logo

Genes within 1Mb (chr6:131904561:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 8.23e-01 0.0184 0.0823 0.194 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -496914 sc-eQTL 5.28e-01 0.0758 0.12 0.194 B L1
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 7.19e-01 0.0163 0.0453 0.194 B L1
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 3.93e-01 0.0772 0.0901 0.194 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 2.84e-01 0.0912 0.0849 0.194 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 2.52e-01 0.0589 0.0513 0.194 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 1.07e-01 0.172 0.106 0.194 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 7.05e-01 -0.041 0.108 0.194 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -227327 sc-eQTL 7.25e-03 0.189 0.0699 0.194 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0997 0.107 0.194 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0346 0.0874 0.194 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0138 0.0694 0.194 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 6.92e-01 -0.03 0.0757 0.194 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 5.15e-01 0.0336 0.0514 0.194 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 3.95e-01 0.0792 0.093 0.194 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 1.77e-01 -0.14 0.104 0.194 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 8.25e-01 0.0192 0.0863 0.194 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 5.62e-01 0.0494 0.085 0.194 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0657 0.101 0.194 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 1.88e-01 0.0453 0.0343 0.194 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 6.08e-02 0.181 0.0961 0.194 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00952 0.104 0.194 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0274 0.0914 0.185 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0599 0.0806 0.185 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -830204 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00218 0.1 0.185 DC L1
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 3.52e-01 -0.109 0.117 0.185 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -809494 sc-eQTL 8.26e-01 0.0238 0.108 0.185 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 3.63e-01 0.105 0.115 0.185 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0424 0.0647 0.185 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 8.90e-01 -0.016 0.115 0.185 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0568 0.102 0.185 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 2.92e-01 -0.104 0.0988 0.194 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 2.23e-01 0.0719 0.0588 0.194 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -830204 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0138 0.101 0.194 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 9.69e-01 0.00375 0.0963 0.194 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -809494 sc-eQTL 2.93e-01 -0.115 0.109 0.194 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 4.84e-02 -0.151 0.0763 0.194 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000507 0.0461 0.194 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 8.53e-01 0.0177 0.0956 0.194 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0692 0.0911 0.194 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0164 0.0885 0.193 NK L1
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 6.65e-01 0.0351 0.0809 0.193 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 1.52e-01 -0.158 0.11 0.193 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0283 0.0456 0.193 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 1.26e-01 0.148 0.0963 0.193 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 1.63e-01 -0.138 0.0989 0.194 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 7.42e-02 -0.16 0.0892 0.194 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 7.66e-01 0.0334 0.112 0.194 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 5.46e-01 0.0657 0.109 0.194 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 8.88e-01 0.00605 0.0431 0.194 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 3.50e-01 0.0916 0.0979 0.194 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0641 0.118 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00931 0.111 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -496914 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0251 0.126 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 2.24e-01 -0.144 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 9.03e-02 0.222 0.13 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0857 0.126 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0397 0.0675 0.184 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0633 0.131 0.184 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 5.36e-01 0.0733 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -227327 sc-eQTL 7.18e-01 0.0408 0.113 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 9.16e-01 0.0123 0.117 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -496914 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0704 0.114 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 9.80e-01 0.00188 0.0744 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 2.13e-01 0.141 0.113 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 4.68e-01 0.0813 0.112 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 6.29e-01 0.0331 0.0685 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 2.59e-01 0.13 0.115 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 2.31e-01 -0.148 0.123 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -227327 sc-eQTL 2.17e-01 0.13 0.105 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 3.61e-02 0.231 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -496914 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0485 0.115 0.192 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 5.91e-01 0.0485 0.0901 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 4.78e-01 0.0823 0.116 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 2.99e-01 -0.122 0.118 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 3.02e-01 0.0586 0.0567 0.192 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 4.96e-02 0.237 0.12 0.192 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 2.57e-01 -0.134 0.118 0.192 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -227327 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 2.30e-01 -0.11 0.0915 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -496914 sc-eQTL 7.50e-01 0.0398 0.125 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 2.20e-01 0.0669 0.0543 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 4.49e-01 0.074 0.0976 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 9.65e-02 0.176 0.105 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 7.72e-01 0.0175 0.0603 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 4.69e-01 0.0887 0.122 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 5.37e-01 -0.072 0.116 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -227327 sc-eQTL 1.30e-01 0.117 0.0767 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0336 0.103 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -496914 sc-eQTL 8.34e-01 0.0245 0.117 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 5.46e-01 0.0385 0.0636 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000607 0.118 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0552 0.117 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0459 0.0618 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 8.41e-01 0.0248 0.124 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0219 0.118 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -227327 sc-eQTL 3.56e-01 0.0756 0.0817 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0279 0.0993 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 2.17e-01 0.151 0.122 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 5.26e-01 0.0809 0.127 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 7.16e-01 -0.045 0.124 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0207 0.0571 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 9.37e-01 0.00973 0.122 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 3.58e-01 -0.106 0.115 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0451 0.111 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 2.81e-01 -0.102 0.0943 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 5.62e-01 0.0469 0.0806 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0356 0.0875 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00197 0.0568 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 3.21e-01 0.105 0.105 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0844 0.109 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 2.91e-01 -0.12 0.114 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0176 0.104 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0607 0.0874 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 8.14e-01 0.0242 0.103 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 6.25e-01 0.0261 0.0531 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0362 0.102 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0929 0.123 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00591 0.12 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0121 0.12 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 1.41e-01 -0.163 0.11 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 4.41e-01 0.0888 0.115 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 7.35e-01 0.016 0.0472 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 9.26e-01 0.0114 0.121 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 2.35e-01 -0.139 0.117 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 4.97e-01 0.0675 0.0991 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 3.14e-01 0.102 0.101 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 3.17e-01 -0.113 0.112 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00706 0.0603 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 5.56e-01 0.067 0.114 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 1.85e-01 -0.155 0.116 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00219 0.12 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 8.41e-01 0.0194 0.0966 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0207 0.104 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 1.66e-01 0.082 0.0591 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 7.16e-02 0.196 0.108 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0961 0.119 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0523 0.12 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 2.01e-01 -0.154 0.12 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 5.16e-01 0.0776 0.119 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0505 0.0581 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 9.74e-01 0.0043 0.13 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0291 0.128 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 3.76e-01 -0.113 0.128 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 8.14e-01 0.029 0.123 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 4.27e-01 0.101 0.127 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 1.73e-01 0.0931 0.0681 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 3.28e-01 0.122 0.125 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 5.17e-01 0.0838 0.129 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 7.47e-01 0.0369 0.115 0.193 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 5.92e-01 0.0639 0.119 0.193 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 3.16e-01 0.125 0.125 0.193 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 7.32e-01 0.0416 0.121 0.193 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00699 0.0597 0.193 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0331 0.123 0.193 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 8.73e-01 0.0199 0.125 0.193 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0269 0.123 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 1.14e-01 0.205 0.129 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0673 0.125 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00163 0.0696 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 3.30e-01 0.123 0.126 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 9.70e-01 0.00362 0.095 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00394 0.0976 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 2.32e-01 -0.142 0.118 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 8.58e-01 -0.00847 0.0471 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 2.27e-01 0.125 0.103 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 9.64e-01 0.0054 0.119 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 5.02e-02 -0.236 0.12 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0878 0.121 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0708 0.0561 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 6.07e-01 0.0644 0.125 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 3.19e-01 0.103 0.103 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0499 0.107 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00456 0.117 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0475 0.0632 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 4.12e-01 0.089 0.108 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0242 0.15 0.207 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -496914 sc-eQTL 5.54e-01 0.0738 0.124 0.207 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 5.25e-01 0.0661 0.104 0.207 PB L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 6.02e-01 0.0739 0.141 0.207 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 5.95e-02 -0.238 0.125 0.207 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 2.79e-01 0.078 0.0717 0.207 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 7.62e-02 0.243 0.136 0.207 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0745 0.135 0.207 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -227327 sc-eQTL 3.93e-01 0.0759 0.0885 0.207 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0668 0.104 0.193 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 1.17e-01 -0.168 0.107 0.193 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 2.68e-01 -0.134 0.12 0.193 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 6.04e-01 0.0598 0.115 0.193 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0421 0.0435 0.193 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 4.57e-01 0.0771 0.103 0.193 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0679 0.113 0.193 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 6.69e-01 0.0501 0.117 0.194 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 3.97e-01 0.0991 0.117 0.194 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 3.71e-01 -0.108 0.12 0.194 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 1.16e-01 -0.154 0.0978 0.194 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 9.52e-02 0.0724 0.0432 0.194 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 2.21e-01 -0.127 0.103 0.194 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0826 0.123 0.194 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00265 0.103 0.183 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0242 0.102 0.183 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -830204 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0625 0.101 0.183 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 2.99e-01 -0.137 0.132 0.183 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -809494 sc-eQTL 6.33e-01 0.0571 0.119 0.183 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 9.57e-01 0.00627 0.116 0.183 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0369 0.0573 0.183 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 5.12e-01 -0.084 0.128 0.183 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 2.51e-01 -0.13 0.113 0.183 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0629 0.108 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 2.31e-01 0.0912 0.076 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -830204 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0367 0.108 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 9.31e-01 0.00928 0.106 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -809494 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0949 0.108 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 8.03e-02 -0.152 0.0863 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000438 0.0483 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0111 0.104 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 7.39e-01 0.0311 0.0931 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 7.82e-01 0.0314 0.113 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 3.77e-01 0.0733 0.0828 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -830204 sc-eQTL 9.45e-01 0.00713 0.104 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 7.31e-01 0.0387 0.112 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -809494 sc-eQTL 1.17e-01 -0.176 0.112 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 3.59e-02 -0.154 0.0729 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 5.33e-01 0.0331 0.053 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 6.71e-01 0.0469 0.11 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 3.03e-02 -0.212 0.0971 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 2.86e-02 -0.297 0.134 0.179 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0104 0.143 0.179 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 4.23e-01 -0.123 0.153 0.179 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 2.13e-01 0.197 0.157 0.179 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0306 0.0602 0.179 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 1.60e-01 0.225 0.159 0.179 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0798 0.156 0.179 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0694 0.114 0.193 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 3.05e-01 0.113 0.11 0.193 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -830204 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0674 0.112 0.193 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 2.35e-01 0.145 0.122 0.193 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -809494 sc-eQTL 3.05e-01 -0.113 0.11 0.193 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 7.31e-02 -0.201 0.111 0.193 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000572 0.0488 0.193 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0568 0.12 0.193 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 7.87e-01 0.0321 0.119 0.193 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 2.03e-01 -0.139 0.109 0.19 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00529 0.0832 0.19 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -830204 sc-eQTL 3.03e-02 -0.253 0.116 0.19 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0998 0.119 0.19 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -809494 sc-eQTL 4.16e-01 0.0947 0.116 0.19 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 1.21e-01 -0.173 0.111 0.19 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 4.87e-01 0.0391 0.0561 0.19 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 6.38e-01 0.0544 0.115 0.19 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 5.59e-01 0.0581 0.0992 0.19 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0493 0.134 0.186 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 6.07e-01 0.0496 0.0963 0.186 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -830204 sc-eQTL 2.36e-01 0.115 0.0966 0.186 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0806 0.135 0.186 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -809494 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0425 0.0987 0.186 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 4.70e-01 0.085 0.117 0.186 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 7.72e-01 0.0235 0.0809 0.186 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 8.76e-01 0.0173 0.11 0.186 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0573 0.12 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 2.16e-01 0.131 0.106 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -496914 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0392 0.12 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00395 0.0682 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 1.54e-01 0.149 0.104 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0141 0.108 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 4.11e-01 0.0506 0.0613 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 9.07e-02 0.179 0.105 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 2.09e-01 -0.142 0.112 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -227327 sc-eQTL 3.58e-01 0.1 0.109 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0973 0.0871 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -496914 sc-eQTL 8.33e-01 0.0265 0.125 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 1.66e-01 0.0713 0.0512 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 5.05e-01 0.0644 0.0965 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 4.80e-01 0.0707 0.0998 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0147 0.0604 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 4.37e-01 0.0946 0.122 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0669 0.114 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -227327 sc-eQTL 6.66e-02 0.133 0.0719 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0384 0.104 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 1.96e-01 0.0825 0.0636 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -830204 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00106 0.104 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 8.68e-01 0.0167 0.1 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -809494 sc-eQTL 2.33e-01 -0.129 0.108 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 4.86e-02 -0.141 0.0711 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 7.48e-01 0.0158 0.0492 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 8.84e-01 0.0143 0.0982 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0811 0.0874 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 841239 sc-eQTL 4.04e-01 -0.091 0.109 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 9.72e-01 0.00274 0.0774 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -830204 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0797 0.114 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00137 0.111 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -809494 sc-eQTL 6.82e-01 0.0463 0.113 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 2.21e-01 -0.13 0.106 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 5.93e-01 0.0241 0.0451 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 3.66e-01 -0.103 0.114 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -908778 sc-eQTL 6.82e-01 0.045 0.11 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -608637 sc-eQTL 8.87e-01 0.0127 0.089 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 276319 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0147 0.0864 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -858898 sc-eQTL 2.53e-01 -0.129 0.112 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -910008 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0282 0.0459 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 769094 sc-eQTL 1.74e-01 0.13 0.0949 0.194 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118523 CCN2 -46811 pQTL 0.00533 0.069 0.0247 0.0 0.0 0.219

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118520 \N 331417 1.25e-06 9.2e-07 3.32e-07 1.32e-06 1.77e-07 4.53e-07 1.07e-06 3.49e-07 1.28e-06 4.19e-07 1.38e-06 5.86e-07 1.62e-06 3.07e-07 5.56e-07 8.19e-07 7.77e-07 6.21e-07 5.88e-07 6.76e-07 6.12e-07 1.08e-06 8.76e-07 5.1e-07 1.88e-06 3.91e-07 8.73e-07 9.36e-07 9.65e-07 1.06e-06 6.52e-07 1.3e-07 2.31e-07 4.83e-07 5.9e-07 4.47e-07 6.17e-07 1.47e-07 4.18e-07 2.8e-07 2.76e-07 1.54e-06 9.66e-08 4.13e-08 1.67e-07 1.3e-07 2.34e-07 5.92e-08 1.86e-07
ENSG00000228495 \N -227354 2.08e-06 2.61e-06 3.29e-07 1.94e-06 4.7e-07 8e-07 1.3e-06 5.97e-07 1.8e-06 8.83e-07 2.05e-06 1.29e-06 3.08e-06 1.43e-06 8.54e-07 1.69e-06 1.04e-06 2.12e-06 6.34e-07 1.13e-06 1.07e-06 2.07e-06 2.12e-06 9.74e-07 2.82e-06 1.22e-06 1.31e-06 1.84e-06 1.67e-06 1.66e-06 1.64e-06 2.51e-07 4.61e-07 8.98e-07 1.35e-06 9.66e-07 7.95e-07 3.84e-07 1.07e-06 3.63e-07 2.88e-07 2.78e-06 6.14e-07 1.99e-07 2.94e-07 3.31e-07 5.64e-07 2.47e-07 1.63e-07