.092 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 5.80e-01 0.0624 0.113 0.092 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 5.85e-01 0.0606 0.111 0.092 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 7.08e-01 0.0493 0.131 0.092 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0283 0.0449 0.092 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 4.11e-01 -0.104 0.126 0.092 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 2.97e-02 -0.294 0.134 0.092 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 2.12e-01 0.133 0.106 0.09 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -634447 sc-eQTL 4.88e-02 -0.26 0.131 0.09 DC L1
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 8.99e-02 -0.263 0.154 0.09 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -613737 sc-eQTL 1.12e-01 -0.226 0.142 0.09 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 8.89e-01 0.0213 0.153 0.09 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0594 0.0855 0.09 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 1.41e-01 0.224 0.152 0.09 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 2.62e-01 -0.152 0.135 0.09 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 6.23e-02 0.144 0.0767 0.092 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -634447 sc-eQTL 2.31e-01 -0.159 0.132 0.092 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 9.31e-01 0.0109 0.126 0.092 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -613737 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0531 0.143 0.092 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 2.58e-01 0.114 0.101 0.092 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 4.00e-01 0.0509 0.0603 0.092 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0444 0.125 0.092 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00923 0.12 0.092 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 9.56e-05 0.456 0.115 0.092 NK L1
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0697 0.109 0.092 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0922 0.148 0.092 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 4.24e-01 -0.049 0.0611 0.092 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0604 0.13 0.092 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 4.11e-01 0.0964 0.117 0.092 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 1.87e-01 -0.193 0.146 0.092 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 2.22e-01 -0.173 0.141 0.092 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 7.76e-01 -0.016 0.0563 0.092 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 9.13e-01 0.0139 0.128 0.092 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 7.72e-01 0.0446 0.154 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -301157 sc-eQTL 2.98e-01 0.163 0.156 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 1.57e-01 0.207 0.146 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 2.23e-01 0.198 0.162 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 5.59e-02 -0.298 0.155 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0284 0.0837 0.097 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 7.58e-01 0.05 0.162 0.097 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0502 0.147 0.097 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -31570 sc-eQTL 8.74e-01 0.0222 0.14 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -301157 sc-eQTL 4.35e-01 -0.114 0.146 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 8.43e-02 0.165 0.0949 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 7.72e-01 0.0422 0.145 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 2.98e-01 -0.15 0.144 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0863 0.088 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 8.80e-01 0.0224 0.148 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 1.09e-01 -0.254 0.158 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -31570 sc-eQTL 1.07e-02 -0.342 0.133 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -301157 sc-eQTL 6.34e-01 0.0683 0.143 0.093 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 3.60e-01 0.103 0.112 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0242 0.145 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0611 0.147 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 9.94e-02 -0.117 0.0705 0.093 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 4.31e-02 -0.304 0.149 0.093 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00607 0.148 0.093 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -31570 sc-eQTL 1.25e-01 0.211 0.137 0.093 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -301157 sc-eQTL 2.72e-01 -0.178 0.161 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 8.68e-05 0.273 0.0682 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0909 0.126 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 5.58e-01 0.0806 0.137 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 3.99e-01 -0.066 0.0781 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 3.87e-01 0.137 0.158 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 7.79e-01 0.0424 0.151 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -31570 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0555 0.0998 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -301157 sc-eQTL 8.86e-01 0.0221 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 2.57e-01 0.0947 0.0834 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0771 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 5.85e-01 0.084 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 1.74e-01 -0.11 0.081 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0193 0.162 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 1.10e-01 -0.248 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -31570 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0339 0.108 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 4.18e-01 0.133 0.163 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 8.93e-01 -0.023 0.17 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 5.38e-01 0.102 0.165 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0546 0.0761 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 4.63e-01 -0.12 0.163 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 7.98e-01 0.0393 0.154 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 1.17e-02 0.305 0.12 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 3.20e-01 0.104 0.104 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0518 0.113 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0596 0.0731 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 1.00e-01 -0.223 0.135 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 6.23e-02 -0.262 0.14 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 5.87e-02 0.258 0.136 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0188 0.115 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0282 0.135 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0878 0.0697 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0268 0.134 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 5.48e-01 0.0974 0.162 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 4.40e-01 0.122 0.157 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0593 0.145 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 5.47e-01 0.0911 0.151 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 8.09e-01 0.015 0.0619 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 1.37e-01 -0.236 0.158 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 4.96e-01 -0.105 0.154 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0742 0.13 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 5.40e-01 0.0821 0.134 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 7.09e-01 0.0554 0.148 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 8.02e-01 0.0199 0.0794 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0922 0.15 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 4.65e-01 -0.113 0.154 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 9.53e-01 0.0093 0.157 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 4.09e-01 -0.104 0.126 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 9.25e-01 0.0128 0.136 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 9.50e-01 0.00492 0.0777 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0619 0.143 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 1.07e-01 -0.251 0.155 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0236 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 9.65e-01 -0.007 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 1.58e-01 -0.221 0.156 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 5.19e-01 0.0493 0.0762 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 5.42e-01 0.104 0.17 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 9.99e-03 -0.427 0.164 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0049 0.17 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 3.12e-01 0.166 0.163 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 4.47e-02 0.338 0.167 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 9.80e-02 0.15 0.0903 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 3.41e-01 -0.159 0.166 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0652 0.172 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 3.11e-01 0.157 0.154 0.093 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 2.11e-01 -0.202 0.161 0.093 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0988 0.157 0.093 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00929 0.0772 0.093 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 4.97e-01 0.109 0.159 0.093 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 3.26e-01 0.159 0.162 0.093 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 4.33e-02 0.309 0.152 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 5.67e-01 -0.093 0.162 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0135 0.156 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 6.49e-01 0.0395 0.0868 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0467 0.157 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 2.62e-02 0.276 0.123 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0696 0.128 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0538 0.156 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0424 0.0619 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0352 0.136 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 7.58e-02 0.272 0.153 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0704 0.155 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0479 0.156 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 1.33e-01 -0.109 0.0721 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 8.44e-01 0.0318 0.161 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 3.05e-04 0.492 0.134 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 6.67e-01 0.0615 0.143 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0182 0.155 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0549 0.0842 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0231 0.144 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -301157 sc-eQTL 1.86e-01 -0.202 0.152 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0595 0.127 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 3.63e-01 -0.158 0.173 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 7.38e-01 0.0523 0.156 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 2.90e-01 0.0937 0.088 0.111 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 6.81e-01 0.0695 0.169 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 4.03e-01 -0.139 0.165 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -31570 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0447 0.109 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 7.68e-01 0.0411 0.139 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0411 0.156 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0956 0.149 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 7.03e-01 0.0215 0.0564 0.093 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0179 0.134 0.093 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 4.26e-01 -0.116 0.146 0.093 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 1.21e-02 0.372 0.147 0.092 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000207 0.153 0.092 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 3.92e-01 0.107 0.125 0.092 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0192 0.0554 0.092 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 4.17e-03 -0.375 0.129 0.092 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 2.91e-01 -0.165 0.156 0.092 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 4.96e-01 0.0909 0.133 0.09 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -634447 sc-eQTL 2.02e-02 -0.306 0.131 0.09 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 3.35e-02 -0.365 0.17 0.09 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -613737 sc-eQTL 3.57e-01 -0.144 0.155 0.09 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 8.74e-01 -0.024 0.152 0.09 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0105 0.0749 0.09 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 4.53e-02 0.333 0.165 0.09 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 4.54e-03 -0.417 0.145 0.09 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 2.35e-01 0.12 0.1 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -634447 sc-eQTL 1.86e-01 -0.188 0.142 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 5.42e-01 0.0859 0.141 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -613737 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0446 0.144 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 3.90e-01 0.0988 0.115 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 6.39e-01 0.03 0.0638 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 3.69e-01 -0.123 0.137 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0283 0.123 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 3.72e-01 0.098 0.11 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -634447 sc-eQTL 8.39e-01 0.0279 0.137 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0768 0.149 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -613737 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00755 0.149 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 8.18e-01 0.0225 0.0976 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0249 0.0702 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 9.90e-01 0.00184 0.146 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 8.91e-01 0.0179 0.13 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 3.68e-01 0.166 0.183 0.088 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00886 0.197 0.088 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 9.50e-01 0.0127 0.204 0.088 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 8.09e-01 0.0188 0.0775 0.088 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 1.81e-01 0.275 0.205 0.088 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 2.84e-01 0.215 0.2 0.088 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 1.08e-01 0.236 0.146 0.091 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -634447 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0999 0.148 0.091 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 4.86e-01 -0.114 0.163 0.091 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -613737 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00987 0.147 0.091 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 2.33e-01 0.178 0.149 0.091 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 8.66e-01 0.011 0.065 0.091 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 2.39e-01 -0.187 0.159 0.091 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 3.79e-01 -0.139 0.158 0.091 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 2.82e-01 0.117 0.108 0.093 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -634447 sc-eQTL 3.66e-03 -0.442 0.15 0.093 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 5.12e-01 0.102 0.155 0.093 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -613737 sc-eQTL 8.64e-01 0.026 0.152 0.093 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 3.61e-01 0.134 0.146 0.093 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 1.74e-02 0.174 0.0724 0.093 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 2.42e-02 0.338 0.149 0.093 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 1.38e-01 -0.192 0.129 0.093 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 5.18e-01 0.0798 0.123 0.096 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -634447 sc-eQTL 3.40e-01 -0.119 0.124 0.096 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 9.99e-01 0.00025 0.173 0.096 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -613737 sc-eQTL 7.91e-03 -0.332 0.124 0.096 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 7.74e-01 0.0433 0.15 0.096 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 7.29e-01 -0.036 0.104 0.096 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0916 0.141 0.096 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 2.77e-01 0.167 0.153 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -301157 sc-eQTL 2.69e-01 0.167 0.151 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 1.49e-02 0.208 0.0845 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 1.74e-01 0.178 0.131 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 3.73e-01 -0.121 0.135 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0696 0.0771 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 4.31e-01 -0.105 0.133 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 3.76e-01 -0.126 0.142 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -31570 sc-eQTL 7.01e-01 0.0526 0.137 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -301157 sc-eQTL 4.24e-01 -0.129 0.161 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 9.18e-04 0.217 0.0645 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0718 0.124 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 5.44e-01 0.0781 0.128 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0762 0.0776 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 5.38e-01 0.0965 0.156 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 4.74e-01 -0.105 0.147 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -31570 sc-eQTL 6.84e-01 -0.038 0.0932 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 1.10e-01 0.135 0.0841 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -634447 sc-eQTL 3.24e-01 -0.136 0.138 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 7.08e-01 0.0498 0.133 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -613737 sc-eQTL 6.52e-01 -0.065 0.144 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 2.76e-01 0.104 0.0949 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 6.90e-01 0.0261 0.0652 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0328 0.13 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 9.25e-01 -0.011 0.116 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 6.94e-02 0.186 0.102 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -634447 sc-eQTL 9.80e-04 -0.494 0.148 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 4.57e-01 -0.11 0.147 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -613737 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0306 0.15 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 1.97e-01 0.182 0.141 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 4.75e-01 0.0429 0.06 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0427 0.151 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -713021 sc-eQTL 1.59e-01 -0.205 0.145 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -412880 sc-eQTL 1.47e-04 0.444 0.115 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 472076 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0529 0.115 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -663141 sc-eQTL 4.15e-01 -0.123 0.15 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -714251 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0455 0.0613 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 964851 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0447 0.127 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -412880 eQTL 4.34e-08 0.143 0.026 0.0 0.0 0.0981
ENSG00000118520 ARG1 527174 eQTL 0.000891 -0.101 0.0304 0.0 0.0 0.0981
ENSG00000118523 CCN2 148946 pQTL 6.5e-11 -0.232 0.0352 0.0 0.0 0.0965

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -412880 7.3e-07 5.6e-07 7.87e-08 3.58e-07 1.05e-07 1.57e-07 3.94e-07 6.75e-08 2.75e-07 1.6e-07 4.13e-07 2.8e-07 6.27e-07 1.07e-07 1.68e-07 1.53e-07 1.62e-07 2.9e-07 1.27e-07 1.15e-07 1.52e-07 2.86e-07 2.77e-07 6.65e-08 6.39e-07 2.07e-07 1.85e-07 2.01e-07 2.13e-07 2.89e-07 1.95e-07 5.46e-08 4.93e-08 1.23e-07 3.04e-07 6.23e-08 1.06e-07 6.46e-08 5.7e-08 5.54e-08 5.56e-08 5.29e-07 2.94e-08 1.06e-08 9.15e-08 1.95e-08 9.19e-08 1.15e-08 4.59e-08