logo

Genes within 1Mb (chr6:132067730:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -333745 sc-eQTL 8.41e-01 -0.021 0.105 0.214 B L1
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 9.78e-01 0.00107 0.0395 0.214 B L1
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0552 0.0786 0.214 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 5.14e-01 0.0485 0.0742 0.214 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0117 0.0449 0.214 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 2.08e-01 -0.117 0.0928 0.214 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 3.99e-01 0.0797 0.0943 0.214 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -64158 sc-eQTL 5.24e-06 -0.276 0.059 0.214 B L1
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0934 0.0758 0.214 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0619 0.0603 0.214 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0335 0.0659 0.214 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 8.16e-01 0.0104 0.0448 0.214 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0398 0.081 0.214 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 1.81e-01 0.121 0.0903 0.214 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 2.15e-01 0.0931 0.0749 0.214 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 3.93e-01 0.0633 0.0739 0.214 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0779 0.0876 0.214 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0311 0.0299 0.214 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 1.55e-01 -0.12 0.0839 0.214 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 7.57e-01 0.0281 0.0907 0.214 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0464 0.0683 0.216 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -667035 sc-eQTL 2.95e-01 0.0886 0.0845 0.216 DC L1
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 1.18e-02 0.249 0.0979 0.216 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -646325 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0419 0.0914 0.216 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0974 0.0976 0.216 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 8.87e-01 0.00779 0.0549 0.216 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 1.81e-01 0.131 0.0974 0.216 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0652 0.0867 0.216 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 9.23e-01 0.00502 0.0517 0.214 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -667035 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0834 0.0885 0.214 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 7.51e-01 0.0267 0.0842 0.214 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -646325 sc-eQTL 4.15e-02 -0.194 0.0945 0.214 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 8.02e-01 0.0169 0.0673 0.214 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 4.19e-01 0.0326 0.0403 0.214 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 1.65e-01 0.116 0.0832 0.214 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0542 0.0797 0.214 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0741 0.0769 0.215 NK L1
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 8.88e-01 0.00995 0.0704 0.215 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 2.52e-01 0.11 0.0956 0.215 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 5.71e-01 0.0225 0.0396 0.215 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0325 0.0843 0.215 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 5.73e-01 0.0438 0.0775 0.214 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 3.57e-01 0.0891 0.0966 0.214 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 1.22e-01 -0.145 0.0932 0.214 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0413 0.0371 0.214 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 9.13e-01 0.00921 0.0846 0.214 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 7.70e-01 0.0298 0.102 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -333745 sc-eQTL 2.76e-01 -0.119 0.109 0.209 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0284 0.102 0.209 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 9.19e-01 0.0116 0.114 0.209 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 6.46e-01 0.0502 0.109 0.209 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00488 0.0585 0.209 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 2.85e-02 -0.247 0.112 0.209 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0352 0.102 0.209 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -64158 sc-eQTL 5.23e-02 -0.189 0.0966 0.209 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -333745 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0338 0.0973 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 9.68e-01 0.00252 0.0637 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 2.53e-01 0.111 0.0966 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 6.07e-01 0.0494 0.0959 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 2.90e-01 0.0621 0.0586 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 1.84e-01 -0.131 0.0981 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00414 0.106 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -64158 sc-eQTL 3.32e-02 -0.191 0.089 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -333745 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0387 0.0971 0.213 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 1.99e-01 0.0978 0.0759 0.213 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0888 0.098 0.213 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0197 0.0997 0.213 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 5.73e-01 0.0271 0.048 0.213 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0142 0.102 0.213 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 3.20e-02 0.214 0.0991 0.213 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -64158 sc-eQTL 3.66e-02 -0.194 0.0924 0.213 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -333745 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0315 0.11 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0166 0.0479 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0383 0.0857 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 1.98e-01 0.12 0.0926 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 3.36e-01 0.0509 0.0528 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 2.86e-01 -0.115 0.107 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 3.88e-01 0.0882 0.102 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -64158 sc-eQTL 2.80e-04 -0.242 0.0656 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -333745 sc-eQTL 7.32e-01 0.0359 0.105 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0183 0.0571 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 2.49e-01 -0.121 0.105 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 1.54e-01 0.149 0.104 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 8.80e-01 0.00841 0.0555 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0147 0.111 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 2.34e-01 0.126 0.105 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -64158 sc-eQTL 1.63e-02 -0.175 0.0724 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 2.37e-01 0.122 0.102 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 2.88e-01 -0.113 0.106 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00166 0.104 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0458 0.0478 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 2.69e-01 0.113 0.102 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 4.29e-01 0.0763 0.0964 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00697 0.0821 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 9.95e-01 0.000407 0.0701 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00107 0.0761 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 7.53e-01 0.0156 0.0493 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 1.15e-01 -0.144 0.0911 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 3.89e-01 0.0818 0.0948 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 9.10e-01 0.0102 0.0903 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 1.40e-01 -0.112 0.0756 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 4.26e-01 -0.071 0.0889 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00317 0.0461 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00194 0.0881 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 7.66e-01 0.0319 0.107 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 7.69e-01 -0.031 0.106 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 7.40e-02 -0.173 0.0966 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 7.75e-01 0.029 0.101 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 6.89e-01 0.0167 0.0416 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 6.91e-01 0.0426 0.107 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 2.83e-02 0.226 0.102 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 7.45e-01 -0.028 0.086 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 3.95e-01 0.075 0.088 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0892 0.0976 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00702 0.0523 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 6.74e-01 0.0415 0.0986 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 8.35e-02 0.175 0.101 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 3.97e-04 0.369 0.102 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 5.03e-01 0.0569 0.0847 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0213 0.091 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0195 0.0521 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 2.22e-01 -0.117 0.0954 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0595 0.104 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0181 0.103 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0809 0.103 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 5.02e-01 0.0688 0.102 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 4.97e-01 -0.034 0.0499 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0034 0.111 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 1.94e-01 0.142 0.109 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0086 0.11 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 9.50e-01 0.00666 0.106 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 1.30e-01 -0.166 0.109 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 2.92e-01 0.0622 0.0588 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 3.96e-02 -0.221 0.107 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 1.40e-01 -0.164 0.111 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 8.11e-01 0.024 0.1 0.212 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 5.21e-01 0.0673 0.105 0.212 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 9.37e-01 0.00799 0.102 0.212 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0438 0.05 0.212 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 8.20e-01 0.0236 0.103 0.212 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 8.79e-01 -0.016 0.105 0.212 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0685 0.101 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 5.41e-02 0.206 0.106 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 6.33e-01 0.0491 0.103 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 4.29e-01 0.0454 0.0572 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 8.16e-01 0.0242 0.104 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0646 0.0824 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 4.02e-01 -0.071 0.0846 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0348 0.103 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 7.55e-01 0.0128 0.0409 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0705 0.0899 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0492 0.1 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 6.65e-01 0.0439 0.101 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 2.15e-01 0.126 0.101 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 6.25e-01 0.0231 0.0472 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 2.15e-01 -0.13 0.104 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0105 0.0894 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0571 0.0924 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 6.83e-02 0.183 0.0998 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 8.08e-01 0.0132 0.0546 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 7.92e-01 0.0247 0.0934 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -333745 sc-eQTL 5.33e-01 -0.073 0.117 0.2 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 5.26e-01 0.0619 0.0974 0.2 PB L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 2.57e-01 -0.15 0.132 0.2 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 8.22e-01 0.0268 0.119 0.2 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 4.78e-01 0.048 0.0675 0.2 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 4.44e-01 0.0989 0.129 0.2 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 5.87e-01 0.069 0.127 0.2 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -64158 sc-eQTL 6.23e-01 0.0411 0.0833 0.2 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 6.79e-01 0.0395 0.0955 0.215 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 6.13e-01 0.0545 0.107 0.215 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0787 0.102 0.215 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00322 0.0388 0.215 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0216 0.0922 0.215 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0607 0.1 0.215 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 5.42e-02 -0.194 0.1 0.214 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0317 0.104 0.214 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0358 0.0852 0.214 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 9.05e-01 0.0045 0.0377 0.214 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 6.15e-02 0.167 0.0891 0.214 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 1.08e-01 0.171 0.106 0.214 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0973 0.0882 0.217 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -667035 sc-eQTL 6.53e-01 0.0396 0.0879 0.217 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 1.89e-01 0.15 0.114 0.217 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -646325 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0307 0.103 0.217 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 7.66e-01 0.03 0.101 0.217 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 2.57e-01 0.0564 0.0495 0.217 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 6.84e-01 0.0451 0.111 0.217 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 1.18e-01 0.154 0.0978 0.217 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0274 0.066 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -667035 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00785 0.0932 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00288 0.0922 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -646325 sc-eQTL 4.04e-02 -0.192 0.0931 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 7.23e-01 0.0267 0.0752 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 1.90e-01 0.0548 0.0416 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 2.81e-01 0.0968 0.0895 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 6.17e-02 -0.15 0.0799 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00231 0.0716 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -667035 sc-eQTL 2.50e-01 -0.103 0.0891 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 6.55e-01 0.0434 0.097 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -646325 sc-eQTL 1.20e-02 -0.242 0.0956 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0072 0.0636 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 3.97e-01 0.0388 0.0457 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 7.24e-01 0.0336 0.095 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 6.81e-01 0.0349 0.0847 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 3.12e-01 -0.125 0.124 0.206 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0125 0.133 0.206 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 2.50e-01 -0.158 0.137 0.206 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 6.87e-01 0.0211 0.0523 0.206 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0867 0.139 0.206 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 3.19e-01 0.135 0.135 0.206 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00626 0.0994 0.22 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -667035 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0806 0.1 0.22 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0987 0.11 0.22 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -646325 sc-eQTL 1.38e-02 -0.243 0.0978 0.22 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 7.14e-01 0.037 0.101 0.22 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 5.30e-01 0.0276 0.0439 0.22 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 1.80e-01 0.144 0.107 0.22 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 1.38e-01 0.158 0.106 0.22 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 1.93e-01 0.0926 0.0709 0.217 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -667035 sc-eQTL 4.13e-01 0.0823 0.1 0.217 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0147 0.102 0.217 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -646325 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0203 0.0998 0.217 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0663 0.0959 0.217 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0742 0.0478 0.217 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 3.05e-01 -0.101 0.0985 0.217 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 8.69e-01 0.0141 0.085 0.217 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 3.53e-01 0.0794 0.0852 0.198 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -667035 sc-eQTL 6.61e-01 0.0377 0.0859 0.198 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 1.25e-01 0.183 0.119 0.198 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -646325 sc-eQTL 3.03e-01 0.0901 0.0872 0.198 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 8.30e-02 -0.18 0.103 0.198 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 2.60e-01 0.0808 0.0714 0.198 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 2.27e-02 0.221 0.0962 0.198 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 2.67e-01 -0.118 0.106 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -333745 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0129 0.104 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00718 0.0588 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 5.18e-01 0.0582 0.09 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00942 0.0931 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 1.33e-01 0.0796 0.0528 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 2.13e-01 -0.114 0.0912 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 4.59e-01 0.0721 0.0972 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -64158 sc-eQTL 2.32e-04 -0.341 0.0909 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -333745 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0277 0.11 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00127 0.0451 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0933 0.0844 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 4.69e-02 0.173 0.0868 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 3.36e-01 0.051 0.0529 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 2.63e-01 -0.119 0.106 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 1.36e-01 0.149 0.0994 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -64158 sc-eQTL 1.38e-04 -0.238 0.0613 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 6.12e-01 -0.028 0.0551 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -667035 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0575 0.0898 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 6.06e-01 0.0446 0.0863 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -646325 sc-eQTL 2.45e-02 -0.21 0.0926 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00554 0.062 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 1.33e-01 0.0638 0.0423 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 2.04e-01 0.108 0.0844 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0779 0.0754 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 2.06e-01 0.0874 0.0688 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -667035 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0147 0.102 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0271 0.0989 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -646325 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0814 0.101 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0239 0.0949 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0385 0.0402 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 7.28e-01 0.0354 0.102 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -745609 sc-eQTL 1.41e-01 0.144 0.0973 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -445468 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0671 0.0774 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 439488 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0172 0.0753 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -695729 sc-eQTL 3.01e-01 0.101 0.0979 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -746839 sc-eQTL 6.52e-01 0.0181 0.04 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 932263 sc-eQTL 6.91e-01 -0.033 0.083 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -445468 eQTL 0.0122 -0.0443 0.0177 0.0 0.0 0.228
ENSG00000118523 CCN2 116358 pQTL 5.16e-09 -0.14 0.0238 0.0 0.0 0.225

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N -333745 1.26e-06 9.39e-07 2.62e-07 4.84e-07 9.6e-08 4.08e-07 1.02e-06 2.62e-07 1.14e-06 2.81e-07 1.26e-06 5.6e-07 1.56e-06 2.57e-07 4.3e-07 4.84e-07 7.79e-07 5.33e-07 3.56e-07 3.42e-07 2.86e-07 7.58e-07 6.1e-07 3.59e-07 1.79e-06 2.44e-07 5.83e-07 4.98e-07 8.24e-07 9.93e-07 4.71e-07 4.4e-08 1.72e-07 2.72e-07 4.22e-07 3.21e-07 2.94e-07 1.58e-07 1.33e-07 9.55e-09 1.97e-07 1.26e-06 5.54e-08 4.11e-08 1.82e-07 6.01e-08 1.78e-07 8.81e-08 4.96e-08
ENSG00000079950 STX7 -445468 7.74e-07 6.09e-07 1.08e-07 3.87e-07 1.05e-07 1.97e-07 5.28e-07 8.37e-08 3.82e-07 2.06e-07 4.97e-07 3.68e-07 7.19e-07 1.23e-07 1.57e-07 1.92e-07 1.85e-07 3.58e-07 1.81e-07 1.08e-07 1.86e-07 3.13e-07 3.03e-07 1.17e-07 6.65e-07 2.33e-07 2.57e-07 2.19e-07 3e-07 4.9e-07 2.55e-07 7.71e-08 4.35e-08 1.21e-07 3.36e-07 7.86e-08 1.06e-07 9.46e-08 5.67e-08 6.05e-08 8.35e-08 4.55e-07 2.71e-08 5.74e-09 1.17e-07 1.88e-08 8.13e-08 2.25e-08 5.56e-08