logo

Genes within 1Mb (chr6:132093699:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -307776 sc-eQTL 9.70e-01 0.00569 0.15 0.094 B L1
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 7.18e-03 0.151 0.0557 0.094 B L1
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 2.45e-01 -0.131 0.113 0.094 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 8.24e-01 0.0237 0.107 0.094 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0711 0.0643 0.094 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 8.18e-01 0.0309 0.134 0.094 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 4.02e-01 -0.114 0.135 0.094 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -38189 sc-eQTL 2.90e-01 0.0941 0.0888 0.094 B L1
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 2.66e-03 0.325 0.107 0.094 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 2.09e-01 0.109 0.0863 0.094 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 9.92e-01 0.000924 0.0946 0.094 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0921 0.064 0.094 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 8.20e-02 -0.202 0.115 0.094 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 4.13e-01 -0.107 0.13 0.094 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 7.44e-01 0.0355 0.109 0.094 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 5.18e-01 0.0692 0.107 0.094 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 7.92e-01 0.0335 0.127 0.094 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0352 0.0433 0.094 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0968 0.122 0.094 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 3.85e-02 -0.27 0.13 0.094 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 1.57e-01 0.144 0.102 0.092 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -641066 sc-eQTL 3.83e-02 -0.261 0.125 0.092 DC L1
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 1.44e-01 -0.217 0.148 0.092 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -620356 sc-eQTL 1.67e-01 -0.189 0.136 0.092 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 8.47e-01 0.0282 0.146 0.092 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0554 0.0818 0.092 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 9.95e-02 0.24 0.145 0.092 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 3.46e-01 -0.122 0.129 0.092 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 4.18e-02 0.151 0.0738 0.094 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -641066 sc-eQTL 2.72e-01 -0.14 0.128 0.094 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 9.52e-01 0.00725 0.122 0.094 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -620356 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0845 0.138 0.094 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 2.84e-01 0.104 0.0969 0.094 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 5.04e-01 0.0389 0.0582 0.094 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0262 0.121 0.094 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0118 0.115 0.094 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 1.69e-04 0.425 0.111 0.094 NK L1
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0535 0.105 0.094 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 5.38e-01 -0.088 0.143 0.094 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0496 0.059 0.094 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0382 0.125 0.094 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 4.11e-01 0.0932 0.113 0.094 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 1.46e-01 -0.205 0.141 0.094 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 1.88e-01 -0.18 0.136 0.094 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0191 0.0543 0.094 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000748 0.124 0.094 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 7.79e-01 0.0417 0.149 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -307776 sc-eQTL 2.98e-01 0.163 0.156 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 1.57e-01 0.207 0.146 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 2.23e-01 0.198 0.162 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 5.59e-02 -0.298 0.155 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0284 0.0837 0.097 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 7.58e-01 0.05 0.162 0.097 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0502 0.147 0.097 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -38189 sc-eQTL 8.74e-01 0.0222 0.14 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -307776 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0751 0.14 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 9.03e-02 0.155 0.0913 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 9.00e-01 0.0176 0.14 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 3.57e-01 -0.128 0.138 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0817 0.0846 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00876 0.142 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 1.57e-01 -0.216 0.152 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -38189 sc-eQTL 2.08e-02 -0.299 0.128 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -307776 sc-eQTL 7.60e-01 0.0423 0.138 0.095 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 4.79e-01 0.0768 0.108 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00473 0.14 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0746 0.142 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 1.09e-01 -0.109 0.0679 0.095 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 5.51e-02 -0.278 0.144 0.095 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 8.66e-01 0.0242 0.142 0.095 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -38189 sc-eQTL 2.27e-01 0.16 0.132 0.095 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -307776 sc-eQTL 3.75e-01 -0.139 0.156 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 1.33e-04 0.257 0.066 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0898 0.122 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 4.29e-01 0.105 0.132 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0547 0.0754 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 3.47e-01 0.144 0.153 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 9.23e-01 0.014 0.146 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -38189 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0415 0.0965 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -307776 sc-eQTL 8.20e-01 0.0338 0.148 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 3.41e-01 0.0768 0.0805 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 4.04e-01 -0.124 0.149 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 6.13e-01 0.075 0.148 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 1.85e-01 -0.104 0.0781 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0278 0.157 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 1.93e-01 -0.194 0.149 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -38189 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0038 0.104 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 4.44e-01 0.12 0.156 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0296 0.163 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 5.13e-01 0.103 0.158 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0521 0.0728 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0863 0.156 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00373 0.147 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 1.24e-02 0.292 0.116 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 2.66e-01 0.112 0.1 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0439 0.109 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0703 0.0704 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 1.30e-01 -0.198 0.13 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 1.07e-01 -0.219 0.135 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 1.01e-01 0.216 0.131 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 8.29e-01 -0.024 0.111 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 9.88e-01 0.00191 0.13 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0907 0.0671 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 9.83e-01 0.00271 0.129 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 4.17e-01 0.127 0.156 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 4.82e-01 0.107 0.151 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0568 0.14 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 4.62e-01 0.107 0.145 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 8.72e-01 0.00964 0.0597 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 1.58e-01 -0.217 0.153 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0911 0.148 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0751 0.126 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 5.30e-01 0.0813 0.129 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 7.88e-01 0.0385 0.143 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 7.93e-01 0.0201 0.0766 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0709 0.144 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0936 0.148 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0155 0.151 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0842 0.122 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 9.04e-01 0.0157 0.131 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0108 0.0748 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0726 0.137 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 1.53e-01 -0.214 0.149 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0434 0.151 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 9.34e-01 0.0125 0.152 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 2.11e-01 -0.187 0.149 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 5.81e-01 0.0404 0.0731 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 5.69e-01 0.0928 0.163 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 9.22e-03 -0.414 0.158 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 8.39e-01 0.0333 0.163 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 4.48e-01 0.12 0.157 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 7.36e-02 0.29 0.161 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 1.09e-01 0.14 0.0868 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 4.51e-01 -0.121 0.16 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0799 0.165 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 2.86e-01 0.158 0.148 0.095 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 1.84e-01 -0.206 0.155 0.095 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 3.80e-01 -0.133 0.151 0.095 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0148 0.0742 0.095 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 5.21e-01 0.0985 0.153 0.095 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 3.40e-01 0.149 0.155 0.095 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 6.58e-02 0.272 0.147 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0798 0.157 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 9.74e-01 0.00492 0.15 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 7.41e-01 0.0277 0.0838 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0158 0.152 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 3.76e-02 0.249 0.119 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0604 0.124 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0572 0.15 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 4.72e-01 -0.043 0.0596 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0234 0.131 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 9.63e-02 0.245 0.147 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0309 0.149 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0414 0.15 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 1.17e-01 -0.109 0.0693 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 9.89e-01 0.00215 0.155 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 3.20e-04 0.472 0.129 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 5.63e-01 0.0797 0.138 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00908 0.15 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0613 0.0811 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00272 0.139 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -307776 sc-eQTL 1.86e-01 -0.202 0.152 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0595 0.127 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 3.63e-01 -0.158 0.173 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 7.38e-01 0.0523 0.156 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 2.90e-01 0.0937 0.088 0.111 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 6.81e-01 0.0695 0.169 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 4.03e-01 -0.139 0.165 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -38189 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0447 0.109 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 8.20e-01 0.0304 0.134 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0443 0.151 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 5.49e-01 -0.086 0.143 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 6.26e-01 0.0265 0.0543 0.096 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0367 0.129 0.096 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 4.75e-01 -0.1 0.14 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 1.19e-02 0.359 0.141 0.094 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 9.26e-01 0.0137 0.148 0.094 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 4.34e-01 0.0946 0.121 0.094 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0214 0.0534 0.094 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 8.37e-03 -0.333 0.125 0.094 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 3.03e-01 -0.155 0.151 0.094 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 4.51e-01 0.0966 0.128 0.093 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -641066 sc-eQTL 1.60e-02 -0.304 0.125 0.093 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 6.73e-02 -0.302 0.164 0.093 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -620356 sc-eQTL 4.77e-01 -0.106 0.149 0.093 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00949 0.146 0.093 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 9.80e-01 0.00179 0.0719 0.093 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 2.81e-02 0.351 0.158 0.093 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 4.53e-03 -0.401 0.139 0.093 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 2.46e-01 0.113 0.0967 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -641066 sc-eQTL 2.37e-01 -0.162 0.137 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 5.38e-01 0.0835 0.135 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -620356 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0787 0.138 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 3.73e-01 0.0986 0.11 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 7.81e-01 0.0171 0.0614 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0957 0.132 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0309 0.119 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 4.12e-01 0.0868 0.106 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -641066 sc-eQTL 8.64e-01 0.0227 0.132 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0721 0.143 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -620356 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0337 0.143 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 8.49e-01 0.018 0.0939 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0329 0.0676 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 8.99e-01 0.0179 0.14 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 8.64e-01 0.0214 0.125 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 5.17e-01 0.115 0.177 0.091 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0444 0.191 0.091 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 8.57e-01 0.0355 0.197 0.091 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 7.85e-01 0.0204 0.0748 0.091 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 2.18e-01 0.245 0.198 0.091 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 1.82e-01 0.258 0.192 0.091 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 7.83e-02 0.249 0.14 0.093 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -641066 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0615 0.143 0.093 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 4.64e-01 -0.115 0.157 0.093 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -620356 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0122 0.141 0.093 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 2.92e-01 0.151 0.143 0.093 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 9.23e-01 0.00608 0.0625 0.093 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 3.09e-01 -0.156 0.153 0.093 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 3.97e-01 -0.129 0.152 0.093 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 2.37e-01 0.123 0.104 0.095 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -641066 sc-eQTL 3.22e-03 -0.429 0.144 0.095 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 5.71e-01 0.0846 0.149 0.095 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -620356 sc-eQTL 9.55e-01 0.00827 0.146 0.095 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 3.79e-01 0.124 0.14 0.095 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 4.45e-02 0.141 0.0697 0.095 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 2.80e-02 0.316 0.143 0.095 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 1.55e-01 -0.177 0.124 0.095 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 5.45e-01 0.071 0.117 0.099 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -641066 sc-eQTL 2.86e-01 -0.126 0.117 0.099 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 8.21e-01 0.0372 0.164 0.099 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -620356 sc-eQTL 8.91e-03 -0.311 0.117 0.099 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 7.86e-01 0.0388 0.143 0.099 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0406 0.0983 0.099 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0647 0.134 0.099 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 2.00e-01 0.186 0.145 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -307776 sc-eQTL 2.26e-01 0.176 0.145 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 2.65e-02 0.182 0.0817 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 2.15e-01 0.157 0.126 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 4.00e-01 -0.11 0.13 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0621 0.0743 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 3.66e-01 -0.116 0.128 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0873 0.137 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -38189 sc-eQTL 7.93e-01 0.0346 0.132 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -307776 sc-eQTL 5.17e-01 -0.101 0.156 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 1.13e-03 0.206 0.0623 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 3.90e-01 -0.103 0.12 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 4.82e-01 0.0872 0.124 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0675 0.0749 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 5.35e-01 0.0938 0.151 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 5.30e-01 -0.089 0.141 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -38189 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00866 0.09 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 1.28e-01 0.124 0.0811 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -641066 sc-eQTL 3.73e-01 -0.118 0.133 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 7.19e-01 0.0461 0.128 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -620356 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0955 0.138 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 3.07e-01 0.0937 0.0914 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 8.26e-01 0.0138 0.0628 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0141 0.125 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0149 0.112 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 4.68e-02 0.196 0.0981 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -641066 sc-eQTL 1.60e-03 -0.455 0.142 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 4.19e-01 -0.115 0.142 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -620356 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0476 0.144 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 2.44e-01 0.158 0.136 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 6.23e-01 0.0284 0.0577 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0292 0.146 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -719640 sc-eQTL 1.57e-01 -0.198 0.14 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -419499 sc-eQTL 2.05e-04 0.419 0.111 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 465457 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0393 0.111 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -669760 sc-eQTL 4.19e-01 -0.117 0.145 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -720870 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0467 0.0591 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 958232 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0268 0.123 0.095 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -419499 eQTL 5.31e-08 0.142 0.0259 0.0 0.0 0.0986
ENSG00000118520 ARG1 520555 eQTL 0.000977 -0.1 0.0304 0.0 0.0 0.0986
ENSG00000118523 CCN2 142327 pQTL 3.9e-11 -0.234 0.0351 0.0 0.0 0.0972

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -419499 1.26e-06 9.37e-07 2.7e-07 5.92e-07 1.19e-07 3.12e-07 8.96e-07 2.7e-07 8.36e-07 3.09e-07 1.16e-06 5.81e-07 1.35e-06 2.55e-07 4.31e-07 4.84e-07 5.92e-07 5.27e-07 4.7e-07 3.54e-07 2.89e-07 6.91e-07 6.11e-07 4.44e-07 1.54e-06 2.53e-07 5.49e-07 5.29e-07 7.07e-07 8.63e-07 4.59e-07 7.24e-08 1.75e-07 3.82e-07 3.96e-07 4.5e-07 4.74e-07 1.38e-07 2.19e-07 8.82e-08 1.99e-07 1.4e-06 6.17e-08 1.23e-08 1.87e-07 7.77e-08 1.45e-07 8.48e-08 8.44e-08