logo

Genes within 1Mb (chr6:132039552:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0251 0.0698 0.229 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -361923 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0369 0.102 0.229 B L1
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 9.26e-01 0.00355 0.0384 0.229 B L1
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 8.50e-01 0.0145 0.0766 0.229 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 4.41e-01 0.0557 0.0721 0.229 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0026 0.0437 0.229 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 1.47e-01 -0.131 0.0902 0.229 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 3.55e-01 0.085 0.0917 0.229 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -92336 sc-eQTL 2.61e-05 -0.249 0.0578 0.229 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0815 0.0908 0.229 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0928 0.074 0.229 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0427 0.0589 0.229 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 8.03e-01 -0.016 0.0643 0.229 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 4.15e-01 0.0357 0.0437 0.229 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 2.00e-01 -0.101 0.0788 0.229 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 3.92e-01 0.0757 0.0883 0.229 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 2.84e-01 0.0781 0.0727 0.229 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 4.29e-01 0.0568 0.0717 0.229 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0447 0.0851 0.229 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 8.16e-01 -0.00676 0.0291 0.229 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 5.95e-02 -0.154 0.0811 0.229 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 9.25e-01 0.00833 0.088 0.229 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 2.64e-01 0.0838 0.0748 0.225 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0649 0.0661 0.225 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -695213 sc-eQTL 3.15e-01 0.0825 0.0819 0.225 DC L1
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 1.37e-02 0.236 0.0949 0.225 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -674503 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0638 0.0886 0.225 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 2.53e-01 -0.108 0.0945 0.225 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0282 0.0531 0.225 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 4.00e-01 0.0799 0.0947 0.225 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0531 0.0841 0.225 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 1.97e-01 -0.107 0.083 0.229 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0167 0.0496 0.229 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -695213 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0289 0.0852 0.229 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 4.81e-01 0.057 0.0809 0.229 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -674503 sc-eQTL 9.05e-02 -0.155 0.0911 0.229 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 6.50e-01 0.0294 0.0647 0.229 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 2.68e-01 0.0429 0.0387 0.229 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 5.28e-01 0.0507 0.0803 0.229 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0527 0.0766 0.229 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0452 0.0747 0.227 NK L1
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 6.23e-01 0.0336 0.0683 0.227 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 5.22e-01 0.0595 0.0929 0.227 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 4.99e-01 0.026 0.0384 0.227 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0424 0.0817 0.227 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 3.25e-01 0.0819 0.083 0.229 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 5.51e-01 0.0449 0.0752 0.229 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 6.60e-01 0.0415 0.094 0.229 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 9.93e-02 -0.15 0.0905 0.229 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0279 0.0361 0.229 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 8.06e-01 0.0202 0.0822 0.229 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 2.48e-01 0.114 0.0985 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0317 0.0919 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -361923 sc-eQTL 3.22e-01 -0.103 0.104 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0182 0.0978 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 8.27e-01 0.0238 0.108 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 6.90e-01 0.0416 0.104 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00774 0.0558 0.23 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 1.78e-02 -0.254 0.106 0.23 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0369 0.0976 0.23 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -92336 sc-eQTL 9.78e-02 -0.154 0.0924 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 5.49e-01 0.0581 0.0969 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -361923 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0739 0.0937 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00408 0.0614 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 1.10e-01 0.149 0.0928 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 8.23e-01 0.0207 0.0925 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 2.39e-01 0.0666 0.0564 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 2.58e-01 -0.107 0.0946 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 8.45e-01 0.0199 0.102 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -92336 sc-eQTL 5.64e-02 -0.165 0.0859 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 6.08e-01 0.047 0.0914 0.228 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -361923 sc-eQTL 1.87e-01 -0.125 0.0944 0.228 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 4.01e-01 0.0625 0.0742 0.228 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 2.79e-01 -0.104 0.0955 0.228 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0293 0.0972 0.228 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 2.26e-01 0.0567 0.0467 0.228 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0541 0.0997 0.228 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 1.62e-02 0.234 0.0964 0.228 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -92336 sc-eQTL 7.16e-02 -0.164 0.0904 0.228 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 8.14e-01 0.0182 0.0772 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -361923 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0334 0.105 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 6.96e-01 -0.018 0.0458 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 6.72e-01 0.0348 0.0821 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 1.73e-01 0.121 0.0886 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 2.45e-01 0.059 0.0505 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 2.71e-01 -0.113 0.102 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 8.70e-01 0.016 0.0978 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -92336 sc-eQTL 1.51e-03 -0.203 0.0633 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0125 0.0891 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -361923 sc-eQTL 8.17e-01 0.0233 0.101 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 7.43e-01 -0.018 0.055 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0284 0.102 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 6.86e-02 0.183 0.1 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 5.35e-01 0.0332 0.0534 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0285 0.107 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 1.05e-01 0.165 0.101 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -92336 sc-eQTL 2.86e-02 -0.154 0.0699 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0016 0.0803 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 7.72e-01 0.0287 0.099 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 2.96e-01 -0.108 0.103 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 9.76e-01 -0.003 0.0999 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0437 0.0461 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 1.46e-01 0.143 0.0982 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 4.11e-01 0.0766 0.0929 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0402 0.0943 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 6.45e-01 -0.037 0.0801 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 7.88e-01 0.0184 0.0684 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 8.26e-01 0.0163 0.0742 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 3.27e-01 0.0472 0.048 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 1.70e-02 -0.212 0.0882 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 9.20e-01 0.00935 0.0927 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000338 0.0959 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 7.73e-01 0.0253 0.0876 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0776 0.0735 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0397 0.0863 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 6.52e-01 0.0202 0.0447 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0416 0.0854 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 6.09e-01 0.053 0.104 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 1.32e-01 -0.154 0.102 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 6.67e-01 0.044 0.102 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 2.80e-02 -0.206 0.0931 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 6.55e-01 0.0439 0.0981 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 3.60e-01 0.0368 0.0402 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 7.19e-01 0.0373 0.103 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 1.71e-01 0.137 0.0996 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 7.93e-01 -0.022 0.084 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 3.12e-01 0.0871 0.0859 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0392 0.0954 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 7.60e-01 0.0156 0.0511 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0123 0.0963 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 1.03e-01 0.161 0.0984 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 6.39e-04 0.345 0.0994 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 7.34e-01 0.028 0.0821 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0521 0.0881 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 6.22e-01 0.0249 0.0504 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 1.36e-01 -0.138 0.0923 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0617 0.101 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 9.29e-01 0.00889 0.1 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0349 0.101 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 4.40e-01 0.0769 0.0993 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0334 0.0484 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0604 0.108 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 5.31e-01 0.0666 0.106 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 5.88e-01 -0.058 0.107 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 8.69e-01 0.017 0.103 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 1.03e-01 -0.173 0.106 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 9.12e-02 0.0963 0.0567 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 8.09e-02 -0.182 0.104 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 3.35e-01 -0.104 0.108 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 8.51e-01 0.0175 0.0927 0.227 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 6.41e-01 0.0451 0.0965 0.227 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 4.18e-01 0.0818 0.101 0.227 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 6.11e-01 -0.05 0.0982 0.227 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0401 0.0482 0.227 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 6.72e-01 0.0423 0.0998 0.227 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 4.36e-01 0.0789 0.101 0.227 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00278 0.0977 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 1.44e-01 0.151 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0103 0.0992 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 1.41e-01 0.0812 0.055 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0145 0.1 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0501 0.08 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0508 0.0822 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0981 0.0999 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 6.41e-01 0.0186 0.0397 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0598 0.0873 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 8.92e-01 0.0131 0.0965 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 9.75e-01 0.00306 0.0975 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 4.29e-01 0.0773 0.0975 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 7.03e-01 0.0173 0.0455 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 2.37e-01 -0.12 0.101 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 9.68e-01 0.00346 0.0869 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0156 0.0899 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 7.52e-02 0.173 0.097 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 6.27e-01 0.0258 0.053 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 7.97e-01 0.0234 0.0907 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0518 0.134 0.222 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -361923 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0563 0.111 0.222 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 6.18e-01 0.0464 0.0928 0.222 PB L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 2.31e-02 -0.284 0.123 0.222 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 5.82e-01 0.0626 0.113 0.222 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 6.08e-01 0.0331 0.0644 0.222 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 5.81e-01 0.068 0.123 0.222 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 8.68e-01 0.0201 0.121 0.222 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -92336 sc-eQTL 7.25e-01 0.028 0.0794 0.222 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 3.43e-01 0.0851 0.0896 0.23 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 7.81e-01 0.0259 0.0928 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 4.25e-01 0.0833 0.104 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 9.93e-01 0.000906 0.0996 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 8.61e-01 -0.00662 0.0377 0.23 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000839 0.0896 0.23 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0258 0.0975 0.23 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 2.58e-01 -0.111 0.098 0.229 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 6.35e-02 -0.182 0.0976 0.229 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 9.79e-01 0.00272 0.101 0.229 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00645 0.0828 0.229 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 5.57e-01 0.0215 0.0366 0.229 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 2.70e-01 0.0961 0.087 0.229 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 1.34e-01 0.155 0.103 0.229 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 5.24e-01 0.0546 0.0855 0.227 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 6.30e-02 -0.158 0.0844 0.227 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -695213 sc-eQTL 9.64e-01 0.00379 0.0847 0.227 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 1.79e-01 0.148 0.11 0.227 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -674503 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0475 0.0995 0.227 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 8.18e-01 0.0224 0.097 0.227 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 5.45e-01 0.029 0.0478 0.227 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0172 0.107 0.227 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 4.54e-02 0.189 0.0938 0.227 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 1.41e-01 -0.133 0.0898 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0413 0.0634 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -695213 sc-eQTL 6.96e-01 0.0352 0.0897 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 7.17e-01 0.0322 0.0887 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -674503 sc-eQTL 7.30e-02 -0.162 0.0899 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 5.41e-01 0.0443 0.0723 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 1.27e-01 0.0613 0.04 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 7.17e-01 0.0314 0.0864 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 2.79e-02 -0.17 0.0767 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0896 0.0942 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0541 0.0691 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -695213 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0702 0.0862 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 7.67e-01 0.0278 0.0937 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -674503 sc-eQTL 1.40e-02 -0.229 0.0924 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00395 0.0614 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 4.12e-01 0.0363 0.0442 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 8.17e-01 0.0213 0.0918 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 2.51e-01 0.0939 0.0816 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0541 0.115 0.212 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0489 0.12 0.212 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0312 0.129 0.212 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 1.82e-01 -0.178 0.132 0.212 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 6.42e-01 0.0236 0.0507 0.212 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0226 0.135 0.212 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 3.63e-01 0.119 0.131 0.212 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0944 0.0993 0.233 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 8.53e-01 0.0179 0.0966 0.233 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -695213 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00353 0.0975 0.233 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0379 0.107 0.233 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -674503 sc-eQTL 3.76e-02 -0.2 0.0954 0.233 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 7.65e-01 0.0293 0.098 0.233 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 4.12e-01 0.035 0.0426 0.233 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 1.84e-01 0.139 0.104 0.233 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 1.31e-01 0.156 0.103 0.233 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 6.63e-01 0.0399 0.0915 0.226 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 6.83e-02 0.127 0.0692 0.226 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -695213 sc-eQTL 2.34e-01 0.117 0.0981 0.226 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 4.96e-01 0.0679 0.0996 0.226 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -674503 sc-eQTL 8.79e-01 0.0149 0.0977 0.226 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0267 0.0939 0.226 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0587 0.0469 0.226 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 2.95e-01 -0.101 0.0964 0.226 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00725 0.0832 0.226 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 9.31e-01 0.00998 0.115 0.201 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 4.47e-01 0.0631 0.0826 0.201 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -695213 sc-eQTL 5.45e-01 0.0506 0.0832 0.201 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 1.36e-01 0.173 0.115 0.201 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -674503 sc-eQTL 3.16e-01 0.085 0.0845 0.201 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 1.56e-01 -0.143 0.1 0.201 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 4.57e-01 0.0518 0.0694 0.201 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 2.65e-02 0.209 0.0933 0.201 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 8.57e-02 -0.176 0.102 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 5.33e-01 0.0551 0.0883 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -361923 sc-eQTL 3.63e-01 -0.091 0.0999 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00515 0.0567 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 4.29e-01 0.0686 0.0867 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 7.38e-01 -0.03 0.0897 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 9.58e-02 0.0849 0.0508 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 2.13e-01 -0.11 0.0879 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 2.57e-01 0.106 0.0935 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -92336 sc-eQTL 2.11e-04 -0.33 0.0876 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00113 0.0739 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -361923 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0369 0.106 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00281 0.0435 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00143 0.0817 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 2.73e-02 0.186 0.0835 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 1.74e-01 0.0694 0.0509 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 2.47e-01 -0.119 0.103 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 2.95e-01 0.101 0.0962 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -92336 sc-eQTL 6.26e-04 -0.207 0.0596 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 3.93e-02 -0.177 0.0852 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0579 0.0528 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -695213 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0117 0.0862 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 5.96e-01 0.044 0.0828 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -674503 sc-eQTL 5.98e-02 -0.169 0.0892 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 8.70e-01 0.00971 0.0595 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 9.27e-02 0.0684 0.0405 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 6.62e-01 0.0357 0.0813 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0764 0.0724 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 976230 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0264 0.0939 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 8.51e-02 0.114 0.0662 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -695213 sc-eQTL 8.82e-01 0.0146 0.098 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 5.17e-01 0.0619 0.0954 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -674503 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0281 0.0971 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00907 0.0916 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 4.71e-01 -0.028 0.0388 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 7.76e-01 0.0279 0.098 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -773787 sc-eQTL 1.55e-01 0.134 0.0939 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -473646 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0389 0.0753 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 411310 sc-eQTL 8.95e-01 0.00965 0.0731 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -723907 sc-eQTL 5.78e-01 0.0531 0.0952 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -775017 sc-eQTL 6.52e-01 0.0176 0.0389 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 904085 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0291 0.0806 0.226 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -473646 eQTL 0.00697 -0.0466 0.0172 0.0 0.0 0.239
ENSG00000118523 CCN2 88180 pQTL 3.43e-11 -0.154 0.023 0.0 0.0 0.241

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -473646 7.57e-07 3.55e-07 1.03e-07 2.87e-07 1.13e-07 1.57e-07 4.42e-07 1.09e-07 3.62e-07 2.01e-07 4.64e-07 3.08e-07 5.62e-07 1.01e-07 1.51e-07 2.08e-07 1.73e-07 3.56e-07 1.56e-07 1.08e-07 1.76e-07 3.1e-07 3.02e-07 1.23e-07 5.53e-07 2.4e-07 2.22e-07 1.97e-07 2.84e-07 3.71e-07 2.31e-07 8.14e-08 5.73e-08 1.19e-07 2.15e-07 7.92e-08 7.97e-08 6.2e-08 5.62e-08 5.54e-08 5.56e-08 3.85e-07 2.28e-08 1.99e-08 1.01e-07 1.32e-08 9.68e-08 0.0 5.44e-08