logo

Genes within 1Mb (chr6:131912965:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 5.77e-01 0.0473 0.0847 0.169 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -488510 sc-eQTL 4.61e-01 0.0913 0.123 0.169 B L1
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 9.54e-01 0.0027 0.0466 0.169 B L1
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 3.14e-01 0.0936 0.0927 0.169 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 3.45e-01 0.0828 0.0875 0.169 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 1.68e-01 0.073 0.0528 0.169 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 1.30e-01 0.166 0.109 0.169 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0401 0.112 0.169 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -218923 sc-eQTL 1.23e-02 0.182 0.0721 0.169 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0396 0.111 0.169 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0239 0.0908 0.169 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00298 0.0721 0.169 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0486 0.0786 0.169 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 4.52e-01 0.0402 0.0534 0.169 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 7.04e-01 0.0367 0.0967 0.169 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 2.29e-01 -0.13 0.108 0.169 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 9.83e-01 0.00187 0.0895 0.169 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 4.35e-01 0.0689 0.088 0.169 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0509 0.104 0.169 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 1.10e-01 0.057 0.0355 0.169 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 1.48e-01 0.145 0.0999 0.169 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0277 0.108 0.169 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0294 0.0957 0.158 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0903 0.0842 0.158 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -821800 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0268 0.105 0.158 DC L1
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0724 0.123 0.158 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -801090 sc-eQTL 5.76e-01 0.0633 0.113 0.158 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 2.19e-01 0.149 0.121 0.158 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0184 0.0678 0.158 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 6.60e-01 0.0533 0.121 0.158 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 2.27e-01 -0.13 0.107 0.158 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 2.34e-01 -0.123 0.103 0.169 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 2.46e-01 0.0717 0.0617 0.169 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -821800 sc-eQTL 5.92e-01 0.057 0.106 0.169 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 6.70e-01 0.043 0.101 0.169 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -801090 sc-eQTL 2.11e-01 -0.143 0.114 0.169 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 5.46e-02 -0.155 0.08 0.169 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 7.18e-01 0.0175 0.0483 0.169 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0118 0.1 0.169 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0025 0.0956 0.169 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00747 0.0925 0.167 NK L1
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 6.04e-01 0.0438 0.0845 0.167 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 1.11e-01 -0.183 0.114 0.167 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 9.71e-01 0.0017 0.0476 0.167 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 1.24e-01 0.155 0.101 0.167 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0657 0.103 0.169 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 6.69e-02 -0.171 0.0928 0.169 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0117 0.117 0.169 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0309 0.113 0.169 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 6.52e-01 0.0203 0.0448 0.169 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 3.78e-01 0.09 0.102 0.169 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 4.12e-01 -0.101 0.123 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0107 0.115 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -488510 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0306 0.13 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 1.97e-01 -0.157 0.121 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 2.82e-01 0.145 0.135 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 4.24e-01 -0.104 0.129 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 7.85e-01 0.019 0.0695 0.161 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 3.41e-01 -0.128 0.134 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 7.58e-01 0.0375 0.122 0.161 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -218923 sc-eQTL 3.34e-01 0.112 0.116 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 7.89e-01 0.0324 0.121 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -488510 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0633 0.117 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0197 0.0766 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 2.24e-01 0.142 0.116 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 8.49e-01 0.022 0.115 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 5.53e-01 0.0419 0.0706 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 4.12e-01 0.0973 0.118 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 1.71e-01 -0.174 0.127 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -218923 sc-eQTL 3.51e-01 0.101 0.108 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 3.42e-02 0.239 0.112 0.166 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -488510 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0966 0.117 0.166 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00499 0.0922 0.166 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 7.82e-01 0.0329 0.119 0.166 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 8.94e-01 -0.016 0.121 0.166 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 1.84e-01 0.077 0.0578 0.166 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 1.36e-02 0.303 0.122 0.166 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 9.81e-02 -0.2 0.12 0.166 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -218923 sc-eQTL 4.78e-01 0.0802 0.113 0.166 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0613 0.0951 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -488510 sc-eQTL 5.40e-01 0.0793 0.129 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 3.02e-01 0.0583 0.0564 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 2.85e-01 0.108 0.101 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 1.32e-01 0.165 0.109 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 2.36e-01 0.074 0.0623 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 5.89e-01 0.0686 0.127 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0811 0.121 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -218923 sc-eQTL 1.37e-01 0.119 0.0795 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 8.44e-01 0.0213 0.108 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -488510 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0629 0.122 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 7.15e-01 0.0244 0.0666 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 8.54e-01 0.0227 0.123 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0729 0.122 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 9.75e-01 0.00207 0.0648 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 7.08e-01 0.0485 0.129 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 9.78e-01 0.00349 0.124 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -218923 sc-eQTL 4.27e-01 0.0681 0.0856 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0377 0.104 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 4.37e-01 0.1 0.128 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 5.41e-01 0.0819 0.134 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0611 0.13 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0328 0.0599 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 6.73e-01 0.0542 0.128 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 1.41e-01 -0.178 0.12 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 9.66e-01 0.00496 0.116 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 2.05e-01 -0.125 0.098 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 5.25e-01 0.0535 0.0839 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0291 0.0911 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 9.11e-01 0.00661 0.0591 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 6.01e-01 0.0574 0.11 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 3.71e-01 -0.102 0.114 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0802 0.118 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 6.67e-01 0.0466 0.108 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0282 0.0911 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0213 0.107 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 4.29e-01 0.0438 0.0553 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00591 0.106 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0995 0.128 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00578 0.125 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000893 0.125 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 5.79e-02 -0.218 0.114 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 2.00e-01 0.154 0.12 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 3.47e-01 0.0463 0.0491 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0015 0.127 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 3.21e-01 -0.121 0.122 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 3.15e-01 0.104 0.104 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 1.43e-01 0.156 0.106 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0726 0.118 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 7.19e-01 0.0228 0.0631 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 8.29e-01 0.0258 0.119 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 4.61e-02 -0.243 0.121 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 3.37e-01 -0.12 0.124 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 5.43e-01 0.0609 0.1 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 6.49e-01 -0.049 0.107 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 1.66e-01 0.0851 0.0612 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 2.12e-01 0.141 0.113 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0774 0.123 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 8.30e-01 0.027 0.126 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 3.95e-01 -0.108 0.126 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 2.08e-01 0.157 0.125 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00635 0.061 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 4.76e-01 0.0968 0.136 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 9.46e-01 0.00908 0.134 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0449 0.131 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0479 0.126 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 4.27e-01 0.103 0.13 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 1.81e-01 0.0934 0.0696 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 6.17e-01 0.0641 0.128 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 5.64e-01 0.0762 0.132 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 4.74e-01 0.0867 0.121 0.167 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 8.60e-01 0.0223 0.126 0.167 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 1.74e-01 0.179 0.131 0.167 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0182 0.128 0.167 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 6.15e-01 0.0318 0.063 0.167 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0376 0.13 0.167 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0208 0.132 0.167 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0157 0.129 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 1.46e-01 0.198 0.136 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 3.69e-01 -0.118 0.131 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0139 0.0729 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 3.92e-01 0.113 0.132 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0208 0.0995 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 8.45e-01 0.0201 0.102 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 2.64e-01 -0.139 0.124 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 5.84e-01 0.0271 0.0494 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 3.40e-01 0.104 0.108 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 9.78e-01 0.00347 0.126 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 4.30e-02 -0.257 0.126 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 2.93e-01 -0.134 0.127 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0463 0.0594 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 3.78e-01 0.116 0.132 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 1.43e-01 0.16 0.108 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0546 0.113 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 7.57e-01 -0.038 0.123 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00567 0.0665 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 1.09e-01 0.182 0.113 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 4.66e-01 -0.116 0.158 0.181 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -488510 sc-eQTL 3.28e-01 0.129 0.131 0.181 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00219 0.11 0.181 PB L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 2.44e-01 0.174 0.149 0.181 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 6.29e-02 -0.249 0.132 0.181 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 9.01e-02 0.129 0.0754 0.181 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 1.59e-01 0.205 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 4.29e-01 -0.113 0.143 0.181 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -218923 sc-eQTL 7.42e-01 0.031 0.0941 0.181 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 8.22e-01 0.0242 0.107 0.167 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 3.08e-01 -0.113 0.11 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 7.62e-02 -0.22 0.124 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 6.84e-01 0.0484 0.119 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0321 0.0449 0.167 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 3.51e-01 0.0998 0.107 0.167 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0681 0.116 0.167 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 8.56e-01 0.022 0.121 0.169 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 4.17e-01 0.0982 0.121 0.169 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0121 0.124 0.169 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 1.50e-01 -0.146 0.101 0.169 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 9.36e-02 0.0752 0.0447 0.169 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 4.96e-02 -0.21 0.106 0.169 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0564 0.127 0.169 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00581 0.108 0.154 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0872 0.108 0.154 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -821800 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0929 0.107 0.154 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 4.87e-01 -0.097 0.139 0.154 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -801090 sc-eQTL 3.62e-01 0.115 0.126 0.154 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 6.06e-01 0.0635 0.123 0.154 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 8.99e-01 0.00772 0.0607 0.154 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 7.25e-01 0.0476 0.135 0.154 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 1.30e-01 -0.181 0.119 0.154 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 3.18e-01 -0.113 0.113 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 2.29e-01 0.0955 0.0791 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -821800 sc-eQTL 9.28e-01 0.0102 0.112 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 6.75e-01 0.0465 0.111 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -801090 sc-eQTL 2.06e-01 -0.143 0.113 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 3.62e-02 -0.189 0.0896 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 8.03e-01 0.0126 0.0503 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0117 0.108 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 3.64e-01 0.0881 0.0968 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 5.59e-01 0.0692 0.118 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 4.15e-01 0.0706 0.0864 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -821800 sc-eQTL 3.26e-01 0.106 0.108 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 8.46e-01 0.0229 0.117 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -801090 sc-eQTL 4.02e-02 -0.24 0.116 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 2.79e-02 -0.168 0.076 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 3.22e-01 0.0548 0.0552 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 9.85e-01 0.00221 0.115 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 1.22e-01 -0.158 0.102 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 1.56e-01 -0.207 0.145 0.148 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0451 0.153 0.148 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 2.48e-01 -0.19 0.163 0.148 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 3.08e-01 0.173 0.169 0.148 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 7.33e-01 -0.022 0.0645 0.148 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 1.22e-01 0.264 0.17 0.148 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 2.42e-01 -0.195 0.166 0.148 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 3.76e-01 -0.106 0.12 0.167 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 5.03e-01 0.0782 0.116 0.167 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -821800 sc-eQTL 3.41e-01 -0.112 0.117 0.167 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 2.68e-02 0.285 0.128 0.167 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -801090 sc-eQTL 2.23e-01 -0.142 0.116 0.167 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 9.00e-02 -0.2 0.117 0.167 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00427 0.0515 0.167 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 2.85e-01 -0.135 0.126 0.167 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 8.71e-01 0.0204 0.125 0.167 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 1.57e-01 -0.163 0.115 0.163 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0116 0.088 0.163 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -821800 sc-eQTL 1.88e-01 -0.163 0.124 0.163 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0563 0.126 0.163 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -801090 sc-eQTL 4.16e-01 0.1 0.123 0.163 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 2.78e-01 -0.129 0.118 0.163 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 1.43e-01 0.0871 0.0592 0.163 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 7.31e-01 0.042 0.122 0.163 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 1.93e-01 0.137 0.105 0.163 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0865 0.141 0.158 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0198 0.101 0.158 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -821800 sc-eQTL 2.41e-01 0.119 0.101 0.158 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 5.36e-01 -0.088 0.142 0.158 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -801090 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0347 0.104 0.158 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 6.08e-01 0.0634 0.123 0.158 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 6.59e-01 0.0376 0.085 0.158 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 9.26e-01 0.0107 0.116 0.158 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0856 0.126 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 1.52e-01 0.156 0.108 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -488510 sc-eQTL 4.04e-01 -0.103 0.123 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0409 0.0698 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 3.37e-01 0.103 0.107 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 7.89e-01 0.0296 0.11 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 2.17e-01 0.0776 0.0627 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 1.87e-01 0.143 0.108 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 7.19e-02 -0.207 0.115 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -218923 sc-eQTL 3.51e-01 0.104 0.111 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0463 0.0908 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -488510 sc-eQTL 9.39e-01 0.00991 0.13 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 3.37e-01 0.0514 0.0534 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 2.75e-01 0.11 0.1 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 7.33e-01 0.0354 0.104 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 5.45e-01 0.0381 0.0628 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 4.55e-01 0.0945 0.126 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0649 0.118 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -218923 sc-eQTL 1.12e-01 0.119 0.0749 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0612 0.108 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 1.82e-01 0.0889 0.0664 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -821800 sc-eQTL 5.19e-01 0.0702 0.109 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 8.38e-01 0.0213 0.104 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -801090 sc-eQTL 1.22e-01 -0.175 0.113 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 4.37e-02 -0.151 0.0742 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 5.35e-01 0.0319 0.0514 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 9.45e-01 0.00709 0.103 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00549 0.0915 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 849643 sc-eQTL 3.49e-01 -0.107 0.114 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00373 0.0814 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -821800 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0422 0.12 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 4.95e-01 0.0796 0.116 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -801090 sc-eQTL 6.97e-01 0.0462 0.119 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 2.72e-01 -0.123 0.112 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 2.09e-01 0.0596 0.0473 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 1.87e-01 -0.158 0.119 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -900374 sc-eQTL 6.71e-01 0.0489 0.115 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -600233 sc-eQTL 8.20e-01 0.0212 0.0931 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 284723 sc-eQTL 9.43e-01 0.0065 0.0904 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -850494 sc-eQTL 2.28e-01 -0.142 0.117 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -901604 sc-eQTL 9.28e-01 0.00433 0.0481 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 777498 sc-eQTL 1.55e-01 0.142 0.0992 0.168 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118523 CCN2 -38407 pQTL 0.0398 0.0533 0.0259 0.0 0.0 0.194

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118520 \N 339821 6.09e-07 5.74e-07 7.45e-08 2.96e-07 9.82e-08 7.75e-08 3.33e-07 5.82e-08 2.6e-07 1.03e-07 4.39e-07 1.2e-07 4.74e-07 9.15e-08 6.12e-08 1.1e-07 1.01e-07 2.56e-07 7.76e-08 6.03e-08 1.34e-07 2.24e-07 2.11e-07 3.07e-08 5.15e-07 1.86e-07 1.48e-07 1.28e-07 1.36e-07 1.58e-07 1.86e-07 3.59e-08 3.65e-08 9.81e-08 1.56e-07 3.14e-08 7.52e-08 8.17e-08 4.9e-08 3.6e-08 5.44e-08 3.85e-07 3.14e-08 1.65e-07 3.84e-08 9.65e-09 1.2e-07 1.88e-09 4.9e-08
ENSG00000154269 \N 284523 9.47e-07 8.9e-07 9.89e-08 4.36e-07 1.03e-07 1.54e-07 5.28e-07 8.11e-08 4.74e-07 1.65e-07 9.46e-07 1.82e-07 9.37e-07 1.52e-07 1.24e-07 1.92e-07 3.69e-07 3.67e-07 1.7e-07 7.54e-08 1.91e-07 3.65e-07 3.19e-07 3.83e-08 1.16e-06 2.39e-07 2.52e-07 1.77e-07 2.57e-07 3.39e-07 3.43e-07 4.58e-08 5.17e-08 1.16e-07 3.34e-07 3.24e-08 1.07e-07 5.8e-08 6.29e-08 7.04e-08 6.14e-08 7.53e-07 2.99e-08 2.07e-07 3.55e-08 1.37e-08 7e-08 2.07e-09 4.81e-08
ENSG00000228495 \N -218950 1.26e-06 1.08e-06 3.08e-07 6.49e-07 1.05e-07 3.36e-07 9.74e-07 2.06e-07 1.11e-06 3.17e-07 1.38e-06 4.21e-07 1.95e-06 2.54e-07 3.72e-07 4.91e-07 8.28e-07 5.67e-07 3.98e-07 1.78e-07 2.53e-07 8.66e-07 6.26e-07 1.73e-07 2.1e-06 2.54e-07 6.38e-07 3.95e-07 7e-07 8.5e-07 5.62e-07 6.31e-08 4.83e-08 2.31e-07 4.17e-07 7.86e-08 3.37e-07 1.07e-07 1.33e-07 2.56e-08 3.6e-08 1.49e-06 5.6e-08 1.99e-07 8.43e-08 4.33e-08 8.01e-08 7.14e-09 4.82e-08