logo

Genes within 1Mb (chr6:132043892:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 7.72e-03 0.3 0.112 0.079 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -357583 sc-eQTL 9.50e-01 0.0105 0.166 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 1.82e-02 0.147 0.0616 0.079 B L1
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 3.38e-01 -0.119 0.124 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0605 0.117 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0488 0.0709 0.079 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 8.30e-01 0.0316 0.147 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 3.11e-01 -0.151 0.149 0.079 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -87996 sc-eQTL 3.65e-01 0.0887 0.0978 0.079 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0652 0.147 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 1.08e-03 0.388 0.117 0.079 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 2.65e-01 0.106 0.0949 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 8.03e-01 -0.026 0.104 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 1.25e-01 -0.108 0.0703 0.079 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 4.63e-02 -0.254 0.127 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 3.70e-01 -0.128 0.143 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 7.03e-01 0.0457 0.12 0.079 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00488 0.118 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 6.22e-01 0.069 0.14 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 6.75e-01 -0.02 0.0477 0.079 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 2.68e-01 -0.149 0.134 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 2.60e-02 -0.32 0.143 0.079 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 6.16e-01 0.0636 0.127 0.079 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 8.65e-02 0.191 0.111 0.079 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -690873 sc-eQTL 8.12e-02 -0.242 0.138 0.079 DC L1
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 6.59e-02 -0.299 0.162 0.079 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -670163 sc-eQTL 1.02e-01 -0.245 0.149 0.079 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 9.34e-01 0.0133 0.16 0.079 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 9.55e-01 0.00509 0.0899 0.079 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 3.07e-01 0.164 0.16 0.079 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0897 0.142 0.079 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0204 0.137 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 3.18e-02 0.175 0.0808 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -690873 sc-eQTL 4.46e-01 -0.107 0.14 0.079 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 8.08e-01 0.0324 0.133 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -670163 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0247 0.151 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 2.66e-01 0.118 0.106 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 3.32e-01 0.0619 0.0637 0.079 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 3.85e-01 -0.115 0.132 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 5.32e-01 0.0791 0.126 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 1.81e-05 0.53 0.121 0.079 NK L1
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 2.99e-01 -0.12 0.115 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0889 0.157 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0484 0.0649 0.079 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0694 0.138 0.079 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 7.55e-01 0.0433 0.139 0.079 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 5.47e-01 0.0756 0.125 0.079 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 3.14e-01 -0.158 0.156 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 1.29e-01 -0.23 0.151 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0116 0.0601 0.079 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0474 0.137 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 9.68e-01 0.00662 0.165 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 2.00e-01 -0.187 0.145 0.084 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -357583 sc-eQTL 3.10e-01 0.168 0.165 0.084 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 4.20e-02 0.315 0.154 0.084 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 3.35e-01 0.166 0.172 0.084 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 2.43e-01 -0.193 0.165 0.084 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 9.26e-01 0.00821 0.0887 0.084 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 3.10e-01 0.175 0.171 0.084 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 4.91e-01 -0.107 0.155 0.084 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -87996 sc-eQTL 7.28e-01 0.0515 0.148 0.084 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 3.97e-01 0.136 0.16 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -357583 sc-eQTL 4.98e-01 -0.105 0.155 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 9.61e-02 0.169 0.101 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0278 0.155 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 1.78e-01 -0.206 0.152 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0826 0.0936 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 7.91e-01 0.0417 0.157 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 1.91e-01 -0.22 0.168 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -87996 sc-eQTL 2.75e-02 -0.315 0.142 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 1.99e-01 0.188 0.146 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -357583 sc-eQTL 8.31e-02 0.263 0.151 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 5.05e-01 0.0795 0.119 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0314 0.154 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 8.90e-01 0.0215 0.156 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 1.67e-01 -0.104 0.0748 0.08 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 2.97e-02 -0.346 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00723 0.157 0.08 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -87996 sc-eQTL 1.65e-01 0.203 0.145 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 4.71e-04 0.438 0.123 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -357583 sc-eQTL 3.02e-01 -0.178 0.172 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 1.58e-03 0.236 0.0736 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 2.77e-01 -0.147 0.135 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 7.88e-01 0.0393 0.146 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0818 0.0832 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 4.94e-01 0.116 0.169 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 4.91e-01 0.111 0.161 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -87996 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0726 0.106 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 2.91e-02 0.312 0.142 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -357583 sc-eQTL 8.66e-01 0.0276 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 3.23e-01 0.0877 0.0885 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 4.54e-01 -0.123 0.164 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0302 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0921 0.086 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0614 0.172 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 2.25e-01 -0.2 0.164 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -87996 sc-eQTL 9.65e-01 0.00505 0.114 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 4.61e-01 0.102 0.139 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 5.79e-01 0.0949 0.171 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 7.63e-01 0.0537 0.178 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 7.61e-01 0.0526 0.173 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0539 0.0797 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 6.91e-02 -0.309 0.169 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 4.80e-01 0.114 0.161 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0543 0.153 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 4.67e-03 0.364 0.127 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 3.77e-01 0.0978 0.11 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0841 0.12 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0842 0.0777 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 8.13e-02 -0.251 0.144 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 1.14e-01 -0.236 0.149 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 7.14e-01 0.0575 0.157 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 3.71e-02 0.298 0.142 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0969 0.12 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0526 0.141 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0895 0.073 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 9.79e-01 0.00377 0.14 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00123 0.17 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0911 0.166 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 3.20e-01 0.165 0.166 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 9.14e-01 0.0166 0.153 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 5.07e-01 0.106 0.159 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00211 0.0655 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 1.76e-01 -0.227 0.168 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0889 0.163 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0813 0.139 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 2.32e-01 0.17 0.142 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 4.85e-01 0.111 0.158 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 5.29e-01 0.0534 0.0846 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 2.93e-01 -0.168 0.159 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 4.56e-01 -0.122 0.164 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 9.78e-01 0.00451 0.166 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 1.04e-01 -0.216 0.133 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 5.22e-01 0.0918 0.143 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0423 0.0819 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0549 0.151 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 5.10e-02 -0.32 0.163 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 9.68e-01 0.00658 0.164 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 9.30e-01 0.0145 0.165 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 1.22e-01 -0.251 0.162 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 4.78e-01 0.0564 0.0793 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 5.42e-01 0.108 0.177 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 7.04e-03 -0.465 0.171 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 9.81e-01 0.00439 0.181 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 6.72e-01 0.0736 0.174 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 1.34e-01 0.269 0.179 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 2.67e-01 0.107 0.0963 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 4.45e-01 -0.135 0.177 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00454 0.183 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 9.60e-01 0.00798 0.16 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 5.23e-01 0.106 0.166 0.08 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 3.79e-01 -0.153 0.174 0.08 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 2.68e-01 -0.188 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 8.95e-01 -0.011 0.0833 0.08 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 9.15e-01 0.0184 0.172 0.08 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 5.34e-01 0.109 0.175 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 4.21e-02 0.332 0.162 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 3.02e-01 -0.179 0.173 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 9.14e-01 0.0179 0.166 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 7.40e-01 0.0308 0.0927 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0677 0.168 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 1.13e-02 0.332 0.13 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 3.34e-01 -0.131 0.135 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0287 0.165 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 4.55e-01 -0.049 0.0654 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0486 0.144 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 1.63e-01 0.225 0.161 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 8.98e-01 -0.021 0.163 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 4.61e-01 -0.121 0.164 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0887 0.076 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 9.49e-01 0.0109 0.169 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 1.35e-04 0.551 0.142 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 3.88e-01 0.131 0.152 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0166 0.165 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0561 0.0895 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 9.17e-01 -0.016 0.153 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 2.58e-01 0.222 0.195 0.093 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -357583 sc-eQTL 1.96e-01 -0.21 0.162 0.093 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 2.21e-01 -0.166 0.135 0.093 PB L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0565 0.185 0.093 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 6.00e-01 0.0873 0.166 0.093 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 2.26e-01 0.114 0.0937 0.093 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 9.28e-01 0.0164 0.18 0.093 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0734 0.177 0.093 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -87996 sc-eQTL 9.55e-01 0.00659 0.116 0.093 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 2.68e-01 -0.158 0.142 0.08 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 8.80e-01 0.0222 0.147 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0514 0.166 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 4.05e-01 -0.132 0.158 0.08 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 5.46e-01 0.0361 0.0597 0.08 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 8.15e-01 0.0333 0.142 0.08 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0855 0.155 0.08 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0169 0.157 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 7.23e-02 0.282 0.156 0.079 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 6.14e-01 0.0815 0.161 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 3.29e-01 0.129 0.132 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0319 0.0584 0.079 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 1.13e-02 -0.35 0.137 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 5.28e-01 -0.104 0.165 0.079 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 2.04e-01 0.179 0.14 0.078 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 2.27e-01 0.17 0.14 0.078 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -690873 sc-eQTL 5.57e-02 -0.266 0.138 0.078 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 6.33e-03 -0.491 0.178 0.078 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -670163 sc-eQTL 3.54e-01 -0.152 0.164 0.078 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0226 0.16 0.078 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 4.54e-01 0.0591 0.0787 0.078 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 4.66e-02 0.349 0.174 0.078 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 1.38e-02 -0.382 0.154 0.078 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 1.89e-01 -0.2 0.152 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 1.28e-01 0.163 0.107 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -690873 sc-eQTL 3.59e-01 -0.139 0.151 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 6.27e-01 0.0727 0.15 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -670163 sc-eQTL 8.87e-01 0.0218 0.153 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 5.29e-01 0.0771 0.122 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 4.67e-01 0.0493 0.0678 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 2.68e-01 -0.161 0.145 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 4.65e-01 0.0956 0.131 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 8.37e-01 0.0328 0.159 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 1.13e-01 0.184 0.116 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -690873 sc-eQTL 7.83e-01 0.0401 0.145 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0327 0.158 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -670163 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00136 0.158 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 7.14e-01 0.038 0.103 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00154 0.0745 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 5.10e-01 -0.102 0.154 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 8.70e-01 0.0226 0.138 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 9.99e-01 0.000244 0.18 0.079 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 3.21e-01 0.187 0.188 0.079 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 8.27e-01 0.0444 0.202 0.079 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 9.53e-01 0.0122 0.209 0.079 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 7.28e-01 0.0277 0.0795 0.079 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 3.16e-01 0.212 0.211 0.079 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 1.65e-01 0.285 0.204 0.079 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 8.36e-01 0.0334 0.161 0.078 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 3.00e-01 0.162 0.156 0.078 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -690873 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0667 0.158 0.078 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 6.09e-01 -0.089 0.174 0.078 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -670163 sc-eQTL 5.69e-01 0.0892 0.156 0.078 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 1.83e-01 0.212 0.158 0.078 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0326 0.0691 0.078 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 2.75e-01 -0.185 0.169 0.078 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 2.50e-01 -0.194 0.168 0.078 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 4.25e-01 0.12 0.15 0.081 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 6.22e-01 0.0565 0.114 0.081 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -690873 sc-eQTL 6.54e-03 -0.436 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 7.98e-01 0.0419 0.164 0.081 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -670163 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0161 0.161 0.081 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 2.85e-01 0.165 0.154 0.081 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 2.63e-02 0.171 0.0764 0.081 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 9.80e-02 0.262 0.158 0.081 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 2.59e-01 -0.154 0.136 0.081 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0355 0.178 0.085 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 5.17e-01 0.0829 0.128 0.085 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -690873 sc-eQTL 2.71e-01 -0.142 0.128 0.085 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 8.15e-01 0.0421 0.179 0.085 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -670163 sc-eQTL 3.13e-03 -0.382 0.127 0.085 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 7.76e-01 0.0444 0.156 0.085 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0161 0.107 0.085 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 3.14e-01 -0.148 0.146 0.085 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 1.19e-01 0.247 0.158 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 5.27e-01 0.0896 0.141 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -357583 sc-eQTL 1.05e-01 0.259 0.159 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 1.44e-02 0.221 0.0895 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 3.53e-01 0.129 0.139 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 5.97e-01 -0.076 0.144 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 3.47e-01 -0.077 0.0817 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0922 0.141 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 3.29e-01 -0.147 0.15 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -87996 sc-eQTL 6.84e-01 0.0591 0.145 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 1.18e-04 0.454 0.116 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -357583 sc-eQTL 4.27e-01 -0.137 0.172 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 8.69e-03 0.184 0.0695 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 3.32e-01 -0.129 0.132 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 9.36e-01 0.011 0.137 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0822 0.0828 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 8.15e-01 0.0393 0.167 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0293 0.157 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -87996 sc-eQTL 7.56e-01 -0.031 0.0995 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0654 0.146 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 2.62e-02 0.199 0.0887 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -690873 sc-eQTL 5.30e-01 -0.092 0.146 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 6.15e-01 0.0708 0.141 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -670163 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0317 0.153 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 3.59e-01 0.0926 0.101 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 5.08e-01 0.0458 0.0691 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 4.43e-01 -0.106 0.138 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 4.88e-01 0.0854 0.123 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 980570 sc-eQTL 9.16e-01 0.016 0.152 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 2.14e-01 0.134 0.108 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -690873 sc-eQTL 5.19e-03 -0.44 0.156 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 3.57e-01 -0.143 0.154 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -670163 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0644 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 1.33e-01 0.223 0.148 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 6.06e-01 0.0325 0.0629 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0893 0.159 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -769447 sc-eQTL 1.74e-01 -0.208 0.152 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -469306 sc-eQTL 4.58e-05 0.503 0.121 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 415650 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0854 0.122 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -719567 sc-eQTL 4.32e-01 -0.125 0.159 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -770677 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0416 0.0649 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 908425 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0559 0.135 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -469306 eQTL 6.06e-09 0.165 0.0282 0.0 0.0 0.0829
ENSG00000112299 VNN1 -670163 eQTL 0.0332 0.0835 0.0391 0.0 0.0 0.0829
ENSG00000118520 ARG1 470748 eQTL 0.0253 -0.0743 0.0332 0.0 0.0 0.0829
ENSG00000118523 CCN2 92520 pQTL 2.86e-12 -0.269 0.0382 0.0 0.0 0.0806

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -469306 1.05e-06 6.46e-07 1.54e-07 3.99e-07 1.04e-07 2.64e-07 6.18e-07 2.26e-07 7.11e-07 3.04e-07 9.47e-07 5.01e-07 9.77e-07 1.6e-07 3.08e-07 3.79e-07 5.34e-07 4.39e-07 2.88e-07 1.89e-07 2.49e-07 5.5e-07 3.99e-07 2.7e-07 9.82e-07 2.38e-07 4.25e-07 3.18e-07 5.41e-07 6.42e-07 3.68e-07 6.37e-08 5.3e-08 2.1e-07 3.42e-07 1.94e-07 1.43e-07 1.1e-07 7.9e-08 1.6e-08 1.15e-07 6.27e-07 4.53e-08 1.88e-08 1.67e-07 1.5e-08 1.1e-07 2.28e-08 6.14e-08
ENSG00000154269 \N 415450 1.25e-06 8.33e-07 2.75e-07 4.14e-07 1.64e-07 3.24e-07 7.32e-07 3.34e-07 1.08e-06 2.77e-07 1.13e-06 5.75e-07 1.3e-06 2.1e-07 4.05e-07 5.69e-07 7.47e-07 5.27e-07 3.98e-07 3.96e-07 2.89e-07 7.58e-07 5.87e-07 4.09e-07 1.47e-06 3.02e-07 5.82e-07 4.4e-07 7.61e-07 8.59e-07 4.48e-07 3.51e-08 1.27e-07 3.79e-07 3.28e-07 3.38e-07 2.96e-07 1.14e-07 1.24e-07 9.74e-09 2.37e-07 9.49e-07 6.37e-08 1.11e-08 1.8e-07 4.43e-08 1.82e-07 5.86e-08 5.77e-08