Genes within 1Mb (chr6:132058673:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 8.30e-03 0.295 0.111 0.081 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -342802 sc-eQTL 9.05e-01 0.0196 0.164 0.081 B L1
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 1.38e-02 0.152 0.061 0.081 B L1
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 3.43e-01 -0.117 0.123 0.081 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0471 0.116 0.081 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0501 0.0703 0.081 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 6.12e-01 0.0741 0.146 0.081 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 4.16e-01 -0.121 0.148 0.081 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -73215 sc-eQTL 4.06e-01 0.0808 0.097 0.081 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0595 0.146 0.081 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 1.76e-03 0.368 0.116 0.081 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 3.55e-01 0.0873 0.0942 0.081 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 9.04e-01 0.0125 0.103 0.081 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 1.74e-01 -0.095 0.0697 0.081 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 7.04e-02 -0.229 0.126 0.081 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 4.51e-01 -0.107 0.141 0.081 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 4.77e-01 0.0844 0.118 0.081 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 9.06e-01 0.0137 0.117 0.081 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 5.85e-01 0.0755 0.138 0.081 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0122 0.0473 0.081 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 2.97e-01 -0.139 0.133 0.081 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 4.13e-02 -0.29 0.141 0.081 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 7.53e-01 0.0395 0.125 0.081 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 9.61e-02 0.184 0.11 0.081 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -676092 sc-eQTL 8.04e-02 -0.239 0.136 0.081 DC L1
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 5.78e-02 -0.305 0.16 0.081 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -655382 sc-eQTL 1.15e-01 -0.233 0.147 0.081 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 9.19e-01 0.0161 0.158 0.081 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000173 0.0889 0.081 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 2.46e-01 0.184 0.158 0.081 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 4.13e-01 -0.115 0.14 0.081 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 9.95e-01 0.000918 0.136 0.081 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 3.35e-02 0.171 0.08 0.081 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -676092 sc-eQTL 3.88e-01 -0.12 0.139 0.081 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 9.31e-01 0.0114 0.132 0.081 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -655382 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0358 0.149 0.081 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 2.64e-01 0.118 0.105 0.081 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 3.23e-01 0.0624 0.063 0.081 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 4.15e-01 -0.107 0.131 0.081 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 6.65e-01 0.0541 0.125 0.081 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 4.04e-05 0.504 0.12 0.082 NK L1
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 2.40e-01 -0.134 0.114 0.082 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 3.93e-01 -0.133 0.155 0.082 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0308 0.0644 0.082 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0433 0.137 0.082 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 5.77e-01 0.0765 0.137 0.081 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 5.65e-01 0.0714 0.124 0.081 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 1.37e-01 -0.23 0.154 0.081 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 9.77e-02 -0.248 0.149 0.081 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00662 0.0595 0.081 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0473 0.135 0.081 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 8.35e-01 0.0339 0.163 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 2.22e-01 -0.177 0.144 0.087 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -342802 sc-eQTL 2.71e-01 0.181 0.164 0.087 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 9.28e-02 0.258 0.153 0.087 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 1.64e-01 0.237 0.17 0.087 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 1.40e-01 -0.241 0.163 0.087 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 8.48e-01 0.0168 0.0877 0.087 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 4.04e-01 0.142 0.17 0.087 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0491 0.154 0.087 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -73215 sc-eQTL 6.65e-01 0.0635 0.146 0.087 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 4.23e-01 0.127 0.159 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -342802 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0687 0.154 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 5.07e-02 0.196 0.0997 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0141 0.153 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 1.83e-01 -0.201 0.151 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0776 0.0927 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 9.17e-01 0.0163 0.156 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 1.12e-01 -0.265 0.166 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -73215 sc-eQTL 1.86e-02 -0.333 0.14 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 1.07e-01 0.233 0.144 0.082 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -342802 sc-eQTL 9.83e-02 0.248 0.15 0.082 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 5.32e-01 0.0738 0.118 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 9.56e-01 0.00833 0.152 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 9.73e-01 0.00515 0.155 0.082 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 1.71e-01 -0.102 0.0741 0.082 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 7.27e-02 -0.284 0.157 0.082 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00333 0.155 0.082 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -73215 sc-eQTL 2.00e-01 0.186 0.144 0.082 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 4.63e-04 0.434 0.122 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -342802 sc-eQTL 2.60e-01 -0.192 0.17 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 9.25e-04 0.244 0.0727 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 2.73e-01 -0.147 0.133 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 5.99e-01 0.0763 0.145 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0632 0.0824 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 4.03e-01 0.14 0.167 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 3.34e-01 0.154 0.159 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -73215 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0894 0.105 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 3.58e-02 0.298 0.141 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -342802 sc-eQTL 8.54e-01 0.0296 0.161 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 2.72e-01 0.0966 0.0877 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 4.75e-01 -0.116 0.162 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0207 0.161 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0806 0.0853 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 9.46e-01 0.0116 0.171 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 2.96e-01 -0.17 0.163 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -73215 sc-eQTL 9.37e-01 0.0089 0.113 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 5.69e-01 0.0781 0.137 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 5.66e-01 0.097 0.169 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 8.41e-01 0.0352 0.176 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 5.75e-01 0.0955 0.17 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0314 0.0787 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 1.83e-01 -0.224 0.168 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 3.52e-01 0.148 0.158 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0613 0.151 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 5.72e-03 0.352 0.126 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 4.72e-01 0.0788 0.109 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0457 0.119 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0676 0.077 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 1.07e-01 -0.231 0.142 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 1.06e-01 -0.24 0.148 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 5.66e-01 0.0894 0.156 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 6.71e-02 0.26 0.141 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 3.91e-01 -0.103 0.119 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0292 0.14 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0726 0.0725 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 9.25e-01 0.0131 0.139 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 7.51e-01 0.0534 0.168 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 4.58e-01 -0.122 0.164 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 3.39e-01 0.157 0.164 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00371 0.151 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 3.68e-01 0.142 0.157 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 8.00e-01 0.0164 0.0647 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 2.38e-01 -0.196 0.166 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0678 0.161 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0598 0.138 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 3.31e-01 0.137 0.141 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 4.98e-01 0.106 0.156 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 4.12e-01 0.0687 0.0835 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 3.43e-01 -0.15 0.157 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 6.09e-01 -0.083 0.162 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 6.70e-01 0.0701 0.164 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 2.06e-01 -0.167 0.132 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 5.34e-01 0.0883 0.142 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0239 0.0812 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0549 0.149 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 8.07e-02 -0.284 0.162 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00885 0.162 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 9.79e-01 0.00426 0.163 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 7.90e-02 -0.282 0.16 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 2.97e-01 0.0818 0.0783 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 4.72e-01 0.126 0.175 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 8.37e-03 -0.45 0.169 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 9.47e-01 0.0119 0.178 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 6.34e-01 0.0817 0.171 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 7.24e-02 0.317 0.176 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 1.32e-01 0.143 0.0947 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 3.32e-01 -0.169 0.174 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0566 0.18 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 6.44e-01 0.073 0.158 0.082 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 7.72e-01 0.0478 0.164 0.082 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 1.77e-01 -0.232 0.171 0.082 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 3.12e-01 -0.169 0.167 0.082 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 8.90e-01 0.0114 0.0823 0.082 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000928 0.17 0.082 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 5.35e-01 0.107 0.172 0.082 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 4.73e-02 0.321 0.161 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 4.02e-01 -0.144 0.171 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00581 0.165 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 5.85e-01 0.0503 0.0918 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0186 0.167 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 1.77e-02 0.309 0.129 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 3.86e-01 -0.117 0.134 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0787 0.164 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0265 0.0649 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0273 0.143 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 2.03e-01 0.204 0.16 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0351 0.162 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0849 0.163 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0697 0.0756 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 9.08e-01 0.0194 0.168 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 1.22e-04 0.55 0.141 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 6.38e-01 0.0709 0.15 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0564 0.164 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0228 0.0888 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 9.89e-01 0.00204 0.152 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 2.63e-01 0.216 0.192 0.096 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -342802 sc-eQTL 2.37e-01 -0.189 0.159 0.096 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 1.96e-01 -0.172 0.133 0.096 PB L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0608 0.182 0.096 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 8.10e-01 0.0394 0.163 0.096 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 1.83e-01 0.123 0.092 0.096 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 9.17e-01 0.0185 0.177 0.096 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0673 0.174 0.096 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -73215 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00873 0.114 0.096 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 3.11e-01 -0.143 0.141 0.083 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 8.88e-01 0.0205 0.146 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0762 0.164 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 3.14e-01 -0.158 0.156 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 4.23e-01 0.0475 0.0591 0.083 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 8.88e-01 0.0198 0.141 0.083 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0624 0.153 0.083 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 8.24e-01 0.0347 0.156 0.081 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 6.97e-02 0.282 0.155 0.081 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 6.79e-01 0.0663 0.16 0.081 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 3.56e-01 0.121 0.131 0.081 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0346 0.0579 0.081 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 9.38e-03 -0.356 0.136 0.081 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0666 0.164 0.081 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 2.38e-01 0.164 0.139 0.08 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 3.34e-01 0.134 0.138 0.08 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -676092 sc-eQTL 6.81e-02 -0.251 0.137 0.08 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 7.62e-03 -0.475 0.176 0.08 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -655382 sc-eQTL 4.15e-01 -0.132 0.162 0.08 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0238 0.158 0.08 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 5.48e-01 0.0468 0.0779 0.08 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 4.30e-02 0.351 0.172 0.08 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 8.79e-03 -0.401 0.152 0.08 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 3.22e-01 -0.149 0.15 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 1.25e-01 0.162 0.105 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -676092 sc-eQTL 2.77e-01 -0.163 0.149 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 7.14e-01 0.0544 0.148 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -655382 sc-eQTL 9.37e-01 -0.012 0.151 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 5.53e-01 0.0718 0.121 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 4.61e-01 0.0495 0.067 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 2.98e-01 -0.15 0.144 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 4.84e-01 0.0907 0.129 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 7.71e-01 0.0457 0.157 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 1.38e-01 0.17 0.115 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -676092 sc-eQTL 7.32e-01 0.0494 0.144 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0754 0.156 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -655382 sc-eQTL 9.40e-01 0.0119 0.156 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 6.86e-01 0.0414 0.102 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00202 0.0736 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 5.04e-01 -0.102 0.153 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 9.68e-01 0.00542 0.136 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 9.99e-01 0.000244 0.18 0.079 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 3.21e-01 0.187 0.188 0.079 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 8.27e-01 0.0444 0.202 0.079 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 9.53e-01 0.0122 0.209 0.079 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 7.28e-01 0.0277 0.0795 0.079 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 3.16e-01 0.212 0.211 0.079 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 1.65e-01 0.285 0.204 0.079 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 9.64e-01 0.00719 0.16 0.08 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 3.40e-01 0.148 0.155 0.08 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -676092 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0995 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0488 0.172 0.08 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -655382 sc-eQTL 7.56e-01 0.0482 0.155 0.08 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 1.47e-01 0.228 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0254 0.0685 0.08 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 2.50e-01 -0.193 0.167 0.08 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 1.85e-01 -0.221 0.166 0.08 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 5.73e-01 0.0841 0.149 0.084 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 7.55e-01 0.0355 0.114 0.084 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -676092 sc-eQTL 6.17e-03 -0.435 0.157 0.084 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 6.25e-01 0.0794 0.162 0.084 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -655382 sc-eQTL 7.44e-01 -0.052 0.159 0.084 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 3.20e-01 0.152 0.153 0.084 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 3.26e-02 0.163 0.0758 0.084 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 1.14e-01 0.248 0.156 0.084 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 1.27e-01 -0.206 0.135 0.084 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0355 0.178 0.085 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 5.17e-01 0.0829 0.128 0.085 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -676092 sc-eQTL 2.71e-01 -0.142 0.128 0.085 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 8.15e-01 0.0421 0.179 0.085 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -655382 sc-eQTL 3.13e-03 -0.382 0.127 0.085 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 7.76e-01 0.0444 0.156 0.085 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0161 0.107 0.085 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 3.14e-01 -0.148 0.146 0.085 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 1.19e-01 0.247 0.158 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 4.35e-01 0.109 0.14 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -342802 sc-eQTL 6.89e-02 0.288 0.158 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 1.11e-02 0.227 0.0886 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 1.91e-01 0.18 0.137 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 4.41e-01 -0.11 0.142 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0636 0.081 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0928 0.14 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 2.83e-01 -0.16 0.148 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -73215 sc-eQTL 6.52e-01 0.0647 0.143 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 1.53e-04 0.443 0.115 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -342802 sc-eQTL 3.91e-01 -0.146 0.17 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 4.99e-03 0.195 0.0687 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 3.34e-01 -0.127 0.131 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 7.70e-01 0.0398 0.136 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0655 0.0821 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 5.69e-01 0.0943 0.165 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 9.24e-01 0.0147 0.155 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -73215 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0405 0.0985 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0248 0.144 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 2.81e-02 0.194 0.0877 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -676092 sc-eQTL 4.68e-01 -0.105 0.144 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 8.18e-01 0.0321 0.139 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -655382 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0436 0.151 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 3.47e-01 0.0937 0.0995 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 5.15e-01 0.0445 0.0683 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0964 0.136 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 5.60e-01 0.0709 0.122 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 995351 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0274 0.151 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 2.61e-01 0.12 0.107 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -676092 sc-eQTL 3.79e-03 -0.452 0.154 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0927 0.153 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -655382 sc-eQTL 4.81e-01 -0.11 0.156 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 1.26e-01 0.225 0.146 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 5.54e-01 0.037 0.0624 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0997 0.157 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -754666 sc-eQTL 1.01e-01 -0.248 0.151 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -454525 sc-eQTL 9.97e-05 0.477 0.12 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 430431 sc-eQTL 3.81e-01 -0.106 0.121 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -704786 sc-eQTL 2.96e-01 -0.165 0.157 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -755896 sc-eQTL 7.34e-01 -0.022 0.0644 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 923206 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0368 0.134 0.082 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -454525 eQTL 1.67e-08 0.156 0.0274 0.0 0.0 0.0868
ENSG00000112299 VNN1 -655382 eQTL 0.0317 0.0819 0.0381 0.0 0.0 0.0868
ENSG00000118520 ARG1 485529 eQTL 0.0228 -0.0736 0.0323 0.0 0.0 0.0868
ENSG00000118523 CCN2 107301 pQTL 1.2e-11 -0.253 0.037 0.0 0.0 0.0853


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -454525 1.22e-06 1.47e-06 1.31e-07 6.38e-07 9.6e-08 4.35e-07 1.61e-06 4.37e-07 1.75e-06 4.82e-07 2.12e-06 7.32e-07 2.63e-06 3.26e-07 5.58e-07 6.7e-07 8e-07 5.48e-07 2.57e-07 1.87e-07 3.39e-07 1.72e-06 8.26e-07 2.39e-07 2.21e-06 2.36e-07 5.49e-07 7.99e-07 1.05e-06 1.22e-06 1.83e-06 5.38e-08 4.42e-08 1.64e-07 4.2e-07 1.28e-07 1e-07 6.97e-08 6.63e-08 5.77e-08 4.47e-08 1.93e-06 7.23e-08 1.43e-08 1.25e-07 7.57e-08 8.01e-08 0.0 4.85e-08
ENSG00000154269 \N 430231 1.3e-06 2.11e-06 1.46e-07 8.58e-07 1.18e-07 4.49e-07 1.55e-06 3.77e-07 1.73e-06 5.9e-07 2.51e-06 8.32e-07 2.62e-06 4.11e-07 5.65e-07 7.95e-07 9.08e-07 5.55e-07 2.88e-07 2.76e-07 3.95e-07 1.92e-06 8.91e-07 2.95e-07 2.32e-06 2.34e-07 6.16e-07 9.43e-07 1.24e-06 1.29e-06 2.02e-06 6.78e-08 5.55e-08 1.69e-07 4.4e-07 1.44e-07 1.15e-07 8.21e-08 6.74e-08 2.53e-08 4.89e-08 2.17e-06 6.28e-08 1.08e-08 1.48e-07 9.85e-08 8.84e-08 2.8e-09 4.98e-08