logo

Genes within 1Mb (chr6:132097080:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -304395 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0202 0.157 0.09 B L1
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 6.41e-03 0.161 0.0584 0.09 B L1
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 4.53e-01 -0.089 0.118 0.09 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0108 0.112 0.09 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0614 0.0674 0.09 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 7.82e-01 0.0389 0.14 0.09 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 3.78e-01 -0.125 0.142 0.09 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -34808 sc-eQTL 3.14e-01 0.094 0.093 0.09 B L1
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 2.02e-03 0.348 0.111 0.09 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 2.99e-01 0.094 0.0903 0.09 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 8.28e-01 0.0214 0.0987 0.09 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 2.90e-01 -0.071 0.067 0.09 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 4.57e-02 -0.242 0.12 0.09 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 2.76e-01 -0.148 0.135 0.09 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 5.70e-01 0.0647 0.114 0.09 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 6.92e-01 0.0444 0.112 0.09 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 7.91e-01 0.0352 0.133 0.09 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 8.28e-01 -0.00987 0.0454 0.09 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 2.80e-01 -0.138 0.127 0.09 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 4.46e-02 -0.275 0.136 0.09 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 2.73e-01 0.118 0.107 0.088 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -637685 sc-eQTL 5.05e-02 -0.259 0.132 0.088 DC L1
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 1.05e-01 -0.253 0.155 0.088 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -616975 sc-eQTL 6.37e-02 -0.266 0.142 0.088 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 9.24e-01 0.0146 0.154 0.088 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0316 0.0862 0.088 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 1.54e-01 0.219 0.153 0.088 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 2.45e-01 -0.158 0.136 0.088 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 8.22e-02 0.135 0.0774 0.09 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -637685 sc-eQTL 3.43e-01 -0.127 0.133 0.09 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 9.68e-01 0.00516 0.127 0.09 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -616975 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0467 0.144 0.09 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 2.75e-01 0.111 0.101 0.09 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 2.86e-01 0.0649 0.0607 0.09 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0728 0.126 0.09 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 9.95e-01 0.00079 0.12 0.09 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 1.04e-04 0.46 0.116 0.09 NK L1
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0733 0.11 0.09 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 4.76e-01 -0.107 0.15 0.09 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0309 0.0621 0.09 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0556 0.132 0.09 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 4.52e-01 0.0894 0.119 0.09 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 1.66e-01 -0.205 0.148 0.09 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 1.02e-01 -0.235 0.143 0.09 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0154 0.057 0.09 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00382 0.13 0.09 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 7.29e-01 0.0542 0.156 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -304395 sc-eQTL 2.40e-01 0.186 0.158 0.094 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 1.43e-01 0.217 0.148 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 2.30e-01 0.198 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 6.16e-02 -0.295 0.157 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00366 0.0848 0.094 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 8.24e-01 0.0365 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0572 0.148 0.094 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -34808 sc-eQTL 6.92e-01 0.0562 0.142 0.094 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -304395 sc-eQTL 4.87e-01 -0.103 0.148 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 7.87e-02 0.17 0.096 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 7.42e-01 0.0484 0.147 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 2.34e-01 -0.173 0.145 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0703 0.0891 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 9.12e-01 0.0165 0.15 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 9.43e-02 -0.268 0.16 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -34808 sc-eQTL 1.78e-02 -0.322 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -304395 sc-eQTL 6.74e-01 0.061 0.145 0.091 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 3.48e-01 0.107 0.113 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0155 0.146 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0242 0.149 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 1.45e-01 -0.104 0.0712 0.091 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 6.54e-02 -0.28 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0087 0.149 0.091 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -34808 sc-eQTL 7.78e-02 0.245 0.138 0.091 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -304395 sc-eQTL 2.59e-01 -0.184 0.163 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 1.85e-04 0.263 0.069 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0896 0.128 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 5.30e-01 0.0871 0.138 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0352 0.0789 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 3.73e-01 0.143 0.16 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 7.15e-01 0.0556 0.152 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -34808 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0495 0.101 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -304395 sc-eQTL 9.99e-01 0.000242 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 2.78e-01 0.0912 0.0839 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0626 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 7.36e-01 0.0522 0.154 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0804 0.0816 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 9.49e-01 0.0105 0.163 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 1.72e-01 -0.213 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -34808 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0217 0.108 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 5.64e-01 0.0951 0.165 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0102 0.171 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 7.34e-01 0.0565 0.166 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0564 0.0767 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 2.66e-01 -0.183 0.164 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 5.91e-01 0.0833 0.155 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 1.05e-02 0.312 0.121 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 4.32e-01 0.0824 0.105 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0219 0.114 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0428 0.0737 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 9.71e-02 -0.227 0.136 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 5.14e-02 -0.276 0.141 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 6.29e-02 0.255 0.137 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0132 0.116 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0135 0.136 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0716 0.0702 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0305 0.134 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 6.78e-01 0.0678 0.163 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 3.03e-01 0.163 0.158 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0818 0.146 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 4.14e-01 0.124 0.152 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 6.62e-01 0.0273 0.0623 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 1.04e-01 -0.26 0.159 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 5.07e-01 -0.103 0.155 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0444 0.132 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 2.83e-01 0.145 0.135 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 5.90e-01 0.0811 0.15 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 4.75e-01 0.0575 0.0803 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 4.22e-01 -0.122 0.151 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 4.08e-01 -0.129 0.156 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0431 0.158 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 2.87e-01 -0.136 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 9.95e-01 0.00094 0.137 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 8.64e-01 0.0134 0.0782 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 4.86e-01 -0.1 0.144 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 1.46e-01 -0.228 0.156 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0236 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 9.65e-01 -0.007 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 1.58e-01 -0.221 0.156 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 5.19e-01 0.0493 0.0762 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 5.42e-01 0.104 0.17 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 9.99e-03 -0.427 0.164 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 9.73e-01 0.00582 0.172 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 4.78e-01 0.118 0.166 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 8.54e-02 0.294 0.17 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 7.36e-02 0.165 0.0915 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 3.41e-01 -0.161 0.168 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0363 0.174 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 4.85e-01 0.109 0.156 0.091 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 3.39e-01 -0.156 0.163 0.091 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 4.31e-01 -0.125 0.158 0.091 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00241 0.0781 0.091 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 6.48e-01 0.0737 0.161 0.091 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 3.15e-01 0.164 0.163 0.091 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 6.08e-02 0.29 0.154 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0635 0.164 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0114 0.157 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 5.38e-01 0.0541 0.0877 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 7.34e-01 -0.054 0.159 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 2.83e-02 0.276 0.125 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0744 0.13 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 7.24e-01 -0.056 0.158 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0251 0.0628 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0397 0.138 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 5.64e-02 0.295 0.154 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 5.62e-01 -0.091 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0234 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0912 0.0729 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 8.74e-01 0.0258 0.163 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 2.71e-04 0.504 0.136 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 5.49e-01 0.087 0.145 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0309 0.158 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0445 0.0856 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0155 0.147 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -304395 sc-eQTL 1.85e-01 -0.204 0.153 0.107 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0994 0.128 0.107 PB L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 4.19e-01 -0.141 0.174 0.107 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 8.18e-01 0.0362 0.157 0.107 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 2.16e-01 0.11 0.0885 0.107 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 7.81e-01 0.0474 0.17 0.107 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 4.31e-01 -0.132 0.167 0.107 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -34808 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0469 0.11 0.107 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 7.97e-01 0.0361 0.14 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0636 0.158 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 4.60e-01 -0.111 0.15 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 5.47e-01 0.0343 0.0569 0.091 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0215 0.135 0.091 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 4.61e-01 -0.109 0.147 0.091 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 2.59e-02 0.332 0.148 0.09 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 9.51e-01 0.00939 0.154 0.09 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 3.43e-01 0.12 0.126 0.09 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 6.80e-01 -0.023 0.0558 0.09 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 2.80e-03 -0.393 0.13 0.09 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 4.09e-01 -0.13 0.157 0.09 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 6.89e-01 0.0539 0.134 0.088 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -637685 sc-eQTL 3.71e-02 -0.277 0.132 0.088 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 2.77e-02 -0.38 0.171 0.088 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -616975 sc-eQTL 3.20e-01 -0.156 0.157 0.088 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 7.39e-01 -0.051 0.153 0.088 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 7.52e-01 0.0239 0.0755 0.088 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 2.72e-02 0.37 0.166 0.088 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 5.31e-03 -0.413 0.146 0.088 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 2.99e-01 0.105 0.101 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -637685 sc-eQTL 2.64e-01 -0.16 0.143 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 5.89e-01 0.0767 0.142 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -616975 sc-eQTL 7.83e-01 -0.04 0.145 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 4.89e-01 0.0803 0.116 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 4.49e-01 0.0488 0.0642 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 2.69e-01 -0.153 0.138 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00259 0.124 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 3.57e-01 0.102 0.11 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -637685 sc-eQTL 7.30e-01 0.0478 0.138 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 4.86e-01 -0.105 0.15 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -616975 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0145 0.15 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 8.44e-01 0.0194 0.0983 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00206 0.0708 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0357 0.147 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 8.54e-01 0.0242 0.131 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 3.68e-01 0.166 0.183 0.088 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00886 0.197 0.088 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 9.50e-01 0.0127 0.204 0.088 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 8.09e-01 0.0188 0.0775 0.088 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 1.81e-01 0.275 0.205 0.088 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 2.84e-01 0.215 0.2 0.088 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 1.61e-01 0.208 0.148 0.089 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -637685 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0792 0.15 0.089 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0915 0.165 0.089 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -616975 sc-eQTL 9.92e-01 0.00155 0.148 0.089 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 2.71e-01 0.166 0.15 0.089 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 8.13e-01 0.0155 0.0657 0.089 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 2.06e-01 -0.204 0.16 0.089 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 2.91e-01 -0.169 0.159 0.089 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 3.13e-01 0.111 0.11 0.09 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -637685 sc-eQTL 8.52e-03 -0.405 0.153 0.09 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 4.53e-01 0.118 0.157 0.09 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -616975 sc-eQTL 8.79e-01 0.0234 0.154 0.09 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 3.86e-01 0.128 0.148 0.09 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 1.03e-02 0.189 0.0731 0.09 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 4.46e-02 0.305 0.151 0.09 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 1.91e-01 -0.171 0.131 0.09 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 6.67e-01 0.0535 0.124 0.093 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -637685 sc-eQTL 3.08e-01 -0.128 0.125 0.093 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 8.83e-01 0.0258 0.174 0.093 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -616975 sc-eQTL 2.17e-03 -0.385 0.123 0.093 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 7.29e-01 0.0525 0.152 0.093 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00895 0.104 0.093 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 4.06e-01 -0.118 0.142 0.093 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 2.83e-01 0.166 0.154 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -304395 sc-eQTL 2.64e-01 0.171 0.152 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 1.32e-02 0.213 0.0853 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 1.73e-01 0.18 0.132 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 3.93e-01 -0.117 0.137 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0612 0.0779 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 3.96e-01 -0.114 0.134 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 3.45e-01 -0.135 0.143 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -34808 sc-eQTL 4.85e-01 0.0966 0.138 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -304395 sc-eQTL 3.63e-01 -0.148 0.163 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 1.65e-03 0.208 0.0653 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0601 0.125 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 6.00e-01 0.0682 0.13 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0482 0.0785 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 5.09e-01 0.105 0.158 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0771 0.148 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -34808 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0331 0.0941 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 1.26e-01 0.13 0.0849 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -637685 sc-eQTL 4.68e-01 -0.101 0.139 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 8.23e-01 0.0299 0.134 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -616975 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0619 0.145 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 2.91e-01 0.101 0.0956 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 4.59e-01 0.0487 0.0657 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 6.53e-01 -0.059 0.131 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 9.32e-01 0.00993 0.117 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 9.61e-02 0.173 0.103 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -637685 sc-eQTL 2.75e-03 -0.454 0.15 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0947 0.149 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -616975 sc-eQTL 8.23e-01 -0.034 0.152 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 2.31e-01 0.171 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 3.56e-01 0.056 0.0605 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0726 0.153 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -716259 sc-eQTL 1.34e-01 -0.22 0.147 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -416118 sc-eQTL 1.55e-04 0.449 0.116 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 468838 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0552 0.117 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -666379 sc-eQTL 3.75e-01 -0.135 0.152 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -717489 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0262 0.0622 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 961613 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0454 0.129 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -416118 eQTL 5.42e-08 0.145 0.0264 0.0 0.0 0.0947
ENSG00000112299 VNN1 -616975 eQTL 0.025 0.0822 0.0366 0.0 0.0 0.0947
ENSG00000112303 VNN2 -666379 pQTL 0.0429 -0.0887 0.0437 0.0 0.0 0.0928
ENSG00000118520 ARG1 523936 eQTL 0.00446 -0.0883 0.031 0.0 0.0 0.0947
ENSG00000118523 CCN2 145708 pQTL 1e-12 -0.257 0.0357 0.0 0.0 0.0928

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -416118 1.04e-06 6.09e-07 1.12e-07 3.81e-07 9.16e-08 2.42e-07 5.76e-07 1.45e-07 4.43e-07 2.57e-07 7.32e-07 4.28e-07 8.16e-07 1.49e-07 2.57e-07 2.89e-07 3.52e-07 4.11e-07 2.17e-07 1.69e-07 2.05e-07 3.95e-07 3.77e-07 1.76e-07 7.94e-07 2.54e-07 3.1e-07 2.59e-07 4.06e-07 5.82e-07 3.1e-07 6.49e-08 4.55e-08 1.57e-07 3.3e-07 1.21e-07 1.02e-07 9.33e-08 6.38e-08 2.68e-08 1.03e-07 5.52e-07 4.47e-08 1.76e-08 1.49e-07 1.37e-08 1.26e-07 1.24e-08 5.93e-08
ENSG00000146409 \N -716259 3.14e-07 1.42e-07 5.93e-08 2.05e-07 1.03e-07 8.33e-08 1.9e-07 5.85e-08 1.5e-07 7.6e-08 1.59e-07 1.22e-07 1.87e-07 7.95e-08 5.69e-08 7.98e-08 4.45e-08 1.56e-07 7.12e-08 5.2e-08 1.27e-07 1.39e-07 1.58e-07 3.22e-08 1.72e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.07e-07 1.07e-07 3.6e-08 3.13e-08 9.3e-08 3.02e-08 2.68e-08 5.58e-08 8.89e-08 6.76e-08 4.08e-08 5.87e-08 1.48e-07 4.7e-08 1.88e-08 3.29e-08 1.71e-08 8.74e-08 1.93e-09 4.82e-08