logo

Genes within 1Mb (chr6:132062763:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 8.33e-03 0.291 0.109 0.083 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -338712 sc-eQTL 9.06e-01 0.0193 0.162 0.083 B L1
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 8.00e-03 0.161 0.0602 0.083 B L1
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 2.70e-01 -0.135 0.122 0.083 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0215 0.115 0.083 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0694 0.0694 0.083 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 6.09e-01 0.074 0.144 0.083 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 3.32e-01 -0.142 0.146 0.083 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -69125 sc-eQTL 5.35e-01 0.0597 0.096 0.083 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0662 0.144 0.083 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 1.67e-03 0.366 0.115 0.083 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 3.02e-01 0.0964 0.0931 0.083 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0207 0.102 0.083 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 1.19e-01 -0.108 0.0688 0.083 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 8.76e-02 -0.213 0.124 0.083 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 4.63e-01 -0.103 0.14 0.083 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 4.88e-01 0.0812 0.117 0.083 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 7.82e-01 0.0318 0.115 0.083 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 5.12e-01 0.0896 0.136 0.083 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0319 0.0466 0.083 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 4.39e-01 -0.101 0.131 0.083 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 2.72e-02 -0.31 0.139 0.083 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 6.78e-01 0.0517 0.124 0.083 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 6.93e-02 0.199 0.109 0.083 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -672002 sc-eQTL 7.78e-02 -0.24 0.135 0.083 DC L1
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 4.89e-02 -0.314 0.158 0.083 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -651292 sc-eQTL 1.92e-01 -0.192 0.146 0.083 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 8.83e-01 0.0232 0.157 0.083 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0301 0.0882 0.083 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 2.26e-01 0.19 0.157 0.083 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 4.36e-01 -0.109 0.139 0.083 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00438 0.135 0.083 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 2.41e-02 0.18 0.0793 0.083 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -672002 sc-eQTL 2.61e-01 -0.155 0.137 0.083 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 8.94e-01 0.0174 0.131 0.083 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -651292 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0429 0.148 0.083 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 2.47e-01 0.121 0.104 0.083 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 4.49e-01 0.0475 0.0626 0.083 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0757 0.13 0.083 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 7.31e-01 0.0426 0.124 0.083 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 3.75e-05 0.499 0.118 0.084 NK L1
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 2.53e-01 -0.129 0.112 0.084 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 4.48e-01 -0.116 0.153 0.084 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0503 0.0634 0.084 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0488 0.135 0.084 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 5.17e-01 0.0878 0.135 0.083 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 5.15e-01 0.0797 0.122 0.083 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 1.56e-01 -0.217 0.152 0.083 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 2.21e-01 -0.181 0.148 0.083 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00761 0.0587 0.083 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0268 0.134 0.083 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 8.80e-01 0.0242 0.161 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 3.02e-01 -0.147 0.142 0.089 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -338712 sc-eQTL 3.36e-01 0.156 0.161 0.089 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 1.04e-01 0.246 0.151 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 1.60e-01 0.236 0.167 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 1.28e-01 -0.245 0.16 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0101 0.0866 0.089 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 3.60e-01 0.153 0.167 0.089 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0418 0.152 0.089 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -69125 sc-eQTL 8.53e-01 0.0268 0.145 0.089 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 4.20e-01 0.126 0.157 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -338712 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0816 0.152 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 5.54e-02 0.19 0.0984 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0192 0.151 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 2.41e-01 -0.175 0.149 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0946 0.0913 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 8.84e-01 0.0225 0.153 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 1.29e-01 -0.25 0.164 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -69125 sc-eQTL 1.11e-02 -0.354 0.138 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 7.45e-02 0.256 0.143 0.084 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -338712 sc-eQTL 8.96e-02 0.252 0.148 0.084 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 5.46e-01 0.0705 0.117 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00154 0.151 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0352 0.153 0.084 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 1.18e-01 -0.115 0.0732 0.084 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 4.76e-02 -0.309 0.155 0.084 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00061 0.154 0.084 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -69125 sc-eQTL 2.95e-01 0.15 0.143 0.084 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 7.33e-04 0.414 0.121 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -338712 sc-eQTL 2.75e-01 -0.184 0.168 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 4.67e-04 0.254 0.0716 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 2.68e-01 -0.146 0.132 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 6.30e-01 0.0691 0.143 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0958 0.0812 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 4.19e-01 0.134 0.165 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 3.85e-01 0.137 0.157 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -69125 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0947 0.104 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 3.49e-02 0.297 0.14 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -338712 sc-eQTL 7.41e-01 0.053 0.16 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 2.51e-01 0.1 0.087 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 4.17e-01 -0.131 0.161 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 9.27e-01 0.0147 0.16 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 1.82e-01 -0.113 0.0844 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0208 0.169 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 1.98e-01 -0.208 0.161 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -69125 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00471 0.112 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 6.41e-01 0.0633 0.136 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 4.17e-01 0.136 0.167 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 9.04e-01 0.021 0.174 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 4.01e-01 0.142 0.169 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0299 0.078 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 3.47e-01 -0.157 0.167 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 5.24e-01 0.1 0.157 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0614 0.149 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 6.71e-03 0.341 0.125 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 3.51e-01 0.101 0.108 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0774 0.117 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0849 0.076 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 1.12e-01 -0.225 0.141 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 1.27e-01 -0.224 0.146 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 6.66e-01 0.0667 0.154 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 6.35e-02 0.261 0.14 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 3.67e-01 -0.107 0.118 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0444 0.139 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0893 0.0718 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 9.05e-01 0.0164 0.138 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 6.12e-01 0.0846 0.167 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 3.84e-01 -0.142 0.163 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 4.92e-01 0.112 0.163 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 8.99e-01 0.0191 0.15 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 4.98e-01 0.106 0.156 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 9.58e-01 0.00334 0.0641 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 3.00e-01 -0.171 0.164 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0702 0.159 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0915 0.135 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 6.21e-01 0.0689 0.139 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 6.15e-01 0.0775 0.154 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 7.37e-01 0.0278 0.0824 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 4.52e-01 -0.117 0.155 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0666 0.16 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 4.45e-01 0.124 0.163 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 3.13e-01 -0.132 0.131 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 4.80e-01 0.0994 0.14 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0324 0.0805 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0142 0.148 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 5.67e-02 -0.307 0.16 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00885 0.162 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 9.79e-01 0.00426 0.163 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 7.90e-02 -0.282 0.16 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 2.97e-01 0.0818 0.0783 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 4.72e-01 0.126 0.175 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 8.37e-03 -0.45 0.169 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 9.99e-01 0.000314 0.175 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 4.31e-01 0.133 0.168 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 3.67e-02 0.362 0.172 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 1.71e-01 0.128 0.0933 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 3.34e-01 -0.166 0.171 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0866 0.177 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 7.93e-01 0.041 0.156 0.084 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 5.32e-01 0.101 0.162 0.084 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 9.86e-02 -0.28 0.169 0.084 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 4.02e-01 -0.138 0.165 0.084 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 9.67e-01 0.0034 0.0812 0.084 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 8.15e-01 0.0393 0.168 0.084 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 5.49e-01 0.102 0.17 0.084 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 3.29e-02 0.341 0.159 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 3.05e-01 -0.174 0.169 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00818 0.163 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 7.05e-01 0.0343 0.0907 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0114 0.164 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 1.63e-02 0.308 0.127 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 4.05e-01 -0.11 0.132 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0758 0.161 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0451 0.064 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0229 0.141 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 2.54e-01 0.181 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0142 0.161 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 4.95e-01 -0.11 0.161 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0889 0.0747 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 8.76e-01 0.026 0.167 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 1.42e-04 0.536 0.138 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 7.66e-01 0.0441 0.148 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0419 0.161 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0347 0.0873 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00669 0.149 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 2.23e-01 0.233 0.19 0.1 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -338712 sc-eQTL 2.38e-01 -0.187 0.158 0.1 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 3.35e-01 -0.128 0.132 0.1 PB L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0798 0.18 0.1 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 7.27e-01 0.0567 0.162 0.1 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 2.52e-01 0.105 0.0915 0.1 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 8.07e-01 0.0429 0.176 0.1 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0761 0.172 0.1 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -69125 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00691 0.113 0.1 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 3.45e-01 -0.132 0.139 0.085 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 8.56e-01 0.0263 0.144 0.085 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0516 0.162 0.085 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 3.67e-01 -0.14 0.154 0.085 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 5.69e-01 0.0334 0.0585 0.085 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 8.70e-01 0.0229 0.139 0.085 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0716 0.151 0.085 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 6.72e-01 0.0654 0.154 0.083 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 3.53e-02 0.324 0.153 0.083 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 7.29e-01 0.0551 0.159 0.083 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 4.08e-01 0.108 0.13 0.083 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0302 0.0575 0.083 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 1.36e-02 -0.336 0.135 0.083 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 5.18e-01 -0.105 0.162 0.083 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 1.65e-01 0.192 0.138 0.083 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 2.11e-01 0.172 0.137 0.083 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -672002 sc-eQTL 3.86e-02 -0.281 0.135 0.083 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 9.76e-03 -0.456 0.174 0.083 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -651292 sc-eQTL 4.58e-01 -0.119 0.16 0.083 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 9.77e-01 0.00455 0.157 0.083 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 8.99e-01 0.00982 0.0773 0.083 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 7.01e-02 0.311 0.171 0.083 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 7.56e-03 -0.405 0.15 0.083 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 3.52e-01 -0.139 0.149 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 9.18e-02 0.177 0.104 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -672002 sc-eQTL 1.93e-01 -0.193 0.148 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 6.60e-01 0.0647 0.147 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -651292 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0174 0.15 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 4.43e-01 0.0921 0.12 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 6.63e-01 0.0291 0.0665 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 4.10e-01 -0.118 0.143 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 6.34e-01 0.0611 0.128 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 8.19e-01 0.0357 0.156 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 1.48e-01 0.165 0.114 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -672002 sc-eQTL 8.45e-01 0.0279 0.143 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 7.67e-01 -0.046 0.155 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -651292 sc-eQTL 9.03e-01 0.019 0.155 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 6.62e-01 0.0444 0.101 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0268 0.073 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0607 0.152 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00108 0.135 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 9.99e-01 0.000244 0.18 0.079 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 3.21e-01 0.187 0.188 0.079 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 8.27e-01 0.0444 0.202 0.079 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 9.53e-01 0.0122 0.209 0.079 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 7.28e-01 0.0277 0.0795 0.079 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 3.16e-01 0.212 0.211 0.079 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 1.65e-01 0.285 0.204 0.079 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00988 0.158 0.082 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 2.42e-01 0.18 0.153 0.082 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -672002 sc-eQTL 4.32e-01 -0.122 0.155 0.082 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0742 0.17 0.082 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -651292 sc-eQTL 8.21e-01 0.0347 0.153 0.082 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 1.23e-01 0.24 0.155 0.082 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0295 0.0678 0.082 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 2.89e-01 -0.176 0.166 0.082 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 2.55e-01 -0.188 0.165 0.082 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 6.14e-01 0.0743 0.147 0.086 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 6.97e-01 0.0438 0.112 0.086 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -672002 sc-eQTL 2.49e-03 -0.474 0.155 0.086 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 6.93e-01 0.0634 0.16 0.086 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -651292 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0475 0.157 0.086 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 2.97e-01 0.158 0.151 0.086 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 5.10e-02 0.147 0.0751 0.086 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 6.62e-02 0.285 0.154 0.086 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 8.79e-02 -0.228 0.133 0.086 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0269 0.176 0.088 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 3.85e-01 0.11 0.127 0.088 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -672002 sc-eQTL 3.02e-01 -0.132 0.127 0.088 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 9.33e-01 0.0149 0.178 0.088 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -651292 sc-eQTL 1.12e-02 -0.327 0.127 0.088 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 8.22e-01 0.0349 0.155 0.088 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0446 0.107 0.088 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 4.13e-01 -0.119 0.145 0.088 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 1.17e-01 0.247 0.157 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 3.00e-01 0.144 0.138 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -338712 sc-eQTL 7.22e-02 0.282 0.156 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 1.27e-02 0.22 0.0877 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 1.91e-01 0.178 0.136 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 4.18e-01 -0.114 0.141 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0726 0.0801 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0833 0.138 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 3.13e-01 -0.149 0.147 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -69125 sc-eQTL 9.00e-01 0.0179 0.142 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 2.24e-04 0.426 0.114 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -338712 sc-eQTL 4.59e-01 -0.125 0.168 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 2.92e-03 0.204 0.0676 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 2.88e-01 -0.138 0.129 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 7.04e-01 0.051 0.134 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0954 0.0809 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 6.02e-01 0.0853 0.163 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0177 0.153 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -69125 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0454 0.0972 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0194 0.143 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 2.38e-02 0.198 0.087 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -672002 sc-eQTL 3.20e-01 -0.143 0.143 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 6.98e-01 0.0536 0.138 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -651292 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0473 0.15 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 3.30e-01 0.0965 0.0987 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 7.67e-01 0.0201 0.0678 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0674 0.135 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 6.95e-01 0.0473 0.121 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 999441 sc-eQTL 7.48e-01 -0.048 0.149 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 1.99e-01 0.136 0.106 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -672002 sc-eQTL 1.34e-03 -0.495 0.152 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 4.74e-01 -0.109 0.152 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -651292 sc-eQTL 4.98e-01 -0.105 0.154 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 1.06e-01 0.235 0.145 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 7.03e-01 0.0236 0.0618 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0675 0.156 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -750576 sc-eQTL 1.22e-01 -0.232 0.149 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -450435 sc-eQTL 9.42e-05 0.472 0.118 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 434521 sc-eQTL 3.92e-01 -0.102 0.119 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -700696 sc-eQTL 3.32e-01 -0.151 0.155 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -751806 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0428 0.0634 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 927296 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0363 0.132 0.084 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -450435 eQTL 1.32e-08 0.154 0.0269 0.0 0.0 0.0898
ENSG00000118520 ARG1 489619 eQTL 0.00448 -0.0901 0.0316 0.0 0.0 0.0898
ENSG00000118523 CCN2 111391 pQTL 1.9e-10 -0.235 0.0366 0.0 0.0 0.0878

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -450435 4.37e-07 3.35e-07 6.57e-08 2.58e-07 1.08e-07 1.25e-07 3.94e-07 7.12e-08 2.26e-07 1.37e-07 2.84e-07 2.04e-07 3.77e-07 9.15e-08 1.07e-07 1.14e-07 9.53e-08 2.66e-07 9.69e-08 7.49e-08 1.35e-07 2.3e-07 2.26e-07 5.01e-08 3.7e-07 1.9e-07 1.39e-07 1.54e-07 1.76e-07 2.19e-07 1.59e-07 5.22e-08 4.87e-08 1.01e-07 8.75e-08 4.68e-08 7.97e-08 5.92e-08 4.74e-08 7.78e-08 4.42e-08 2.72e-07 2.28e-08 1.95e-08 4e-08 1.01e-08 9.26e-08 0.0 4.61e-08
ENSG00000154269 \N 434321 5.14e-07 4e-07 6.99e-08 2.87e-07 1.03e-07 1.32e-07 4.14e-07 7.52e-08 2.53e-07 1.46e-07 3.25e-07 2.22e-07 4.11e-07 9.48e-08 1.24e-07 1.26e-07 1.17e-07 2.83e-07 1.13e-07 7.29e-08 1.52e-07 2.51e-07 2.48e-07 6.65e-08 4.27e-07 2.01e-07 1.57e-07 1.7e-07 2.03e-07 2.59e-07 1.76e-07 5.54e-08 5.2e-08 9.81e-08 1.22e-07 5.04e-08 9.77e-08 5.36e-08 4.78e-08 8.34e-08 5.1e-08 2.91e-07 1.21e-08 1.52e-08 4.99e-08 8.24e-09 9.25e-08 0.0 4.61e-08