logo

Genes within 1Mb (chr6:131853490:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 7.96e-02 0.173 0.0982 0.1 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -547985 sc-eQTL 2.75e-01 0.158 0.144 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00714 0.0544 0.1 B L1
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 2.62e-01 0.122 0.108 0.1 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 6.82e-01 0.0419 0.102 0.1 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 6.20e-01 0.0307 0.0618 0.1 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 2.38e-01 0.152 0.128 0.1 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 3.02e-01 -0.134 0.13 0.1 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -278398 sc-eQTL 1.80e-02 0.201 0.0843 0.1 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0582 0.128 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0386 0.104 0.1 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00365 0.0827 0.1 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0169 0.0902 0.1 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0347 0.0613 0.1 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0192 0.111 0.1 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0412 0.124 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 2.69e-02 -0.234 0.105 0.1 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 7.94e-02 -0.183 0.104 0.1 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 6.80e-02 -0.225 0.123 0.1 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 2.10e-01 -0.053 0.0422 0.1 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 1.64e-01 -0.165 0.118 0.1 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 4.10e-01 -0.106 0.128 0.1 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 9.92e-01 0.00105 0.106 0.099 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00532 0.0933 0.099 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -881275 sc-eQTL 5.17e-01 0.075 0.116 0.099 DC L1
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 8.10e-01 0.0327 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -860565 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.125 0.099 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0103 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 9.03e-01 0.00918 0.0749 0.099 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0603 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0604 0.118 0.099 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 3.58e-01 -0.109 0.118 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 4.79e-01 0.05 0.0705 0.1 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -881275 sc-eQTL 6.76e-01 0.0507 0.121 0.1 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0877 0.115 0.1 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -860565 sc-eQTL 4.78e-01 0.0924 0.13 0.1 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0844 0.0918 0.1 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0855 0.0548 0.1 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 2.52e-01 -0.131 0.114 0.1 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 9.69e-01 0.00424 0.109 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 1.90e-01 0.145 0.111 0.101 NK L1
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 9.16e-01 0.0108 0.102 0.101 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 3.29e-01 -0.135 0.138 0.101 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0733 0.057 0.101 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 7.17e-01 0.0442 0.122 0.101 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 2.72e-02 -0.268 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0027 0.11 0.1 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0382 0.138 0.1 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 3.74e-01 -0.119 0.133 0.1 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0653 0.0527 0.1 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 9.58e-02 -0.241 0.144 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 1.06e-01 -0.204 0.125 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547985 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0435 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 1.34e-02 0.329 0.132 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 6.46e-01 0.0684 0.149 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0702 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 7.17e-01 0.0278 0.0765 0.107 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 3.87e-01 0.128 0.148 0.107 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0868 0.134 0.107 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278398 sc-eQTL 4.59e-01 0.0947 0.128 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 9.99e-02 0.221 0.134 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547985 sc-eQTL 1.75e-01 0.176 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0673 0.085 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 5.22e-01 0.083 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 5.06e-01 0.0852 0.128 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0156 0.0785 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 3.71e-01 0.118 0.131 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 9.52e-01 0.00848 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278398 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00144 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 8.62e-02 0.215 0.125 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547985 sc-eQTL 3.03e-02 0.281 0.129 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 2.51e-01 -0.117 0.102 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 1.63e-02 -0.314 0.13 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 2.43e-01 0.156 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0165 0.0644 0.099 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 3.36e-01 -0.132 0.137 0.099 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 7.06e-02 -0.242 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278398 sc-eQTL 6.14e-02 0.234 0.124 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 5.85e-02 0.207 0.109 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547985 sc-eQTL 7.90e-01 0.0398 0.149 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 9.73e-01 0.00224 0.0652 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 3.60e-01 0.107 0.117 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 1.48e-01 0.183 0.126 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0524 0.072 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 3.12e-01 0.148 0.146 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 9.25e-01 0.0131 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278398 sc-eQTL 1.71e-01 0.126 0.0918 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 3.13e-01 0.126 0.125 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547985 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0249 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0759 0.077 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 4.42e-01 0.11 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0954 0.141 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0169 0.075 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 6.67e-01 0.0645 0.15 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00335 0.143 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278398 sc-eQTL 2.98e-02 0.215 0.0981 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 3.11e-01 0.12 0.118 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0246 0.146 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 6.05e-01 0.0786 0.152 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 7.78e-01 0.0415 0.147 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0532 0.068 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 1.49e-01 -0.21 0.145 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0279 0.137 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 2.08e-01 -0.168 0.133 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 3.51e-01 -0.106 0.113 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 2.90e-01 -0.102 0.0963 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 7.62e-01 0.0317 0.105 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 8.97e-01 0.00878 0.068 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0268 0.126 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0215 0.131 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 5.49e-01 0.0814 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 8.73e-01 0.0198 0.124 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 9.95e-01 0.000648 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0607 0.122 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0732 0.0632 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 9.37e-01 0.00955 0.121 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0759 0.147 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0722 0.142 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 3.12e-01 -0.144 0.142 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0189 0.131 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0141 0.137 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0769 0.0558 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 9.93e-01 0.00119 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 7.54e-01 0.0436 0.139 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 3.09e-02 -0.25 0.115 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00288 0.119 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 3.09e-01 -0.135 0.132 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 2.22e-02 -0.161 0.07 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 7.83e-01 0.0368 0.134 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 2.90e-01 -0.145 0.137 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 8.40e-01 0.0295 0.146 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 6.71e-02 -0.214 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 7.28e-02 -0.225 0.125 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0175 0.072 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 4.20e-01 -0.107 0.132 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 6.74e-01 0.0607 0.144 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 6.46e-02 -0.263 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 7.83e-02 0.252 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 7.68e-01 0.0418 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 3.78e-01 0.0609 0.069 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 5.59e-02 -0.293 0.152 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 1.08e-01 -0.243 0.15 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 3.84e-03 -0.422 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0618 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0708 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0658 0.0786 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 2.53e-01 -0.164 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 4.17e-01 -0.121 0.149 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 3.08e-01 -0.134 0.131 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0732 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 3.26e-01 -0.141 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0635 0.139 0.1 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0595 0.0684 0.1 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 1.74e-01 -0.192 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0807 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0908 0.141 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 8.10e-01 -0.036 0.149 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0221 0.143 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 6.50e-01 0.0362 0.0798 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 8.84e-01 0.0211 0.145 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 5.31e-01 0.0741 0.118 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0889 0.121 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0942 0.148 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0887 0.0584 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 4.49e-01 0.0978 0.129 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 5.26e-01 -0.09 0.142 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 3.27e-01 0.141 0.143 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0272 0.144 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 5.34e-01 0.0417 0.0669 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 9.01e-01 0.0185 0.149 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00864 0.125 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 4.64e-01 0.0944 0.129 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 4.46e-01 -0.107 0.14 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 3.16e-01 0.0762 0.0759 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 6.51e-01 0.0588 0.13 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 4.90e-01 0.123 0.177 0.111 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -547985 sc-eQTL 2.28e-01 0.177 0.146 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0812 0.123 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 5.95e-01 0.089 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 2.28e-01 -0.181 0.149 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 2.27e-02 0.193 0.0834 0.111 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0461 0.163 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 1.09e-01 -0.255 0.158 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278398 sc-eQTL 1.58e-01 -0.148 0.104 0.111 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 1.32e-01 -0.192 0.127 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 7.59e-01 0.0406 0.132 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 5.01e-01 -0.1 0.149 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0622 0.142 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0197 0.0536 0.096 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 1.31e-01 0.192 0.127 0.096 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0176 0.139 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 2.33e-01 -0.165 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 6.46e-01 0.0635 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0343 0.142 0.1 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 6.23e-01 0.0573 0.116 0.1 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0352 0.0514 0.1 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 8.95e-02 -0.208 0.122 0.1 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0217 0.145 0.1 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 8.77e-01 0.0189 0.122 0.095 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 5.18e-01 0.0788 0.122 0.095 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -881275 sc-eQTL 4.01e-01 -0.102 0.121 0.095 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 7.37e-01 0.0528 0.157 0.095 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -860565 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000267 0.142 0.095 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 3.83e-01 0.121 0.138 0.095 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 7.10e-01 0.0255 0.0684 0.095 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00222 0.153 0.095 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 5.98e-01 0.0715 0.136 0.095 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 4.06e-01 -0.107 0.128 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 2.84e-01 0.0968 0.0902 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -881275 sc-eQTL 7.53e-01 0.0402 0.128 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 3.81e-01 -0.111 0.126 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -860565 sc-eQTL 3.14e-01 0.13 0.129 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0957 0.103 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0936 0.0569 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0193 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0589 0.11 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 1.06e-01 -0.215 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 9.72e-01 0.00344 0.0976 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -881275 sc-eQTL 1.63e-01 0.17 0.121 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 5.63e-01 0.0766 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -860565 sc-eQTL 3.61e-01 0.121 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0512 0.0866 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0622 0.0623 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0677 0.129 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 5.26e-01 0.0734 0.115 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 9.89e-01 0.00199 0.151 0.109 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 1.13e-01 -0.25 0.156 0.109 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 2.36e-01 0.201 0.168 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0261 0.174 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0791 0.0661 0.109 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 1.55e-01 0.25 0.175 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0082 0.172 0.109 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0103 0.136 0.102 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 3.88e-01 0.114 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -881275 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0197 0.133 0.102 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 4.03e-01 -0.122 0.146 0.102 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -860565 sc-eQTL 8.27e-01 0.0287 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 9.84e-01 0.00271 0.134 0.102 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0158 0.0582 0.102 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 3.80e-02 -0.295 0.141 0.102 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 8.10e-01 -0.034 0.142 0.102 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 6.45e-01 0.0591 0.128 0.1 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0824 0.0974 0.1 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -881275 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0807 0.138 0.1 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0546 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -860565 sc-eQTL 7.77e-01 0.0387 0.137 0.1 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 4.26e-01 -0.105 0.131 0.1 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 1.05e-01 0.106 0.0655 0.1 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 5.40e-01 0.083 0.135 0.1 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 8.54e-01 0.0214 0.116 0.1 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 3.99e-01 0.138 0.163 0.093 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0221 0.118 0.093 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -881275 sc-eQTL 4.83e-02 0.233 0.117 0.093 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 2.94e-01 0.173 0.165 0.093 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -860565 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0464 0.12 0.093 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 4.30e-01 -0.113 0.143 0.093 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 5.42e-01 0.0603 0.0987 0.093 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 5.49e-02 -0.258 0.133 0.093 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 5.37e-01 0.0904 0.146 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 7.46e-01 0.0399 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -547985 sc-eQTL 4.56e-02 0.277 0.138 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 8.70e-01 -0.013 0.0788 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0159 0.121 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 3.80e-01 0.109 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0561 0.0709 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 7.75e-01 0.035 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 1.93e-01 -0.169 0.13 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -278398 sc-eQTL 2.25e-01 0.153 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 1.65e-02 0.248 0.102 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -547985 sc-eQTL 9.41e-01 0.011 0.149 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0326 0.0612 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 1.36e-01 0.171 0.114 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 4.47e-01 0.0905 0.119 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0391 0.0718 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 6.03e-01 0.0754 0.145 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 6.06e-01 0.0701 0.136 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -278398 sc-eQTL 2.82e-02 0.188 0.0852 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 1.27e-01 -0.189 0.123 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 4.54e-01 0.0569 0.0759 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -881275 sc-eQTL 5.42e-01 0.0757 0.124 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0395 0.119 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -860565 sc-eQTL 3.57e-01 0.119 0.129 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0947 0.0852 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0911 0.0583 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0763 0.117 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00127 0.104 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 790168 sc-eQTL 8.18e-01 0.0299 0.13 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00408 0.0924 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -881275 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0703 0.136 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 3.15e-01 -0.133 0.132 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -860565 sc-eQTL 8.06e-01 0.0331 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0643 0.127 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 5.88e-01 0.0292 0.0538 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 1.83e-01 -0.181 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -959849 sc-eQTL 8.63e-01 0.0226 0.131 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659708 sc-eQTL 1.93e-01 0.147 0.112 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225248 sc-eQTL 8.90e-01 0.0152 0.109 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -909969 sc-eQTL 3.11e-01 -0.144 0.142 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -961079 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0738 0.0579 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 718023 sc-eQTL 8.49e-01 0.0229 0.121 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -860565 eQTL 0.00595 -0.0996 0.0361 0.0 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N -547985 1.34e-06 9.47e-07 3.12e-07 1.04e-06 2.71e-07 4.79e-07 1.28e-06 3.66e-07 1.39e-06 4.65e-07 1.56e-06 6.16e-07 2.02e-06 2.81e-07 5.28e-07 8.25e-07 8.13e-07 5.47e-07 7.73e-07 6.83e-07 6.56e-07 1.38e-06 9.01e-07 5.82e-07 2.05e-06 3.91e-07 8.73e-07 7.99e-07 1.15e-06 1.23e-06 6.29e-07 1.57e-07 2.61e-07 5.18e-07 5.82e-07 4.44e-07 6.1e-07 2.38e-07 3.76e-07 1.54e-07 2.98e-07 1.49e-06 1.68e-07 5.7e-08 1.86e-07 1.99e-07 2.14e-07 5.45e-08 1.23e-07