logo

Genes within 1Mb (chr6:131846387:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 7.96e-02 0.173 0.0982 0.1 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -555088 sc-eQTL 2.75e-01 0.158 0.144 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00714 0.0544 0.1 B L1
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 2.62e-01 0.122 0.108 0.1 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 6.82e-01 0.0419 0.102 0.1 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 6.20e-01 0.0307 0.0618 0.1 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 2.38e-01 0.152 0.128 0.1 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 3.02e-01 -0.134 0.13 0.1 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -285501 sc-eQTL 1.80e-02 0.201 0.0843 0.1 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0582 0.128 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0386 0.104 0.1 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00365 0.0827 0.1 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0169 0.0902 0.1 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0347 0.0613 0.1 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0192 0.111 0.1 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0412 0.124 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 2.69e-02 -0.234 0.105 0.1 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 7.94e-02 -0.183 0.104 0.1 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 6.80e-02 -0.225 0.123 0.1 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 2.10e-01 -0.053 0.0422 0.1 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 1.64e-01 -0.165 0.118 0.1 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 4.10e-01 -0.106 0.128 0.1 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 9.92e-01 0.00105 0.106 0.099 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00532 0.0933 0.099 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -888378 sc-eQTL 5.17e-01 0.075 0.116 0.099 DC L1
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 8.10e-01 0.0327 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -867668 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.125 0.099 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0103 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 9.03e-01 0.00918 0.0749 0.099 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0603 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0604 0.118 0.099 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 3.58e-01 -0.109 0.118 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 4.79e-01 0.05 0.0705 0.1 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -888378 sc-eQTL 6.76e-01 0.0507 0.121 0.1 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0877 0.115 0.1 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -867668 sc-eQTL 4.78e-01 0.0924 0.13 0.1 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0844 0.0918 0.1 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0855 0.0548 0.1 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 2.52e-01 -0.131 0.114 0.1 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 9.69e-01 0.00424 0.109 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 1.90e-01 0.145 0.111 0.101 NK L1
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 9.16e-01 0.0108 0.102 0.101 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 3.29e-01 -0.135 0.138 0.101 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0733 0.057 0.101 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 7.17e-01 0.0442 0.122 0.101 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 2.72e-02 -0.268 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0027 0.11 0.1 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0382 0.138 0.1 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 3.74e-01 -0.119 0.133 0.1 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0653 0.0527 0.1 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 9.58e-02 -0.241 0.144 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 1.06e-01 -0.204 0.125 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555088 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0435 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 1.34e-02 0.329 0.132 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 6.46e-01 0.0684 0.149 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0702 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 7.17e-01 0.0278 0.0765 0.107 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 3.87e-01 0.128 0.148 0.107 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0868 0.134 0.107 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285501 sc-eQTL 4.59e-01 0.0947 0.128 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 9.99e-02 0.221 0.134 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555088 sc-eQTL 1.75e-01 0.176 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0673 0.085 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 5.22e-01 0.083 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 5.06e-01 0.0852 0.128 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0156 0.0785 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 3.71e-01 0.118 0.131 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 9.52e-01 0.00848 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285501 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00144 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 8.62e-02 0.215 0.125 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555088 sc-eQTL 3.03e-02 0.281 0.129 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 2.51e-01 -0.117 0.102 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 1.63e-02 -0.314 0.13 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 2.43e-01 0.156 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0165 0.0644 0.099 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 3.36e-01 -0.132 0.137 0.099 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 7.06e-02 -0.242 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285501 sc-eQTL 6.14e-02 0.234 0.124 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 5.85e-02 0.207 0.109 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555088 sc-eQTL 7.90e-01 0.0398 0.149 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 9.73e-01 0.00224 0.0652 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 3.60e-01 0.107 0.117 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 1.48e-01 0.183 0.126 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0524 0.072 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 3.12e-01 0.148 0.146 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 9.25e-01 0.0131 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285501 sc-eQTL 1.71e-01 0.126 0.0918 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 3.13e-01 0.126 0.125 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555088 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0249 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0759 0.077 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 4.42e-01 0.11 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0954 0.141 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0169 0.075 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 6.67e-01 0.0645 0.15 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00335 0.143 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285501 sc-eQTL 2.98e-02 0.215 0.0981 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 3.11e-01 0.12 0.118 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0246 0.146 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 6.05e-01 0.0786 0.152 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 7.78e-01 0.0415 0.147 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0532 0.068 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 1.49e-01 -0.21 0.145 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0279 0.137 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 2.08e-01 -0.168 0.133 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 3.51e-01 -0.106 0.113 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 2.90e-01 -0.102 0.0963 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 7.62e-01 0.0317 0.105 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 8.97e-01 0.00878 0.068 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0268 0.126 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0215 0.131 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 5.49e-01 0.0814 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 8.73e-01 0.0198 0.124 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 9.95e-01 0.000648 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0607 0.122 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0732 0.0632 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 9.37e-01 0.00955 0.121 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0759 0.147 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0722 0.142 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 3.12e-01 -0.144 0.142 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0189 0.131 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0141 0.137 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0769 0.0558 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 9.93e-01 0.00119 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 7.54e-01 0.0436 0.139 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 3.09e-02 -0.25 0.115 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00288 0.119 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 3.09e-01 -0.135 0.132 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 2.22e-02 -0.161 0.07 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 7.83e-01 0.0368 0.134 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 2.90e-01 -0.145 0.137 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 8.40e-01 0.0295 0.146 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 6.71e-02 -0.214 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 7.28e-02 -0.225 0.125 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0175 0.072 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 4.20e-01 -0.107 0.132 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 6.74e-01 0.0607 0.144 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 6.46e-02 -0.263 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 7.83e-02 0.252 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 7.68e-01 0.0418 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 3.78e-01 0.0609 0.069 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 5.59e-02 -0.293 0.152 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 1.08e-01 -0.243 0.15 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 3.84e-03 -0.422 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0618 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0708 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0658 0.0786 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 2.53e-01 -0.164 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 4.17e-01 -0.121 0.149 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 3.08e-01 -0.134 0.131 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0732 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 3.26e-01 -0.141 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0635 0.139 0.1 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0595 0.0684 0.1 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 1.74e-01 -0.192 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0807 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0908 0.141 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 8.10e-01 -0.036 0.149 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0221 0.143 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 6.50e-01 0.0362 0.0798 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 8.84e-01 0.0211 0.145 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 5.31e-01 0.0741 0.118 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0889 0.121 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0942 0.148 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0887 0.0584 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 4.49e-01 0.0978 0.129 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 5.26e-01 -0.09 0.142 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 3.27e-01 0.141 0.143 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0272 0.144 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 5.34e-01 0.0417 0.0669 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 9.01e-01 0.0185 0.149 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00864 0.125 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 4.64e-01 0.0944 0.129 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 4.46e-01 -0.107 0.14 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 3.16e-01 0.0762 0.0759 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 6.51e-01 0.0588 0.13 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 4.90e-01 0.123 0.177 0.111 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555088 sc-eQTL 2.28e-01 0.177 0.146 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0812 0.123 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 5.95e-01 0.089 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 2.28e-01 -0.181 0.149 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 2.27e-02 0.193 0.0834 0.111 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0461 0.163 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 1.09e-01 -0.255 0.158 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285501 sc-eQTL 1.58e-01 -0.148 0.104 0.111 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 1.32e-01 -0.192 0.127 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 7.59e-01 0.0406 0.132 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 5.01e-01 -0.1 0.149 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0622 0.142 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0197 0.0536 0.096 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 1.31e-01 0.192 0.127 0.096 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0176 0.139 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 2.33e-01 -0.165 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 6.46e-01 0.0635 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0343 0.142 0.1 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 6.23e-01 0.0573 0.116 0.1 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0352 0.0514 0.1 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 8.95e-02 -0.208 0.122 0.1 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0217 0.145 0.1 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 8.77e-01 0.0189 0.122 0.095 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 5.18e-01 0.0788 0.122 0.095 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -888378 sc-eQTL 4.01e-01 -0.102 0.121 0.095 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 7.37e-01 0.0528 0.157 0.095 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -867668 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000267 0.142 0.095 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 3.83e-01 0.121 0.138 0.095 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 7.10e-01 0.0255 0.0684 0.095 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00222 0.153 0.095 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 5.98e-01 0.0715 0.136 0.095 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 4.06e-01 -0.107 0.128 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 2.84e-01 0.0968 0.0902 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -888378 sc-eQTL 7.53e-01 0.0402 0.128 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 3.81e-01 -0.111 0.126 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -867668 sc-eQTL 3.14e-01 0.13 0.129 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0957 0.103 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0936 0.0569 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0193 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0589 0.11 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 1.06e-01 -0.215 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 9.72e-01 0.00344 0.0976 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -888378 sc-eQTL 1.63e-01 0.17 0.121 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 5.63e-01 0.0766 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -867668 sc-eQTL 3.61e-01 0.121 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0512 0.0866 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0622 0.0623 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0677 0.129 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 5.26e-01 0.0734 0.115 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 9.89e-01 0.00199 0.151 0.109 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 1.13e-01 -0.25 0.156 0.109 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 2.36e-01 0.201 0.168 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0261 0.174 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0791 0.0661 0.109 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 1.55e-01 0.25 0.175 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0082 0.172 0.109 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0103 0.136 0.102 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 3.88e-01 0.114 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -888378 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0197 0.133 0.102 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 4.03e-01 -0.122 0.146 0.102 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -867668 sc-eQTL 8.27e-01 0.0287 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 9.84e-01 0.00271 0.134 0.102 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0158 0.0582 0.102 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 3.80e-02 -0.295 0.141 0.102 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 8.10e-01 -0.034 0.142 0.102 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 6.45e-01 0.0591 0.128 0.1 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0824 0.0974 0.1 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -888378 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0807 0.138 0.1 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0546 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -867668 sc-eQTL 7.77e-01 0.0387 0.137 0.1 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 4.26e-01 -0.105 0.131 0.1 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 1.05e-01 0.106 0.0655 0.1 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 5.40e-01 0.083 0.135 0.1 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 8.54e-01 0.0214 0.116 0.1 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 3.99e-01 0.138 0.163 0.093 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0221 0.118 0.093 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -888378 sc-eQTL 4.83e-02 0.233 0.117 0.093 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 2.94e-01 0.173 0.165 0.093 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -867668 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0464 0.12 0.093 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 4.30e-01 -0.113 0.143 0.093 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 5.42e-01 0.0603 0.0987 0.093 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 5.49e-02 -0.258 0.133 0.093 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 5.37e-01 0.0904 0.146 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 7.46e-01 0.0399 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -555088 sc-eQTL 4.56e-02 0.277 0.138 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 8.70e-01 -0.013 0.0788 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0159 0.121 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 3.80e-01 0.109 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0561 0.0709 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 7.75e-01 0.035 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 1.93e-01 -0.169 0.13 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -285501 sc-eQTL 2.25e-01 0.153 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 1.65e-02 0.248 0.102 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -555088 sc-eQTL 9.41e-01 0.011 0.149 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0326 0.0612 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 1.36e-01 0.171 0.114 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 4.47e-01 0.0905 0.119 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0391 0.0718 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 6.03e-01 0.0754 0.145 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 6.06e-01 0.0701 0.136 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -285501 sc-eQTL 2.82e-02 0.188 0.0852 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 1.27e-01 -0.189 0.123 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 4.54e-01 0.0569 0.0759 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -888378 sc-eQTL 5.42e-01 0.0757 0.124 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0395 0.119 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -867668 sc-eQTL 3.57e-01 0.119 0.129 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0947 0.0852 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0911 0.0583 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0763 0.117 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00127 0.104 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 783065 sc-eQTL 8.18e-01 0.0299 0.13 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00408 0.0924 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -888378 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0703 0.136 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 3.15e-01 -0.133 0.132 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -867668 sc-eQTL 8.06e-01 0.0331 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0643 0.127 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 5.88e-01 0.0292 0.0538 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 1.83e-01 -0.181 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -966952 sc-eQTL 8.63e-01 0.0226 0.131 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -666811 sc-eQTL 1.93e-01 0.147 0.112 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 218145 sc-eQTL 8.90e-01 0.0152 0.109 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -917072 sc-eQTL 3.11e-01 -0.144 0.142 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -968182 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0738 0.0579 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 710920 sc-eQTL 8.49e-01 0.0229 0.121 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -867668 eQTL 0.00709 -0.0967 0.0358 0.0 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N -555088 9.39e-07 8.23e-07 1.57e-07 6.06e-07 1.54e-07 4.02e-07 7.02e-07 1.37e-07 7.15e-07 3.11e-07 1.09e-06 5.39e-07 1.28e-06 2.9e-07 1.57e-07 3.68e-07 5.06e-07 5.12e-07 4e-07 8.31e-08 1.92e-07 6.91e-07 6.63e-07 1.44e-07 1.72e-06 2.53e-07 4.37e-07 3.18e-07 4.9e-07 9.21e-07 3.79e-07 7.69e-08 5.41e-08 1.75e-07 3.42e-07 6.94e-08 1.13e-07 7.66e-08 6.41e-08 2.2e-08 4.68e-08 9.76e-07 3.37e-08 5.83e-09 8.45e-08 1.28e-07 7.52e-08 1.13e-08 4.61e-08