Genes within 1Mb (chr6:131995148:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 8.29e-01 0.0148 0.0686 0.261 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -406327 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0539 0.1 0.261 B L1
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 1.28e-01 0.0573 0.0375 0.261 B L1
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0264 0.0752 0.261 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 5.53e-01 0.0421 0.0709 0.261 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0189 0.0429 0.261 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 1.24e-01 -0.137 0.0886 0.261 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00315 0.0903 0.261 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -136740 sc-eQTL 7.45e-05 -0.231 0.0571 0.261 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0242 0.0893 0.261 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 5.11e-01 0.048 0.0728 0.261 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 9.93e-01 0.000497 0.0578 0.261 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 7.04e-01 -0.024 0.0631 0.261 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 8.28e-01 0.00934 0.0429 0.261 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 5.34e-02 -0.149 0.0769 0.261 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 7.06e-01 0.0327 0.0868 0.261 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 4.27e-02 0.144 0.0708 0.261 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 6.14e-01 0.0355 0.0704 0.261 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0109 0.0835 0.261 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0188 0.0285 0.261 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 3.47e-02 -0.169 0.0794 0.261 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0437 0.0862 0.261 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 2.04e-01 0.0937 0.0735 0.259 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0391 0.0651 0.259 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -739617 sc-eQTL 7.10e-01 0.03 0.0808 0.259 DC L1
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 3.98e-02 0.194 0.0938 0.259 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -718907 sc-eQTL 1.29e-01 -0.132 0.0867 0.259 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 2.57e-01 -0.106 0.093 0.259 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0655 0.0521 0.259 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 1.99e-01 0.12 0.0929 0.259 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0617 0.0827 0.259 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0772 0.082 0.261 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 5.08e-01 0.0325 0.0489 0.261 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -739617 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0515 0.084 0.261 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 3.85e-01 0.0695 0.0797 0.261 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -718907 sc-eQTL 2.08e-01 -0.114 0.0901 0.261 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 4.55e-01 0.0478 0.0638 0.261 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 8.63e-02 0.0655 0.038 0.261 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 6.98e-01 0.0308 0.0793 0.261 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 3.41e-01 -0.072 0.0755 0.261 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 1.23e-01 0.113 0.0733 0.26 NK L1
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 8.15e-01 0.0157 0.0674 0.26 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 2.23e-01 0.112 0.0914 0.26 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 6.45e-01 0.0175 0.0379 0.26 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0641 0.0805 0.26 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 2.19e-01 0.101 0.0817 0.261 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 2.32e-01 0.0887 0.074 0.261 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 6.42e-01 0.0432 0.0926 0.261 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 1.76e-02 -0.212 0.0886 0.261 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0417 0.0355 0.261 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 5.97e-01 0.0429 0.0809 0.261 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 5.63e-01 0.0565 0.0974 0.261 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0826 0.0898 0.265 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -406327 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0138 0.102 0.265 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 7.04e-01 0.0365 0.0957 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 9.17e-01 0.0111 0.106 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0111 0.102 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0375 0.0545 0.265 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 1.94e-01 -0.137 0.105 0.265 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0604 0.0955 0.265 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -136740 sc-eQTL 7.60e-02 -0.161 0.0904 0.265 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 6.49e-01 0.0434 0.0952 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -406327 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0987 0.0919 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 3.77e-01 0.0533 0.0602 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 1.01e-01 0.15 0.0912 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0214 0.0908 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 1.32e-01 0.0836 0.0553 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0641 0.0932 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0591 0.1 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -136740 sc-eQTL 3.78e-03 -0.245 0.0835 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 4.25e-01 0.0723 0.0905 0.261 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -406327 sc-eQTL 2.40e-01 -0.11 0.0936 0.261 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 1.62e-01 0.103 0.0734 0.261 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 2.63e-01 -0.106 0.0947 0.261 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0644 0.0963 0.261 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 5.13e-01 0.0304 0.0464 0.261 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 2.78e-01 -0.107 0.0986 0.261 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 2.13e-02 0.222 0.0957 0.261 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -136740 sc-eQTL 8.88e-02 -0.153 0.0897 0.261 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 1.34e-01 0.115 0.0761 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -406327 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0224 0.104 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 1.79e-01 0.0611 0.0453 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0103 0.0814 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 3.07e-01 0.0901 0.0881 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 3.51e-01 0.0469 0.0502 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 2.26e-01 -0.123 0.102 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00216 0.097 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -136740 sc-eQTL 5.14e-03 -0.178 0.0631 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 5.75e-01 0.049 0.0874 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -406327 sc-eQTL 7.28e-01 0.0345 0.0991 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 6.66e-01 0.0234 0.054 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0231 0.0997 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 3.72e-02 0.206 0.0981 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 5.12e-01 0.0344 0.0524 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0169 0.105 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 6.34e-01 0.0478 0.1 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -136740 sc-eQTL 1.88e-02 -0.162 0.0685 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0295 0.0796 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 3.89e-01 0.0846 0.098 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 3.23e-01 -0.101 0.102 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 9.19e-01 0.01 0.0991 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 9.74e-02 -0.0757 0.0455 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 2.00e-01 0.126 0.0975 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 5.90e-01 0.0498 0.0922 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 8.23e-01 0.0206 0.0924 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 2.59e-01 0.0885 0.0782 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 5.41e-01 0.041 0.0669 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00673 0.0727 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 4.13e-01 0.0386 0.0471 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 2.95e-03 -0.258 0.0858 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0306 0.0907 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 5.96e-01 0.0501 0.0946 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 8.62e-02 0.148 0.0858 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0619 0.0726 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0504 0.0851 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00313 0.0442 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 7.58e-01 -0.026 0.0843 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 7.83e-01 0.0282 0.102 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 2.71e-01 -0.111 0.1 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 2.82e-01 0.108 0.1 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 1.45e-01 -0.135 0.0923 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 6.38e-01 0.0455 0.0966 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 6.08e-01 0.0203 0.0396 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0661 0.102 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 5.23e-01 0.063 0.0985 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 9.67e-01 0.00345 0.0829 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 9.73e-02 0.141 0.0844 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0309 0.0942 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 8.01e-01 0.0127 0.0504 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0354 0.095 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 2.79e-01 0.106 0.0975 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 5.76e-04 0.341 0.0974 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0221 0.0806 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 9.16e-01 0.00908 0.0865 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 5.21e-01 0.0318 0.0495 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 1.31e-01 -0.137 0.0905 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 2.75e-01 -0.108 0.099 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 4.99e-01 0.0668 0.0987 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 9.12e-01 -0.011 0.0991 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 6.07e-01 0.0505 0.098 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0231 0.0478 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0589 0.106 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0118 0.105 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 8.61e-01 0.0184 0.105 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 7.60e-01 0.031 0.101 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0845 0.104 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 5.85e-02 0.106 0.0558 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 2.20e-01 -0.126 0.103 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0588 0.106 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 6.61e-01 0.0401 0.0912 0.26 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 3.81e-01 0.0834 0.0949 0.26 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 4.92e-01 0.0684 0.0993 0.26 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 2.99e-01 -0.1 0.0964 0.26 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0465 0.0474 0.26 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 4.61e-01 0.0725 0.0981 0.26 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 6.91e-01 0.0396 0.0996 0.26 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 4.39e-01 0.0749 0.0964 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 2.95e-01 0.107 0.102 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 8.44e-01 0.0193 0.0981 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 2.14e-01 0.0679 0.0544 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0432 0.099 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 1.94e-01 0.102 0.0781 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0384 0.0806 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0408 0.0981 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 8.58e-01 0.00696 0.0389 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 2.06e-01 -0.108 0.0853 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 3.64e-01 0.0873 0.0959 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 8.06e-01 0.0238 0.0971 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 6.85e-01 0.0395 0.0972 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 8.82e-01 0.00675 0.0453 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 3.07e-01 -0.103 0.1 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 1.81e-01 0.114 0.085 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0101 0.0883 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 1.88e-02 0.224 0.0947 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 8.96e-01 0.00681 0.0521 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 8.08e-01 0.0217 0.0891 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0119 0.129 0.267 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -406327 sc-eQTL 1.51e-01 -0.153 0.106 0.267 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00856 0.0891 0.267 PB L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 2.42e-02 -0.271 0.118 0.267 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 2.03e-01 0.138 0.108 0.267 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 6.04e-01 0.0322 0.0618 0.267 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 3.46e-01 0.111 0.118 0.267 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0364 0.116 0.267 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -136740 sc-eQTL 5.88e-01 0.0414 0.0761 0.267 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 5.01e-01 0.0585 0.0868 0.263 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 5.06e-01 0.0598 0.0898 0.263 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 1.71e-01 0.138 0.101 0.263 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0453 0.0963 0.263 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00124 0.0365 0.263 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 8.04e-01 0.0215 0.0867 0.263 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0654 0.0942 0.263 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 3.24e-01 -0.095 0.0962 0.261 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 2.41e-01 -0.113 0.0962 0.261 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 8.61e-01 0.0174 0.0992 0.261 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0147 0.0812 0.261 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00137 0.0359 0.261 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 7.41e-01 0.0283 0.0855 0.261 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 2.41e-01 0.119 0.101 0.261 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 2.60e-01 0.0956 0.0846 0.259 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 1.35e-01 -0.126 0.084 0.259 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -739617 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0365 0.0839 0.259 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 8.89e-01 0.0152 0.109 0.259 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -718907 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0739 0.0985 0.259 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00227 0.0961 0.259 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0131 0.0475 0.259 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 3.42e-01 0.101 0.106 0.259 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 4.31e-01 0.074 0.0939 0.259 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 6.78e-02 -0.163 0.0886 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00687 0.0628 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -739617 sc-eQTL 9.70e-01 0.00332 0.0888 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 5.23e-01 0.0561 0.0877 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -718907 sc-eQTL 1.48e-01 -0.129 0.0891 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 5.30e-01 0.045 0.0715 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 6.02e-02 0.0745 0.0394 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0333 0.0854 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 3.84e-02 -0.158 0.0759 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0471 0.093 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 9.62e-01 0.00327 0.0682 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -739617 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0677 0.085 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 6.35e-01 0.044 0.0924 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -718907 sc-eQTL 6.35e-02 -0.171 0.0917 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0056 0.0606 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 2.92e-01 0.046 0.0435 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 6.43e-01 0.042 0.0904 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 6.85e-01 0.0328 0.0807 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0306 0.112 0.245 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 6.64e-01 0.051 0.117 0.245 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 9.19e-01 0.0129 0.126 0.245 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 8.17e-02 -0.225 0.128 0.245 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 5.31e-01 0.0309 0.0493 0.245 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 8.65e-01 0.0223 0.131 0.245 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 3.88e-01 0.11 0.127 0.245 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 3.52e-01 -0.091 0.0976 0.264 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 3.27e-01 0.0931 0.0947 0.264 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -739617 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0354 0.0958 0.264 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0959 0.105 0.264 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -718907 sc-eQTL 7.20e-02 -0.17 0.094 0.264 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 6.94e-01 0.0379 0.0963 0.264 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 5.97e-01 0.0222 0.0419 0.264 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 3.37e-01 0.0988 0.103 0.264 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 4.76e-01 0.0727 0.102 0.264 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 3.89e-01 0.0778 0.09 0.258 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 1.56e-02 0.165 0.0677 0.258 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -739617 sc-eQTL 5.71e-01 0.0551 0.0969 0.258 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 3.70e-01 0.088 0.0981 0.258 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -718907 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0132 0.0963 0.258 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 7.74e-01 0.0266 0.0926 0.258 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0464 0.0463 0.258 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 2.62e-01 -0.107 0.095 0.258 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0723 0.0819 0.258 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 9.75e-01 0.00355 0.112 0.24 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 6.36e-01 0.0384 0.0809 0.24 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -739617 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00377 0.0815 0.24 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 9.35e-02 0.19 0.113 0.24 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -718907 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0468 0.0828 0.24 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 1.48e-01 -0.142 0.0981 0.24 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00324 0.068 0.24 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 4.19e-02 0.188 0.0915 0.24 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0941 0.1 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 6.47e-01 0.0399 0.0871 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -406327 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0165 0.0988 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 2.70e-01 0.0617 0.0558 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 3.23e-01 0.0847 0.0855 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0706 0.0884 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 1.56e-01 0.0715 0.0502 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0968 0.0868 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 5.61e-01 0.0539 0.0925 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -136740 sc-eQTL 2.46e-04 -0.323 0.0865 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 1.84e-01 0.0963 0.0723 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -406327 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0276 0.104 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 1.03e-01 0.0696 0.0425 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 8.42e-01 -0.016 0.0803 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 4.72e-02 0.164 0.0823 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 2.19e-01 0.0617 0.0501 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 2.07e-01 -0.128 0.101 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 7.90e-01 0.0253 0.0948 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -136740 sc-eQTL 1.27e-03 -0.192 0.0588 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 5.69e-02 -0.162 0.0844 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0111 0.0524 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -739617 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0351 0.0853 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 4.57e-01 0.061 0.0819 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -718907 sc-eQTL 1.85e-01 -0.118 0.0887 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 6.60e-01 0.0259 0.0588 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 3.70e-02 0.0839 0.04 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 8.29e-01 0.0175 0.0805 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0912 0.0716 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0142 0.0927 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 5.77e-03 0.18 0.0646 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -739617 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0784 0.0966 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 7.36e-01 0.0319 0.0942 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -718907 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0628 0.0958 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 8.92e-01 0.0123 0.0904 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0158 0.0383 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 9.50e-01 0.00602 0.0967 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -818191 sc-eQTL 7.63e-01 0.0281 0.0931 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -518050 sc-eQTL 1.45e-01 0.108 0.0738 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 366906 sc-eQTL 9.26e-01 0.00668 0.072 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -768311 sc-eQTL 2.90e-01 0.0993 0.0936 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -819421 sc-eQTL 8.03e-01 0.00958 0.0383 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 859681 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0602 0.0793 0.259 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079819 EPB41L2 931826 eQTL 0.00598 -0.0616 0.0224 0.00139 0.0 0.274
ENSG00000118523 CCN2 43776 pQTL 8.94e-20 -0.203 0.022 0.0 0.0 0.274


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina