logo

Genes within 1Mb (chr6:131955880:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 9.25e-02 0.131 0.0774 0.171 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -445595 sc-eQTL 1.01e-01 -0.186 0.113 0.171 B L1
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 4.32e-01 0.0337 0.0428 0.171 B L1
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 8.23e-01 0.0192 0.0855 0.171 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 7.45e-01 0.0263 0.0806 0.171 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 5.07e-02 -0.0949 0.0483 0.171 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 9.39e-01 0.00774 0.101 0.171 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 9.43e-01 0.00741 0.103 0.171 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -176008 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0126 0.0673 0.171 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 9.15e-01 0.0108 0.101 0.171 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 3.47e-02 0.174 0.0818 0.171 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 3.04e-01 0.0674 0.0655 0.171 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 4.63e-01 0.0526 0.0715 0.171 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0618 0.0485 0.171 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 1.76e-01 -0.119 0.0877 0.171 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 1.43e-01 -0.144 0.098 0.171 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0333 0.0815 0.171 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 4.12e-01 0.0659 0.0801 0.171 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 4.13e-01 0.0779 0.095 0.171 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 7.80e-01 0.00909 0.0325 0.171 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 2.93e-01 -0.096 0.0912 0.171 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 6.01e-01 0.0514 0.0982 0.171 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 6.98e-01 0.0335 0.0863 0.169 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 6.74e-01 0.0321 0.0762 0.169 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -778885 sc-eQTL 2.68e-01 -0.105 0.0942 0.169 DC L1
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 2.19e-01 -0.136 0.111 0.169 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -758175 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0473 0.102 0.169 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 7.29e-01 0.0379 0.109 0.169 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 5.43e-01 0.0373 0.0612 0.169 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 4.70e-01 0.0788 0.109 0.169 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 8.68e-01 0.0161 0.0969 0.169 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 6.85e-01 -0.038 0.0935 0.171 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 3.06e-01 0.0571 0.0556 0.171 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -778885 sc-eQTL 2.27e-01 -0.116 0.0954 0.171 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0859 0.0907 0.171 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -758175 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0308 0.103 0.171 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 5.74e-01 0.0409 0.0726 0.171 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 1.48e-01 0.063 0.0433 0.171 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00434 0.0902 0.171 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 7.31e-01 0.0296 0.0861 0.171 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 9.64e-02 0.139 0.0831 0.172 NK L1
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 7.07e-01 0.0288 0.0765 0.172 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0643 0.104 0.172 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 9.95e-01 0.000253 0.0431 0.172 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 9.10e-01 0.0104 0.0915 0.172 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0222 0.093 0.171 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 8.88e-01 0.0119 0.0841 0.171 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0125 0.105 0.171 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0709 0.102 0.171 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0372 0.0403 0.171 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0168 0.0918 0.171 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 4.82e-01 0.0778 0.11 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 1.28e-01 -0.15 0.0979 0.181 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -445595 sc-eQTL 7.42e-01 0.0368 0.112 0.181 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 2.91e-01 0.111 0.105 0.181 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 5.67e-03 0.318 0.114 0.181 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0481 0.112 0.181 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0708 0.0596 0.181 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 2.94e-01 -0.122 0.115 0.181 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 7.64e-01 0.0315 0.105 0.181 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -176008 sc-eQTL 4.24e-01 0.0798 0.0997 0.181 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 7.82e-01 0.0299 0.108 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -445595 sc-eQTL 1.28e-01 -0.159 0.104 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 3.17e-01 0.0685 0.0682 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 5.54e-01 0.0616 0.104 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 3.05e-01 -0.106 0.103 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0502 0.063 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 5.71e-01 0.06 0.106 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 5.38e-01 0.0701 0.114 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -176008 sc-eQTL 1.58e-01 -0.136 0.0961 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 9.54e-02 0.167 0.0995 0.17 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -445595 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00953 0.104 0.17 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 4.94e-01 0.0557 0.0814 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 2.59e-01 -0.119 0.105 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0497 0.106 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0333 0.0513 0.17 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 1.68e-01 -0.15 0.109 0.17 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 5.95e-01 -0.057 0.107 0.17 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -176008 sc-eQTL 4.15e-01 0.0814 0.0997 0.17 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 1.69e-02 0.206 0.0855 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -445595 sc-eQTL 7.29e-02 -0.211 0.117 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 3.22e-02 0.11 0.0509 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 5.25e-01 0.0586 0.0921 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 1.32e-01 0.15 0.0994 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 1.54e-01 -0.0811 0.0567 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 1.61e-01 0.161 0.115 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 4.60e-02 0.218 0.109 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -176008 sc-eQTL 9.84e-01 0.00143 0.0727 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 2.59e-01 0.112 0.0991 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -445595 sc-eQTL 5.01e-01 0.0759 0.113 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 1.95e-01 0.0794 0.0611 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0433 0.113 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 3.87e-01 0.0975 0.112 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 6.01e-02 -0.112 0.0592 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 9.87e-01 0.00199 0.119 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 4.06e-02 -0.232 0.113 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -176008 sc-eQTL 7.78e-01 0.0223 0.0789 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0527 0.0913 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0255 0.113 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0629 0.117 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0612 0.114 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0421 0.0524 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 3.27e-01 0.11 0.112 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 1.00e-01 0.174 0.105 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 7.37e-01 0.035 0.104 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 9.07e-02 0.149 0.088 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 4.93e-01 0.0519 0.0755 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 5.30e-01 0.0515 0.082 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0187 0.0532 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 7.77e-02 -0.174 0.0981 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 1.74e-02 -0.242 0.101 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 4.03e-01 0.0904 0.108 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 1.42e-01 0.145 0.0981 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 8.12e-01 0.0197 0.0829 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 2.48e-01 0.112 0.0969 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 8.99e-02 -0.0852 0.05 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 8.58e-01 0.0172 0.0962 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 4.46e-01 0.089 0.116 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 9.60e-01 0.00557 0.112 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 4.61e-02 0.222 0.111 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0606 0.103 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 5.93e-01 0.0573 0.107 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 8.27e-01 -0.00961 0.044 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 3.25e-01 -0.111 0.113 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 1.31e-01 -0.165 0.109 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 6.47e-01 -0.043 0.0937 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 1.13e-01 0.152 0.0955 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 3.12e-01 0.108 0.106 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 3.34e-01 0.0551 0.0569 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0668 0.107 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 1.83e-01 0.147 0.11 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 9.56e-01 0.00632 0.113 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0111 0.0912 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 7.05e-01 0.037 0.0978 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 4.13e-01 0.0459 0.0559 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 7.81e-02 -0.181 0.102 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00497 0.112 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 2.90e-01 -0.119 0.112 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0453 0.113 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 1.89e-01 -0.147 0.111 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 9.26e-01 0.00509 0.0545 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 7.45e-01 0.0395 0.121 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 1.17e-01 -0.187 0.119 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 1.07e-01 -0.191 0.118 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 3.60e-01 0.105 0.114 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 6.85e-02 0.215 0.117 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 4.28e-02 0.128 0.063 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 3.75e-01 -0.103 0.116 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 6.79e-01 0.0498 0.12 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00709 0.103 0.173 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0317 0.108 0.173 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 8.25e-01 0.0249 0.113 0.173 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0819 0.109 0.173 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0143 0.0538 0.173 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 9.26e-01 0.0104 0.111 0.173 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 4.75e-01 0.0806 0.113 0.173 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 2.98e-01 0.114 0.109 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 5.45e-01 -0.07 0.115 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 1.44e-01 -0.162 0.11 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00708 0.0618 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0871 0.112 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 1.91e-01 0.117 0.0889 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 8.92e-01 0.0124 0.0917 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 6.90e-01 0.0445 0.112 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 9.93e-01 0.000371 0.0443 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 9.30e-01 0.00862 0.0973 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 3.13e-02 0.237 0.109 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 8.42e-01 0.0223 0.112 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00692 0.112 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 8.37e-01 0.0107 0.0521 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 6.05e-01 -0.06 0.116 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 8.00e-01 0.0248 0.0974 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 2.47e-01 0.117 0.1 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 3.30e-01 -0.107 0.109 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 6.99e-01 0.023 0.0594 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 7.82e-01 0.0282 0.102 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 5.64e-01 0.0864 0.149 0.174 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -445595 sc-eQTL 3.58e-01 -0.114 0.124 0.174 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 4.91e-01 0.0715 0.103 0.174 PB L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 8.46e-01 0.0275 0.141 0.174 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 2.99e-01 0.131 0.126 0.174 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 9.20e-02 0.121 0.071 0.174 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 4.53e-01 0.103 0.137 0.174 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 1.27e-01 -0.205 0.133 0.174 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -176008 sc-eQTL 4.41e-01 0.0683 0.0884 0.174 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 7.42e-01 -0.032 0.097 0.172 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 6.07e-01 0.0517 0.1 0.172 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 1.86e-01 0.149 0.112 0.172 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 5.06e-01 0.0716 0.107 0.172 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0303 0.0406 0.172 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 5.92e-01 0.0518 0.0967 0.172 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 3.01e-01 -0.109 0.105 0.172 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0602 0.107 0.171 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 4.48e-01 0.0817 0.108 0.171 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0352 0.111 0.171 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 4.76e-01 0.0646 0.0905 0.171 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 8.55e-01 0.00735 0.0401 0.171 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 6.76e-03 -0.257 0.0938 0.171 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 9.31e-01 0.00975 0.113 0.171 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 7.33e-02 0.171 0.0951 0.171 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 8.75e-01 -0.015 0.0955 0.171 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -778885 sc-eQTL 2.81e-01 -0.102 0.0945 0.171 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 2.07e-01 -0.156 0.123 0.171 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -758175 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0478 0.111 0.171 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 9.06e-01 0.0128 0.109 0.171 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 4.34e-01 0.042 0.0535 0.171 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 1.35e-01 0.179 0.119 0.171 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 4.06e-02 -0.217 0.105 0.171 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0926 0.102 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 8.94e-01 0.0096 0.0717 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -778885 sc-eQTL 9.52e-02 -0.169 0.101 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 4.60e-01 0.074 0.1 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -758175 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0973 0.102 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 7.02e-01 0.0313 0.0817 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 1.93e-01 0.059 0.0452 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0974 0.0973 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 6.85e-01 0.0356 0.0875 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0524 0.106 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0319 0.0777 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -778885 sc-eQTL 7.19e-01 0.0349 0.097 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 2.00e-01 -0.135 0.105 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -758175 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0372 0.105 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 9.95e-01 0.000437 0.069 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 5.07e-01 0.033 0.0496 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 3.40e-01 0.0984 0.103 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 8.36e-01 0.0191 0.092 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00991 0.12 0.176 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 1.38e-01 0.185 0.124 0.176 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 3.76e-01 -0.119 0.134 0.176 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 8.91e-01 -0.019 0.139 0.176 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0139 0.0528 0.176 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 3.96e-01 0.119 0.14 0.176 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 3.23e-01 0.135 0.136 0.176 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0406 0.107 0.171 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 4.52e-02 0.207 0.103 0.171 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -778885 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0432 0.105 0.171 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 1.46e-01 -0.167 0.115 0.171 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -758175 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0475 0.104 0.171 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 5.47e-01 0.0635 0.105 0.171 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0127 0.0458 0.171 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 7.69e-01 -0.033 0.112 0.171 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 2.75e-01 -0.122 0.111 0.171 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0228 0.102 0.174 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 1.44e-01 0.113 0.0772 0.174 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -778885 sc-eQTL 3.52e-01 -0.102 0.109 0.174 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 2.69e-01 -0.123 0.111 0.174 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -758175 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0148 0.109 0.174 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 2.89e-01 -0.111 0.104 0.174 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 2.79e-01 0.0568 0.0523 0.174 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 1.79e-01 0.144 0.107 0.174 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 2.79e-01 -0.1 0.0923 0.174 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 7.98e-02 -0.213 0.121 0.181 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 8.64e-01 0.0151 0.0877 0.181 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -778885 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0075 0.0883 0.181 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 9.86e-01 0.00218 0.123 0.181 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -758175 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0786 0.0897 0.181 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 4.21e-01 0.0862 0.107 0.181 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0345 0.0736 0.181 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0436 0.1 0.181 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 1.17e-01 0.171 0.108 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 9.89e-01 0.00137 0.0969 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -445595 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0875 0.11 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 1.46e-01 0.0903 0.0619 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 1.52e-01 0.136 0.0947 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0664 0.0983 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0611 0.0559 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0828 0.0966 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 3.64e-01 0.0934 0.103 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -176008 sc-eQTL 6.63e-01 0.0433 0.0992 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 1.47e-02 0.2 0.0812 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -445595 sc-eQTL 3.19e-01 -0.118 0.118 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 7.81e-02 0.0853 0.0482 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 6.83e-01 0.0372 0.0911 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 1.25e-01 0.144 0.0937 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0863 0.0567 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 3.28e-01 0.112 0.115 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 8.00e-01 0.0273 0.108 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -176008 sc-eQTL 8.25e-01 0.0151 0.0683 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0663 0.0974 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 7.02e-01 0.023 0.06 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -778885 sc-eQTL 2.57e-01 -0.111 0.0975 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0132 0.094 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -758175 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0362 0.102 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 4.47e-01 0.0513 0.0673 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 2.44e-01 0.0539 0.0461 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00915 0.0922 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 5.79e-01 0.0456 0.0822 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0347 0.103 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 7.78e-02 0.129 0.0726 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -778885 sc-eQTL 4.57e-02 -0.214 0.107 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 7.81e-02 -0.184 0.104 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -758175 sc-eQTL 5.36e-01 -0.066 0.107 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0324 0.1 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 7.03e-01 0.0163 0.0426 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 7.32e-01 0.0368 0.107 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -857459 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0856 0.103 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -557318 sc-eQTL 1.52e-01 0.12 0.0836 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 327638 sc-eQTL 3.95e-01 0.0694 0.0814 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -807579 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0623 0.106 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -858689 sc-eQTL 8.65e-01 0.00737 0.0434 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 820413 sc-eQTL 8.92e-01 0.0122 0.09 0.172 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 eQTL 0.000172 -0.109 0.0289 0.00344 0.0 0.142
ENSG00000079950 STX7 -557318 eQTL 1.1e-05 0.0955 0.0216 0.0 0.0 0.142
ENSG00000112303 VNN2 -807579 pQTL 0.0125 -0.0886 0.0354 0.0 0.0 0.141
ENSG00000118523 CCN2 4508 pQTL 3.76e-11 -0.194 0.029 0.0 0.0 0.141

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079819 EPB41L2 892558 2.64e-07 1.16e-07 3.65e-08 2.05e-07 9.02e-08 9.61e-08 1.42e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.57e-08 1.56e-07 8.36e-08 1.33e-07 6.56e-08 5.98e-08 7.5e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.21e-08 4.07e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.26e-07 4.26e-08 1.33e-07 1.15e-07 1.07e-07 9.32e-08 1.03e-07 1.12e-07 9.73e-08 3.94e-08 3.26e-08 8.55e-08 7.36e-08 3.6e-08 5.05e-08 9.55e-08 6.55e-08 3.8e-08 4.69e-08 1.35e-07 5.27e-08 1.45e-08 5.43e-08 1.84e-08 1.26e-07 3.86e-09 4.77e-08
ENSG00000079950 STX7 -557318 3.1e-07 1.76e-07 5.64e-08 3.62e-07 9.8e-08 8.85e-08 2.4e-07 5.62e-08 1.59e-07 1.03e-07 1.83e-07 1.48e-07 2.38e-07 8.42e-08 1.57e-07 7.89e-08 4.31e-08 1.77e-07 7.39e-08 6.02e-08 1.22e-07 1.56e-07 1.58e-07 3.07e-08 2.37e-07 1.25e-07 1.72e-07 1.26e-07 1.31e-07 1.05e-07 1.26e-07 5.01e-08 3.38e-08 1.02e-07 1.31e-07 5.04e-08 5.96e-08 9.17e-08 4.75e-08 7.65e-08 3.31e-08 1.55e-07 2.47e-08 1.43e-08 3.71e-08 8.24e-09 1e-07 0.0 4.9e-08