logo

Genes within 1Mb (chr6:131853789:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 7.96e-02 0.173 0.0982 0.1 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -547686 sc-eQTL 2.75e-01 0.158 0.144 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00714 0.0544 0.1 B L1
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 2.62e-01 0.122 0.108 0.1 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 6.82e-01 0.0419 0.102 0.1 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 6.20e-01 0.0307 0.0618 0.1 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 2.38e-01 0.152 0.128 0.1 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 3.02e-01 -0.134 0.13 0.1 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -278099 sc-eQTL 1.80e-02 0.201 0.0843 0.1 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0582 0.128 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0386 0.104 0.1 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00365 0.0827 0.1 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0169 0.0902 0.1 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0347 0.0613 0.1 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0192 0.111 0.1 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0412 0.124 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 2.69e-02 -0.234 0.105 0.1 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 7.94e-02 -0.183 0.104 0.1 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 6.80e-02 -0.225 0.123 0.1 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 2.10e-01 -0.053 0.0422 0.1 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 1.64e-01 -0.165 0.118 0.1 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 4.10e-01 -0.106 0.128 0.1 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 9.92e-01 0.00105 0.106 0.099 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00532 0.0933 0.099 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -880976 sc-eQTL 5.17e-01 0.075 0.116 0.099 DC L1
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 8.10e-01 0.0327 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -860266 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.125 0.099 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0103 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 9.03e-01 0.00918 0.0749 0.099 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0603 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0604 0.118 0.099 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 3.58e-01 -0.109 0.118 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 4.79e-01 0.05 0.0705 0.1 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -880976 sc-eQTL 6.76e-01 0.0507 0.121 0.1 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0877 0.115 0.1 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -860266 sc-eQTL 4.78e-01 0.0924 0.13 0.1 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0844 0.0918 0.1 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0855 0.0548 0.1 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 2.52e-01 -0.131 0.114 0.1 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 9.69e-01 0.00424 0.109 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 1.90e-01 0.145 0.111 0.101 NK L1
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 9.16e-01 0.0108 0.102 0.101 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 3.29e-01 -0.135 0.138 0.101 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0733 0.057 0.101 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 7.17e-01 0.0442 0.122 0.101 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 2.72e-02 -0.268 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0027 0.11 0.1 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0382 0.138 0.1 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 3.74e-01 -0.119 0.133 0.1 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0653 0.0527 0.1 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 9.58e-02 -0.241 0.144 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 1.06e-01 -0.204 0.125 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547686 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0435 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 1.34e-02 0.329 0.132 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 6.46e-01 0.0684 0.149 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0702 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 7.17e-01 0.0278 0.0765 0.107 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 3.87e-01 0.128 0.148 0.107 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0868 0.134 0.107 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278099 sc-eQTL 4.59e-01 0.0947 0.128 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 9.99e-02 0.221 0.134 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547686 sc-eQTL 1.75e-01 0.176 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0673 0.085 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 5.22e-01 0.083 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 5.06e-01 0.0852 0.128 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0156 0.0785 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 3.71e-01 0.118 0.131 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 9.52e-01 0.00848 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278099 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00144 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 8.62e-02 0.215 0.125 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547686 sc-eQTL 3.03e-02 0.281 0.129 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 2.51e-01 -0.117 0.102 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 1.63e-02 -0.314 0.13 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 2.43e-01 0.156 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0165 0.0644 0.099 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 3.36e-01 -0.132 0.137 0.099 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 7.06e-02 -0.242 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278099 sc-eQTL 6.14e-02 0.234 0.124 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 5.85e-02 0.207 0.109 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547686 sc-eQTL 7.90e-01 0.0398 0.149 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 9.73e-01 0.00224 0.0652 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 3.60e-01 0.107 0.117 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 1.48e-01 0.183 0.126 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0524 0.072 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 3.12e-01 0.148 0.146 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 9.25e-01 0.0131 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278099 sc-eQTL 1.71e-01 0.126 0.0918 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 3.13e-01 0.126 0.125 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547686 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0249 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0759 0.077 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 4.42e-01 0.11 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0954 0.141 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0169 0.075 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 6.67e-01 0.0645 0.15 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00335 0.143 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278099 sc-eQTL 2.98e-02 0.215 0.0981 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 3.11e-01 0.12 0.118 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0246 0.146 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 6.05e-01 0.0786 0.152 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 7.78e-01 0.0415 0.147 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0532 0.068 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 1.49e-01 -0.21 0.145 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0279 0.137 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 2.08e-01 -0.168 0.133 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 3.51e-01 -0.106 0.113 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 2.90e-01 -0.102 0.0963 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 7.62e-01 0.0317 0.105 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 8.97e-01 0.00878 0.068 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0268 0.126 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0215 0.131 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 5.49e-01 0.0814 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 8.73e-01 0.0198 0.124 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 9.95e-01 0.000648 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0607 0.122 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0732 0.0632 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 9.37e-01 0.00955 0.121 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0759 0.147 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0722 0.142 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 3.12e-01 -0.144 0.142 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0189 0.131 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0141 0.137 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0769 0.0558 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 9.93e-01 0.00119 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 7.54e-01 0.0436 0.139 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 3.09e-02 -0.25 0.115 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00288 0.119 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 3.09e-01 -0.135 0.132 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 2.22e-02 -0.161 0.07 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 7.83e-01 0.0368 0.134 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 2.90e-01 -0.145 0.137 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 8.40e-01 0.0295 0.146 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 6.71e-02 -0.214 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 7.28e-02 -0.225 0.125 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0175 0.072 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 4.20e-01 -0.107 0.132 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 6.74e-01 0.0607 0.144 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 6.46e-02 -0.263 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 7.83e-02 0.252 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 7.68e-01 0.0418 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 3.78e-01 0.0609 0.069 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 5.59e-02 -0.293 0.152 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 1.08e-01 -0.243 0.15 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 3.84e-03 -0.422 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0618 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0708 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0658 0.0786 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 2.53e-01 -0.164 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 4.17e-01 -0.121 0.149 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 3.08e-01 -0.134 0.131 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0732 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 3.26e-01 -0.141 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0635 0.139 0.1 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0595 0.0684 0.1 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 1.74e-01 -0.192 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0807 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0908 0.141 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 8.10e-01 -0.036 0.149 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0221 0.143 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 6.50e-01 0.0362 0.0798 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 8.84e-01 0.0211 0.145 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 5.31e-01 0.0741 0.118 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0889 0.121 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0942 0.148 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0887 0.0584 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 4.49e-01 0.0978 0.129 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 5.26e-01 -0.09 0.142 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 3.27e-01 0.141 0.143 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0272 0.144 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 5.34e-01 0.0417 0.0669 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 9.01e-01 0.0185 0.149 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00864 0.125 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 4.64e-01 0.0944 0.129 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 4.46e-01 -0.107 0.14 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 3.16e-01 0.0762 0.0759 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 6.51e-01 0.0588 0.13 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 4.90e-01 0.123 0.177 0.111 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547686 sc-eQTL 2.28e-01 0.177 0.146 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0812 0.123 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 5.95e-01 0.089 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 2.28e-01 -0.181 0.149 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 2.27e-02 0.193 0.0834 0.111 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0461 0.163 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 1.09e-01 -0.255 0.158 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278099 sc-eQTL 1.58e-01 -0.148 0.104 0.111 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 1.32e-01 -0.192 0.127 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 7.59e-01 0.0406 0.132 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 5.01e-01 -0.1 0.149 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0622 0.142 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0197 0.0536 0.096 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 1.31e-01 0.192 0.127 0.096 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0176 0.139 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 2.33e-01 -0.165 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 6.46e-01 0.0635 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0343 0.142 0.1 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 6.23e-01 0.0573 0.116 0.1 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0352 0.0514 0.1 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 8.95e-02 -0.208 0.122 0.1 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0217 0.145 0.1 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 8.77e-01 0.0189 0.122 0.095 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 5.18e-01 0.0788 0.122 0.095 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -880976 sc-eQTL 4.01e-01 -0.102 0.121 0.095 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 7.37e-01 0.0528 0.157 0.095 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -860266 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000267 0.142 0.095 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 3.83e-01 0.121 0.138 0.095 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 7.10e-01 0.0255 0.0684 0.095 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00222 0.153 0.095 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 5.98e-01 0.0715 0.136 0.095 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 4.06e-01 -0.107 0.128 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 2.84e-01 0.0968 0.0902 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -880976 sc-eQTL 7.53e-01 0.0402 0.128 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 3.81e-01 -0.111 0.126 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -860266 sc-eQTL 3.14e-01 0.13 0.129 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0957 0.103 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0936 0.0569 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0193 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0589 0.11 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 1.06e-01 -0.215 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 9.72e-01 0.00344 0.0976 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -880976 sc-eQTL 1.63e-01 0.17 0.121 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 5.63e-01 0.0766 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -860266 sc-eQTL 3.61e-01 0.121 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0512 0.0866 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0622 0.0623 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0677 0.129 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 5.26e-01 0.0734 0.115 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 9.89e-01 0.00199 0.151 0.109 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 1.13e-01 -0.25 0.156 0.109 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 2.36e-01 0.201 0.168 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0261 0.174 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0791 0.0661 0.109 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 1.55e-01 0.25 0.175 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0082 0.172 0.109 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0103 0.136 0.102 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 3.88e-01 0.114 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -880976 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0197 0.133 0.102 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 4.03e-01 -0.122 0.146 0.102 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -860266 sc-eQTL 8.27e-01 0.0287 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 9.84e-01 0.00271 0.134 0.102 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0158 0.0582 0.102 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 3.80e-02 -0.295 0.141 0.102 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 8.10e-01 -0.034 0.142 0.102 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 6.45e-01 0.0591 0.128 0.1 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0824 0.0974 0.1 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -880976 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0807 0.138 0.1 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0546 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -860266 sc-eQTL 7.77e-01 0.0387 0.137 0.1 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 4.26e-01 -0.105 0.131 0.1 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 1.05e-01 0.106 0.0655 0.1 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 5.40e-01 0.083 0.135 0.1 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 8.54e-01 0.0214 0.116 0.1 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 3.99e-01 0.138 0.163 0.093 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0221 0.118 0.093 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -880976 sc-eQTL 4.83e-02 0.233 0.117 0.093 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 2.94e-01 0.173 0.165 0.093 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -860266 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0464 0.12 0.093 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 4.30e-01 -0.113 0.143 0.093 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 5.42e-01 0.0603 0.0987 0.093 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 5.49e-02 -0.258 0.133 0.093 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 5.37e-01 0.0904 0.146 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 7.46e-01 0.0399 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -547686 sc-eQTL 4.56e-02 0.277 0.138 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 8.70e-01 -0.013 0.0788 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0159 0.121 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 3.80e-01 0.109 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0561 0.0709 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 7.75e-01 0.035 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 1.93e-01 -0.169 0.13 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -278099 sc-eQTL 2.25e-01 0.153 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 1.65e-02 0.248 0.102 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -547686 sc-eQTL 9.41e-01 0.011 0.149 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0326 0.0612 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 1.36e-01 0.171 0.114 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 4.47e-01 0.0905 0.119 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0391 0.0718 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 6.03e-01 0.0754 0.145 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 6.06e-01 0.0701 0.136 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -278099 sc-eQTL 2.82e-02 0.188 0.0852 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 1.27e-01 -0.189 0.123 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 4.54e-01 0.0569 0.0759 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -880976 sc-eQTL 5.42e-01 0.0757 0.124 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0395 0.119 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -860266 sc-eQTL 3.57e-01 0.119 0.129 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0947 0.0852 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0911 0.0583 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0763 0.117 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00127 0.104 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 790467 sc-eQTL 8.18e-01 0.0299 0.13 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00408 0.0924 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -880976 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0703 0.136 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 3.15e-01 -0.133 0.132 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -860266 sc-eQTL 8.06e-01 0.0331 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0643 0.127 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 5.88e-01 0.0292 0.0538 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 1.83e-01 -0.181 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -959550 sc-eQTL 8.63e-01 0.0226 0.131 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659409 sc-eQTL 1.93e-01 0.147 0.112 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225547 sc-eQTL 8.90e-01 0.0152 0.109 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -909670 sc-eQTL 3.11e-01 -0.144 0.142 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -960780 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0738 0.0579 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 718322 sc-eQTL 8.49e-01 0.0229 0.121 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -860266 eQTL 0.00599 -0.0995 0.0361 0.0 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N -547686 3.92e-07 4.24e-07 9.89e-08 3.57e-07 1.1e-07 1.54e-07 3.33e-07 8.11e-08 2.56e-07 1.65e-07 3.66e-07 2.28e-07 4.54e-07 8.85e-08 2.57e-07 1.75e-07 9.53e-08 2.66e-07 1.62e-07 8.41e-08 1.33e-07 2.3e-07 2.04e-07 6.65e-08 4.54e-07 2.46e-07 1.87e-07 2.13e-07 1.76e-07 3.52e-07 1.93e-07 4.77e-08 5.64e-08 1.02e-07 1.67e-07 5.14e-08 1.02e-07 7.92e-08 5.77e-08 2.59e-08 5.04e-08 3.43e-07 3.18e-08 1.27e-08 3.2e-08 9.86e-09 9.26e-08 0.0 4.97e-08