logo

Genes within 1Mb (chr6:132083741:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -317734 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0202 0.157 0.09 B L1
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 6.41e-03 0.161 0.0584 0.09 B L1
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 4.53e-01 -0.089 0.118 0.09 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0108 0.112 0.09 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0614 0.0674 0.09 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 7.82e-01 0.0389 0.14 0.09 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 3.78e-01 -0.125 0.142 0.09 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -48147 sc-eQTL 3.14e-01 0.094 0.093 0.09 B L1
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 2.02e-03 0.348 0.111 0.09 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 2.99e-01 0.094 0.0903 0.09 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 8.28e-01 0.0214 0.0987 0.09 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 2.90e-01 -0.071 0.067 0.09 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 4.57e-02 -0.242 0.12 0.09 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 2.76e-01 -0.148 0.135 0.09 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 5.70e-01 0.0647 0.114 0.09 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 6.92e-01 0.0444 0.112 0.09 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 7.91e-01 0.0352 0.133 0.09 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 8.28e-01 -0.00987 0.0454 0.09 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 2.80e-01 -0.138 0.127 0.09 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 4.46e-02 -0.275 0.136 0.09 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 2.73e-01 0.118 0.107 0.088 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -651024 sc-eQTL 5.05e-02 -0.259 0.132 0.088 DC L1
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 1.05e-01 -0.253 0.155 0.088 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -630314 sc-eQTL 6.37e-02 -0.266 0.142 0.088 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 9.24e-01 0.0146 0.154 0.088 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0316 0.0862 0.088 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 1.54e-01 0.219 0.153 0.088 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 2.45e-01 -0.158 0.136 0.088 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 8.22e-02 0.135 0.0774 0.09 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -651024 sc-eQTL 3.43e-01 -0.127 0.133 0.09 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 9.68e-01 0.00516 0.127 0.09 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -630314 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0467 0.144 0.09 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 2.75e-01 0.111 0.101 0.09 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 2.86e-01 0.0649 0.0607 0.09 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0728 0.126 0.09 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 9.95e-01 0.00079 0.12 0.09 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 1.04e-04 0.46 0.116 0.09 NK L1
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0733 0.11 0.09 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 4.76e-01 -0.107 0.15 0.09 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0309 0.0621 0.09 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0556 0.132 0.09 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 4.52e-01 0.0894 0.119 0.09 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 1.66e-01 -0.205 0.148 0.09 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 1.02e-01 -0.235 0.143 0.09 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0154 0.057 0.09 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00382 0.13 0.09 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 7.29e-01 0.0542 0.156 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -317734 sc-eQTL 2.40e-01 0.186 0.158 0.094 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 1.43e-01 0.217 0.148 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 2.30e-01 0.198 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 6.16e-02 -0.295 0.157 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00366 0.0848 0.094 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 8.24e-01 0.0365 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0572 0.148 0.094 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -48147 sc-eQTL 6.92e-01 0.0562 0.142 0.094 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -317734 sc-eQTL 4.87e-01 -0.103 0.148 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 7.87e-02 0.17 0.096 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 7.42e-01 0.0484 0.147 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 2.34e-01 -0.173 0.145 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0703 0.0891 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 9.12e-01 0.0165 0.15 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 9.43e-02 -0.268 0.16 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -48147 sc-eQTL 1.78e-02 -0.322 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -317734 sc-eQTL 6.74e-01 0.061 0.145 0.091 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 3.48e-01 0.107 0.113 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0155 0.146 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0242 0.149 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 1.45e-01 -0.104 0.0712 0.091 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 6.54e-02 -0.28 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0087 0.149 0.091 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -48147 sc-eQTL 7.78e-02 0.245 0.138 0.091 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -317734 sc-eQTL 2.59e-01 -0.184 0.163 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 1.85e-04 0.263 0.069 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0896 0.128 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 5.30e-01 0.0871 0.138 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0352 0.0789 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 3.73e-01 0.143 0.16 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 7.15e-01 0.0556 0.152 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -48147 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0495 0.101 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -317734 sc-eQTL 9.99e-01 0.000242 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 2.78e-01 0.0912 0.0839 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0626 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 7.36e-01 0.0522 0.154 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0804 0.0816 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 9.49e-01 0.0105 0.163 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 1.72e-01 -0.213 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -48147 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0217 0.108 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 5.64e-01 0.0951 0.165 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0102 0.171 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 7.34e-01 0.0565 0.166 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0564 0.0767 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 2.66e-01 -0.183 0.164 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 5.91e-01 0.0833 0.155 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 1.05e-02 0.312 0.121 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 4.32e-01 0.0824 0.105 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0219 0.114 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0428 0.0737 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 9.71e-02 -0.227 0.136 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 5.14e-02 -0.276 0.141 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 6.29e-02 0.255 0.137 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0132 0.116 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0135 0.136 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0716 0.0702 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0305 0.134 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 6.78e-01 0.0678 0.163 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 3.03e-01 0.163 0.158 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0818 0.146 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 4.14e-01 0.124 0.152 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 6.62e-01 0.0273 0.0623 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 1.04e-01 -0.26 0.159 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 5.07e-01 -0.103 0.155 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0444 0.132 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 2.83e-01 0.145 0.135 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 5.90e-01 0.0811 0.15 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 4.75e-01 0.0575 0.0803 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 4.22e-01 -0.122 0.151 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 4.08e-01 -0.129 0.156 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0431 0.158 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 2.87e-01 -0.136 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 9.95e-01 0.00094 0.137 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 8.64e-01 0.0134 0.0782 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 4.86e-01 -0.1 0.144 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 1.46e-01 -0.228 0.156 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0236 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 9.65e-01 -0.007 0.158 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 1.58e-01 -0.221 0.156 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 5.19e-01 0.0493 0.0762 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 5.42e-01 0.104 0.17 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 9.99e-03 -0.427 0.164 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 9.73e-01 0.00582 0.172 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 4.78e-01 0.118 0.166 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 8.54e-02 0.294 0.17 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 7.36e-02 0.165 0.0915 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 3.41e-01 -0.161 0.168 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0363 0.174 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 4.85e-01 0.109 0.156 0.091 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 3.39e-01 -0.156 0.163 0.091 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 4.31e-01 -0.125 0.158 0.091 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00241 0.0781 0.091 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 6.48e-01 0.0737 0.161 0.091 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 3.15e-01 0.164 0.163 0.091 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 6.08e-02 0.29 0.154 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0635 0.164 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0114 0.157 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 5.38e-01 0.0541 0.0877 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 7.34e-01 -0.054 0.159 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 2.83e-02 0.276 0.125 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0744 0.13 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 7.24e-01 -0.056 0.158 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0251 0.0628 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0397 0.138 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 5.64e-02 0.295 0.154 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 5.62e-01 -0.091 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0234 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0912 0.0729 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 8.74e-01 0.0258 0.163 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 2.71e-04 0.504 0.136 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 5.49e-01 0.087 0.145 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0309 0.158 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0445 0.0856 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0155 0.147 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -317734 sc-eQTL 1.85e-01 -0.204 0.153 0.107 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0994 0.128 0.107 PB L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 4.19e-01 -0.141 0.174 0.107 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 8.18e-01 0.0362 0.157 0.107 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 2.16e-01 0.11 0.0885 0.107 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 7.81e-01 0.0474 0.17 0.107 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 4.31e-01 -0.132 0.167 0.107 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -48147 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0469 0.11 0.107 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 7.97e-01 0.0361 0.14 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0636 0.158 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 4.60e-01 -0.111 0.15 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 5.47e-01 0.0343 0.0569 0.091 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0215 0.135 0.091 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 4.61e-01 -0.109 0.147 0.091 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 2.59e-02 0.332 0.148 0.09 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 9.51e-01 0.00939 0.154 0.09 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 3.43e-01 0.12 0.126 0.09 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 6.80e-01 -0.023 0.0558 0.09 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 2.80e-03 -0.393 0.13 0.09 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 4.09e-01 -0.13 0.157 0.09 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 6.89e-01 0.0539 0.134 0.088 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -651024 sc-eQTL 3.71e-02 -0.277 0.132 0.088 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 2.77e-02 -0.38 0.171 0.088 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -630314 sc-eQTL 3.20e-01 -0.156 0.157 0.088 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 7.39e-01 -0.051 0.153 0.088 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 7.52e-01 0.0239 0.0755 0.088 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 2.72e-02 0.37 0.166 0.088 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 5.31e-03 -0.413 0.146 0.088 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 2.99e-01 0.105 0.101 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -651024 sc-eQTL 2.64e-01 -0.16 0.143 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 5.89e-01 0.0767 0.142 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -630314 sc-eQTL 7.83e-01 -0.04 0.145 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 4.89e-01 0.0803 0.116 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 4.49e-01 0.0488 0.0642 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 2.69e-01 -0.153 0.138 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00259 0.124 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 3.57e-01 0.102 0.11 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -651024 sc-eQTL 7.30e-01 0.0478 0.138 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 4.86e-01 -0.105 0.15 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -630314 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0145 0.15 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 8.44e-01 0.0194 0.0983 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00206 0.0708 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0357 0.147 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 8.54e-01 0.0242 0.131 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 3.68e-01 0.166 0.183 0.088 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00886 0.197 0.088 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 9.50e-01 0.0127 0.204 0.088 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 8.09e-01 0.0188 0.0775 0.088 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 1.81e-01 0.275 0.205 0.088 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 2.84e-01 0.215 0.2 0.088 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 1.61e-01 0.208 0.148 0.089 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -651024 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0792 0.15 0.089 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0915 0.165 0.089 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -630314 sc-eQTL 9.92e-01 0.00155 0.148 0.089 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 2.71e-01 0.166 0.15 0.089 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 8.13e-01 0.0155 0.0657 0.089 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 2.06e-01 -0.204 0.16 0.089 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 2.91e-01 -0.169 0.159 0.089 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 3.13e-01 0.111 0.11 0.09 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -651024 sc-eQTL 8.52e-03 -0.405 0.153 0.09 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 4.53e-01 0.118 0.157 0.09 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -630314 sc-eQTL 8.79e-01 0.0234 0.154 0.09 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 3.86e-01 0.128 0.148 0.09 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 1.03e-02 0.189 0.0731 0.09 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 4.46e-02 0.305 0.151 0.09 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 1.91e-01 -0.171 0.131 0.09 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 6.67e-01 0.0535 0.124 0.093 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -651024 sc-eQTL 3.08e-01 -0.128 0.125 0.093 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 8.83e-01 0.0258 0.174 0.093 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -630314 sc-eQTL 2.17e-03 -0.385 0.123 0.093 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 7.29e-01 0.0525 0.152 0.093 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00895 0.104 0.093 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 4.06e-01 -0.118 0.142 0.093 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 2.83e-01 0.166 0.154 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -317734 sc-eQTL 2.64e-01 0.171 0.152 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 1.32e-02 0.213 0.0853 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 1.73e-01 0.18 0.132 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 3.93e-01 -0.117 0.137 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0612 0.0779 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 3.96e-01 -0.114 0.134 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 3.45e-01 -0.135 0.143 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -48147 sc-eQTL 4.85e-01 0.0966 0.138 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -317734 sc-eQTL 3.63e-01 -0.148 0.163 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 1.65e-03 0.208 0.0653 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0601 0.125 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 6.00e-01 0.0682 0.13 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0482 0.0785 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 5.09e-01 0.105 0.158 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0771 0.148 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -48147 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0331 0.0941 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 1.26e-01 0.13 0.0849 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -651024 sc-eQTL 4.68e-01 -0.101 0.139 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 8.23e-01 0.0299 0.134 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -630314 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0619 0.145 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 2.91e-01 0.101 0.0956 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 4.59e-01 0.0487 0.0657 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 6.53e-01 -0.059 0.131 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 9.32e-01 0.00993 0.117 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 9.61e-02 0.173 0.103 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -651024 sc-eQTL 2.75e-03 -0.454 0.15 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0947 0.149 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -630314 sc-eQTL 8.23e-01 -0.034 0.152 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 2.31e-01 0.171 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 3.56e-01 0.056 0.0605 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0726 0.153 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -729598 sc-eQTL 1.34e-01 -0.22 0.147 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -429457 sc-eQTL 1.55e-04 0.449 0.116 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 455499 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0552 0.117 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -679718 sc-eQTL 3.75e-01 -0.135 0.152 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -730828 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0262 0.0622 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 948274 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0454 0.129 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -429457 eQTL 6.92e-08 0.144 0.0264 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000112299 VNN1 -630314 eQTL 0.0224 0.0837 0.0366 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000112303 VNN2 -679718 pQTL 0.0449 -0.0878 0.0437 0.0 0.0 0.0936
ENSG00000118520 ARG1 510597 eQTL 0.00481 -0.0876 0.031 0.0 0.0 0.0952
ENSG00000118523 CCN2 132369 pQTL 5.78e-13 -0.26 0.0357 0.0 0.0 0.0936

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -429457 7.23e-07 2.67e-07 6.28e-08 2.53e-07 1.07e-07 1.13e-07 3.42e-07 6.72e-08 2.12e-07 1.21e-07 3.32e-07 1.91e-07 3.77e-07 8.26e-08 7.98e-08 1.06e-07 6.63e-08 2.56e-07 7.42e-08 6.58e-08 1.27e-07 2.06e-07 2e-07 3.83e-08 3.27e-07 1.51e-07 1.39e-07 1.54e-07 1.54e-07 1.85e-07 1.78e-07 4.58e-08 4.74e-08 1.01e-07 1.01e-07 4.68e-08 3.91e-08 8.17e-08 6.49e-08 6.43e-08 6.21e-08 2.6e-07 3.13e-08 1.09e-08 5.49e-08 1.01e-08 8.61e-08 2.16e-09 4.94e-08