logo

Genes within 1Mb (chr6:131998611:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 8.29e-01 0.0148 0.0686 0.261 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -402864 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0539 0.1 0.261 B L1
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 1.28e-01 0.0573 0.0375 0.261 B L1
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0264 0.0752 0.261 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 5.53e-01 0.0421 0.0709 0.261 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0189 0.0429 0.261 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 1.24e-01 -0.137 0.0886 0.261 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00315 0.0903 0.261 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -133277 sc-eQTL 7.45e-05 -0.231 0.0571 0.261 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0242 0.0893 0.261 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 5.11e-01 0.048 0.0728 0.261 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 9.93e-01 0.000497 0.0578 0.261 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 7.04e-01 -0.024 0.0631 0.261 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 8.28e-01 0.00934 0.0429 0.261 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 5.34e-02 -0.149 0.0769 0.261 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 7.06e-01 0.0327 0.0868 0.261 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 4.27e-02 0.144 0.0708 0.261 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 6.14e-01 0.0355 0.0704 0.261 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0109 0.0835 0.261 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0188 0.0285 0.261 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 3.47e-02 -0.169 0.0794 0.261 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0437 0.0862 0.261 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 2.04e-01 0.0937 0.0735 0.259 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0391 0.0651 0.259 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -736154 sc-eQTL 7.10e-01 0.03 0.0808 0.259 DC L1
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 3.98e-02 0.194 0.0938 0.259 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -715444 sc-eQTL 1.29e-01 -0.132 0.0867 0.259 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 2.57e-01 -0.106 0.093 0.259 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0655 0.0521 0.259 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 1.99e-01 0.12 0.0929 0.259 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0617 0.0827 0.259 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0772 0.082 0.261 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 5.08e-01 0.0325 0.0489 0.261 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -736154 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0515 0.084 0.261 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 3.85e-01 0.0695 0.0797 0.261 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -715444 sc-eQTL 2.08e-01 -0.114 0.0901 0.261 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 4.55e-01 0.0478 0.0638 0.261 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 8.63e-02 0.0655 0.038 0.261 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 6.98e-01 0.0308 0.0793 0.261 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 3.41e-01 -0.072 0.0755 0.261 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 1.23e-01 0.113 0.0733 0.26 NK L1
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 8.15e-01 0.0157 0.0674 0.26 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 2.23e-01 0.112 0.0914 0.26 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 6.45e-01 0.0175 0.0379 0.26 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0641 0.0805 0.26 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 2.19e-01 0.101 0.0817 0.261 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 2.32e-01 0.0887 0.074 0.261 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 6.42e-01 0.0432 0.0926 0.261 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 1.76e-02 -0.212 0.0886 0.261 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0417 0.0355 0.261 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 5.97e-01 0.0429 0.0809 0.261 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 5.63e-01 0.0565 0.0974 0.261 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0826 0.0898 0.265 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -402864 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0138 0.102 0.265 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 7.04e-01 0.0365 0.0957 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 9.17e-01 0.0111 0.106 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0111 0.102 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0375 0.0545 0.265 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 1.94e-01 -0.137 0.105 0.265 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0604 0.0955 0.265 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -133277 sc-eQTL 7.60e-02 -0.161 0.0904 0.265 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 6.49e-01 0.0434 0.0952 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -402864 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0987 0.0919 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 3.77e-01 0.0533 0.0602 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 1.01e-01 0.15 0.0912 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0214 0.0908 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 1.32e-01 0.0836 0.0553 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0641 0.0932 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0591 0.1 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -133277 sc-eQTL 3.78e-03 -0.245 0.0835 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 4.25e-01 0.0723 0.0905 0.261 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -402864 sc-eQTL 2.40e-01 -0.11 0.0936 0.261 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 1.62e-01 0.103 0.0734 0.261 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 2.63e-01 -0.106 0.0947 0.261 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0644 0.0963 0.261 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 5.13e-01 0.0304 0.0464 0.261 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 2.78e-01 -0.107 0.0986 0.261 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 2.13e-02 0.222 0.0957 0.261 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -133277 sc-eQTL 8.88e-02 -0.153 0.0897 0.261 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 1.34e-01 0.115 0.0761 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -402864 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0224 0.104 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 1.79e-01 0.0611 0.0453 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0103 0.0814 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 3.07e-01 0.0901 0.0881 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 3.51e-01 0.0469 0.0502 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 2.26e-01 -0.123 0.102 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00216 0.097 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -133277 sc-eQTL 5.14e-03 -0.178 0.0631 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 5.75e-01 0.049 0.0874 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -402864 sc-eQTL 7.28e-01 0.0345 0.0991 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 6.66e-01 0.0234 0.054 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0231 0.0997 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 3.72e-02 0.206 0.0981 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 5.12e-01 0.0344 0.0524 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0169 0.105 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 6.34e-01 0.0478 0.1 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -133277 sc-eQTL 1.88e-02 -0.162 0.0685 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0295 0.0796 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 3.89e-01 0.0846 0.098 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 3.23e-01 -0.101 0.102 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 9.19e-01 0.01 0.0991 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 9.74e-02 -0.0757 0.0455 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 2.00e-01 0.126 0.0975 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 5.90e-01 0.0498 0.0922 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 8.23e-01 0.0206 0.0924 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 2.59e-01 0.0885 0.0782 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 5.41e-01 0.041 0.0669 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00673 0.0727 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 4.13e-01 0.0386 0.0471 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 2.95e-03 -0.258 0.0858 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0306 0.0907 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 5.96e-01 0.0501 0.0946 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 8.62e-02 0.148 0.0858 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0619 0.0726 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0504 0.0851 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00313 0.0442 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 7.58e-01 -0.026 0.0843 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 7.83e-01 0.0282 0.102 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 2.71e-01 -0.111 0.1 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 2.82e-01 0.108 0.1 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 1.45e-01 -0.135 0.0923 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 6.38e-01 0.0455 0.0966 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 6.08e-01 0.0203 0.0396 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0661 0.102 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 5.23e-01 0.063 0.0985 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 9.67e-01 0.00345 0.0829 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 9.73e-02 0.141 0.0844 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0309 0.0942 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 8.01e-01 0.0127 0.0504 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0354 0.095 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 2.79e-01 0.106 0.0975 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 5.76e-04 0.341 0.0974 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0221 0.0806 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 9.16e-01 0.00908 0.0865 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 5.21e-01 0.0318 0.0495 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 1.31e-01 -0.137 0.0905 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 2.75e-01 -0.108 0.099 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 4.99e-01 0.0668 0.0987 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 9.12e-01 -0.011 0.0991 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 6.07e-01 0.0505 0.098 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0231 0.0478 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0589 0.106 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0118 0.105 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 8.61e-01 0.0184 0.105 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 7.60e-01 0.031 0.101 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0845 0.104 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 5.85e-02 0.106 0.0558 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 2.20e-01 -0.126 0.103 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0588 0.106 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 6.61e-01 0.0401 0.0912 0.26 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 3.81e-01 0.0834 0.0949 0.26 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 4.92e-01 0.0684 0.0993 0.26 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 2.99e-01 -0.1 0.0964 0.26 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0465 0.0474 0.26 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 4.61e-01 0.0725 0.0981 0.26 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 6.91e-01 0.0396 0.0996 0.26 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 4.39e-01 0.0749 0.0964 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 2.95e-01 0.107 0.102 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 8.44e-01 0.0193 0.0981 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 2.14e-01 0.0679 0.0544 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0432 0.099 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 1.94e-01 0.102 0.0781 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0384 0.0806 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0408 0.0981 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 8.58e-01 0.00696 0.0389 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 2.06e-01 -0.108 0.0853 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 3.64e-01 0.0873 0.0959 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 8.06e-01 0.0238 0.0971 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 6.85e-01 0.0395 0.0972 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 8.82e-01 0.00675 0.0453 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 3.07e-01 -0.103 0.1 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 1.81e-01 0.114 0.085 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0101 0.0883 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 1.88e-02 0.224 0.0947 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 8.96e-01 0.00681 0.0521 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 8.08e-01 0.0217 0.0891 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0119 0.129 0.267 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -402864 sc-eQTL 1.51e-01 -0.153 0.106 0.267 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00856 0.0891 0.267 PB L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 2.42e-02 -0.271 0.118 0.267 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 2.03e-01 0.138 0.108 0.267 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 6.04e-01 0.0322 0.0618 0.267 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 3.46e-01 0.111 0.118 0.267 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0364 0.116 0.267 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -133277 sc-eQTL 5.88e-01 0.0414 0.0761 0.267 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 5.01e-01 0.0585 0.0868 0.263 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 5.06e-01 0.0598 0.0898 0.263 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 1.71e-01 0.138 0.101 0.263 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0453 0.0963 0.263 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00124 0.0365 0.263 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 8.04e-01 0.0215 0.0867 0.263 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0654 0.0942 0.263 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 3.24e-01 -0.095 0.0962 0.261 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 2.41e-01 -0.113 0.0962 0.261 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 8.61e-01 0.0174 0.0992 0.261 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0147 0.0812 0.261 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00137 0.0359 0.261 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 7.41e-01 0.0283 0.0855 0.261 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 2.41e-01 0.119 0.101 0.261 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 2.60e-01 0.0956 0.0846 0.259 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 1.35e-01 -0.126 0.084 0.259 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -736154 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0365 0.0839 0.259 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 8.89e-01 0.0152 0.109 0.259 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -715444 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0739 0.0985 0.259 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00227 0.0961 0.259 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0131 0.0475 0.259 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 3.42e-01 0.101 0.106 0.259 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 4.31e-01 0.074 0.0939 0.259 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 6.78e-02 -0.163 0.0886 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00687 0.0628 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -736154 sc-eQTL 9.70e-01 0.00332 0.0888 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 5.23e-01 0.0561 0.0877 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -715444 sc-eQTL 1.48e-01 -0.129 0.0891 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 5.30e-01 0.045 0.0715 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 6.02e-02 0.0745 0.0394 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0333 0.0854 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 3.84e-02 -0.158 0.0759 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0471 0.093 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 9.62e-01 0.00327 0.0682 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -736154 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0677 0.085 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 6.35e-01 0.044 0.0924 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -715444 sc-eQTL 6.35e-02 -0.171 0.0917 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0056 0.0606 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 2.92e-01 0.046 0.0435 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 6.43e-01 0.042 0.0904 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 6.85e-01 0.0328 0.0807 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0306 0.112 0.245 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 6.64e-01 0.051 0.117 0.245 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 9.19e-01 0.0129 0.126 0.245 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 8.17e-02 -0.225 0.128 0.245 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 5.31e-01 0.0309 0.0493 0.245 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 8.65e-01 0.0223 0.131 0.245 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 3.88e-01 0.11 0.127 0.245 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 3.52e-01 -0.091 0.0976 0.264 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 3.27e-01 0.0931 0.0947 0.264 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -736154 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0354 0.0958 0.264 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0959 0.105 0.264 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -715444 sc-eQTL 7.20e-02 -0.17 0.094 0.264 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 6.94e-01 0.0379 0.0963 0.264 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 5.97e-01 0.0222 0.0419 0.264 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 3.37e-01 0.0988 0.103 0.264 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 4.76e-01 0.0727 0.102 0.264 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 3.89e-01 0.0778 0.09 0.258 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 1.56e-02 0.165 0.0677 0.258 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -736154 sc-eQTL 5.71e-01 0.0551 0.0969 0.258 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 3.70e-01 0.088 0.0981 0.258 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -715444 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0132 0.0963 0.258 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 7.74e-01 0.0266 0.0926 0.258 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0464 0.0463 0.258 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 2.62e-01 -0.107 0.095 0.258 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0723 0.0819 0.258 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 9.75e-01 0.00355 0.112 0.24 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 6.36e-01 0.0384 0.0809 0.24 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -736154 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00377 0.0815 0.24 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 9.35e-02 0.19 0.113 0.24 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -715444 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0468 0.0828 0.24 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 1.48e-01 -0.142 0.0981 0.24 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00324 0.068 0.24 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 4.19e-02 0.188 0.0915 0.24 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0941 0.1 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 6.47e-01 0.0399 0.0871 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -402864 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0165 0.0988 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 2.70e-01 0.0617 0.0558 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 3.23e-01 0.0847 0.0855 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0706 0.0884 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 1.56e-01 0.0715 0.0502 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0968 0.0868 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 5.61e-01 0.0539 0.0925 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -133277 sc-eQTL 2.46e-04 -0.323 0.0865 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 1.84e-01 0.0963 0.0723 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -402864 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0276 0.104 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 1.03e-01 0.0696 0.0425 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 8.42e-01 -0.016 0.0803 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 4.72e-02 0.164 0.0823 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 2.19e-01 0.0617 0.0501 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 2.07e-01 -0.128 0.101 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 7.90e-01 0.0253 0.0948 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -133277 sc-eQTL 1.27e-03 -0.192 0.0588 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 5.69e-02 -0.162 0.0844 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0111 0.0524 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -736154 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0351 0.0853 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 4.57e-01 0.061 0.0819 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -715444 sc-eQTL 1.85e-01 -0.118 0.0887 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 6.60e-01 0.0259 0.0588 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 3.70e-02 0.0839 0.04 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 8.29e-01 0.0175 0.0805 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0912 0.0716 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0142 0.0927 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 5.77e-03 0.18 0.0646 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -736154 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0784 0.0966 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 7.36e-01 0.0319 0.0942 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -715444 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0628 0.0958 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 8.92e-01 0.0123 0.0904 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0158 0.0383 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 9.50e-01 0.00602 0.0967 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -814728 sc-eQTL 7.63e-01 0.0281 0.0931 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -514587 sc-eQTL 1.45e-01 0.108 0.0738 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 370369 sc-eQTL 9.26e-01 0.00668 0.072 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -764848 sc-eQTL 2.90e-01 0.0993 0.0936 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -815958 sc-eQTL 8.03e-01 0.00958 0.0383 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 863144 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0602 0.0793 0.259 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079819 EPB41L2 935289 eQTL 0.00602 -0.0613 0.0223 0.00133 0.0 0.273
ENSG00000118523 CCN2 47239 pQTL 1.77e-19 -0.201 0.0219 0.0 0.0 0.274

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000228495 \N -133304 4.65e-06 9.5e-06 8.35e-07 3.5e-06 1.66e-06 1.62e-06 5.64e-06 1.11e-06 4.53e-06 2.5e-06 7.7e-06 3.23e-06 9.33e-06 3.14e-06 1.23e-06 3.81e-06 2.2e-06 4e-06 1.53e-06 1.39e-06 2.98e-06 4.96e-06 4.64e-06 1.6e-06 9e-06 1.65e-06 2.33e-06 1.53e-06 4.46e-06 4.4e-06 3.28e-06 5.08e-07 8.13e-07 1.87e-06 1.97e-06 8.88e-07 9.38e-07 3.91e-07 8.94e-07 4.07e-07 1.52e-07 7.98e-06 4.02e-07 1.46e-07 4.29e-07 6.03e-07 6.64e-07 2.07e-07 1.58e-07