logo

Genes within 1Mb (chr6:131958003:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 5.71e-02 0.176 0.0922 0.124 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -443472 sc-eQTL 1.83e-01 -0.181 0.135 0.124 B L1
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 1.59e-01 0.0719 0.0509 0.124 B L1
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0279 0.102 0.124 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 8.02e-01 0.0241 0.0962 0.124 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 9.21e-02 -0.0978 0.0578 0.124 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 9.89e-01 0.00167 0.121 0.124 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 7.34e-01 0.0416 0.122 0.124 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -173885 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00294 0.0803 0.124 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 5.62e-01 0.0697 0.12 0.124 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 2.61e-02 0.217 0.0968 0.124 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 9.46e-01 0.00522 0.0777 0.124 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0314 0.0848 0.124 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0894 0.0573 0.124 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 1.64e-01 -0.145 0.104 0.124 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 1.44e-01 -0.17 0.116 0.124 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0142 0.0966 0.124 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 7.31e-01 0.0328 0.0951 0.124 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 3.13e-01 0.114 0.112 0.124 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 7.86e-01 0.0105 0.0385 0.124 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0959 0.108 0.124 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0827 0.116 0.124 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 8.47e-01 0.0202 0.104 0.122 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0145 0.0922 0.122 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -776762 sc-eQTL 1.36e-01 -0.17 0.114 0.122 DC L1
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 5.36e-01 -0.083 0.134 0.122 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -756052 sc-eQTL 4.96e-01 -0.084 0.123 0.122 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 8.75e-01 0.0207 0.132 0.122 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 9.97e-01 0.000234 0.074 0.122 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 3.27e-01 0.129 0.132 0.122 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 8.12e-01 0.0279 0.117 0.122 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 2.58e-01 -0.128 0.113 0.124 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 1.31e-01 0.101 0.067 0.124 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -776762 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0725 0.115 0.124 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0655 0.11 0.124 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -756052 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0449 0.124 0.124 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 2.15e-01 0.109 0.0874 0.124 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 1.80e-01 0.0704 0.0524 0.124 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0798 0.109 0.124 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 3.21e-01 0.103 0.104 0.124 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 3.18e-02 0.214 0.0992 0.124 NK L1
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 9.09e-01 0.0105 0.0917 0.124 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0812 0.125 0.124 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00626 0.0517 0.124 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 5.33e-01 0.0684 0.11 0.124 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 9.85e-01 0.00203 0.111 0.124 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 8.04e-01 0.0248 0.1 0.124 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0725 0.125 0.124 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 5.16e-02 -0.235 0.12 0.124 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0198 0.048 0.124 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 9.08e-01 0.0127 0.109 0.124 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 7.88e-01 0.0354 0.131 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 1.86e-01 -0.15 0.113 0.143 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -443472 sc-eQTL 4.74e-01 0.0922 0.128 0.143 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 2.43e-01 0.141 0.12 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 6.90e-02 0.242 0.132 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0705 0.128 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0574 0.0687 0.143 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0916 0.133 0.143 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0622 0.12 0.143 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -173885 sc-eQTL 2.94e-01 0.121 0.115 0.143 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 2.57e-01 0.146 0.129 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -443472 sc-eQTL 2.70e-01 -0.138 0.125 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 5.01e-01 0.0551 0.0816 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0331 0.124 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 1.57e-01 -0.174 0.122 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0791 0.0752 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0297 0.126 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 7.57e-01 0.042 0.136 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -173885 sc-eQTL 1.05e-01 -0.187 0.115 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 6.82e-01 0.0491 0.12 0.123 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -443472 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0368 0.124 0.123 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 7.97e-01 0.0251 0.0972 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 2.41e-01 -0.147 0.125 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0034 0.127 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0645 0.0611 0.123 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 2.89e-02 -0.284 0.129 0.123 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0274 0.128 0.123 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -173885 sc-eQTL 6.32e-01 0.0571 0.119 0.123 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 5.11e-03 0.287 0.101 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -443472 sc-eQTL 1.25e-01 -0.215 0.14 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 5.59e-03 0.169 0.0603 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000194 0.11 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 1.82e-01 0.159 0.119 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0976 0.0675 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 1.79e-01 0.185 0.137 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 1.99e-02 0.303 0.129 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -173885 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0259 0.0867 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 6.98e-02 0.213 0.117 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -443472 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0536 0.133 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 2.79e-01 0.0788 0.0725 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0923 0.134 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 4.55e-01 0.0998 0.133 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 1.98e-01 -0.091 0.0704 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 8.64e-01 0.0242 0.141 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 2.46e-01 -0.157 0.134 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -173885 sc-eQTL 3.20e-01 0.0929 0.0933 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 9.75e-01 0.00349 0.111 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0752 0.137 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 6.43e-01 -0.066 0.142 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 9.94e-01 0.00101 0.138 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0433 0.0638 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0146 0.137 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 7.19e-02 0.231 0.128 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 9.01e-01 0.0153 0.124 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 7.67e-02 0.186 0.104 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0157 0.0897 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0459 0.0973 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0629 0.063 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 7.07e-02 -0.211 0.116 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 3.96e-02 -0.249 0.12 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 1.16e-01 0.201 0.128 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 2.18e-02 0.268 0.116 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0758 0.0984 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 4.50e-01 0.0874 0.115 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 6.76e-02 -0.109 0.0594 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 4.30e-01 0.0902 0.114 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 9.02e-01 0.0172 0.139 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 9.27e-01 0.0122 0.133 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 7.84e-02 0.234 0.132 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 9.95e-01 0.000802 0.123 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 3.71e-01 0.114 0.128 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0158 0.0525 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 2.41e-01 -0.158 0.134 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 2.26e-01 -0.158 0.13 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0654 0.112 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 1.66e-02 0.274 0.113 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 2.13e-01 0.158 0.127 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 1.87e-01 0.0898 0.0679 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0782 0.128 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 4.37e-01 0.103 0.132 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 8.52e-01 0.0253 0.135 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 1.21e-01 -0.169 0.108 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 4.88e-01 0.081 0.117 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00104 0.0669 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 2.86e-01 -0.131 0.123 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 1.82e-01 -0.179 0.134 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 3.02e-01 -0.14 0.135 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 8.33e-01 0.0287 0.136 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 2.66e-01 -0.15 0.134 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 8.57e-01 0.0118 0.0656 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 8.94e-01 0.0195 0.146 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 7.42e-02 -0.256 0.143 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0828 0.144 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 6.55e-01 0.062 0.139 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 1.51e-01 0.205 0.143 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 2.29e-01 0.0927 0.0768 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 2.56e-01 -0.16 0.141 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 9.25e-01 0.0138 0.146 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0546 0.125 0.126 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0655 0.13 0.126 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00737 0.136 0.126 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 4.46e-02 -0.266 0.131 0.126 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 8.79e-01 -0.00999 0.0653 0.126 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 9.03e-01 0.0165 0.135 0.126 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 9.13e-01 0.015 0.137 0.126 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 1.24e-01 0.201 0.13 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 3.61e-01 -0.126 0.138 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 3.91e-01 -0.114 0.132 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0168 0.0739 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0185 0.134 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 1.73e-01 0.145 0.106 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0459 0.11 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 7.58e-01 0.0413 0.134 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0109 0.053 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 9.53e-01 0.00686 0.117 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 5.63e-02 0.249 0.129 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 8.93e-01 0.0177 0.132 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 4.47e-01 -0.101 0.132 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00475 0.0616 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0756 0.137 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 5.60e-01 0.0678 0.116 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 1.49e-01 0.173 0.119 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 4.48e-01 -0.099 0.13 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 4.27e-01 0.0563 0.0707 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 2.82e-01 0.131 0.121 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 9.67e-01 0.00699 0.168 0.141 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -443472 sc-eQTL 5.48e-01 -0.084 0.139 0.141 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 9.16e-01 0.0123 0.116 0.141 PB L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 3.12e-01 0.16 0.158 0.141 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 1.11e-01 0.226 0.141 0.141 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 8.63e-02 0.138 0.0797 0.141 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 2.50e-01 0.177 0.153 0.141 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 3.73e-01 -0.135 0.151 0.141 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -173885 sc-eQTL 5.46e-01 0.0602 0.0994 0.141 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0589 0.116 0.124 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 1.50e-01 0.172 0.119 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 4.28e-01 0.107 0.135 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0487 0.129 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0125 0.0487 0.124 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 6.64e-01 0.0503 0.116 0.124 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0872 0.126 0.124 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 8.30e-01 0.0276 0.128 0.124 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 9.51e-01 0.00797 0.128 0.124 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00793 0.132 0.124 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 4.10e-01 0.089 0.108 0.124 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 7.24e-01 0.0169 0.0478 0.124 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 1.36e-02 -0.279 0.112 0.124 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0381 0.135 0.124 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 2.07e-01 0.146 0.115 0.124 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0374 0.115 0.124 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -776762 sc-eQTL 4.55e-02 -0.228 0.113 0.124 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 1.99e-01 -0.191 0.148 0.124 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -756052 sc-eQTL 4.03e-01 -0.113 0.134 0.124 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 7.79e-01 0.0369 0.131 0.124 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 4.68e-01 0.047 0.0646 0.124 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 3.82e-02 0.298 0.143 0.124 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 1.64e-01 -0.178 0.127 0.124 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 3.91e-02 -0.255 0.123 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 6.31e-01 0.0419 0.0871 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -776762 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0898 0.123 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 5.60e-01 0.0711 0.122 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -756052 sc-eQTL 2.45e-01 -0.144 0.124 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 4.67e-01 0.0723 0.0993 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 3.69e-01 0.0495 0.0551 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 3.25e-01 -0.117 0.118 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 3.40e-01 0.102 0.106 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0864 0.129 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 6.77e-01 0.0396 0.0947 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -776762 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0037 0.118 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 2.70e-01 -0.142 0.128 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -756052 sc-eQTL 4.30e-01 -0.101 0.128 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 5.96e-01 0.0446 0.0841 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 4.76e-01 0.0432 0.0605 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 7.51e-01 0.04 0.126 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 9.41e-01 0.00826 0.112 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 8.24e-01 0.0323 0.145 0.124 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 2.50e-01 0.174 0.151 0.124 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 2.33e-01 -0.194 0.162 0.124 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 4.09e-01 -0.139 0.167 0.124 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0214 0.0639 0.124 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 1.86e-01 0.224 0.169 0.124 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 7.20e-02 0.296 0.163 0.124 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0285 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 1.30e-01 0.191 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -776762 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00961 0.128 0.124 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0863 0.14 0.124 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -756052 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0135 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 2.97e-01 0.134 0.128 0.124 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0611 0.0556 0.124 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0342 0.137 0.124 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 4.07e-01 -0.113 0.136 0.124 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 9.33e-01 0.0104 0.124 0.127 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 2.67e-01 0.105 0.094 0.127 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -776762 sc-eQTL 1.74e-01 -0.181 0.132 0.127 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 9.94e-01 0.00103 0.135 0.127 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -756052 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000671 0.132 0.127 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 8.14e-01 -0.03 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 8.03e-02 0.111 0.0632 0.127 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 6.90e-01 0.0521 0.131 0.127 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0646 0.112 0.127 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 4.86e-01 -0.103 0.148 0.124 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0731 0.107 0.124 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -776762 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0629 0.107 0.124 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 5.80e-01 0.083 0.15 0.124 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -756052 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0973 0.109 0.124 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0209 0.13 0.124 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 2.42e-01 -0.105 0.0892 0.124 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0781 0.122 0.124 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 9.75e-02 0.219 0.132 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 7.10e-01 0.0431 0.116 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -443472 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0506 0.131 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 1.44e-01 0.108 0.074 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 4.72e-01 0.082 0.114 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0451 0.118 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0987 0.0667 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 7.03e-02 -0.209 0.115 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 8.04e-01 0.0306 0.123 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -173885 sc-eQTL 7.70e-01 0.0348 0.119 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 1.61e-03 0.307 0.0962 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -443472 sc-eQTL 1.52e-01 -0.202 0.141 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 5.26e-02 0.112 0.0575 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0273 0.109 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 1.63e-01 0.157 0.112 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0907 0.0679 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 3.77e-01 0.121 0.137 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 3.31e-01 0.125 0.128 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -173885 sc-eQTL 9.34e-01 0.00682 0.0817 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 1.01e-01 -0.194 0.118 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 3.71e-01 0.0653 0.0728 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -776762 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0586 0.119 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0445 0.114 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -756052 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0807 0.124 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 2.03e-01 0.104 0.0817 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 3.65e-01 0.051 0.0561 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 6.89e-01 -0.045 0.112 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 3.09e-01 0.102 0.0998 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0306 0.124 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 8.94e-02 0.149 0.0875 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -776762 sc-eQTL 2.75e-02 -0.285 0.128 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0834 0.126 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -756052 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0675 0.128 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 8.24e-01 0.027 0.121 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 5.18e-01 0.0333 0.0514 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0567 0.13 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -855336 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0436 0.125 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -555195 sc-eQTL 8.34e-02 0.174 0.0998 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 329761 sc-eQTL 5.89e-01 0.0527 0.0976 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -805456 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0852 0.127 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -856566 sc-eQTL 9.92e-01 0.000498 0.052 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 822536 sc-eQTL 5.81e-01 0.0595 0.108 0.125 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079819 EPB41L2 894681 eQTL 0.00773 -0.0873 0.0327 0.0 0.0 0.111
ENSG00000079950 STX7 -555195 eQTL 3.87e-08 0.134 0.0243 0.0 0.0 0.111
ENSG00000112299 VNN1 -756052 pQTL 0.0368 0.115 0.0552 0.0 0.0 0.109
ENSG00000112299 VNN1 -756052 eQTL 0.0131 0.0835 0.0336 0.0 0.0 0.111
ENSG00000112303 VNN2 -805456 pQTL 0.00619 -0.109 0.0397 0.0 0.0 0.109
ENSG00000118523 CCN2 6631 pQTL 4.88e-14 -0.247 0.0324 0.0 0.0 0.109

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -555195 2.69e-07 1.34e-07 6.86e-08 1.82e-07 8.83e-08 9.91e-08 1.81e-07 5.35e-08 1.45e-07 4.4e-08 1.54e-07 8.59e-08 1.47e-07 7.37e-08 6.25e-08 7.53e-08 4.09e-08 1.33e-07 6.07e-08 4.03e-08 1.22e-07 1.24e-07 1.45e-07 4.53e-08 1.32e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.15e-08 1.05e-07 1.07e-07 9.64e-08 3.82e-08 2.92e-08 8.55e-08 9.15e-08 3.99e-08 5.06e-08 9.26e-08 7.52e-08 3.55e-08 4.02e-08 1.33e-07 4.76e-08 2.02e-08 7.91e-08 1.68e-08 1.26e-07 4.41e-09 4.61e-08