logo

Genes within 1Mb (chr6:132025218:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0517 0.0702 0.222 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -376257 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0224 0.102 0.222 B L1
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 8.14e-01 0.00912 0.0387 0.222 B L1
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 8.45e-01 0.0151 0.0771 0.222 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 7.69e-01 0.0214 0.0727 0.222 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00526 0.0439 0.222 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 1.03e-01 -0.148 0.0907 0.222 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 3.25e-01 0.091 0.0923 0.222 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -106670 sc-eQTL 2.21e-05 -0.252 0.0582 0.222 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0634 0.0912 0.222 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0782 0.0743 0.222 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0457 0.0591 0.222 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 5.88e-01 -0.035 0.0645 0.222 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 5.22e-01 0.0281 0.0438 0.222 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0971 0.0791 0.222 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 3.67e-01 0.0801 0.0886 0.222 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 1.64e-01 0.102 0.073 0.222 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 5.71e-01 0.0409 0.0722 0.222 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0323 0.0856 0.222 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 6.83e-01 -0.012 0.0293 0.222 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 5.16e-02 -0.16 0.0816 0.222 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 8.87e-01 0.0126 0.0885 0.222 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 3.41e-01 0.0723 0.0758 0.221 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0496 0.067 0.221 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -709547 sc-eQTL 3.19e-01 0.083 0.083 0.221 DC L1
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 1.89e-02 0.228 0.0963 0.221 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -688837 sc-eQTL 4.97e-01 -0.061 0.0897 0.221 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 2.60e-01 -0.108 0.0958 0.221 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0423 0.0538 0.221 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 3.85e-01 0.0834 0.0959 0.221 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0443 0.0852 0.221 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 1.45e-01 -0.122 0.0837 0.222 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0134 0.0501 0.222 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -709547 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0159 0.086 0.222 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 3.67e-01 0.0738 0.0815 0.222 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -688837 sc-eQTL 7.77e-02 -0.163 0.0919 0.222 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 5.62e-01 0.0379 0.0653 0.222 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 3.87e-01 0.0339 0.0391 0.222 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 5.57e-01 0.0477 0.081 0.222 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0327 0.0774 0.222 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0263 0.0757 0.221 NK L1
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 7.77e-01 0.0197 0.0693 0.221 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 3.16e-01 0.0946 0.0941 0.221 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 4.50e-01 0.0295 0.039 0.221 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0525 0.0828 0.221 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 3.41e-01 0.0797 0.0835 0.222 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 4.96e-01 0.0516 0.0756 0.222 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 6.46e-01 0.0435 0.0945 0.222 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 8.15e-02 -0.159 0.0909 0.222 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0311 0.0362 0.222 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 6.81e-01 0.034 0.0826 0.222 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 3.47e-01 0.0935 0.0992 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0376 0.0934 0.224 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -376257 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0909 0.106 0.224 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0162 0.0994 0.224 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 9.17e-01 0.0115 0.11 0.224 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 6.91e-01 0.042 0.106 0.224 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 9.09e-01 0.00649 0.0567 0.224 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 3.60e-02 -0.229 0.108 0.224 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0408 0.0993 0.224 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -106670 sc-eQTL 1.07e-01 -0.152 0.094 0.224 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 4.76e-01 0.0697 0.0976 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -376257 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0613 0.0944 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00122 0.0619 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 1.43e-01 0.138 0.0936 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 9.42e-01 0.00678 0.0932 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 1.50e-01 0.0819 0.0568 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 2.92e-01 -0.101 0.0954 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 7.61e-01 0.0314 0.103 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -106670 sc-eQTL 4.29e-02 -0.176 0.0865 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0153 0.093 0.222 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -376257 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0675 0.0963 0.222 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 5.00e-01 0.051 0.0756 0.222 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0648 0.0974 0.222 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0627 0.0989 0.222 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 2.05e-01 0.0604 0.0475 0.222 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0701 0.101 0.222 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 5.64e-03 0.273 0.0977 0.222 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -106670 sc-eQTL 4.17e-02 -0.188 0.0918 0.222 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 8.73e-01 0.0125 0.0781 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -376257 sc-eQTL 9.58e-01 0.00561 0.106 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0191 0.0463 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 7.04e-01 0.0316 0.083 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 3.38e-01 0.0863 0.0899 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 2.32e-01 0.0613 0.0511 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 1.62e-01 -0.145 0.103 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 7.24e-01 0.035 0.0989 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -106670 sc-eQTL 1.02e-03 -0.213 0.0639 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0571 0.0899 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -376257 sc-eQTL 7.13e-01 0.0375 0.102 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0158 0.0555 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0552 0.102 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 1.35e-01 0.152 0.101 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 3.88e-01 0.0466 0.0539 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 7.24e-01 -0.038 0.108 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 1.23e-01 0.159 0.102 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -106670 sc-eQTL 5.08e-02 -0.139 0.0707 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0194 0.0817 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 5.78e-01 0.0561 0.101 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 2.14e-01 -0.13 0.104 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 8.59e-01 0.0181 0.102 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 5.37e-01 -0.029 0.0469 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 2.33e-01 0.12 0.1 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 3.94e-01 0.0807 0.0945 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0334 0.0945 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0192 0.0802 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 7.60e-01 0.0209 0.0685 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0172 0.0743 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 4.30e-01 0.0381 0.0482 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 1.43e-02 -0.218 0.0883 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 8.55e-01 0.0169 0.0928 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 8.11e-01 0.0231 0.0966 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 6.34e-01 0.0421 0.0882 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 1.68e-01 -0.102 0.0738 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0381 0.0869 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 6.47e-01 0.0207 0.0451 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0105 0.0861 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 6.97e-01 0.0407 0.104 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 1.64e-01 -0.143 0.103 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 7.61e-01 0.0314 0.103 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 3.77e-02 -0.197 0.094 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 7.73e-01 0.0286 0.099 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 4.12e-01 0.0333 0.0405 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 8.29e-01 0.0226 0.104 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 8.54e-02 0.173 0.1 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0181 0.0845 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 3.53e-01 0.0805 0.0865 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0309 0.096 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 5.54e-01 0.0305 0.0514 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0279 0.0969 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 6.32e-02 0.184 0.0988 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 5.29e-05 0.408 0.099 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 8.26e-01 0.0182 0.0827 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0217 0.0888 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 8.69e-01 0.00838 0.0508 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 1.45e-01 -0.136 0.093 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0654 0.102 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00547 0.101 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0304 0.101 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 5.82e-01 0.0552 0.1 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0295 0.0488 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0543 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 5.15e-01 0.0697 0.107 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0448 0.108 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 8.52e-01 0.0194 0.104 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 1.23e-01 -0.165 0.106 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 1.13e-01 0.0911 0.0572 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 9.52e-02 -0.176 0.105 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 2.91e-01 -0.115 0.109 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 7.74e-01 0.0269 0.0935 0.221 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 7.29e-01 0.0337 0.0974 0.221 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 5.08e-01 0.0675 0.102 0.221 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0661 0.099 0.221 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0377 0.0487 0.221 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 7.00e-01 0.0388 0.101 0.221 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 6.14e-01 0.0516 0.102 0.221 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00347 0.0988 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 1.36e-01 0.155 0.104 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 9.76e-01 0.00305 0.1 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 1.39e-01 0.0825 0.0556 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00443 0.101 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0272 0.0809 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0394 0.0832 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0718 0.101 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 4.93e-01 0.0276 0.0401 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0707 0.0882 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0112 0.0972 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 8.98e-01 0.0126 0.0982 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 4.50e-01 0.0743 0.0983 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 4.20e-01 0.037 0.0458 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 2.21e-01 -0.125 0.101 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 7.62e-01 0.0266 0.0877 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0424 0.0907 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 4.71e-02 0.195 0.0977 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 5.64e-01 0.0309 0.0535 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 9.05e-01 0.011 0.0916 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0654 0.137 0.211 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -376257 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0693 0.114 0.211 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 7.46e-01 0.0309 0.0952 0.211 PB L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 3.61e-02 -0.269 0.127 0.211 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 4.77e-01 0.0828 0.116 0.211 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 5.94e-01 0.0353 0.066 0.211 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 6.56e-01 0.0562 0.126 0.211 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 6.97e-01 0.0483 0.124 0.211 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -106670 sc-eQTL 5.85e-01 0.0445 0.0813 0.211 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 5.38e-01 0.0556 0.0902 0.224 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 7.78e-01 0.0264 0.0933 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 3.78e-01 0.0927 0.105 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0124 0.1 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00674 0.0379 0.224 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 8.90e-01 0.0125 0.0901 0.224 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0303 0.098 0.224 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0888 0.0994 0.222 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 5.09e-02 -0.194 0.0988 0.222 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 7.97e-01 0.0263 0.102 0.222 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 9.56e-01 0.00459 0.0839 0.222 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 7.15e-01 0.0136 0.0371 0.222 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 1.05e-01 0.143 0.0878 0.222 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 1.02e-01 0.171 0.104 0.222 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 6.28e-01 0.0424 0.0872 0.222 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 1.01e-01 -0.142 0.0862 0.222 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -709547 sc-eQTL 9.21e-01 0.00854 0.0863 0.222 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 2.38e-01 0.132 0.112 0.222 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -688837 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0417 0.101 0.222 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 6.88e-01 0.0397 0.0988 0.222 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 6.51e-01 0.0221 0.0488 0.222 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 8.98e-01 -0.014 0.109 0.222 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 4.64e-02 0.192 0.0956 0.222 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 1.23e-01 -0.14 0.0907 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0291 0.0641 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -709547 sc-eQTL 6.25e-01 0.0443 0.0906 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 6.41e-01 0.0418 0.0896 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -688837 sc-eQTL 5.60e-02 -0.174 0.0907 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 4.42e-01 0.0563 0.073 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 2.33e-01 0.0484 0.0405 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 6.66e-01 0.0376 0.0872 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 7.23e-02 -0.14 0.0777 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 1.97e-01 -0.123 0.095 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0496 0.0698 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -709547 sc-eQTL 3.60e-01 -0.08 0.0871 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 7.31e-01 0.0326 0.0947 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -688837 sc-eQTL 1.62e-02 -0.227 0.0935 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 8.85e-01 0.00896 0.0621 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 5.68e-01 0.0256 0.0447 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 8.94e-01 0.0124 0.0927 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 2.67e-01 0.0918 0.0825 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0343 0.116 0.209 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0472 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00235 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 1.78e-01 -0.181 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 5.37e-01 0.0317 0.0512 0.209 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0216 0.136 0.209 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 3.47e-01 0.125 0.132 0.209 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0738 0.0998 0.227 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00395 0.0971 0.227 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -709547 sc-eQTL 9.24e-01 0.00938 0.098 0.227 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0178 0.108 0.227 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -688837 sc-eQTL 3.66e-02 -0.202 0.0958 0.227 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 7.69e-01 0.029 0.0984 0.227 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 8.49e-01 0.00815 0.0428 0.227 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 2.05e-01 0.133 0.105 0.227 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 1.76e-01 0.141 0.104 0.227 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 7.19e-01 0.0334 0.0926 0.222 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 1.73e-01 0.096 0.0702 0.222 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -709547 sc-eQTL 1.98e-01 0.128 0.0992 0.222 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 5.05e-01 0.0674 0.101 0.222 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -688837 sc-eQTL 8.88e-01 -0.014 0.0989 0.222 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00809 0.0951 0.222 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 9.75e-02 -0.0789 0.0474 0.222 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 2.11e-01 -0.122 0.0975 0.222 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0404 0.0842 0.222 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 6.31e-01 0.0562 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 4.30e-01 0.0666 0.0841 0.195 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -709547 sc-eQTL 5.57e-01 0.0498 0.0847 0.195 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 1.07e-01 0.19 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -688837 sc-eQTL 2.87e-01 0.0918 0.086 0.195 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 1.47e-01 -0.149 0.102 0.195 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 8.31e-01 0.0151 0.0707 0.195 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 2.06e-02 0.222 0.0948 0.195 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 1.50e-01 -0.151 0.104 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 6.55e-01 0.0402 0.0896 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -376257 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0252 0.102 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0041 0.0576 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 3.57e-01 0.0811 0.0879 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0672 0.091 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 8.51e-02 0.0891 0.0515 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 2.18e-01 -0.11 0.0892 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 1.64e-01 0.132 0.0948 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -106670 sc-eQTL 9.77e-05 -0.352 0.0886 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0167 0.0747 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -376257 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00388 0.107 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 9.51e-01 0.0027 0.044 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0142 0.0826 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 8.72e-02 0.146 0.0848 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 1.51e-01 0.0742 0.0514 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 1.29e-01 -0.158 0.104 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 2.37e-01 0.115 0.0972 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -106670 sc-eQTL 7.56e-04 -0.206 0.0603 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 3.35e-02 -0.184 0.0861 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0487 0.0534 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -709547 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00724 0.0872 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 5.03e-01 0.0562 0.0837 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -688837 sc-eQTL 4.93e-02 -0.178 0.0901 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 7.93e-01 0.0158 0.0601 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 1.75e-01 0.0559 0.041 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 6.97e-01 0.0321 0.0822 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0552 0.0733 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 961896 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0437 0.0952 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 1.41e-01 0.0995 0.0673 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -709547 sc-eQTL 6.77e-01 0.0415 0.0994 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 4.38e-01 0.0751 0.0967 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -688837 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0587 0.0985 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 8.79e-01 0.0142 0.093 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0396 0.0393 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 8.21e-01 0.0225 0.0994 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -788121 sc-eQTL 2.04e-01 0.121 0.0954 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -487980 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0256 0.0763 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 396976 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00578 0.0741 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -738241 sc-eQTL 3.53e-01 0.0897 0.0964 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -789351 sc-eQTL 5.36e-01 0.0244 0.0394 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 889751 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0521 0.0816 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -487980 eQTL 0.0253 -0.0388 0.0173 0.0 0.0 0.24
ENSG00000118523 CCN2 73846 pQTL 8.64e-11 -0.151 0.0231 0.0 0.0 0.241

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000228495 \N -106697 5.63e-06 5.52e-06 7.3e-07 3.42e-06 1.62e-06 1.54e-06 6.72e-06 1.03e-06 5e-06 2.88e-06 6.86e-06 3.25e-06 8.51e-06 1.76e-06 1.09e-06 3.73e-06 1.92e-06 3.98e-06 1.44e-06 1.37e-06 2.79e-06 4.88e-06 4.6e-06 1.93e-06 8.15e-06 2.01e-06 2.34e-06 1.49e-06 4.66e-06 5.36e-06 2.71e-06 4.18e-07 5.2e-07 1.84e-06 2.04e-06 1.17e-06 1.08e-06 4.57e-07 8.12e-07 5.77e-07 4.96e-07 7.03e-06 4.55e-07 1.84e-07 6.07e-07 9.82e-07 1.13e-06 5.51e-07 3.29e-07