Genes within 1Mb (chr6:131968284:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 1.23e-01 0.113 0.0728 0.233 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -433191 sc-eQTL 4.55e-01 0.0799 0.107 0.233 B L1
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0605 0.0401 0.233 B L1
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 2.03e-01 0.102 0.0801 0.233 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 1.26e-01 0.116 0.0754 0.233 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 1.92e-01 0.0597 0.0456 0.233 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 2.47e-01 0.11 0.0948 0.233 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 6.12e-01 0.0489 0.0964 0.233 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -163604 sc-eQTL 1.46e-03 0.199 0.0618 0.233 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0636 0.0979 0.233 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0159 0.08 0.233 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 2.07e-01 0.0801 0.0632 0.233 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0243 0.0693 0.233 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 3.73e-01 -0.042 0.047 0.233 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 4.99e-01 0.0576 0.0851 0.233 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 1.46e-01 -0.138 0.0948 0.233 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0207 0.0773 0.233 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 7.86e-01 0.0207 0.0761 0.233 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0637 0.0901 0.233 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0292 0.0308 0.233 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 4.54e-01 0.065 0.0866 0.233 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 1.69e-01 -0.128 0.0928 0.233 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 8.22e-02 -0.141 0.0806 0.225 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0913 0.0714 0.225 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -766481 sc-eQTL 1.00e+00 -2.31e-06 0.0889 0.225 DC L1
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0664 0.104 0.225 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -745771 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0746 0.0958 0.225 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0339 0.103 0.225 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 2.89e-01 0.061 0.0574 0.225 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0366 0.103 0.225 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 7.11e-02 0.164 0.0904 0.225 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 8.14e-02 -0.152 0.0868 0.233 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0382 0.052 0.233 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -766481 sc-eQTL 3.11e-01 0.0907 0.0892 0.233 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0216 0.085 0.233 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -745771 sc-eQTL 4.27e-01 0.0765 0.0961 0.233 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 6.18e-01 0.0339 0.0679 0.233 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0147 0.0407 0.233 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 8.93e-01 0.0114 0.0843 0.233 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 4.43e-01 0.0618 0.0804 0.233 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00283 0.0818 0.232 NK L1
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 3.56e-01 -0.069 0.0747 0.232 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 5.55e-01 0.0601 0.102 0.232 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0133 0.0421 0.232 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0815 0.0894 0.232 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0125 0.0882 0.233 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 1.52e-01 -0.114 0.0795 0.233 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 8.13e-01 0.0236 0.0997 0.233 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00285 0.0966 0.233 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 1.82e-01 -0.051 0.0381 0.233 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00549 0.0871 0.233 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0638 0.105 0.233 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0836 0.0981 0.227 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -433191 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0608 0.112 0.227 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0162 0.105 0.227 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 5.44e-01 0.0704 0.116 0.227 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0494 0.111 0.227 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 8.06e-01 0.0147 0.0597 0.227 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0276 0.116 0.227 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 5.00e-01 0.0705 0.104 0.227 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -163604 sc-eQTL 4.14e-01 0.0815 0.0995 0.227 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 2.23e-01 0.125 0.102 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -433191 sc-eQTL 3.04e-01 -0.102 0.0988 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 9.81e-01 0.00154 0.0648 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 3.73e-01 0.0878 0.0984 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 8.14e-02 0.17 0.0969 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 7.47e-01 0.0193 0.0597 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 6.75e-01 0.0421 0.1 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 6.21e-01 0.0533 0.108 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -163604 sc-eQTL 3.90e-01 0.0786 0.0913 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 4.34e-02 0.193 0.0952 0.233 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -433191 sc-eQTL 5.72e-01 0.0564 0.0996 0.233 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0828 0.078 0.233 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 5.78e-01 0.056 0.101 0.233 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 1.64e-02 0.244 0.101 0.233 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 4.93e-01 0.0338 0.0492 0.233 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00314 0.105 0.233 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 9.09e-02 -0.173 0.102 0.233 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -163604 sc-eQTL 3.59e-01 0.088 0.0956 0.233 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0617 0.0821 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -433191 sc-eQTL 1.60e-01 0.157 0.111 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 3.16e-02 -0.105 0.0483 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 6.80e-01 0.0361 0.0875 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 3.30e-01 0.0924 0.0947 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 5.09e-01 0.0357 0.054 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 9.64e-01 0.00501 0.11 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 4.37e-01 0.081 0.104 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -163604 sc-eQTL 1.56e-02 0.166 0.0681 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 2.75e-01 0.102 0.0935 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -433191 sc-eQTL 2.99e-01 0.11 0.106 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0305 0.0579 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 2.07e-01 0.135 0.107 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0845 0.106 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 5.42e-01 0.0343 0.0562 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 4.97e-01 0.0763 0.112 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 2.08e-01 0.135 0.107 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -163604 sc-eQTL 1.98e-02 0.173 0.0735 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 4.34e-01 0.068 0.0868 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 5.06e-01 0.0713 0.107 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 2.00e-02 0.258 0.11 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0236 0.108 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 6.32e-01 0.0239 0.0499 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0261 0.107 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 1.24e-01 -0.155 0.1 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0263 0.102 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0982 0.086 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 6.51e-01 0.0334 0.0736 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 8.94e-01 0.0107 0.0799 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0206 0.0518 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 2.68e-01 0.107 0.096 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 2.39e-01 -0.117 0.0994 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0818 0.103 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 6.86e-01 0.0382 0.0944 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 3.51e-01 0.0742 0.0793 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0655 0.093 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00102 0.0483 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 2.40e-01 -0.108 0.0919 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 7.48e-01 -0.036 0.112 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 1.29e-01 -0.159 0.105 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 6.91e-01 0.0419 0.105 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 9.12e-01 0.0107 0.097 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 6.71e-01 -0.043 0.101 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 4.71e-02 -0.082 0.0411 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 1.26e-01 0.163 0.106 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 1.54e-01 -0.147 0.103 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 8.35e-01 0.0183 0.0879 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 9.53e-02 0.15 0.0895 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 8.33e-01 -0.021 0.0998 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 1.88e-02 -0.125 0.0527 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0532 0.101 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 1.98e-01 -0.133 0.103 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0519 0.108 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0185 0.0868 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0355 0.0931 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0019 0.0533 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 4.67e-02 0.194 0.0971 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0187 0.107 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0826 0.108 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 3.41e-01 0.103 0.108 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 2.61e-01 0.121 0.107 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0416 0.0522 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0106 0.117 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 9.71e-01 0.00422 0.115 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0469 0.112 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0272 0.108 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 5.85e-01 0.0611 0.112 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 7.15e-01 -0.022 0.0601 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00697 0.11 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0923 0.114 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0106 0.0985 0.232 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 3.22e-01 -0.102 0.102 0.232 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 2.80e-01 -0.116 0.107 0.232 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0642 0.104 0.232 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 4.03e-01 -0.043 0.0512 0.232 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 6.13e-01 0.0537 0.106 0.232 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0617 0.107 0.232 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0376 0.107 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 4.64e-01 0.0833 0.113 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0259 0.109 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 8.01e-02 -0.106 0.0603 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 3.65e-01 0.0999 0.11 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 3.17e-01 -0.088 0.0877 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0538 0.0903 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 2.64e-01 0.123 0.11 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0112 0.0436 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 2.75e-01 -0.105 0.0957 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 9.18e-01 -0.011 0.107 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0564 0.108 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 6.64e-01 -0.047 0.108 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0616 0.0501 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 7.08e-01 0.0419 0.112 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 6.80e-01 0.0388 0.0938 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0767 0.0969 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 4.36e-01 0.0823 0.105 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0316 0.0572 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0718 0.0978 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0271 0.129 0.248 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -433191 sc-eQTL 1.81e-01 -0.143 0.106 0.248 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 5.24e-02 -0.172 0.0879 0.248 PB L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 3.69e-01 0.109 0.121 0.248 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 1.21e-01 -0.169 0.108 0.248 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 3.37e-01 0.0596 0.0617 0.248 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 1.85e-01 0.157 0.117 0.248 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0627 0.116 0.248 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -163604 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0952 0.0759 0.248 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0049 0.0946 0.226 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 2.49e-01 -0.113 0.0975 0.226 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 8.88e-01 0.0155 0.11 0.226 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0401 0.105 0.226 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0148 0.0397 0.226 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0598 0.0943 0.226 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 5.03e-01 0.0689 0.103 0.226 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00403 0.104 0.233 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 3.25e-01 0.103 0.104 0.233 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 3.58e-01 0.0984 0.107 0.233 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 2.28e-01 -0.106 0.0873 0.233 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00358 0.0388 0.233 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00332 0.0923 0.233 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 2.92e-02 -0.238 0.108 0.233 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 5.36e-02 -0.173 0.0889 0.229 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0397 0.0894 0.229 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -766481 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0443 0.0887 0.229 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 8.92e-01 0.0157 0.115 0.229 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -745771 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0534 0.104 0.229 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0725 0.102 0.229 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 8.46e-01 -0.00977 0.0502 0.229 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 3.20e-01 0.111 0.112 0.229 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 3.55e-01 0.0919 0.0992 0.229 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 1.12e-01 -0.151 0.0947 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0141 0.067 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -766481 sc-eQTL 6.05e-01 0.049 0.0946 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 2.75e-01 -0.102 0.0933 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -745771 sc-eQTL 3.10e-01 0.0969 0.0953 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0614 0.0763 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 9.11e-01 0.00476 0.0424 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 8.65e-01 0.0155 0.0911 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 6.56e-02 0.15 0.0812 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0963 0.0987 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 2.24e-01 0.0881 0.0722 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -766481 sc-eQTL 5.27e-01 0.0573 0.0904 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 5.22e-01 0.063 0.0981 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -745771 sc-eQTL 5.24e-01 0.0626 0.0981 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 5.09e-01 0.0425 0.0643 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 4.33e-01 0.0363 0.0463 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0107 0.0961 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0822 0.0856 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 4.14e-01 0.0941 0.115 0.227 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 1.62e-01 -0.168 0.12 0.227 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 1.71e-01 0.177 0.128 0.227 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 7.89e-01 0.0357 0.133 0.227 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 1.72e-02 -0.12 0.0497 0.227 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 4.37e-01 -0.105 0.135 0.227 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 2.13e-02 -0.3 0.129 0.227 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0809 0.102 0.229 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 2.71e-01 -0.109 0.0989 0.229 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -766481 sc-eQTL 1.62e-01 0.14 0.0997 0.229 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 1.36e-01 0.164 0.109 0.229 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -745771 sc-eQTL 2.91e-01 -0.105 0.0988 0.229 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 8.24e-01 0.0224 0.101 0.229 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 2.57e-01 0.0497 0.0437 0.229 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 7.47e-01 0.0347 0.107 0.229 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 3.21e-01 -0.106 0.106 0.229 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 1.56e-01 -0.14 0.098 0.224 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 1.25e-01 -0.115 0.0746 0.224 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -766481 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0544 0.106 0.224 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0971 0.107 0.224 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -745771 sc-eQTL 8.29e-01 0.0228 0.105 0.224 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 5.65e-01 0.0583 0.101 0.224 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 2.37e-01 0.0599 0.0505 0.224 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0492 0.104 0.224 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 2.04e-01 0.114 0.0892 0.224 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00333 0.119 0.232 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 1.60e-01 -0.121 0.0853 0.232 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -766481 sc-eQTL 6.57e-01 0.0384 0.0864 0.232 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0677 0.12 0.232 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -745771 sc-eQTL 8.37e-01 0.0181 0.0879 0.232 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 5.80e-01 -0.058 0.105 0.232 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 1.30e-02 0.178 0.0707 0.232 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 2.36e-01 -0.116 0.0979 0.232 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 4.70e-02 0.211 0.105 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 3.25e-01 0.0923 0.0936 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -433191 sc-eQTL 3.27e-01 -0.104 0.106 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0387 0.0602 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 6.20e-01 0.0457 0.0921 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 1.24e-01 0.146 0.0947 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 8.73e-01 0.00871 0.0543 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 4.20e-01 0.0756 0.0935 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0677 0.0995 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -163604 sc-eQTL 3.90e-01 0.0827 0.0959 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 7.14e-01 0.0285 0.0778 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -433191 sc-eQTL 1.02e-01 0.182 0.111 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0624 0.0456 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 2.08e-01 0.108 0.0857 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 7.91e-01 0.0236 0.089 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 4.87e-01 0.0375 0.0538 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 6.61e-01 0.0476 0.108 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 3.28e-01 0.0994 0.101 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -163604 sc-eQTL 6.12e-04 0.218 0.0628 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 9.22e-02 -0.152 0.0901 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 8.01e-01 0.0141 0.0558 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -766481 sc-eQTL 3.31e-01 0.0883 0.0907 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0256 0.0873 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -745771 sc-eQTL 4.19e-01 0.0766 0.0946 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00154 0.0627 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 6.97e-01 0.0168 0.043 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 9.89e-01 0.00124 0.0857 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 5.22e-01 0.049 0.0764 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 sc-eQTL 1.44e-01 -0.143 0.0974 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 4.63e-02 -0.138 0.0688 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -766481 sc-eQTL 3.03e-01 0.105 0.102 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000379 0.0995 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -745771 sc-eQTL 8.50e-01 0.0191 0.101 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 3.87e-01 0.0826 0.0953 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 1.96e-01 0.0523 0.0404 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 7.38e-01 0.0341 0.102 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -845055 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0289 0.0983 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -544914 sc-eQTL 8.97e-01 0.0107 0.0825 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 340042 sc-eQTL 1.80e-01 -0.107 0.0798 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -795175 sc-eQTL 3.29e-01 0.102 0.104 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -846285 sc-eQTL 8.23e-01 -0.00955 0.0426 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 832817 sc-eQTL 1.96e-01 -0.114 0.088 0.233 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 eQTL 0.0039 0.0662 0.0229 0.0 0.0 0.256
ENSG00000118523 CCN2 16912 pQTL 2.73e-21 0.217 0.0225 0.0 0.00338 0.253


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079819 EPB41L2 904962 2.91e-07 1.5e-07 3.72e-08 2.15e-07 9.24e-08 9.05e-08 1.61e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.63e-07 9e-08 1.69e-07 7.13e-08 6.12e-08 7.5e-08 4.09e-08 1.4e-07 5.75e-08 4.3e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.44e-07 2.64e-08 1.55e-07 1.14e-07 1.12e-07 1.01e-07 1.12e-07 1.07e-07 1.02e-07 2.99e-08 3.96e-08 8.56e-08 3.52e-08 3.04e-08 5.35e-08 9.22e-08 6.86e-08 4.41e-08 4.36e-08 1.46e-07 5.24e-08 1.08e-08 3.4e-08 1.55e-08 1.22e-07 1.91e-09 5e-08
ENSG00000118520 \N 395140 1.26e-06 9.03e-07 8.55e-08 3.6e-07 1.07e-07 3.41e-07 5.9e-07 1.76e-07 5.49e-07 2.8e-07 1.09e-06 4.24e-07 1.35e-06 1.57e-07 3.16e-07 3.79e-07 4.87e-07 4.4e-07 2.13e-07 2.27e-07 2.01e-07 5.11e-07 4.66e-07 1.91e-07 1.36e-06 2.49e-07 5.43e-07 3.62e-07 4.13e-07 5.99e-07 3.81e-07 5.71e-08 4.62e-08 2.08e-07 3.24e-07 1.58e-07 2.46e-07 6.89e-08 7.72e-08 9.55e-09 5.23e-08 9.5e-07 7.37e-08 1.93e-08 1.49e-07 6.12e-08 9.95e-08 4.47e-08 6.14e-08