logo

Genes within 1Mb (chr6:131960402:ACAC:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 6.70e-02 0.136 0.0736 0.231 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -441073 sc-eQTL 4.06e-01 0.0899 0.108 0.231 B L1
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0521 0.0407 0.231 B L1
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 1.44e-01 0.119 0.081 0.231 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 1.34e-01 0.115 0.0764 0.231 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 1.29e-01 0.0704 0.0462 0.231 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 2.82e-01 0.104 0.0961 0.231 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 7.98e-01 0.0251 0.0977 0.231 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -171486 sc-eQTL 1.04e-03 0.208 0.0625 0.231 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0811 0.0994 0.231 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 8.88e-01 0.0114 0.0813 0.231 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 2.28e-01 0.0777 0.0643 0.231 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0196 0.0704 0.231 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0415 0.0478 0.231 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 6.50e-01 0.0393 0.0865 0.231 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 1.33e-01 -0.145 0.0963 0.231 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 6.95e-01 0.0307 0.0782 0.231 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 5.99e-01 0.0406 0.077 0.231 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 6.62e-01 -0.04 0.0913 0.231 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0255 0.0312 0.231 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 5.79e-01 0.0488 0.0877 0.231 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 1.37e-01 -0.14 0.0939 0.231 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 6.37e-02 -0.152 0.0815 0.223 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0845 0.0723 0.223 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -774363 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0148 0.09 0.223 DC L1
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0591 0.106 0.223 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -753653 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0572 0.0971 0.223 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 9.85e-01 0.00194 0.104 0.223 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 3.76e-01 0.0516 0.0582 0.223 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0407 0.104 0.223 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 1.17e-01 0.144 0.0917 0.223 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 1.04e-01 -0.144 0.0881 0.231 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0229 0.0528 0.231 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -774363 sc-eQTL 3.45e-01 0.0856 0.0904 0.231 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0199 0.0861 0.231 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -753653 sc-eQTL 3.61e-01 0.0891 0.0973 0.231 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 3.86e-01 0.0597 0.0687 0.231 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0162 0.0412 0.231 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 8.83e-01 0.0126 0.0855 0.231 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 3.78e-01 0.072 0.0814 0.231 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 8.60e-01 0.0146 0.0827 0.23 NK L1
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0639 0.0755 0.23 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 3.85e-01 0.0895 0.103 0.23 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0104 0.0426 0.23 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0926 0.0903 0.23 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0173 0.0891 0.231 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0953 0.0804 0.231 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 6.05e-01 0.0521 0.101 0.231 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0378 0.0975 0.231 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0532 0.0385 0.231 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00952 0.088 0.231 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0759 0.106 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 2.18e-01 -0.123 0.0998 0.224 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -441073 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0669 0.114 0.224 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 9.39e-01 0.00816 0.107 0.224 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 4.89e-01 0.0819 0.118 0.224 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0489 0.114 0.224 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00726 0.0608 0.224 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0688 0.118 0.224 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 6.66e-01 0.0461 0.107 0.224 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -171486 sc-eQTL 2.43e-01 0.119 0.101 0.224 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 2.05e-01 0.131 0.103 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -441073 sc-eQTL 1.92e-01 -0.13 0.0997 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 8.23e-01 0.0146 0.0655 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 3.62e-01 0.0909 0.0995 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 8.11e-02 0.172 0.098 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 8.19e-01 0.0138 0.0604 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 5.42e-01 0.0618 0.101 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 5.91e-01 0.0586 0.109 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -171486 sc-eQTL 4.15e-01 0.0755 0.0924 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 3.22e-02 0.208 0.0965 0.231 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -441073 sc-eQTL 5.95e-01 0.0537 0.101 0.231 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0917 0.0791 0.231 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 4.87e-01 0.071 0.102 0.231 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 1.43e-02 0.253 0.102 0.231 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 3.83e-01 0.0436 0.0499 0.231 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00193 0.106 0.231 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 5.80e-02 -0.197 0.103 0.231 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -171486 sc-eQTL 2.68e-01 0.108 0.0969 0.231 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0485 0.0832 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -441073 sc-eQTL 1.77e-01 0.153 0.113 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 5.71e-02 -0.0938 0.049 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 5.74e-01 0.0499 0.0886 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 5.46e-01 0.0581 0.096 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 5.11e-01 0.036 0.0547 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0071 0.111 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 5.09e-01 0.0697 0.105 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -171486 sc-eQTL 2.89e-02 0.152 0.0691 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 1.82e-01 0.126 0.0944 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -441073 sc-eQTL 2.28e-01 0.129 0.107 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0206 0.0585 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 1.37e-01 0.161 0.108 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0756 0.107 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 4.79e-01 0.0404 0.0569 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 5.67e-01 0.0651 0.114 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 3.58e-01 0.0998 0.108 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -171486 sc-eQTL 1.32e-02 0.185 0.0742 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 5.02e-01 0.0592 0.0879 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 3.57e-01 0.0999 0.108 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 1.93e-02 0.263 0.111 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0345 0.109 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 6.98e-01 0.0196 0.0506 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0323 0.108 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 1.26e-01 -0.156 0.101 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0677 0.103 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0946 0.0874 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 7.71e-01 0.0218 0.0748 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 9.25e-01 0.00761 0.0812 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0276 0.0526 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 3.95e-01 0.0833 0.0976 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 2.44e-01 -0.118 0.101 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0721 0.105 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 4.00e-01 0.0808 0.0958 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 4.62e-01 0.0594 0.0806 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0552 0.0945 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 9.68e-01 0.00195 0.049 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 1.76e-01 -0.127 0.0933 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 7.12e-01 -0.042 0.114 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 1.87e-01 -0.141 0.106 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 6.28e-01 0.0518 0.107 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 8.03e-01 0.0246 0.0983 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0329 0.102 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 3.92e-02 -0.0863 0.0416 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 1.40e-01 0.159 0.107 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 1.36e-01 -0.155 0.104 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 5.36e-01 0.0549 0.0886 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 4.61e-02 0.181 0.09 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00215 0.101 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 2.01e-02 -0.125 0.0532 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0553 0.102 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 2.10e-01 -0.131 0.104 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0154 0.109 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 9.12e-01 0.00971 0.0874 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 7.90e-01 -0.025 0.0938 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0037 0.0537 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 7.00e-02 0.178 0.0979 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0396 0.108 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0609 0.108 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 3.82e-01 0.0947 0.108 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 3.82e-01 0.0938 0.107 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0472 0.0521 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 9.57e-01 0.00621 0.116 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0197 0.114 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 9.23e-01 -0.011 0.114 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0269 0.11 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 4.84e-01 0.0796 0.113 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0283 0.061 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0254 0.112 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0916 0.115 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0401 0.0997 0.229 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0567 0.104 0.229 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0932 0.108 0.229 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0621 0.106 0.229 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0469 0.0519 0.229 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 7.96e-01 0.0278 0.107 0.229 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0461 0.109 0.229 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 8.46e-01 -0.021 0.108 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 3.25e-01 0.113 0.114 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 9.54e-01 0.00637 0.11 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 1.03e-01 -0.0994 0.0608 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 3.56e-01 0.102 0.111 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0556 0.0889 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0589 0.0914 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 1.93e-01 0.145 0.111 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0105 0.0442 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 2.86e-01 -0.104 0.0969 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00918 0.108 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 7.27e-01 -0.038 0.109 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0164 0.109 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0689 0.0505 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 9.41e-01 0.00838 0.113 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 7.16e-01 0.0344 0.0945 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0811 0.0976 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 3.44e-01 0.101 0.106 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0355 0.0576 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0914 0.0985 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0251 0.132 0.244 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -441073 sc-eQTL 1.90e-01 -0.143 0.109 0.244 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 7.65e-02 -0.161 0.0901 0.244 PB L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 4.11e-01 0.102 0.124 0.244 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 1.29e-01 -0.169 0.11 0.244 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 3.60e-01 0.0581 0.0631 0.244 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 2.05e-01 0.153 0.12 0.244 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0653 0.119 0.244 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -171486 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0977 0.0775 0.244 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00296 0.0963 0.224 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 2.09e-01 -0.125 0.0992 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 8.27e-01 0.0245 0.112 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0412 0.107 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 6.93e-01 -0.016 0.0404 0.224 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0553 0.096 0.224 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 7.60e-01 0.0319 0.105 0.224 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 9.85e-01 0.002 0.105 0.231 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 2.46e-01 0.122 0.105 0.231 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 3.98e-01 0.0916 0.108 0.231 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 2.65e-01 -0.099 0.0885 0.231 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0106 0.0392 0.231 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0257 0.0934 0.231 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 3.12e-02 -0.238 0.11 0.231 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 4.48e-02 -0.182 0.0899 0.227 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0084 0.0905 0.227 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -774363 sc-eQTL 5.41e-01 -0.055 0.0898 0.227 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 9.49e-01 0.00751 0.117 0.227 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -753653 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0276 0.106 0.227 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0297 0.103 0.227 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0144 0.0508 0.227 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 3.59e-01 0.104 0.113 0.227 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 5.30e-01 0.0633 0.101 0.227 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 1.53e-01 -0.138 0.096 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00498 0.0678 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -774363 sc-eQTL 7.06e-01 0.0362 0.0958 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 2.76e-01 -0.103 0.0945 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -753653 sc-eQTL 3.04e-01 0.0994 0.0965 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0459 0.0773 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 8.86e-01 0.00616 0.0429 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 9.20e-01 0.00927 0.0923 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 2.96e-02 0.179 0.0819 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0916 0.1 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 1.50e-01 0.105 0.073 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -774363 sc-eQTL 5.55e-01 0.0541 0.0915 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 4.94e-01 0.068 0.0993 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -753653 sc-eQTL 4.89e-01 0.0688 0.0994 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 2.82e-01 0.0701 0.065 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 4.52e-01 0.0353 0.0469 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0137 0.0973 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 2.24e-01 -0.106 0.0865 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 5.34e-01 0.071 0.114 0.227 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 2.18e-01 -0.147 0.119 0.227 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 1.65e-01 0.178 0.127 0.227 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0152 0.132 0.227 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 1.19e-02 -0.125 0.0492 0.227 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0846 0.133 0.227 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 1.27e-02 -0.321 0.127 0.227 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0803 0.104 0.227 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 3.08e-01 -0.103 0.101 0.227 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -774363 sc-eQTL 2.60e-01 0.115 0.102 0.227 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 1.03e-01 0.182 0.111 0.227 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -753653 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0777 0.101 0.227 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 6.64e-01 0.0445 0.102 0.227 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 2.07e-01 0.0562 0.0444 0.227 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 7.69e-01 0.0321 0.109 0.227 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 3.23e-01 -0.107 0.108 0.227 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 1.67e-01 -0.137 0.0991 0.222 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0956 0.0756 0.222 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -774363 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0463 0.107 0.222 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 3.41e-01 -0.103 0.108 0.222 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -753653 sc-eQTL 9.10e-01 0.0121 0.106 0.222 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 5.30e-01 0.0643 0.102 0.222 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 2.28e-01 0.0617 0.0511 0.222 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0214 0.105 0.222 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 1.54e-01 0.129 0.0901 0.222 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0246 0.119 0.232 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 1.51e-01 -0.122 0.0848 0.232 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -774363 sc-eQTL 7.55e-01 0.0269 0.0859 0.232 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0547 0.12 0.232 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -753653 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00968 0.0875 0.232 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0605 0.104 0.232 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 2.72e-02 0.157 0.0706 0.232 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 2.16e-01 -0.121 0.0973 0.232 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 3.99e-02 0.217 0.105 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 3.09e-01 0.0968 0.0949 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -441073 sc-eQTL 2.72e-01 -0.118 0.108 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0262 0.0611 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 5.31e-01 0.0587 0.0934 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 9.99e-02 0.159 0.096 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 9.22e-01 0.0054 0.0551 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 4.41e-01 0.0733 0.0949 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0803 0.101 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -171486 sc-eQTL 2.98e-01 0.101 0.0972 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 5.51e-01 0.047 0.0786 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -441073 sc-eQTL 8.47e-02 0.194 0.112 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 2.19e-01 -0.057 0.0462 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 1.29e-01 0.132 0.0866 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 9.69e-01 0.0035 0.09 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 4.69e-01 0.0395 0.0544 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 7.93e-01 0.0288 0.11 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 5.11e-01 0.0676 0.103 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -171486 sc-eQTL 1.00e-03 0.212 0.0636 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 1.30e-01 -0.139 0.0913 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 6.11e-01 0.0288 0.0564 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -774363 sc-eQTL 3.68e-01 0.0829 0.0918 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0256 0.0884 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -753653 sc-eQTL 3.75e-01 0.0851 0.0958 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 7.28e-01 0.0221 0.0634 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 6.90e-01 0.0174 0.0435 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00134 0.0868 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 4.50e-01 0.0585 0.0773 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 sc-eQTL 1.37e-01 -0.147 0.0986 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 6.50e-02 -0.129 0.0698 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -774363 sc-eQTL 3.53e-01 0.0962 0.103 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00167 0.101 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -753653 sc-eQTL 8.05e-01 0.0253 0.103 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 3.57e-01 0.0892 0.0965 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 1.95e-01 0.0531 0.0409 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 6.71e-01 0.044 0.103 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -852937 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0184 0.0996 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -552796 sc-eQTL 7.32e-01 0.0287 0.0835 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 332160 sc-eQTL 1.76e-01 -0.11 0.0807 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -803057 sc-eQTL 2.23e-01 0.129 0.105 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -854167 sc-eQTL 8.52e-01 -0.00807 0.0431 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 824935 sc-eQTL 1.57e-01 -0.126 0.089 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 eQTL 0.00859 0.0605 0.023 0.0 0.0 0.252
ENSG00000112299 VNN1 -753653 eQTL 0.0439 -0.0476 0.0236 0.0 0.0 0.252
ENSG00000118523 CCN2 9030 pQTL 2.8100000000000003e-21 0.218 0.0226 0.0 0.00558 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079819 EPB41L2 897080 2.77e-07 1.34e-07 8.67e-08 1.79e-07 1.02e-07 9.61e-08 1.67e-07 5.29e-08 1.4e-07 4.23e-08 1.59e-07 7.6e-08 1.47e-07 6.21e-08 5.44e-08 7.26e-08 4.63e-08 1.27e-07 5.2e-08 3.15e-08 1.04e-07 1.28e-07 1.32e-07 5.19e-08 1.33e-07 1.13e-07 1.11e-07 8.71e-08 9.88e-08 1.11e-07 9.73e-08 3.29e-08 2.75e-08 8.26e-08 9.14e-08 4.19e-08 4.7e-08 8.28e-08 8.48e-08 3.87e-08 3.18e-08 2.72e-07 4.36e-08 0.0 1.15e-07 1.72e-08 1.45e-07 4.96e-09 4.72e-08
ENSG00000118520 \N 387258 1.31e-06 9.07e-07 6.39e-07 3.81e-07 1.02e-07 2.86e-07 8.7e-07 5.19e-08 5.02e-07 1.03e-07 9e-07 1.2e-07 1.1e-06 1.52e-07 3.15e-07 3.57e-07 7.77e-07 5.54e-07 9.97e-08 5.07e-08 2.3e-07 7.26e-07 4.4e-07 2.64e-08 1.46e-06 2.01e-07 3.1e-07 2.98e-07 2.4e-07 5.56e-07 3.1e-07 3.52e-08 3.68e-08 1.01e-07 2.61e-07 2.74e-08 5.03e-08 9.22e-08 6.54e-08 3e-08 4.18e-08 2.12e-06 3.99e-08 1.76e-08 7.79e-08 1.84e-08 1e-07 4.7e-09 4.85e-08