Genes within 1Mb (chr6:132056655:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0635 0.0699 0.216 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -344820 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0294 0.102 0.216 B L1
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 6.82e-01 0.0158 0.0385 0.216 B L1
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0427 0.0767 0.216 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 4.96e-01 0.0493 0.0723 0.216 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0306 0.0437 0.216 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 1.50e-01 -0.131 0.0905 0.216 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 3.52e-01 0.0857 0.092 0.216 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -75233 sc-eQTL 1.64e-05 -0.255 0.0579 0.216 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0449 0.0913 0.216 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0978 0.0743 0.216 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0574 0.059 0.216 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0219 0.0646 0.216 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 8.89e-01 0.00615 0.0439 0.216 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0627 0.0793 0.216 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 1.80e-01 0.119 0.0884 0.216 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 2.78e-01 0.0794 0.073 0.216 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 2.89e-01 0.0765 0.0719 0.216 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0569 0.0854 0.216 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0299 0.0291 0.216 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 1.48e-01 -0.119 0.0817 0.216 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 8.08e-01 0.0215 0.0883 0.216 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 1.91e-01 0.0984 0.075 0.218 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0501 0.0665 0.218 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -678110 sc-eQTL 3.37e-01 0.0793 0.0823 0.218 DC L1
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 1.15e-02 0.243 0.0953 0.218 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -657400 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0228 0.0891 0.218 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0963 0.0951 0.218 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0143 0.0534 0.218 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 3.47e-01 0.0895 0.0951 0.218 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0579 0.0845 0.218 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0768 0.0839 0.216 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 9.28e-01 0.00454 0.0501 0.216 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -678110 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0757 0.0859 0.216 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 5.80e-01 0.0452 0.0817 0.216 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -657400 sc-eQTL 3.72e-02 -0.192 0.0916 0.216 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 6.99e-01 0.0253 0.0653 0.216 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 7.50e-01 0.0125 0.0391 0.216 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 1.72e-01 0.111 0.0808 0.216 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0359 0.0774 0.216 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0573 0.0748 0.217 NK L1
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 7.79e-01 0.0193 0.0685 0.217 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 3.28e-01 0.0912 0.093 0.217 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 8.52e-01 0.00722 0.0386 0.217 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0291 0.082 0.217 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 5.89e-01 0.045 0.0832 0.216 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 5.06e-01 0.0502 0.0753 0.216 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 3.71e-01 0.0842 0.094 0.216 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 2.34e-01 -0.108 0.0909 0.216 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0385 0.0361 0.216 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 8.90e-01 0.0114 0.0823 0.216 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 7.49e-01 0.0318 0.099 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 9.66e-01 0.004 0.0932 0.217 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344820 sc-eQTL 1.86e-01 -0.14 0.105 0.217 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0247 0.0992 0.217 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 9.78e-01 0.00302 0.11 0.217 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 6.77e-01 0.0441 0.106 0.217 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0243 0.0565 0.217 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 3.68e-02 -0.228 0.108 0.217 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0226 0.099 0.217 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75233 sc-eQTL 3.97e-02 -0.193 0.0933 0.217 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 6.45e-01 0.0453 0.0981 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344820 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0689 0.0948 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 8.27e-01 0.0136 0.0622 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 2.95e-01 0.0989 0.0943 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 7.39e-01 0.0312 0.0936 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 4.34e-01 0.0449 0.0572 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 2.80e-01 -0.104 0.0958 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 8.83e-01 0.0153 0.103 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75233 sc-eQTL 2.92e-02 -0.19 0.0868 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 8.74e-01 0.0146 0.0917 0.216 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344820 sc-eQTL 6.52e-01 -0.043 0.095 0.216 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 2.37e-01 0.0881 0.0743 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0886 0.0959 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0372 0.0975 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 5.17e-01 0.0305 0.047 0.216 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0237 0.1 0.216 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 2.28e-02 0.222 0.0969 0.216 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75233 sc-eQTL 4.37e-02 -0.184 0.0905 0.216 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0109 0.0779 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344820 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00651 0.106 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00302 0.0463 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0193 0.0829 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 3.43e-01 0.0853 0.0897 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 6.42e-01 0.0238 0.0512 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 2.25e-01 -0.126 0.103 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 4.63e-01 0.0726 0.0987 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75233 sc-eQTL 1.23e-03 -0.209 0.0638 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0764 0.09 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344820 sc-eQTL 6.92e-01 0.0406 0.102 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00784 0.0557 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 3.26e-01 -0.101 0.103 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 7.28e-02 0.183 0.101 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00433 0.0541 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0478 0.108 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 1.80e-01 0.138 0.103 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75233 sc-eQTL 3.04e-02 -0.154 0.0708 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 9.11e-01 0.00914 0.0812 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 3.64e-01 0.0909 0.1 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 2.89e-01 -0.11 0.104 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 5.50e-01 0.0605 0.101 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0458 0.0466 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 1.73e-01 0.136 0.0994 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 7.16e-01 0.0342 0.0941 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0147 0.0947 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0266 0.0804 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 8.94e-01 0.00917 0.0686 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00748 0.0745 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 8.13e-01 0.0115 0.0483 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 5.78e-02 -0.17 0.089 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 3.94e-01 0.0794 0.0929 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0205 0.0965 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 8.49e-01 0.0168 0.0881 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 1.03e-01 -0.12 0.0736 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0222 0.0869 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00379 0.045 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0256 0.086 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 7.23e-01 0.037 0.104 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 2.05e-01 -0.13 0.102 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0338 0.103 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 1.19e-01 -0.147 0.0942 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 9.00e-01 0.0124 0.0987 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 7.26e-01 0.0142 0.0405 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 5.48e-01 0.0625 0.104 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 5.77e-02 0.19 0.0997 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0438 0.0836 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 5.52e-01 0.0511 0.0857 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0539 0.095 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00493 0.0509 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 9.47e-01 0.00641 0.0959 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 8.46e-02 0.17 0.0979 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 3.32e-04 0.362 0.0993 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 3.31e-01 0.0801 0.0822 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 7.01e-01 -0.034 0.0883 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0112 0.0506 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 2.62e-01 -0.104 0.0927 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 4.91e-01 -0.07 0.101 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 8.87e-01 0.0145 0.102 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0858 0.102 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 5.80e-01 0.0561 0.101 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0391 0.0493 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0281 0.11 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 2.65e-01 0.121 0.108 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00702 0.107 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 8.50e-01 0.0194 0.103 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 1.92e-01 -0.138 0.106 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 2.11e-01 0.0713 0.0569 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 9.07e-02 -0.176 0.104 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 1.68e-01 -0.149 0.108 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00315 0.0935 0.214 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 6.56e-01 0.0435 0.0973 0.214 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 5.18e-01 0.0658 0.102 0.214 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00622 0.099 0.214 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 2.96e-01 -0.051 0.0486 0.214 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 7.69e-01 0.0296 0.101 0.214 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0114 0.102 0.214 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0606 0.0985 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 1.63e-01 0.145 0.104 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 8.45e-01 0.0196 0.1 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 4.68e-01 0.0405 0.0557 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 9.74e-01 0.00325 0.101 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 4.48e-01 -0.061 0.0802 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0721 0.0824 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0435 0.1 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 9.48e-01 0.00262 0.0399 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0447 0.0876 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 7.82e-01 -0.027 0.0973 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 7.19e-01 0.0354 0.0983 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 4.96e-01 0.0671 0.0984 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 8.10e-01 0.011 0.0459 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 2.75e-01 -0.111 0.102 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 9.25e-01 0.00824 0.0872 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0328 0.0901 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 9.56e-02 0.163 0.0974 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 8.03e-01 0.0133 0.0532 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 8.74e-01 0.0144 0.091 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0257 0.138 0.2 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344820 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0584 0.114 0.2 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 3.62e-01 0.0871 0.0952 0.2 PB L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 2.21e-01 -0.159 0.129 0.2 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 6.37e-01 0.0551 0.117 0.2 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 6.57e-01 0.0295 0.0662 0.2 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 4.38e-01 0.0982 0.126 0.2 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 6.63e-01 0.0542 0.124 0.2 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75233 sc-eQTL 5.96e-01 0.0433 0.0816 0.2 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 6.72e-01 0.038 0.0899 0.217 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 6.40e-01 0.0435 0.0929 0.217 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 6.36e-01 0.0495 0.105 0.217 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0487 0.0996 0.217 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0193 0.0377 0.217 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00323 0.0897 0.217 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0908 0.0974 0.217 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0949 0.0984 0.216 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 8.82e-02 -0.168 0.0981 0.216 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00108 0.101 0.216 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0204 0.0831 0.216 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 8.68e-01 0.00611 0.0367 0.216 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 1.13e-01 0.139 0.087 0.216 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 1.10e-01 0.165 0.103 0.216 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 2.42e-01 0.101 0.0863 0.22 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 2.12e-01 -0.108 0.0859 0.22 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -678110 sc-eQTL 7.93e-01 0.0225 0.0856 0.22 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 1.63e-01 0.155 0.111 0.22 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -657400 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0296 0.101 0.22 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 6.53e-01 0.0442 0.0981 0.22 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 4.42e-01 0.0373 0.0484 0.22 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00652 0.108 0.22 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 8.81e-02 0.163 0.0952 0.22 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0967 0.0907 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0283 0.0639 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -678110 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00249 0.0904 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 8.36e-01 0.0185 0.0893 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -657400 sc-eQTL 3.42e-02 -0.192 0.0902 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 5.33e-01 0.0455 0.0729 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 4.04e-01 0.0338 0.0404 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 2.90e-01 0.0921 0.0868 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 6.30e-02 -0.145 0.0775 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0854 0.095 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00144 0.0697 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -678110 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0954 0.0868 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 6.45e-01 0.0435 0.0945 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -657400 sc-eQTL 1.27e-02 -0.234 0.0932 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 9.84e-01 0.00121 0.0619 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 6.06e-01 0.023 0.0446 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 5.18e-01 0.0599 0.0924 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 3.88e-01 0.0712 0.0824 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0519 0.116 0.206 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0676 0.121 0.206 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00369 0.13 0.206 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 2.51e-01 -0.154 0.133 0.206 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 4.86e-01 0.0356 0.051 0.206 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0597 0.136 0.206 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 3.03e-01 0.136 0.131 0.206 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0715 0.099 0.222 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00913 0.0963 0.222 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -678110 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0808 0.097 0.222 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0747 0.107 0.222 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -657400 sc-eQTL 1.82e-02 -0.226 0.0948 0.222 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 8.00e-01 0.0247 0.0976 0.222 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 6.65e-01 0.0184 0.0425 0.222 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 1.63e-01 0.145 0.104 0.222 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 1.11e-01 0.164 0.103 0.222 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 5.07e-01 0.0606 0.091 0.219 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 1.71e-01 0.0949 0.0691 0.219 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -678110 sc-eQTL 4.51e-01 0.0739 0.0979 0.219 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 7.97e-01 0.0255 0.0993 0.219 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -657400 sc-eQTL 9.70e-01 0.00371 0.0973 0.219 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0506 0.0935 0.219 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 6.99e-02 -0.0848 0.0465 0.219 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0812 0.0961 0.219 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0168 0.0829 0.219 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 8.21e-01 0.0261 0.115 0.198 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 3.60e-01 0.0756 0.0825 0.198 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -678110 sc-eQTL 5.96e-01 0.0442 0.0832 0.198 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 1.57e-01 0.164 0.115 0.198 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -657400 sc-eQTL 1.73e-01 0.115 0.0842 0.198 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 1.10e-01 -0.161 0.1 0.198 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 6.51e-01 0.0315 0.0694 0.198 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 3.23e-02 0.202 0.0934 0.198 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 1.67e-01 -0.142 0.102 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 5.35e-01 0.0557 0.0895 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -344820 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0514 0.101 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00015 0.0575 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 5.84e-01 0.0482 0.0879 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0194 0.0909 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 1.38e-01 0.0767 0.0515 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0921 0.0892 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 3.31e-01 0.0924 0.0949 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -75233 sc-eQTL 7.88e-05 -0.356 0.0884 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 5.38e-01 -0.046 0.0746 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -344820 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00455 0.107 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 8.40e-01 0.00889 0.044 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0805 0.0824 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 5.28e-02 0.165 0.0847 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 5.53e-01 0.0307 0.0517 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 2.04e-01 -0.132 0.104 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 1.61e-01 0.137 0.0971 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -75233 sc-eQTL 7.98e-04 -0.205 0.0603 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 1.28e-01 -0.132 0.0864 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0291 0.0534 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -678110 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0518 0.0871 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 5.23e-01 0.0535 0.0837 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -657400 sc-eQTL 2.31e-02 -0.205 0.0898 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 9.44e-01 0.00423 0.0601 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 3.08e-01 0.042 0.0411 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 2.19e-01 0.101 0.0819 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0611 0.0732 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0352 0.0943 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 1.90e-01 0.0878 0.0667 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -678110 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0322 0.0985 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 9.17e-01 0.00999 0.096 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -657400 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0554 0.0976 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0205 0.0921 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0482 0.0389 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 6.11e-01 0.0502 0.0984 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -756684 sc-eQTL 1.80e-01 0.127 0.0944 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -456543 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0483 0.0755 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 428413 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00583 0.0734 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -706804 sc-eQTL 3.69e-01 0.0859 0.0955 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -757914 sc-eQTL 9.46e-01 0.00266 0.039 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 921188 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0163 0.0809 0.216 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079819 EPB41L2 993333 eQTL 0.026 -0.0523 0.0235 0.0 0.0 0.233
ENSG00000079950 STX7 -456543 eQTL 0.0134 -0.0436 0.0176 0.0 0.0 0.233
ENSG00000118523 CCN2 105283 pQTL 3.17e-08 -0.131 0.0236 0.0 0.0 0.23


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -456543 7.87e-07 2.89e-07 7.92e-08 2.53e-07 1.08e-07 1.32e-07 3.94e-07 8.11e-08 2.38e-07 1.6e-07 3.32e-07 2.33e-07 4.34e-07 9.18e-08 1.07e-07 1.49e-07 9.53e-08 2.9e-07 9.69e-08 7.29e-08 1.48e-07 2.3e-07 2.26e-07 7.36e-08 4.46e-07 1.9e-07 1.87e-07 1.85e-07 2.03e-07 2.19e-07 1.78e-07 7.6e-08 5.07e-08 1.15e-07 1.33e-07 6.23e-08 5.71e-08 7.1e-08 5.69e-08 8.2e-08 4.42e-08 2.9e-07 2.67e-08 1.84e-08 9.95e-08 9.49e-09 9.1e-08 2.8e-09 5.16e-08