logo

Genes within 1Mb (chr6:131846150:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 6.75e-02 0.175 0.0953 0.103 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -555325 sc-eQTL 3.60e-01 0.128 0.14 0.103 B L1
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0143 0.0528 0.103 B L1
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 2.02e-01 0.134 0.105 0.103 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 6.58e-01 0.044 0.0993 0.103 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 5.42e-01 0.0366 0.06 0.103 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 2.32e-01 0.149 0.124 0.103 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 3.96e-01 -0.107 0.126 0.103 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -285738 sc-eQTL 8.35e-03 0.217 0.0816 0.103 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 6.76e-01 -0.052 0.124 0.103 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0383 0.101 0.103 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 9.74e-01 0.0026 0.0805 0.103 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00426 0.0878 0.103 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0198 0.0597 0.103 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0192 0.108 0.103 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0232 0.121 0.103 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 3.84e-02 -0.213 0.102 0.103 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 5.07e-02 -0.198 0.101 0.103 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 8.27e-02 -0.208 0.119 0.103 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0443 0.041 0.103 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 2.17e-01 -0.143 0.115 0.103 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0782 0.124 0.103 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 9.45e-01 0.0071 0.103 0.101 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 9.93e-01 0.000823 0.0906 0.101 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -888615 sc-eQTL 5.72e-01 0.0635 0.112 0.101 DC L1
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 8.66e-01 0.0222 0.132 0.101 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -867905 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0113 0.121 0.101 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0185 0.13 0.101 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 7.79e-01 0.0204 0.0727 0.101 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0586 0.13 0.101 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0467 0.115 0.101 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0992 0.115 0.103 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 4.17e-01 0.0559 0.0687 0.103 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -888615 sc-eQTL 7.34e-01 0.0401 0.118 0.103 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 3.64e-01 -0.102 0.112 0.103 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -867905 sc-eQTL 6.61e-01 0.0559 0.127 0.103 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 2.64e-01 -0.1 0.0894 0.103 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0678 0.0536 0.103 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 2.94e-01 -0.117 0.111 0.103 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 9.23e-01 0.0103 0.106 0.103 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 2.22e-01 0.132 0.108 0.103 NK L1
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0101 0.0987 0.103 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 4.07e-01 -0.112 0.134 0.103 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0738 0.0554 0.103 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 7.33e-01 0.0404 0.118 0.103 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 2.64e-02 -0.262 0.117 0.103 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 9.66e-01 0.00463 0.107 0.103 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0519 0.134 0.103 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 4.28e-01 -0.103 0.129 0.103 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0629 0.0512 0.103 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 9.92e-01 0.00112 0.117 0.103 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 7.48e-02 -0.25 0.14 0.103 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 1.06e-01 -0.204 0.125 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555325 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0435 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 1.34e-02 0.329 0.132 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 6.46e-01 0.0684 0.149 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0702 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 7.17e-01 0.0278 0.0765 0.107 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 3.87e-01 0.128 0.148 0.107 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0868 0.134 0.107 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285738 sc-eQTL 4.59e-01 0.0947 0.128 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 1.46e-01 0.19 0.13 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555325 sc-eQTL 1.82e-01 0.169 0.126 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0813 0.0826 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 5.86e-01 0.0686 0.126 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 4.27e-01 0.099 0.124 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00723 0.0763 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 3.84e-01 0.111 0.128 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 8.99e-01 0.0175 0.137 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285738 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0153 0.117 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 6.00e-02 0.229 0.121 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555325 sc-eQTL 3.07e-02 0.272 0.125 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0957 0.0991 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 2.85e-02 -0.279 0.127 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 3.22e-01 0.129 0.13 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 9.89e-01 0.000896 0.0626 0.101 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 4.51e-01 -0.101 0.133 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 5.18e-02 -0.253 0.129 0.101 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285738 sc-eQTL 9.28e-02 0.204 0.121 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 4.35e-02 0.215 0.106 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555325 sc-eQTL 9.79e-01 0.00374 0.145 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0116 0.0634 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 3.15e-01 0.114 0.113 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 1.59e-01 0.173 0.123 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0443 0.07 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 3.26e-01 0.14 0.142 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 7.08e-01 0.0507 0.135 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285738 sc-eQTL 5.58e-02 0.171 0.0888 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 4.68e-01 0.0898 0.124 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555325 sc-eQTL 9.87e-01 0.00227 0.14 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0792 0.0762 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 3.09e-01 0.144 0.141 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0862 0.14 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 8.51e-01 -0.014 0.0743 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 6.48e-01 0.0677 0.148 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00309 0.142 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285738 sc-eQTL 2.38e-02 0.221 0.097 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 4.07e-01 0.095 0.114 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0581 0.141 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 5.67e-01 0.0843 0.147 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 7.27e-01 0.0497 0.143 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0513 0.0658 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 1.62e-01 -0.197 0.14 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0371 0.133 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 2.41e-01 -0.152 0.129 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 3.47e-01 -0.103 0.11 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0796 0.0937 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 6.75e-01 0.0427 0.102 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 7.29e-01 0.0229 0.0661 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0288 0.123 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 8.88e-01 -0.018 0.127 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 5.49e-01 0.0792 0.132 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 8.87e-01 0.0172 0.121 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0017 0.102 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0427 0.119 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0574 0.0616 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 9.66e-01 0.00507 0.118 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0516 0.143 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0828 0.138 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 3.22e-01 -0.137 0.138 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0355 0.127 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0167 0.133 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0631 0.0543 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 9.94e-01 0.00101 0.14 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 6.92e-01 0.0537 0.135 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 6.44e-02 -0.209 0.112 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0322 0.116 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 3.63e-01 -0.117 0.128 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 3.09e-02 -0.148 0.0681 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 6.96e-01 0.0508 0.13 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 3.04e-01 -0.137 0.133 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 8.01e-01 0.0356 0.141 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 6.29e-02 -0.211 0.113 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 8.15e-02 -0.212 0.121 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0068 0.0698 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0931 0.128 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 6.07e-01 0.0721 0.14 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 6.49e-02 -0.254 0.137 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 1.03e-01 0.226 0.138 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 8.56e-01 0.0249 0.137 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 3.36e-01 0.0643 0.0667 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 4.89e-02 -0.292 0.147 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 1.85e-01 -0.194 0.146 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 3.42e-03 -0.415 0.14 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0531 0.138 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 6.38e-01 -0.067 0.142 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0563 0.0764 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 2.61e-01 -0.157 0.14 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 4.94e-01 -0.099 0.144 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 3.46e-01 -0.12 0.127 0.102 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 8.16e-01 -0.031 0.133 0.102 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 3.27e-01 -0.136 0.139 0.102 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0381 0.135 0.102 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0577 0.0664 0.102 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 1.83e-01 -0.183 0.137 0.102 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0851 0.139 0.102 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0897 0.137 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0543 0.145 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0101 0.139 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 6.91e-01 0.0308 0.0774 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00436 0.14 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 5.46e-01 0.0696 0.115 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0987 0.118 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0774 0.144 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0902 0.0567 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 4.43e-01 0.0963 0.125 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 4.16e-01 -0.112 0.138 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 4.07e-01 0.116 0.139 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0341 0.14 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 4.42e-01 0.0501 0.065 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 8.95e-01 0.0192 0.145 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0173 0.121 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 5.39e-01 0.077 0.125 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0928 0.136 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 3.17e-01 0.074 0.0737 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 6.52e-01 0.0572 0.126 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 4.90e-01 0.123 0.177 0.111 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -555325 sc-eQTL 2.28e-01 0.177 0.146 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0812 0.123 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 5.95e-01 0.089 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 2.28e-01 -0.181 0.149 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 2.27e-02 0.193 0.0834 0.111 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0461 0.163 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 1.09e-01 -0.255 0.158 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -285738 sc-eQTL 1.58e-01 -0.148 0.104 0.111 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 1.07e-01 -0.199 0.123 0.098 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 7.13e-01 0.0471 0.128 0.098 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0951 0.144 0.098 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00961 0.137 0.098 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 7.58e-01 -0.016 0.0519 0.098 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 1.03e-01 0.201 0.123 0.098 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0288 0.134 0.098 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 2.94e-01 -0.141 0.134 0.103 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 6.56e-01 0.0599 0.134 0.103 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0422 0.138 0.103 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 6.89e-01 0.0453 0.113 0.103 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0257 0.05 0.103 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 1.07e-01 -0.192 0.118 0.103 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000361 0.141 0.103 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 7.92e-01 0.0312 0.118 0.098 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 5.52e-01 0.0703 0.118 0.098 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -888615 sc-eQTL 3.77e-01 -0.104 0.117 0.098 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 6.52e-01 0.0689 0.152 0.098 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -867905 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00235 0.138 0.098 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 4.49e-01 0.102 0.134 0.098 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 5.81e-01 0.0366 0.0662 0.098 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 9.72e-01 0.00518 0.148 0.098 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 6.55e-01 0.0587 0.131 0.098 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0774 0.125 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 2.61e-01 0.0992 0.0879 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -888615 sc-eQTL 8.11e-01 0.0299 0.125 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 3.55e-01 -0.114 0.123 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -867905 sc-eQTL 4.21e-01 0.101 0.126 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 2.90e-01 -0.106 0.1 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 1.67e-01 -0.077 0.0556 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00603 0.12 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0625 0.108 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 7.29e-02 -0.232 0.129 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 9.77e-01 0.00277 0.0949 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -888615 sc-eQTL 1.61e-01 0.166 0.118 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 6.09e-01 0.0659 0.129 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -867905 sc-eQTL 4.24e-01 0.103 0.129 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0528 0.0843 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0445 0.0606 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0502 0.126 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 3.55e-01 0.104 0.112 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 9.75e-01 0.00458 0.145 0.112 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 9.91e-02 -0.25 0.15 0.112 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 2.93e-01 0.171 0.162 0.112 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0339 0.168 0.112 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0637 0.0637 0.112 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 1.74e-01 0.231 0.169 0.112 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0285 0.165 0.112 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0239 0.132 0.104 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 3.65e-01 0.116 0.128 0.104 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -888615 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0309 0.13 0.104 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 3.48e-01 -0.134 0.142 0.104 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -867905 sc-eQTL 9.14e-01 0.0139 0.128 0.104 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0158 0.13 0.104 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 9.89e-01 0.000762 0.0567 0.104 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 3.50e-02 -0.292 0.137 0.104 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0465 0.138 0.104 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 6.59e-01 0.0549 0.124 0.102 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0708 0.0946 0.102 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -888615 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0653 0.134 0.102 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0798 0.135 0.102 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -867905 sc-eQTL 8.65e-01 0.0226 0.133 0.102 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 3.98e-01 -0.108 0.127 0.102 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 7.19e-02 0.115 0.0635 0.102 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 4.22e-01 0.106 0.131 0.102 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 8.46e-01 0.022 0.113 0.102 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 3.92e-01 0.134 0.156 0.096 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00646 0.113 0.096 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -888615 sc-eQTL 5.96e-02 0.213 0.112 0.096 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 3.62e-01 0.144 0.158 0.096 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -867905 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0245 0.116 0.096 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 4.41e-01 -0.106 0.137 0.096 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 5.33e-01 0.0592 0.0947 0.096 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 7.60e-02 -0.229 0.128 0.096 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 4.84e-01 0.0984 0.14 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 7.40e-01 0.0395 0.119 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -555325 sc-eQTL 4.55e-02 0.269 0.134 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0203 0.0764 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0174 0.117 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 3.48e-01 0.113 0.121 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0379 0.0688 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 7.04e-01 0.0452 0.119 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 2.17e-01 -0.156 0.126 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -285738 sc-eQTL 2.02e-01 0.156 0.122 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 1.23e-02 0.251 0.0995 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -555325 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0216 0.145 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0412 0.0594 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 9.01e-02 0.189 0.111 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 4.38e-01 0.0896 0.115 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0291 0.0698 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 6.08e-01 0.0723 0.141 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 4.23e-01 0.106 0.132 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -285738 sc-eQTL 9.93e-03 0.214 0.0824 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 1.55e-01 -0.171 0.12 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 4.22e-01 0.0596 0.0741 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -888615 sc-eQTL 5.80e-01 0.067 0.121 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0482 0.116 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -867905 sc-eQTL 4.67e-01 0.0918 0.126 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 2.13e-01 -0.104 0.0831 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0755 0.0569 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 5.69e-01 -0.065 0.114 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 9.51e-01 0.0063 0.102 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 782828 sc-eQTL 8.59e-01 0.0225 0.127 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 9.52e-01 0.00542 0.0899 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -888615 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0605 0.132 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 2.37e-01 -0.152 0.128 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -867905 sc-eQTL 9.22e-01 0.0128 0.131 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0728 0.124 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 3.57e-01 0.0483 0.0523 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 2.26e-01 -0.16 0.132 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -967189 sc-eQTL 9.65e-01 0.00564 0.127 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -667048 sc-eQTL 2.27e-01 0.132 0.109 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 217908 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00329 0.106 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -917309 sc-eQTL 3.79e-01 -0.122 0.138 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -968419 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0729 0.0564 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 710683 sc-eQTL 8.68e-01 0.0195 0.117 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -867905 eQTL 0.00596 -0.0995 0.0361 0.0 0.0 0.0972

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N -555325 1.29e-06 8.16e-07 2.79e-07 4.27e-07 1.09e-07 2.16e-07 7.53e-07 8.37e-08 7.11e-07 2.8e-07 9.73e-07 4.28e-07 1.43e-06 2.19e-07 4.37e-07 4.91e-07 4.3e-07 5.45e-07 2.57e-07 1.71e-07 5.8e-07 5.71e-07 5.77e-07 1.17e-07 1.49e-06 2.49e-07 3.26e-07 4.71e-07 5.41e-07 6.73e-07 3.81e-07 5.93e-08 1.08e-07 7.03e-07 3.38e-07 4.15e-07 3.62e-07 1.12e-07 6.58e-08 5.77e-08 4.89e-08 1.13e-06 5.37e-07 5.96e-09 7.26e-08 7.09e-08 1.49e-07 3.05e-08 4.98e-08