Genes within 1Mb (chr6:132043381:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0251 0.0698 0.229 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -358094 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0369 0.102 0.229 B L1
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 9.26e-01 0.00355 0.0384 0.229 B L1
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 8.50e-01 0.0145 0.0766 0.229 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 4.41e-01 0.0557 0.0721 0.229 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0026 0.0437 0.229 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 1.47e-01 -0.131 0.0902 0.229 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 3.55e-01 0.085 0.0917 0.229 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -88507 sc-eQTL 2.61e-05 -0.249 0.0578 0.229 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0815 0.0908 0.229 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0928 0.074 0.229 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0427 0.0589 0.229 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 8.03e-01 -0.016 0.0643 0.229 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 4.15e-01 0.0357 0.0437 0.229 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 2.00e-01 -0.101 0.0788 0.229 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 3.92e-01 0.0757 0.0883 0.229 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 2.84e-01 0.0781 0.0727 0.229 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 4.29e-01 0.0568 0.0717 0.229 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0447 0.0851 0.229 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 8.16e-01 -0.00676 0.0291 0.229 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 5.95e-02 -0.154 0.0811 0.229 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 9.25e-01 0.00833 0.088 0.229 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 2.64e-01 0.0838 0.0748 0.225 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0649 0.0661 0.225 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -691384 sc-eQTL 3.15e-01 0.0825 0.0819 0.225 DC L1
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 1.37e-02 0.236 0.0949 0.225 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -670674 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0638 0.0886 0.225 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 2.53e-01 -0.108 0.0945 0.225 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0282 0.0531 0.225 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 4.00e-01 0.0799 0.0947 0.225 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0531 0.0841 0.225 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 1.97e-01 -0.107 0.083 0.229 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0167 0.0496 0.229 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -691384 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0289 0.0852 0.229 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 4.81e-01 0.057 0.0809 0.229 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -670674 sc-eQTL 9.05e-02 -0.155 0.0911 0.229 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 6.50e-01 0.0294 0.0647 0.229 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 2.68e-01 0.0429 0.0387 0.229 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 5.28e-01 0.0507 0.0803 0.229 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0527 0.0766 0.229 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0452 0.0747 0.227 NK L1
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 6.23e-01 0.0336 0.0683 0.227 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 5.22e-01 0.0595 0.0929 0.227 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 4.99e-01 0.026 0.0384 0.227 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0424 0.0817 0.227 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 3.25e-01 0.0819 0.083 0.229 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 5.51e-01 0.0449 0.0752 0.229 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 6.60e-01 0.0415 0.094 0.229 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 9.93e-02 -0.15 0.0905 0.229 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0279 0.0361 0.229 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 8.06e-01 0.0202 0.0822 0.229 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 2.48e-01 0.114 0.0985 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0317 0.0919 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -358094 sc-eQTL 3.22e-01 -0.103 0.104 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0182 0.0978 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 8.27e-01 0.0238 0.108 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 6.90e-01 0.0416 0.104 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00774 0.0558 0.23 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 1.78e-02 -0.254 0.106 0.23 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0369 0.0976 0.23 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -88507 sc-eQTL 9.78e-02 -0.154 0.0924 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 5.49e-01 0.0581 0.0969 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -358094 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0739 0.0937 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00408 0.0614 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 1.10e-01 0.149 0.0928 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 8.23e-01 0.0207 0.0925 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 2.39e-01 0.0666 0.0564 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 2.58e-01 -0.107 0.0946 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 8.45e-01 0.0199 0.102 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -88507 sc-eQTL 5.64e-02 -0.165 0.0859 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 6.08e-01 0.047 0.0914 0.228 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -358094 sc-eQTL 1.87e-01 -0.125 0.0944 0.228 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 4.01e-01 0.0625 0.0742 0.228 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 2.79e-01 -0.104 0.0955 0.228 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0293 0.0972 0.228 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 2.26e-01 0.0567 0.0467 0.228 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0541 0.0997 0.228 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 1.62e-02 0.234 0.0964 0.228 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -88507 sc-eQTL 7.16e-02 -0.164 0.0904 0.228 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 8.14e-01 0.0182 0.0772 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -358094 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0334 0.105 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 6.96e-01 -0.018 0.0458 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 6.72e-01 0.0348 0.0821 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 1.73e-01 0.121 0.0886 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 2.45e-01 0.059 0.0505 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 2.71e-01 -0.113 0.102 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 8.70e-01 0.016 0.0978 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -88507 sc-eQTL 1.51e-03 -0.203 0.0633 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0125 0.0891 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -358094 sc-eQTL 8.17e-01 0.0233 0.101 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 7.43e-01 -0.018 0.055 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0284 0.102 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 6.86e-02 0.183 0.1 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 5.35e-01 0.0332 0.0534 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0285 0.107 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 1.05e-01 0.165 0.101 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -88507 sc-eQTL 2.86e-02 -0.154 0.0699 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0016 0.0803 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 7.72e-01 0.0287 0.099 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 2.96e-01 -0.108 0.103 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 9.76e-01 -0.003 0.0999 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0437 0.0461 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 1.46e-01 0.143 0.0982 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 4.11e-01 0.0766 0.0929 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0402 0.0943 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 6.45e-01 -0.037 0.0801 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 7.88e-01 0.0184 0.0684 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 8.26e-01 0.0163 0.0742 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 3.27e-01 0.0472 0.048 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 1.70e-02 -0.212 0.0882 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 9.20e-01 0.00935 0.0927 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000338 0.0959 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 7.73e-01 0.0253 0.0876 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0776 0.0735 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0397 0.0863 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 6.52e-01 0.0202 0.0447 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0416 0.0854 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 6.09e-01 0.053 0.104 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 1.32e-01 -0.154 0.102 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 6.67e-01 0.044 0.102 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 2.80e-02 -0.206 0.0931 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 6.55e-01 0.0439 0.0981 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 3.60e-01 0.0368 0.0402 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 7.19e-01 0.0373 0.103 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 1.71e-01 0.137 0.0996 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 7.93e-01 -0.022 0.084 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 3.12e-01 0.0871 0.0859 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0392 0.0954 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 7.60e-01 0.0156 0.0511 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0123 0.0963 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 1.03e-01 0.161 0.0984 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 6.39e-04 0.345 0.0994 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 7.34e-01 0.028 0.0821 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0521 0.0881 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 6.22e-01 0.0249 0.0504 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 1.36e-01 -0.138 0.0923 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0617 0.101 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 9.29e-01 0.00889 0.1 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0349 0.101 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 4.40e-01 0.0769 0.0993 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0334 0.0484 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0604 0.108 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 5.31e-01 0.0666 0.106 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 5.88e-01 -0.058 0.107 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 8.69e-01 0.017 0.103 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 1.03e-01 -0.173 0.106 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 9.12e-02 0.0963 0.0567 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 8.09e-02 -0.182 0.104 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 3.35e-01 -0.104 0.108 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 8.51e-01 0.0175 0.0927 0.227 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 6.41e-01 0.0451 0.0965 0.227 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 4.18e-01 0.0818 0.101 0.227 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 6.11e-01 -0.05 0.0982 0.227 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0401 0.0482 0.227 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 6.72e-01 0.0423 0.0998 0.227 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 4.36e-01 0.0789 0.101 0.227 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00278 0.0977 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 1.44e-01 0.151 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0103 0.0992 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 1.41e-01 0.0812 0.055 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0145 0.1 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0501 0.08 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0508 0.0822 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0981 0.0999 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 6.41e-01 0.0186 0.0397 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0598 0.0873 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 8.92e-01 0.0131 0.0965 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 9.75e-01 0.00306 0.0975 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 4.29e-01 0.0773 0.0975 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 7.03e-01 0.0173 0.0455 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 2.37e-01 -0.12 0.101 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 9.68e-01 0.00346 0.0869 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0156 0.0899 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 7.52e-02 0.173 0.097 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 6.27e-01 0.0258 0.053 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 7.97e-01 0.0234 0.0907 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0518 0.134 0.222 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -358094 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0563 0.111 0.222 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 6.18e-01 0.0464 0.0928 0.222 PB L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 2.31e-02 -0.284 0.123 0.222 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 5.82e-01 0.0626 0.113 0.222 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 6.08e-01 0.0331 0.0644 0.222 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 5.81e-01 0.068 0.123 0.222 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 8.68e-01 0.0201 0.121 0.222 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -88507 sc-eQTL 7.25e-01 0.028 0.0794 0.222 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 3.43e-01 0.0851 0.0896 0.23 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 7.81e-01 0.0259 0.0928 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 4.25e-01 0.0833 0.104 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 9.93e-01 0.000906 0.0996 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 8.61e-01 -0.00662 0.0377 0.23 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000839 0.0896 0.23 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0258 0.0975 0.23 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 2.58e-01 -0.111 0.098 0.229 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 6.35e-02 -0.182 0.0976 0.229 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 9.79e-01 0.00272 0.101 0.229 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00645 0.0828 0.229 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 5.57e-01 0.0215 0.0366 0.229 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 2.70e-01 0.0961 0.087 0.229 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 1.34e-01 0.155 0.103 0.229 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 5.24e-01 0.0546 0.0855 0.227 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 6.30e-02 -0.158 0.0844 0.227 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -691384 sc-eQTL 9.64e-01 0.00379 0.0847 0.227 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 1.79e-01 0.148 0.11 0.227 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -670674 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0475 0.0995 0.227 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 8.18e-01 0.0224 0.097 0.227 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 5.45e-01 0.029 0.0478 0.227 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0172 0.107 0.227 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 4.54e-02 0.189 0.0938 0.227 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 1.41e-01 -0.133 0.0898 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0413 0.0634 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -691384 sc-eQTL 6.96e-01 0.0352 0.0897 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 7.17e-01 0.0322 0.0887 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -670674 sc-eQTL 7.30e-02 -0.162 0.0899 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 5.41e-01 0.0443 0.0723 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 1.27e-01 0.0613 0.04 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 7.17e-01 0.0314 0.0864 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 2.79e-02 -0.17 0.0767 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0896 0.0942 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0541 0.0691 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -691384 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0702 0.0862 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 7.67e-01 0.0278 0.0937 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -670674 sc-eQTL 1.40e-02 -0.229 0.0924 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00395 0.0614 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 4.12e-01 0.0363 0.0442 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 8.17e-01 0.0213 0.0918 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 2.51e-01 0.0939 0.0816 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0541 0.115 0.212 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0489 0.12 0.212 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0312 0.129 0.212 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 1.82e-01 -0.178 0.132 0.212 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 6.42e-01 0.0236 0.0507 0.212 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0226 0.135 0.212 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 3.63e-01 0.119 0.131 0.212 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0944 0.0993 0.233 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 8.53e-01 0.0179 0.0966 0.233 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -691384 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00353 0.0975 0.233 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0379 0.107 0.233 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -670674 sc-eQTL 3.76e-02 -0.2 0.0954 0.233 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 7.65e-01 0.0293 0.098 0.233 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 4.12e-01 0.035 0.0426 0.233 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 1.84e-01 0.139 0.104 0.233 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 1.31e-01 0.156 0.103 0.233 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 6.63e-01 0.0399 0.0915 0.226 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 6.83e-02 0.127 0.0692 0.226 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -691384 sc-eQTL 2.34e-01 0.117 0.0981 0.226 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 4.96e-01 0.0679 0.0996 0.226 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -670674 sc-eQTL 8.79e-01 0.0149 0.0977 0.226 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0267 0.0939 0.226 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0587 0.0469 0.226 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 2.95e-01 -0.101 0.0964 0.226 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00725 0.0832 0.226 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 9.31e-01 0.00998 0.115 0.201 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 4.47e-01 0.0631 0.0826 0.201 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -691384 sc-eQTL 5.45e-01 0.0506 0.0832 0.201 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 1.36e-01 0.173 0.115 0.201 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -670674 sc-eQTL 3.16e-01 0.085 0.0845 0.201 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 1.56e-01 -0.143 0.1 0.201 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 4.57e-01 0.0518 0.0694 0.201 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 2.65e-02 0.209 0.0933 0.201 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 8.57e-02 -0.176 0.102 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 5.33e-01 0.0551 0.0883 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -358094 sc-eQTL 3.63e-01 -0.091 0.0999 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00515 0.0567 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 4.29e-01 0.0686 0.0867 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 7.38e-01 -0.03 0.0897 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 9.58e-02 0.0849 0.0508 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 2.13e-01 -0.11 0.0879 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 2.57e-01 0.106 0.0935 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -88507 sc-eQTL 2.11e-04 -0.33 0.0876 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00113 0.0739 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -358094 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0369 0.106 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00281 0.0435 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00143 0.0817 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 2.73e-02 0.186 0.0835 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 1.74e-01 0.0694 0.0509 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 2.47e-01 -0.119 0.103 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 2.95e-01 0.101 0.0962 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -88507 sc-eQTL 6.26e-04 -0.207 0.0596 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 3.93e-02 -0.177 0.0852 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0579 0.0528 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -691384 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0117 0.0862 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 5.96e-01 0.044 0.0828 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -670674 sc-eQTL 5.98e-02 -0.169 0.0892 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 8.70e-01 0.00971 0.0595 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 9.27e-02 0.0684 0.0405 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 6.62e-01 0.0357 0.0813 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0764 0.0724 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 980059 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0264 0.0939 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 8.51e-02 0.114 0.0662 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -691384 sc-eQTL 8.82e-01 0.0146 0.098 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 5.17e-01 0.0619 0.0954 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -670674 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0281 0.0971 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00907 0.0916 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 4.71e-01 -0.028 0.0388 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 7.76e-01 0.0279 0.098 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -769958 sc-eQTL 1.55e-01 0.134 0.0939 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -469817 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0389 0.0753 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 415139 sc-eQTL 8.95e-01 0.00965 0.0731 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -720078 sc-eQTL 5.78e-01 0.0531 0.0952 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -771188 sc-eQTL 6.52e-01 0.0176 0.0389 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 907914 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0291 0.0806 0.226 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -469817 eQTL 0.00715 -0.0463 0.0172 0.0 0.0 0.239
ENSG00000118523 CCN2 92009 pQTL 3.62e-11 -0.153 0.0229 0.0 0.0 0.241


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -469817 6.97e-07 3.35e-07 9.16e-08 2.92e-07 9.72e-08 1.5e-07 4.14e-07 9.69e-08 3.32e-07 1.89e-07 4.3e-07 3.11e-07 5.39e-07 1.01e-07 1.5e-07 1.96e-07 1.35e-07 3.39e-07 1.51e-07 9.01e-08 1.61e-07 2.76e-07 2.77e-07 1.17e-07 5.15e-07 2.32e-07 2.23e-07 1.97e-07 2.57e-07 3.15e-07 2.11e-07 8.48e-08 5.55e-08 1.15e-07 2.15e-07 6.85e-08 6.95e-08 6.1e-08 5.77e-08 6.07e-08 4.63e-08 3.27e-07 3.09e-08 7.32e-09 8.24e-08 9.31e-09 1.05e-07 0.0 5.44e-08