logo

Genes within 1Mb (chr6:131942111:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0405 0.0858 0.169 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -459364 sc-eQTL 3.19e-01 -0.125 0.125 0.169 B L1
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0193 0.0472 0.169 B L1
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0109 0.0942 0.169 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 2.62e-01 0.0996 0.0886 0.169 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0273 0.0537 0.169 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 1.96e-01 0.144 0.111 0.169 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 3.27e-01 -0.111 0.113 0.169 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -189777 sc-eQTL 3.10e-01 0.0753 0.074 0.169 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0636 0.114 0.169 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0641 0.0928 0.169 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 2.20e-01 0.0904 0.0735 0.169 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 2.07e-01 -0.102 0.0802 0.169 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0441 0.0546 0.169 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 1.30e-01 0.149 0.0984 0.169 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0269 0.111 0.169 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 4.17e-01 -0.074 0.091 0.169 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 7.12e-01 0.0332 0.0898 0.169 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 1.72e-01 -0.145 0.106 0.169 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0178 0.0364 0.169 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 2.20e-01 0.125 0.102 0.169 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00362 0.11 0.169 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 6.53e-01 0.045 0.0998 0.162 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0792 0.088 0.162 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -792654 sc-eQTL 1.65e-01 -0.152 0.109 0.162 DC L1
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 1.12e-01 -0.204 0.127 0.162 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -771944 sc-eQTL 8.32e-01 0.025 0.118 0.162 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 9.80e-01 0.00317 0.126 0.162 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0554 0.0707 0.162 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 9.59e-01 0.00649 0.126 0.162 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0137 0.112 0.162 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 1.97e-01 -0.133 0.103 0.169 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 9.82e-01 0.00136 0.0614 0.169 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -792654 sc-eQTL 3.17e-01 0.105 0.105 0.169 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 6.26e-01 0.0488 0.1 0.169 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -771944 sc-eQTL 8.21e-01 0.0257 0.113 0.169 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0456 0.08 0.169 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0663 0.0478 0.169 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 6.07e-01 0.0512 0.0993 0.169 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 1.68e-01 0.131 0.0945 0.169 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0227 0.094 0.167 NK L1
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00756 0.0859 0.167 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0384 0.117 0.167 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0494 0.0483 0.167 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 4.01e-01 0.0864 0.103 0.167 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 4.52e-01 0.0796 0.106 0.169 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 8.12e-02 -0.167 0.0951 0.169 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 1.86e-01 -0.158 0.119 0.169 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 7.92e-01 0.0306 0.116 0.169 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00155 0.0459 0.169 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 3.84e-01 0.091 0.104 0.169 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 1.33e-03 -0.399 0.123 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 2.14e-01 -0.139 0.112 0.166 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -459364 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0589 0.127 0.166 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000965 0.119 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 2.33e-01 -0.158 0.132 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0243 0.127 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 6.44e-01 0.0315 0.068 0.166 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 8.78e-01 0.0202 0.132 0.166 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 1.87e-01 -0.157 0.119 0.166 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -189777 sc-eQTL 2.73e-01 -0.125 0.113 0.166 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0168 0.12 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -459364 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0123 0.116 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0961 0.0755 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 9.61e-01 0.0056 0.115 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 7.34e-01 0.0389 0.114 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0334 0.0699 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 4.54e-01 0.0878 0.117 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 2.03e-01 0.16 0.125 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -189777 sc-eQTL 4.75e-01 0.0765 0.107 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 8.44e-02 0.193 0.111 0.168 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -459364 sc-eQTL 2.64e-01 -0.13 0.116 0.168 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 2.00e-01 -0.117 0.0909 0.168 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0471 0.118 0.168 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 1.03e-01 0.194 0.119 0.168 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 3.22e-01 0.0569 0.0574 0.168 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 5.07e-01 0.0812 0.122 0.168 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 1.59e-04 -0.446 0.116 0.168 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -189777 sc-eQTL 9.20e-01 0.0112 0.112 0.168 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 7.16e-03 -0.259 0.0952 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -459364 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0742 0.132 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0719 0.0573 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 9.33e-01 0.00864 0.103 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 6.23e-01 0.055 0.112 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0213 0.0636 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 7.93e-01 0.0339 0.129 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0859 0.123 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -189777 sc-eQTL 8.91e-02 0.138 0.0808 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 6.05e-01 0.0565 0.109 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -459364 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0343 0.124 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0525 0.0673 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 2.87e-03 0.368 0.122 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 9.97e-01 0.00048 0.124 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 5.67e-01 0.0375 0.0655 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 9.61e-01 0.00635 0.131 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0127 0.125 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -189777 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0471 0.0866 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0362 0.106 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 2.64e-01 0.146 0.131 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 6.08e-01 0.0699 0.136 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 6.12e-01 -0.067 0.132 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 8.40e-01 0.0124 0.061 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0278 0.131 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 7.07e-04 -0.411 0.12 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 2.84e-01 -0.128 0.12 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 1.53e-01 -0.145 0.101 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 2.77e-01 0.0946 0.0867 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0738 0.0942 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0855 0.0609 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 2.70e-02 0.25 0.112 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0658 0.118 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 7.11e-01 0.0442 0.119 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00243 0.109 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 2.93e-01 0.0962 0.0913 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0529 0.107 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 7.82e-01 0.0154 0.0556 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0284 0.106 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 3.83e-01 0.112 0.129 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 2.41e-01 -0.146 0.124 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 2.27e-01 -0.15 0.124 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0931 0.114 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 7.80e-01 0.0333 0.119 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0549 0.0488 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 8.68e-01 0.021 0.126 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 3.95e-01 -0.104 0.122 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0174 0.106 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 3.88e-01 0.0934 0.108 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0548 0.12 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00303 0.0642 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 2.23e-01 0.147 0.121 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 8.13e-02 -0.216 0.124 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 3.44e-03 -0.366 0.124 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 5.81e-01 0.0562 0.102 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 4.84e-02 -0.214 0.108 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00478 0.0624 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 1.65e-01 0.159 0.114 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 5.61e-01 0.0728 0.125 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0657 0.127 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 3.58e-01 0.117 0.127 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0851 0.126 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0383 0.0614 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0287 0.137 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 9.08e-01 0.0156 0.135 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 4.46e-01 -0.102 0.133 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 3.16e-01 -0.129 0.128 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 2.19e-01 -0.163 0.132 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0519 0.0713 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 7.50e-01 0.0417 0.131 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 3.23e-01 0.133 0.135 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 1.40e-01 0.172 0.116 0.165 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 3.54e-01 -0.113 0.121 0.165 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0757 0.127 0.165 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0298 0.124 0.165 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00526 0.0608 0.165 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 1.99e-01 0.161 0.125 0.165 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 2.54e-01 -0.145 0.127 0.165 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 1.55e-01 0.176 0.123 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 6.55e-01 0.0586 0.131 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 9.86e-01 0.00228 0.126 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 9.60e-01 0.00352 0.0701 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0471 0.127 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0649 0.101 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 4.59e-01 0.0768 0.104 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0618 0.126 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0417 0.05 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 6.49e-01 0.0502 0.11 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 5.75e-01 0.07 0.125 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0316 0.126 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 1.03e-01 -0.206 0.125 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 7.78e-02 -0.103 0.0584 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 2.09e-01 0.164 0.13 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0905 0.108 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0685 0.112 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 8.30e-01 0.0263 0.122 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0496 0.0662 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 3.22e-01 0.112 0.113 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 8.05e-01 0.0373 0.151 0.178 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -459364 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0808 0.125 0.178 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 7.61e-01 -0.032 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0495 0.143 0.178 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0608 0.128 0.178 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 2.40e-01 0.0855 0.0723 0.178 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0435 0.139 0.178 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 2.86e-02 -0.296 0.134 0.178 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -189777 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0782 0.0894 0.178 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0699 0.11 0.167 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0679 0.114 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 2.37e-02 -0.289 0.127 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 8.42e-01 0.0244 0.123 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 5.24e-01 0.0296 0.0463 0.167 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 7.64e-01 0.0332 0.11 0.167 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 6.46e-04 -0.404 0.117 0.167 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 2.98e-01 0.127 0.122 0.169 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 6.45e-01 0.0564 0.122 0.169 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0511 0.125 0.169 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 2.68e-01 -0.114 0.102 0.169 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 4.50e-01 0.0344 0.0454 0.169 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 4.27e-01 -0.086 0.108 0.169 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 2.88e-01 -0.136 0.128 0.169 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 5.33e-01 0.0706 0.113 0.151 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0794 0.112 0.151 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -792654 sc-eQTL 3.15e-01 -0.112 0.111 0.151 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 1.63e-01 -0.202 0.145 0.151 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -771944 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0272 0.131 0.151 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 9.29e-01 0.0114 0.128 0.151 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 7.61e-01 0.0193 0.0632 0.151 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 7.60e-01 0.0431 0.141 0.151 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0573 0.125 0.151 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 1.94e-01 -0.146 0.112 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 5.79e-01 -0.044 0.0793 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -792654 sc-eQTL 7.77e-01 0.0318 0.112 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 9.04e-01 0.0134 0.111 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -771944 sc-eQTL 5.03e-01 0.0759 0.113 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 8.27e-01 0.0198 0.0905 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 4.27e-02 -0.102 0.0498 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 1.92e-01 0.141 0.108 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 2.06e-01 0.123 0.0966 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 4.57e-01 -0.087 0.117 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 2.08e-01 0.108 0.0853 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -792654 sc-eQTL 9.53e-02 0.178 0.106 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 9.11e-01 0.013 0.116 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -771944 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0112 0.116 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 5.81e-01 -0.042 0.076 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 5.87e-01 0.0297 0.0547 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 3.31e-01 0.11 0.113 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 3.70e-01 0.0909 0.101 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 8.86e-01 0.0201 0.14 0.161 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 1.86e-01 0.194 0.146 0.161 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 2.71e-01 0.173 0.157 0.161 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 3.68e-01 0.147 0.162 0.161 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0359 0.0619 0.161 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 2.66e-01 0.183 0.164 0.161 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 1.84e-01 -0.213 0.159 0.161 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 4.07e-01 -0.101 0.122 0.162 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 9.00e-01 0.015 0.119 0.162 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -792654 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0444 0.12 0.162 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 4.48e-01 0.0998 0.131 0.162 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -771944 sc-eQTL 9.10e-01 0.0134 0.118 0.162 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 2.27e-01 -0.145 0.12 0.162 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 8.10e-01 0.0126 0.0523 0.162 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0686 0.128 0.162 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0315 0.127 0.162 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0785 0.117 0.165 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0338 0.0893 0.165 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -792654 sc-eQTL 2.70e-01 0.139 0.126 0.165 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0537 0.128 0.165 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -771944 sc-eQTL 8.08e-01 0.0305 0.125 0.165 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 4.48e-01 0.0913 0.12 0.165 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 7.32e-01 0.0207 0.0604 0.165 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 2.97e-01 0.129 0.124 0.165 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 1.61e-01 0.149 0.106 0.165 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 3.70e-01 0.135 0.15 0.164 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 2.24e-01 -0.131 0.108 0.164 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -792654 sc-eQTL 3.02e-01 0.112 0.108 0.164 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 3.08e-01 -0.155 0.151 0.164 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -771944 sc-eQTL 7.16e-01 0.0403 0.111 0.164 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0492 0.132 0.164 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 2.58e-01 -0.103 0.0904 0.164 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 6.59e-01 0.0548 0.124 0.164 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0174 0.134 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00503 0.108 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -459364 sc-eQTL 3.69e-01 -0.11 0.123 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0993 0.0692 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 3.77e-01 -0.094 0.106 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 4.64e-01 0.0807 0.11 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 9.25e-01 0.00592 0.0627 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 2.71e-01 0.119 0.108 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 3.31e-01 -0.112 0.115 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -189777 sc-eQTL 3.86e-01 0.0963 0.111 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 5.09e-02 -0.179 0.091 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -459364 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0752 0.132 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0503 0.054 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 2.53e-01 0.116 0.101 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 9.93e-01 0.000928 0.105 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0274 0.0635 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 4.07e-01 0.106 0.128 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 3.99e-01 -0.101 0.12 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -189777 sc-eQTL 3.37e-01 0.0731 0.076 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 1.62e-01 -0.151 0.107 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 9.45e-01 0.00456 0.0664 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -792654 sc-eQTL 3.16e-01 0.108 0.108 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 7.77e-01 0.0295 0.104 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -771944 sc-eQTL 6.97e-01 0.044 0.113 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0345 0.0745 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 3.09e-01 -0.052 0.051 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 3.94e-01 0.087 0.102 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 1.69e-01 0.125 0.0906 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 878789 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0874 0.116 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0504 0.0824 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -792654 sc-eQTL 6.03e-01 0.0631 0.121 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 5.45e-01 0.0715 0.118 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -771944 sc-eQTL 9.63e-01 0.00566 0.12 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0688 0.113 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00142 0.0481 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00279 0.121 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 sc-eQTL 6.09e-01 0.0597 0.117 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -571087 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0419 0.0945 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 313869 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00977 0.0918 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -821348 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0331 0.12 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -872458 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0535 0.0487 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 806644 sc-eQTL 3.17e-01 0.101 0.101 0.168 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -771944 pQTL 0.0329 0.0982 0.046 0.0 0.0 0.165
ENSG00000118523 CCN2 -9261 pQTL 7.39e-08 0.148 0.0273 0.0 0.0 0.165
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 eQTL 1.97e-05 -0.125 0.0292 0.0 0.0 0.162

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118520 \N 368967 9.14e-07 9.07e-07 1.59e-07 4.19e-07 1.1e-07 2.67e-07 6.09e-07 2.73e-07 7.56e-07 3.11e-07 1.07e-06 5.22e-07 1.1e-06 2.06e-07 4.01e-07 4.12e-07 4.87e-07 4.31e-07 2.88e-07 3.09e-07 2.57e-07 5.5e-07 4.66e-07 2.39e-07 1.38e-06 2.49e-07 5.76e-07 4.11e-07 4.39e-07 7.71e-07 4.55e-07 5.45e-08 4.57e-08 2.08e-07 3.18e-07 3.21e-07 2.94e-07 1.06e-07 1.56e-07 3.03e-08 1.09e-07 9.5e-07 5.65e-08 1.22e-08 1.92e-07 4.23e-08 1.3e-07 7.19e-08 5.55e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 -871228 2.67e-07 1.27e-07 4.91e-08 1.97e-07 9.21e-08 1e-07 1.49e-07 5.43e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.54e-07 8.55e-08 1.45e-07 6.76e-08 6.18e-08 7.36e-08 3.98e-08 1.21e-07 5.75e-08 4.23e-08 1.13e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.42e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.1e-07 9.61e-08 1.08e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.65e-08 3.35e-08 8.34e-08 6.34e-08 3.14e-08 5.61e-08 9.26e-08 6.43e-08 3.67e-08 5.43e-08 1.33e-07 5.2e-08 1.27e-08 4.92e-08 1.84e-08 1.21e-07 1.88e-09 4.88e-08