logo

Genes within 1Mb (chr6:132096635:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -304840 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0197 0.156 0.092 B L1
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 3.62e-03 0.17 0.0577 0.092 B L1
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 3.67e-01 -0.106 0.117 0.092 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 9.13e-01 0.012 0.111 0.092 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0791 0.0666 0.092 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 7.76e-01 0.0396 0.139 0.092 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 3.02e-01 -0.145 0.14 0.092 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -35253 sc-eQTL 4.21e-01 0.0744 0.0922 0.092 B L1
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 1.85e-03 0.349 0.111 0.092 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 2.52e-01 0.103 0.0896 0.092 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00939 0.0981 0.092 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0839 0.0664 0.092 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 5.66e-02 -0.229 0.12 0.092 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 2.84e-01 -0.145 0.135 0.092 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 5.80e-01 0.0624 0.113 0.092 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 5.85e-01 0.0606 0.111 0.092 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 7.08e-01 0.0493 0.131 0.092 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0283 0.0449 0.092 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 4.11e-01 -0.104 0.126 0.092 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 2.97e-02 -0.294 0.134 0.092 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 2.12e-01 0.133 0.106 0.09 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -638130 sc-eQTL 4.88e-02 -0.26 0.131 0.09 DC L1
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 8.99e-02 -0.263 0.154 0.09 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -617420 sc-eQTL 1.12e-01 -0.226 0.142 0.09 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 8.89e-01 0.0213 0.153 0.09 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0594 0.0855 0.09 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 1.41e-01 0.224 0.152 0.09 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 2.62e-01 -0.152 0.135 0.09 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 6.23e-02 0.144 0.0767 0.092 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -638130 sc-eQTL 2.31e-01 -0.159 0.132 0.092 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 9.31e-01 0.0109 0.126 0.092 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -617420 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0531 0.143 0.092 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 2.58e-01 0.114 0.101 0.092 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 4.00e-01 0.0509 0.0603 0.092 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0444 0.125 0.092 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00923 0.12 0.092 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 9.56e-05 0.456 0.115 0.092 NK L1
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0697 0.109 0.092 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0922 0.148 0.092 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 4.24e-01 -0.049 0.0611 0.092 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0604 0.13 0.092 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 4.11e-01 0.0964 0.117 0.092 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 1.87e-01 -0.193 0.146 0.092 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 2.22e-01 -0.173 0.141 0.092 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 7.76e-01 -0.016 0.0563 0.092 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 9.13e-01 0.0139 0.128 0.092 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 7.72e-01 0.0446 0.154 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -304840 sc-eQTL 2.98e-01 0.163 0.156 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 1.57e-01 0.207 0.146 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 2.23e-01 0.198 0.162 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 5.59e-02 -0.298 0.155 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0284 0.0837 0.097 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 7.58e-01 0.05 0.162 0.097 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0502 0.147 0.097 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -35253 sc-eQTL 8.74e-01 0.0222 0.14 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -304840 sc-eQTL 4.35e-01 -0.114 0.146 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 8.43e-02 0.165 0.0949 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 7.72e-01 0.0422 0.145 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 2.98e-01 -0.15 0.144 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0863 0.088 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 8.80e-01 0.0224 0.148 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 1.09e-01 -0.254 0.158 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -35253 sc-eQTL 1.07e-02 -0.342 0.133 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -304840 sc-eQTL 6.34e-01 0.0683 0.143 0.093 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 3.60e-01 0.103 0.112 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0242 0.145 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0611 0.147 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 9.94e-02 -0.117 0.0705 0.093 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 4.31e-02 -0.304 0.149 0.093 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00607 0.148 0.093 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -35253 sc-eQTL 1.25e-01 0.211 0.137 0.093 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -304840 sc-eQTL 2.72e-01 -0.178 0.161 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 8.68e-05 0.273 0.0682 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0909 0.126 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 5.58e-01 0.0806 0.137 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 3.99e-01 -0.066 0.0781 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 3.87e-01 0.137 0.158 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 7.79e-01 0.0424 0.151 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -35253 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0555 0.0998 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -304840 sc-eQTL 8.86e-01 0.0221 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 2.57e-01 0.0947 0.0834 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0771 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 5.85e-01 0.084 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 1.74e-01 -0.11 0.081 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0193 0.162 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 1.10e-01 -0.248 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -35253 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0339 0.108 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 4.18e-01 0.133 0.163 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 8.93e-01 -0.023 0.17 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 5.38e-01 0.102 0.165 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0546 0.0761 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 4.63e-01 -0.12 0.163 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 7.98e-01 0.0393 0.154 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 1.17e-02 0.305 0.12 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 3.20e-01 0.104 0.104 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0518 0.113 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0596 0.0731 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 1.00e-01 -0.223 0.135 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 6.23e-02 -0.262 0.14 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 5.87e-02 0.258 0.136 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0188 0.115 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0282 0.135 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0878 0.0697 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0268 0.134 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 5.48e-01 0.0974 0.162 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 4.40e-01 0.122 0.157 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0593 0.145 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 5.47e-01 0.0911 0.151 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 8.09e-01 0.015 0.0619 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 1.37e-01 -0.236 0.158 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 4.96e-01 -0.105 0.154 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0742 0.13 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 5.40e-01 0.0821 0.134 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 7.09e-01 0.0554 0.148 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 8.02e-01 0.0199 0.0794 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0922 0.15 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 4.65e-01 -0.113 0.154 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 9.53e-01 0.0093 0.157 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 4.09e-01 -0.104 0.126 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 9.25e-01 0.0128 0.136 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 9.50e-01 0.00492 0.0777 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0619 0.143 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 1.07e-01 -0.251 0.155 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0236 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 9.65e-01 -0.007 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 1.58e-01 -0.221 0.156 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 5.19e-01 0.0493 0.0762 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 5.42e-01 0.104 0.17 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 9.99e-03 -0.427 0.164 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0049 0.17 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 3.12e-01 0.166 0.163 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 4.47e-02 0.338 0.167 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 9.80e-02 0.15 0.0903 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 3.41e-01 -0.159 0.166 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0652 0.172 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 3.11e-01 0.157 0.154 0.093 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 2.11e-01 -0.202 0.161 0.093 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0988 0.157 0.093 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00929 0.0772 0.093 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 4.97e-01 0.109 0.159 0.093 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 3.26e-01 0.159 0.162 0.093 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 4.33e-02 0.309 0.152 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 5.67e-01 -0.093 0.162 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0135 0.156 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 6.49e-01 0.0395 0.0868 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0467 0.157 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 2.62e-02 0.276 0.123 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0696 0.128 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0538 0.156 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0424 0.0619 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0352 0.136 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 7.58e-02 0.272 0.153 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0704 0.155 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0479 0.156 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 1.33e-01 -0.109 0.0721 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 8.44e-01 0.0318 0.161 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 3.05e-04 0.492 0.134 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 6.67e-01 0.0615 0.143 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0182 0.155 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0549 0.0842 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0231 0.144 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -304840 sc-eQTL 1.86e-01 -0.202 0.152 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0595 0.127 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 3.63e-01 -0.158 0.173 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 7.38e-01 0.0523 0.156 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 2.90e-01 0.0937 0.088 0.111 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 6.81e-01 0.0695 0.169 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 4.03e-01 -0.139 0.165 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -35253 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0447 0.109 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 7.68e-01 0.0411 0.139 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0411 0.156 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0956 0.149 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 7.03e-01 0.0215 0.0564 0.093 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0179 0.134 0.093 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 4.26e-01 -0.116 0.146 0.093 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 1.21e-02 0.372 0.147 0.092 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000207 0.153 0.092 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 3.92e-01 0.107 0.125 0.092 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0192 0.0554 0.092 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 4.17e-03 -0.375 0.129 0.092 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 2.91e-01 -0.165 0.156 0.092 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 4.96e-01 0.0909 0.133 0.09 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -638130 sc-eQTL 2.02e-02 -0.306 0.131 0.09 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 3.35e-02 -0.365 0.17 0.09 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -617420 sc-eQTL 3.57e-01 -0.144 0.155 0.09 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 8.74e-01 -0.024 0.152 0.09 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0105 0.0749 0.09 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 4.53e-02 0.333 0.165 0.09 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 4.54e-03 -0.417 0.145 0.09 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 2.35e-01 0.12 0.1 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -638130 sc-eQTL 1.86e-01 -0.188 0.142 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 5.42e-01 0.0859 0.141 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -617420 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0446 0.144 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 3.90e-01 0.0988 0.115 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 6.39e-01 0.03 0.0638 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 3.69e-01 -0.123 0.137 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0283 0.123 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 3.72e-01 0.098 0.11 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -638130 sc-eQTL 8.39e-01 0.0279 0.137 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0768 0.149 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -617420 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00755 0.149 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 8.18e-01 0.0225 0.0976 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0249 0.0702 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 9.90e-01 0.00184 0.146 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 8.91e-01 0.0179 0.13 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 3.68e-01 0.166 0.183 0.088 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00886 0.197 0.088 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 9.50e-01 0.0127 0.204 0.088 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 8.09e-01 0.0188 0.0775 0.088 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 1.81e-01 0.275 0.205 0.088 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 2.84e-01 0.215 0.2 0.088 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 1.08e-01 0.236 0.146 0.091 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -638130 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0999 0.148 0.091 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 4.86e-01 -0.114 0.163 0.091 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -617420 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00987 0.147 0.091 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 2.33e-01 0.178 0.149 0.091 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 8.66e-01 0.011 0.065 0.091 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 2.39e-01 -0.187 0.159 0.091 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 3.79e-01 -0.139 0.158 0.091 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 2.82e-01 0.117 0.108 0.093 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -638130 sc-eQTL 3.66e-03 -0.442 0.15 0.093 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 5.12e-01 0.102 0.155 0.093 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -617420 sc-eQTL 8.64e-01 0.026 0.152 0.093 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 3.61e-01 0.134 0.146 0.093 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 1.74e-02 0.174 0.0724 0.093 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 2.42e-02 0.338 0.149 0.093 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 1.38e-01 -0.192 0.129 0.093 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 5.18e-01 0.0798 0.123 0.096 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -638130 sc-eQTL 3.40e-01 -0.119 0.124 0.096 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 9.99e-01 0.00025 0.173 0.096 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -617420 sc-eQTL 7.91e-03 -0.332 0.124 0.096 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 7.74e-01 0.0433 0.15 0.096 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 7.29e-01 -0.036 0.104 0.096 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0916 0.141 0.096 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 2.77e-01 0.167 0.153 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -304840 sc-eQTL 2.69e-01 0.167 0.151 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 1.49e-02 0.208 0.0845 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 1.74e-01 0.178 0.131 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 3.73e-01 -0.121 0.135 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0696 0.0771 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 4.31e-01 -0.105 0.133 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 3.76e-01 -0.126 0.142 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -35253 sc-eQTL 7.01e-01 0.0526 0.137 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -304840 sc-eQTL 4.24e-01 -0.129 0.161 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 9.18e-04 0.217 0.0645 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0718 0.124 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 5.44e-01 0.0781 0.128 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0762 0.0776 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 5.38e-01 0.0965 0.156 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 4.74e-01 -0.105 0.147 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -35253 sc-eQTL 6.84e-01 -0.038 0.0932 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 1.10e-01 0.135 0.0841 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -638130 sc-eQTL 3.24e-01 -0.136 0.138 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 7.08e-01 0.0498 0.133 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -617420 sc-eQTL 6.52e-01 -0.065 0.144 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 2.76e-01 0.104 0.0949 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 6.90e-01 0.0261 0.0652 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0328 0.13 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 9.25e-01 -0.011 0.116 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 6.94e-02 0.186 0.102 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -638130 sc-eQTL 9.80e-04 -0.494 0.148 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 4.57e-01 -0.11 0.147 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -617420 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0306 0.15 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 1.97e-01 0.182 0.141 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 4.75e-01 0.0429 0.06 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0427 0.151 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -716704 sc-eQTL 1.59e-01 -0.205 0.145 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -416563 sc-eQTL 1.47e-04 0.444 0.115 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 468393 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0529 0.115 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -666824 sc-eQTL 4.15e-01 -0.123 0.15 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -717934 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0455 0.0613 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 961168 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0447 0.127 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -416563 eQTL 4.26e-08 0.143 0.026 0.0 0.0 0.0981
ENSG00000118520 ARG1 523491 eQTL 0.000913 -0.101 0.0304 0.0 0.0 0.0981
ENSG00000118523 CCN2 145263 pQTL 6.48e-11 -0.231 0.0351 0.0 0.0 0.0965

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -416563 1.63e-06 2.14e-06 2.43e-07 1.33e-06 3.23e-07 6.41e-07 1.49e-06 3.68e-07 1.66e-06 6.07e-07 2.02e-06 1.28e-06 2.61e-06 5.79e-07 3.96e-07 9.98e-07 1.04e-06 9.58e-07 6.75e-07 5.05e-07 7.11e-07 1.97e-06 1.04e-06 6.25e-07 2.35e-06 6.52e-07 1.03e-06 1e-06 1.59e-06 1.29e-06 8.35e-07 1.92e-07 3.23e-07 6.29e-07 5.52e-07 4.32e-07 7.24e-07 2.03e-07 4.87e-07 3.02e-07 3.03e-07 1.67e-06 4.15e-07 3.36e-08 1.7e-07 2.13e-07 2.09e-07 2.1e-07 1.97e-07