logo

Genes within 1Mb (chr6:131853289:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 7.96e-02 0.173 0.0982 0.1 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -548186 sc-eQTL 2.75e-01 0.158 0.144 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00714 0.0544 0.1 B L1
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 2.62e-01 0.122 0.108 0.1 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 6.82e-01 0.0419 0.102 0.1 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 6.20e-01 0.0307 0.0618 0.1 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 2.38e-01 0.152 0.128 0.1 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 3.02e-01 -0.134 0.13 0.1 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -278599 sc-eQTL 1.80e-02 0.201 0.0843 0.1 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0582 0.128 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0386 0.104 0.1 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00365 0.0827 0.1 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0169 0.0902 0.1 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0347 0.0613 0.1 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0192 0.111 0.1 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0412 0.124 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 2.69e-02 -0.234 0.105 0.1 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 7.94e-02 -0.183 0.104 0.1 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 6.80e-02 -0.225 0.123 0.1 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 2.10e-01 -0.053 0.0422 0.1 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 1.64e-01 -0.165 0.118 0.1 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 4.10e-01 -0.106 0.128 0.1 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 9.92e-01 0.00105 0.106 0.099 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00532 0.0933 0.099 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -881476 sc-eQTL 5.17e-01 0.075 0.116 0.099 DC L1
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 8.10e-01 0.0327 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -860766 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.125 0.099 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0103 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 9.03e-01 0.00918 0.0749 0.099 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0603 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0604 0.118 0.099 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 3.58e-01 -0.109 0.118 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 4.79e-01 0.05 0.0705 0.1 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -881476 sc-eQTL 6.76e-01 0.0507 0.121 0.1 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0877 0.115 0.1 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -860766 sc-eQTL 4.78e-01 0.0924 0.13 0.1 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0844 0.0918 0.1 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0855 0.0548 0.1 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 2.52e-01 -0.131 0.114 0.1 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 9.69e-01 0.00424 0.109 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 1.90e-01 0.145 0.111 0.101 NK L1
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 9.16e-01 0.0108 0.102 0.101 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 3.29e-01 -0.135 0.138 0.101 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0733 0.057 0.101 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 7.17e-01 0.0442 0.122 0.101 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 2.72e-02 -0.268 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0027 0.11 0.1 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0382 0.138 0.1 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 3.74e-01 -0.119 0.133 0.1 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0653 0.0527 0.1 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 9.58e-02 -0.241 0.144 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 1.06e-01 -0.204 0.125 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -548186 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0435 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 1.34e-02 0.329 0.132 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 6.46e-01 0.0684 0.149 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0702 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 7.17e-01 0.0278 0.0765 0.107 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 3.87e-01 0.128 0.148 0.107 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0868 0.134 0.107 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278599 sc-eQTL 4.59e-01 0.0947 0.128 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 9.99e-02 0.221 0.134 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -548186 sc-eQTL 1.75e-01 0.176 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0673 0.085 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 5.22e-01 0.083 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 5.06e-01 0.0852 0.128 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0156 0.0785 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 3.71e-01 0.118 0.131 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 9.52e-01 0.00848 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278599 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00144 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 8.62e-02 0.215 0.125 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -548186 sc-eQTL 3.03e-02 0.281 0.129 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 2.51e-01 -0.117 0.102 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 1.63e-02 -0.314 0.13 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 2.43e-01 0.156 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0165 0.0644 0.099 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 3.36e-01 -0.132 0.137 0.099 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 7.06e-02 -0.242 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278599 sc-eQTL 6.14e-02 0.234 0.124 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 5.85e-02 0.207 0.109 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -548186 sc-eQTL 7.90e-01 0.0398 0.149 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 9.73e-01 0.00224 0.0652 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 3.60e-01 0.107 0.117 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 1.48e-01 0.183 0.126 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0524 0.072 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 3.12e-01 0.148 0.146 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 9.25e-01 0.0131 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278599 sc-eQTL 1.71e-01 0.126 0.0918 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 3.13e-01 0.126 0.125 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -548186 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0249 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0759 0.077 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 4.42e-01 0.11 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0954 0.141 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0169 0.075 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 6.67e-01 0.0645 0.15 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00335 0.143 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278599 sc-eQTL 2.98e-02 0.215 0.0981 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 3.11e-01 0.12 0.118 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0246 0.146 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 6.05e-01 0.0786 0.152 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 7.78e-01 0.0415 0.147 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0532 0.068 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 1.49e-01 -0.21 0.145 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0279 0.137 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 2.08e-01 -0.168 0.133 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 3.51e-01 -0.106 0.113 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 2.90e-01 -0.102 0.0963 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 7.62e-01 0.0317 0.105 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 8.97e-01 0.00878 0.068 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0268 0.126 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0215 0.131 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 5.49e-01 0.0814 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 8.73e-01 0.0198 0.124 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 9.95e-01 0.000648 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0607 0.122 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0732 0.0632 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 9.37e-01 0.00955 0.121 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0759 0.147 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0722 0.142 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 3.12e-01 -0.144 0.142 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0189 0.131 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0141 0.137 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0769 0.0558 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 9.93e-01 0.00119 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 7.54e-01 0.0436 0.139 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 3.09e-02 -0.25 0.115 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00288 0.119 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 3.09e-01 -0.135 0.132 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 2.22e-02 -0.161 0.07 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 7.83e-01 0.0368 0.134 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 2.90e-01 -0.145 0.137 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 8.40e-01 0.0295 0.146 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 6.71e-02 -0.214 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 7.28e-02 -0.225 0.125 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0175 0.072 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 4.20e-01 -0.107 0.132 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 6.74e-01 0.0607 0.144 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 6.46e-02 -0.263 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 7.83e-02 0.252 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 7.68e-01 0.0418 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 3.78e-01 0.0609 0.069 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 5.59e-02 -0.293 0.152 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 1.08e-01 -0.243 0.15 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 3.84e-03 -0.422 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0618 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0708 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0658 0.0786 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 2.53e-01 -0.164 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 4.17e-01 -0.121 0.149 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 3.08e-01 -0.134 0.131 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0732 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 3.26e-01 -0.141 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0635 0.139 0.1 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0595 0.0684 0.1 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 1.74e-01 -0.192 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0807 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0908 0.141 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 8.10e-01 -0.036 0.149 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0221 0.143 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 6.50e-01 0.0362 0.0798 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 8.84e-01 0.0211 0.145 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 5.31e-01 0.0741 0.118 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0889 0.121 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0942 0.148 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0887 0.0584 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 4.49e-01 0.0978 0.129 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 5.26e-01 -0.09 0.142 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 3.27e-01 0.141 0.143 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0272 0.144 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 5.34e-01 0.0417 0.0669 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 9.01e-01 0.0185 0.149 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00864 0.125 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 4.64e-01 0.0944 0.129 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 4.46e-01 -0.107 0.14 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 3.16e-01 0.0762 0.0759 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 6.51e-01 0.0588 0.13 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 4.90e-01 0.123 0.177 0.111 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -548186 sc-eQTL 2.28e-01 0.177 0.146 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0812 0.123 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 5.95e-01 0.089 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 2.28e-01 -0.181 0.149 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 2.27e-02 0.193 0.0834 0.111 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0461 0.163 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 1.09e-01 -0.255 0.158 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -278599 sc-eQTL 1.58e-01 -0.148 0.104 0.111 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 1.32e-01 -0.192 0.127 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 7.59e-01 0.0406 0.132 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 5.01e-01 -0.1 0.149 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0622 0.142 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0197 0.0536 0.096 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 1.31e-01 0.192 0.127 0.096 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0176 0.139 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 2.33e-01 -0.165 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 6.46e-01 0.0635 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0343 0.142 0.1 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 6.23e-01 0.0573 0.116 0.1 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0352 0.0514 0.1 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 8.95e-02 -0.208 0.122 0.1 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0217 0.145 0.1 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 8.77e-01 0.0189 0.122 0.095 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 5.18e-01 0.0788 0.122 0.095 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -881476 sc-eQTL 4.01e-01 -0.102 0.121 0.095 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 7.37e-01 0.0528 0.157 0.095 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -860766 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000267 0.142 0.095 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 3.83e-01 0.121 0.138 0.095 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 7.10e-01 0.0255 0.0684 0.095 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00222 0.153 0.095 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 5.98e-01 0.0715 0.136 0.095 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 4.06e-01 -0.107 0.128 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 2.84e-01 0.0968 0.0902 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -881476 sc-eQTL 7.53e-01 0.0402 0.128 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 3.81e-01 -0.111 0.126 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -860766 sc-eQTL 3.14e-01 0.13 0.129 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0957 0.103 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0936 0.0569 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0193 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0589 0.11 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 1.06e-01 -0.215 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 9.72e-01 0.00344 0.0976 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -881476 sc-eQTL 1.63e-01 0.17 0.121 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 5.63e-01 0.0766 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -860766 sc-eQTL 3.61e-01 0.121 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0512 0.0866 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0622 0.0623 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0677 0.129 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 5.26e-01 0.0734 0.115 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 9.89e-01 0.00199 0.151 0.109 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 1.13e-01 -0.25 0.156 0.109 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 2.36e-01 0.201 0.168 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0261 0.174 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0791 0.0661 0.109 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 1.55e-01 0.25 0.175 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0082 0.172 0.109 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0103 0.136 0.102 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 3.88e-01 0.114 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -881476 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0197 0.133 0.102 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 4.03e-01 -0.122 0.146 0.102 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -860766 sc-eQTL 8.27e-01 0.0287 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 9.84e-01 0.00271 0.134 0.102 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0158 0.0582 0.102 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 3.80e-02 -0.295 0.141 0.102 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 8.10e-01 -0.034 0.142 0.102 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 6.45e-01 0.0591 0.128 0.1 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0824 0.0974 0.1 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -881476 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0807 0.138 0.1 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0546 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -860766 sc-eQTL 7.77e-01 0.0387 0.137 0.1 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 4.26e-01 -0.105 0.131 0.1 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 1.05e-01 0.106 0.0655 0.1 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 5.40e-01 0.083 0.135 0.1 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 8.54e-01 0.0214 0.116 0.1 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 3.99e-01 0.138 0.163 0.093 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0221 0.118 0.093 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -881476 sc-eQTL 4.83e-02 0.233 0.117 0.093 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 2.94e-01 0.173 0.165 0.093 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -860766 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0464 0.12 0.093 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 4.30e-01 -0.113 0.143 0.093 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 5.42e-01 0.0603 0.0987 0.093 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 5.49e-02 -0.258 0.133 0.093 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 5.37e-01 0.0904 0.146 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 7.46e-01 0.0399 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -548186 sc-eQTL 4.56e-02 0.277 0.138 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 8.70e-01 -0.013 0.0788 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0159 0.121 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 3.80e-01 0.109 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0561 0.0709 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 7.75e-01 0.035 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 1.93e-01 -0.169 0.13 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -278599 sc-eQTL 2.25e-01 0.153 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 1.65e-02 0.248 0.102 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -548186 sc-eQTL 9.41e-01 0.011 0.149 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0326 0.0612 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 1.36e-01 0.171 0.114 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 4.47e-01 0.0905 0.119 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0391 0.0718 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 6.03e-01 0.0754 0.145 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 6.06e-01 0.0701 0.136 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -278599 sc-eQTL 2.82e-02 0.188 0.0852 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 1.27e-01 -0.189 0.123 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 4.54e-01 0.0569 0.0759 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -881476 sc-eQTL 5.42e-01 0.0757 0.124 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0395 0.119 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -860766 sc-eQTL 3.57e-01 0.119 0.129 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0947 0.0852 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0911 0.0583 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0763 0.117 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00127 0.104 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 789967 sc-eQTL 8.18e-01 0.0299 0.13 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00408 0.0924 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -881476 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0703 0.136 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 3.15e-01 -0.133 0.132 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -860766 sc-eQTL 8.06e-01 0.0331 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0643 0.127 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 5.88e-01 0.0292 0.0538 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 1.83e-01 -0.181 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -960050 sc-eQTL 8.63e-01 0.0226 0.131 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -659909 sc-eQTL 1.93e-01 0.147 0.112 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 225047 sc-eQTL 8.90e-01 0.0152 0.109 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -910170 sc-eQTL 3.11e-01 -0.144 0.142 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -961280 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0738 0.0579 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 717822 sc-eQTL 8.49e-01 0.0229 0.121 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -860766 eQTL 0.00595 -0.0996 0.0361 0.0 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N -548186 3.62e-07 8.5e-07 6.86e-08 3.62e-07 1.06e-07 8.85e-08 5.01e-07 7.52e-08 2.75e-07 2.16e-07 1.07e-06 3.27e-07 1.05e-06 1.59e-07 1.45e-07 1.92e-07 2.07e-07 3.02e-07 1.13e-07 8.52e-08 1.91e-07 2.76e-07 2.33e-07 4.27e-08 9.26e-07 2.2e-07 1.48e-07 3.18e-07 2.11e-07 2.02e-07 3.66e-07 3.65e-08 5.07e-08 1.54e-07 2.61e-07 4.86e-08 6.14e-08 8.17e-08 4.9e-08 3.6e-08 4.41e-08 3.43e-07 5.2e-08 1.08e-08 6.38e-08 6.12e-08 1.18e-07 1.88e-09 4.73e-08