logo

Genes within 1Mb (chr6:132090725:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -310750 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0202 0.157 0.09 B L1
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 6.41e-03 0.161 0.0584 0.09 B L1
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 4.53e-01 -0.089 0.118 0.09 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0108 0.112 0.09 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0614 0.0674 0.09 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 7.82e-01 0.0389 0.14 0.09 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 3.78e-01 -0.125 0.142 0.09 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -41163 sc-eQTL 3.14e-01 0.094 0.093 0.09 B L1
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 2.02e-03 0.348 0.111 0.09 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 2.99e-01 0.094 0.0903 0.09 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 8.28e-01 0.0214 0.0987 0.09 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 2.90e-01 -0.071 0.067 0.09 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 4.57e-02 -0.242 0.12 0.09 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 2.76e-01 -0.148 0.135 0.09 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 5.70e-01 0.0647 0.114 0.09 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 6.92e-01 0.0444 0.112 0.09 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 7.91e-01 0.0352 0.133 0.09 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 8.28e-01 -0.00987 0.0454 0.09 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 2.80e-01 -0.138 0.127 0.09 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 4.46e-02 -0.275 0.136 0.09 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 2.73e-01 0.118 0.107 0.088 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -644040 sc-eQTL 5.05e-02 -0.259 0.132 0.088 DC L1
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 1.05e-01 -0.253 0.155 0.088 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -623330 sc-eQTL 6.37e-02 -0.266 0.142 0.088 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 9.24e-01 0.0146 0.154 0.088 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0316 0.0862 0.088 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 1.54e-01 0.219 0.153 0.088 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 2.45e-01 -0.158 0.136 0.088 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 8.22e-02 0.135 0.0774 0.09 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -644040 sc-eQTL 3.43e-01 -0.127 0.133 0.09 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 9.68e-01 0.00516 0.127 0.09 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -623330 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0467 0.144 0.09 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 2.75e-01 0.111 0.101 0.09 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 2.86e-01 0.0649 0.0607 0.09 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0728 0.126 0.09 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 9.95e-01 0.00079 0.12 0.09 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 1.04e-04 0.46 0.116 0.09 NK L1
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0733 0.11 0.09 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 4.76e-01 -0.107 0.15 0.09 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0309 0.0621 0.09 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0556 0.132 0.09 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 4.52e-01 0.0894 0.119 0.09 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 1.66e-01 -0.205 0.148 0.09 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 1.02e-01 -0.235 0.143 0.09 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0154 0.057 0.09 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00382 0.13 0.09 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 7.29e-01 0.0542 0.156 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -310750 sc-eQTL 2.40e-01 0.186 0.158 0.094 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 1.43e-01 0.217 0.148 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 2.30e-01 0.198 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 6.16e-02 -0.295 0.157 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00366 0.0848 0.094 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 8.24e-01 0.0365 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0572 0.148 0.094 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -41163 sc-eQTL 6.92e-01 0.0562 0.142 0.094 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -310750 sc-eQTL 4.87e-01 -0.103 0.148 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 7.87e-02 0.17 0.096 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 7.42e-01 0.0484 0.147 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 2.34e-01 -0.173 0.145 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0703 0.0891 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 9.12e-01 0.0165 0.15 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 9.43e-02 -0.268 0.16 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -41163 sc-eQTL 1.78e-02 -0.322 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -310750 sc-eQTL 6.74e-01 0.061 0.145 0.091 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 3.48e-01 0.107 0.113 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0155 0.146 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0242 0.149 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 1.45e-01 -0.104 0.0712 0.091 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 6.54e-02 -0.28 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0087 0.149 0.091 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -41163 sc-eQTL 7.78e-02 0.245 0.138 0.091 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -310750 sc-eQTL 2.59e-01 -0.184 0.163 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 1.85e-04 0.263 0.069 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0896 0.128 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 5.30e-01 0.0871 0.138 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0352 0.0789 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 3.73e-01 0.143 0.16 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 7.15e-01 0.0556 0.152 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -41163 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0495 0.101 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -310750 sc-eQTL 9.99e-01 0.000242 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 2.78e-01 0.0912 0.0839 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0626 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 7.36e-01 0.0522 0.154 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0804 0.0816 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 9.49e-01 0.0105 0.163 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 1.72e-01 -0.213 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -41163 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0217 0.108 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 5.64e-01 0.0951 0.165 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0102 0.171 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 7.34e-01 0.0565 0.166 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0564 0.0767 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 2.66e-01 -0.183 0.164 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 5.91e-01 0.0833 0.155 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 1.05e-02 0.312 0.121 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 4.32e-01 0.0824 0.105 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0219 0.114 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0428 0.0737 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 9.71e-02 -0.227 0.136 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 5.14e-02 -0.276 0.141 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 6.29e-02 0.255 0.137 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0132 0.116 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0135 0.136 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0716 0.0702 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0305 0.134 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 6.78e-01 0.0678 0.163 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 3.03e-01 0.163 0.158 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0818 0.146 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 4.14e-01 0.124 0.152 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 6.62e-01 0.0273 0.0623 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 1.04e-01 -0.26 0.159 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 5.07e-01 -0.103 0.155 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0444 0.132 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 2.83e-01 0.145 0.135 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 5.90e-01 0.0811 0.15 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 4.75e-01 0.0575 0.0803 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 4.22e-01 -0.122 0.151 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 4.08e-01 -0.129 0.156 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0431 0.158 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 2.87e-01 -0.136 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 9.95e-01 0.00094 0.137 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 8.64e-01 0.0134 0.0782 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 4.86e-01 -0.1 0.144 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 1.46e-01 -0.228 0.156 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0236 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 9.65e-01 -0.007 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 1.58e-01 -0.221 0.156 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 5.19e-01 0.0493 0.0762 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 5.42e-01 0.104 0.17 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 9.99e-03 -0.427 0.164 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 9.73e-01 0.00582 0.172 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 4.78e-01 0.118 0.166 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 8.54e-02 0.294 0.17 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 7.36e-02 0.165 0.0915 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 3.41e-01 -0.161 0.168 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0363 0.174 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 4.85e-01 0.109 0.156 0.091 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 3.39e-01 -0.156 0.163 0.091 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 4.31e-01 -0.125 0.158 0.091 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00241 0.0781 0.091 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 6.48e-01 0.0737 0.161 0.091 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 3.15e-01 0.164 0.163 0.091 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 6.08e-02 0.29 0.154 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0635 0.164 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0114 0.157 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 5.38e-01 0.0541 0.0877 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 7.34e-01 -0.054 0.159 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 2.83e-02 0.276 0.125 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0744 0.13 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 7.24e-01 -0.056 0.158 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0251 0.0628 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0397 0.138 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 5.64e-02 0.295 0.154 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 5.62e-01 -0.091 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0234 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0912 0.0729 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 8.74e-01 0.0258 0.163 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 2.71e-04 0.504 0.136 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 5.49e-01 0.087 0.145 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0309 0.158 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0445 0.0856 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0155 0.147 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -310750 sc-eQTL 1.85e-01 -0.204 0.153 0.107 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0994 0.128 0.107 PB L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 4.19e-01 -0.141 0.174 0.107 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 8.18e-01 0.0362 0.157 0.107 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 2.16e-01 0.11 0.0885 0.107 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 7.81e-01 0.0474 0.17 0.107 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 4.31e-01 -0.132 0.167 0.107 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -41163 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0469 0.11 0.107 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 7.97e-01 0.0361 0.14 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0636 0.158 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 4.60e-01 -0.111 0.15 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 5.47e-01 0.0343 0.0569 0.091 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0215 0.135 0.091 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 4.61e-01 -0.109 0.147 0.091 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 2.59e-02 0.332 0.148 0.09 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 9.51e-01 0.00939 0.154 0.09 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 3.43e-01 0.12 0.126 0.09 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 6.80e-01 -0.023 0.0558 0.09 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 2.80e-03 -0.393 0.13 0.09 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 4.09e-01 -0.13 0.157 0.09 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 6.89e-01 0.0539 0.134 0.088 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -644040 sc-eQTL 3.71e-02 -0.277 0.132 0.088 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 2.77e-02 -0.38 0.171 0.088 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -623330 sc-eQTL 3.20e-01 -0.156 0.157 0.088 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 7.39e-01 -0.051 0.153 0.088 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 7.52e-01 0.0239 0.0755 0.088 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 2.72e-02 0.37 0.166 0.088 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 5.31e-03 -0.413 0.146 0.088 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 2.99e-01 0.105 0.101 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -644040 sc-eQTL 2.64e-01 -0.16 0.143 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 5.89e-01 0.0767 0.142 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -623330 sc-eQTL 7.83e-01 -0.04 0.145 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 4.89e-01 0.0803 0.116 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 4.49e-01 0.0488 0.0642 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 2.69e-01 -0.153 0.138 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00259 0.124 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 3.57e-01 0.102 0.11 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -644040 sc-eQTL 7.30e-01 0.0478 0.138 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 4.86e-01 -0.105 0.15 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -623330 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0145 0.15 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 8.44e-01 0.0194 0.0983 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00206 0.0708 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0357 0.147 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 8.54e-01 0.0242 0.131 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 3.68e-01 0.166 0.183 0.088 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00886 0.197 0.088 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 9.50e-01 0.0127 0.204 0.088 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 8.09e-01 0.0188 0.0775 0.088 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 1.81e-01 0.275 0.205 0.088 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 2.84e-01 0.215 0.2 0.088 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 1.61e-01 0.208 0.148 0.089 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -644040 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0792 0.15 0.089 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0915 0.165 0.089 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -623330 sc-eQTL 9.92e-01 0.00155 0.148 0.089 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 2.71e-01 0.166 0.15 0.089 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 8.13e-01 0.0155 0.0657 0.089 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 2.06e-01 -0.204 0.16 0.089 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 2.91e-01 -0.169 0.159 0.089 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 3.13e-01 0.111 0.11 0.09 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -644040 sc-eQTL 8.52e-03 -0.405 0.153 0.09 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 4.53e-01 0.118 0.157 0.09 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -623330 sc-eQTL 8.79e-01 0.0234 0.154 0.09 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 3.86e-01 0.128 0.148 0.09 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 1.03e-02 0.189 0.0731 0.09 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 4.46e-02 0.305 0.151 0.09 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 1.91e-01 -0.171 0.131 0.09 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 6.67e-01 0.0535 0.124 0.093 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -644040 sc-eQTL 3.08e-01 -0.128 0.125 0.093 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 8.83e-01 0.0258 0.174 0.093 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -623330 sc-eQTL 2.17e-03 -0.385 0.123 0.093 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 7.29e-01 0.0525 0.152 0.093 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00895 0.104 0.093 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 4.06e-01 -0.118 0.142 0.093 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 2.83e-01 0.166 0.154 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -310750 sc-eQTL 2.64e-01 0.171 0.152 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 1.32e-02 0.213 0.0853 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 1.73e-01 0.18 0.132 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 3.93e-01 -0.117 0.137 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0612 0.0779 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 3.96e-01 -0.114 0.134 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 3.45e-01 -0.135 0.143 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -41163 sc-eQTL 4.85e-01 0.0966 0.138 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -310750 sc-eQTL 3.63e-01 -0.148 0.163 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 1.65e-03 0.208 0.0653 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0601 0.125 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 6.00e-01 0.0682 0.13 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0482 0.0785 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 5.09e-01 0.105 0.158 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0771 0.148 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -41163 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0331 0.0941 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 1.26e-01 0.13 0.0849 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -644040 sc-eQTL 4.68e-01 -0.101 0.139 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 8.23e-01 0.0299 0.134 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -623330 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0619 0.145 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 2.91e-01 0.101 0.0956 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 4.59e-01 0.0487 0.0657 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 6.53e-01 -0.059 0.131 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 9.32e-01 0.00993 0.117 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 9.61e-02 0.173 0.103 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -644040 sc-eQTL 2.75e-03 -0.454 0.15 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0947 0.149 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -623330 sc-eQTL 8.23e-01 -0.034 0.152 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 2.31e-01 0.171 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 3.56e-01 0.056 0.0605 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0726 0.153 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -722614 sc-eQTL 1.34e-01 -0.22 0.147 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -422473 sc-eQTL 1.55e-04 0.449 0.116 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 462483 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0552 0.117 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -672734 sc-eQTL 3.75e-01 -0.135 0.152 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -723844 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0262 0.0622 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 955258 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0454 0.129 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -422473 eQTL 6.92e-08 0.144 0.0264 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000112299 VNN1 -623330 eQTL 0.0224 0.0837 0.0366 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000112303 VNN2 -672734 pQTL 0.0449 -0.0878 0.0437 0.0 0.0 0.0936
ENSG00000118520 ARG1 517581 eQTL 0.00481 -0.0876 0.031 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000118523 CCN2 139353 pQTL 5.78e-13 -0.26 0.0357 0.0 0.0 0.0936

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -422473 4.89e-06 8.92e-06 1.34e-06 4.16e-06 2.58e-06 4.22e-06 9.57e-06 3.36e-06 1.31e-05 6.13e-06 2.41e-05 5.89e-06 2.01e-05 3.86e-06 5.24e-06 9.02e-06 3.71e-06 1.11e-05 2.15e-06 2.64e-06 1.11e-05 1.36e-05 1.12e-05 1.93e-06 1.19e-05 2.92e-06 4.48e-06 5.78e-06 9.09e-06 4.45e-06 1.27e-05 9.86e-07 1.17e-06 2.26e-06 2.42e-06 3.47e-06 1.74e-06 1.89e-06 9.08e-07 6.06e-07 4.36e-07 4.06e-05 2.06e-06 1.68e-07 8.09e-07 2.52e-06 2.04e-06 7.04e-07 5.79e-07